MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 3316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015667	CAT	2	6	63679	63684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251621
1002	NC_015667	ACA	2	6	63707	63712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251621
1003	NC_015667	TCA	2	6	63784	63789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251621
1004	NC_015667	ACA	2	6	63810	63815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251621
1005	NC_015667	CTC	2	6	63833	63838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251621
1006	NC_015667	CGAG	2	8	63919	63926	25 %	0 %	50 %	25 %	336251621
1007	NC_015667	GAC	2	6	63948	63953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251621
1008	NC_015667	CGAA	2	8	64144	64151	50 %	0 %	25 %	25 %	336251622
1009	NC_015667	GACGC	3	15	64156	64170	20 %	0 %	40 %	40 %	336251622
1010	NC_015667	TGC	2	6	64186	64191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251622
1011	NC_015667	GCG	2	6	64260	64265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251622
1012	NC_015667	CGA	2	6	64270	64275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251622
1013	NC_015667	TTC	2	6	64295	64300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251622
1014	NC_015667	CTT	2	6	64303	64308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251622
1015	NC_015667	CGC	2	6	64338	64343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251622
1016	NC_015667	CACGGC	2	12	64376	64387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251622
1017	NC_015667	CAT	2	6	64417	64422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251622
1018	NC_015667	GAC	2	6	64499	64504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251622
1019	NC_015667	TCA	2	6	64518	64523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251622
1020	NC_015667	TGG	2	6	64545	64550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251622
1021	NC_015667	CGC	2	6	64555	64560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251622
1022	NC_015667	CTCG	2	8	64561	64568	0 %	25 %	25 %	50 %	336251622
1023	NC_015667	CGA	2	6	64573	64578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251622
1024	NC_015667	CTGG	2	8	64618	64625	0 %	25 %	50 %	25 %	336251622
1025	NC_015667	GC	3	6	64633	64638	0 %	0 %	50 %	50 %	336251622
1026	NC_015667	TCC	2	6	64680	64685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251622
1027	NC_015667	CGC	2	6	64804	64809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251622
1028	NC_015667	GCG	2	6	64884	64889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251622
1029	NC_015667	GAAGCG	2	12	64913	64924	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336251622
1030	NC_015667	AAC	2	6	64937	64942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251622
1031	NC_015667	CAG	2	6	64988	64993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251622
1032	NC_015667	GAG	2	6	65066	65071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251622
1033	NC_015667	GAG	2	6	65084	65089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251622
1034	NC_015667	ACA	2	6	65097	65102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251622
1035	NC_015667	CAA	2	6	65134	65139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251622
1036	NC_015667	CGGC	2	8	65234	65241	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
1037	NC_015667	ACGA	2	8	65242	65249	50 %	0 %	25 %	25 %	336251623
1038	NC_015667	GC	3	6	65484	65489	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
1039	NC_015667	CGA	2	6	65499	65504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251623
1040	NC_015667	CAG	2	6	65530	65535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251623
1041	NC_015667	GCC	2	6	65542	65547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251623
1042	NC_015667	GGT	2	6	65574	65579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251623
1043	NC_015667	TCGG	2	8	65609	65616	0 %	25 %	50 %	25 %	336251623
1044	NC_015667	TCG	2	6	65639	65644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251623
1045	NC_015667	GTTC	2	8	65672	65679	0 %	50 %	25 %	25 %	336251623
1046	NC_015667	CGG	2	6	65706	65711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251623
1047	NC_015667	CCAACG	2	12	65712	65723	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	336251623
1048	NC_015667	CG	3	6	65722	65727	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
1049	NC_015667	CG	3	6	65733	65738	0 %	0 %	50 %	50 %	336251623
1050	NC_015667	GCGA	2	8	65746	65753	25 %	0 %	50 %	25 %	336251623
1051	NC_015667	AGTC	2	8	65801	65808	25 %	25 %	25 %	25 %	336251623
1052	NC_015667	GGC	2	6	65829	65834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251623
1053	NC_015667	GTC	2	6	65908	65913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251623
1054	NC_015667	CCGA	2	8	65944	65951	25 %	0 %	25 %	50 %	336251623
1055	NC_015667	CTG	2	6	66075	66080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1056	NC_015667	TCC	2	6	66130	66135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251624
1057	NC_015667	TAC	2	6	66177	66182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251624
1058	NC_015667	TCG	2	6	66238	66243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1059	NC_015667	CCG	2	6	66403	66408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251624
1060	NC_015667	TCG	2	6	66409	66414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1061	NC_015667	GAT	2	6	66419	66424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251624
1062	NC_015667	CGC	2	6	66425	66430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251624
1063	NC_015667	ACG	2	6	66472	66477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1064	NC_015667	GAC	2	6	66518	66523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1065	NC_015667	TCA	2	6	66526	66531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251624
1066	NC_015667	CGGG	2	8	66541	66548	0 %	0 %	75 %	25 %	336251624
1067	NC_015667	C	6	6	66598	66603	0 %	0 %	0 %	100 %	336251624
1068	NC_015667	TCG	2	6	66631	66636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1069	NC_015667	TCG	2	6	66640	66645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1070	NC_015667	CGA	2	6	66689	66694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1071	NC_015667	GTGATG	2	12	66741	66752	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	336251624
1072	NC_015667	GTC	3	9	66765	66773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1073	NC_015667	TCG	2	6	66802	66807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1074	NC_015667	GTG	2	6	66819	66824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251624
1075	NC_015667	GTC	2	6	66882	66887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251624
1076	NC_015667	CATCGC	2	12	66914	66925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336251624
1077	NC_015667	CTA	2	6	66926	66931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251624
1078	NC_015667	CGG	2	6	66947	66952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251624
1079	NC_015667	CAT	2	6	66953	66958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251624
1080	NC_015667	GCG	2	6	67242	67247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251625
1081	NC_015667	ACCG	2	8	67294	67301	25 %	0 %	25 %	50 %	336251625
1082	NC_015667	TCC	2	6	67304	67309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251625
1083	NC_015667	GAA	2	6	67325	67330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251625
1084	NC_015667	GAG	2	6	67349	67354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251625
1085	NC_015667	AGG	2	6	67377	67382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251625
1086	NC_015667	TCG	2	6	67389	67394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251625
1087	NC_015667	CAC	2	6	67412	67417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251625
1088	NC_015667	GACC	2	8	67438	67445	25 %	0 %	25 %	50 %	336251625
1089	NC_015667	ACG	2	6	67473	67478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251625
1090	NC_015667	CAC	2	6	67496	67501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251625
1091	NC_015667	GGA	2	6	67507	67512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251625
1092	NC_015667	GACC	2	8	67516	67523	25 %	0 %	25 %	50 %	336251625
1093	NC_015667	C	6	6	67546	67551	0 %	0 %	0 %	100 %	336251625
1094	NC_015667	GAG	2	6	67601	67606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251625
1095	NC_015667	CGCCGA	2	12	67624	67635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336251625
1096	NC_015667	CGG	2	6	67658	67663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251625
1097	NC_015667	CCA	2	6	67669	67674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251625
1098	NC_015667	GTC	2	6	67826	67831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251625
1099	NC_015667	AGGG	2	8	67863	67870	25 %	0 %	75 %	0 %	336251625
1100	NC_015667	CCAC	2	8	68309	68316	25 %	0 %	0 %	75 %	336251626
1101	NC_015667	CTC	2	6	68320	68325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251626
1102	NC_015667	GTG	2	6	68330	68335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251626
1103	NC_015667	CGA	2	6	68511	68516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1104	NC_015667	GAC	2	6	68688	68693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1105	NC_015667	CGA	2	6	68718	68723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1106	NC_015667	TCG	2	6	68753	68758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1107	NC_015667	GTT	2	6	68811	68816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251627
1108	NC_015667	ATC	2	6	68842	68847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251627
1109	NC_015667	GGA	2	6	68874	68879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251627
1110	NC_015667	TCC	2	6	68882	68887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251627
1111	NC_015667	GAG	2	6	68890	68895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251627
1112	NC_015667	GCG	3	9	68954	68962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251627
1113	NC_015667	CAT	2	6	68976	68981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251627
1114	NC_015667	CCGG	2	8	69008	69015	0 %	0 %	50 %	50 %	336251627
1115	NC_015667	CTT	2	6	69054	69059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251627
1116	NC_015667	GCTC	2	8	69122	69129	0 %	25 %	25 %	50 %	336251627
1117	NC_015667	AGG	2	6	69137	69142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251627
1118	NC_015667	TCA	2	6	69143	69148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251627
1119	NC_015667	TGG	2	6	69181	69186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251627
1120	NC_015667	CTC	2	6	69193	69198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251627
1121	NC_015667	TCG	2	6	69212	69217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1122	NC_015667	CGA	2	6	69219	69224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1123	NC_015667	TGC	2	6	69339	69344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251627
1124	NC_015667	GCG	2	6	69364	69369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251627
1125	NC_015667	CTT	2	6	69429	69434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251627
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1244	NC_015667	GAG	2	6	78014	78019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251636
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1366	NC_015667	TCGATC	2	12	85949	85960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336251643
1367	NC_015667	CGCT	2	8	86018	86025	0 %	25 %	25 %	50 %	336251643
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1490	NC_015667	GTT	2	6	91893	91898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251650
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1492	NC_015667	CGA	2	6	91921	91926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1493	NC_015667	GCT	2	6	91952	91957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1494	NC_015667	GATC	2	8	91987	91994	25 %	25 %	25 %	25 %	336251650
1495	NC_015667	CGA	2	6	92009	92014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1496	NC_015667	CGC	2	6	92053	92058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251650
1497	NC_015667	GCC	2	6	92060	92065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251650
1498	NC_015667	CCG	2	6	92094	92099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251650
1499	NC_015667	CGA	2	6	92110	92115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251650
1500	NC_015667	GGC	2	6	92135	92140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251650

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