MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 2415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	GCGTC	2	10	1567	1576	0 %	20 %	40 %	40 %	336252098
2	NC_015666	GCCTT	2	10	2797	2806	0 %	40 %	20 %	40 %	336252100
3	NC_015666	GGGCG	2	10	3740	3749	0 %	0 %	80 %	20 %	336252101
4	NC_015666	CGGCC	2	10	4847	4856	0 %	0 %	40 %	60 %	336252102
5	NC_015666	CGAAC	2	10	6340	6349	40 %	0 %	20 %	40 %	336252104
6	NC_015666	ATCGG	2	10	6820	6829	20 %	20 %	40 %	20 %	336252104
7	NC_015666	CGCGG	2	10	7452	7461	0 %	0 %	60 %	40 %	336252104
8	NC_015666	GTCGC	2	10	7870	7879	0 %	20 %	40 %	40 %	336252104
9	NC_015666	TGCAC	2	10	9861	9870	20 %	20 %	20 %	40 %	336252106
10	NC_015666	GACCG	2	10	11248	11257	20 %	0 %	40 %	40 %	336252108
11	NC_015666	GTTCG	2	10	11752	11761	0 %	40 %	40 %	20 %	336252108
12	NC_015666	GCTTC	2	10	12351	12360	0 %	40 %	20 %	40 %	336252108
13	NC_015666	CGACG	2	10	14057	14066	20 %	0 %	40 %	40 %	336252109
14	NC_015666	CGGTG	2	10	14673	14682	0 %	20 %	60 %	20 %	336252111
15	NC_015666	GTTCG	2	10	14904	14913	0 %	40 %	40 %	20 %	336252111
16	NC_015666	TCGCC	2	10	15393	15402	0 %	20 %	20 %	60 %	336252111
17	NC_015666	ACTTG	2	10	15414	15423	20 %	40 %	20 %	20 %	336252111
18	NC_015666	GCGCC	2	10	16864	16873	0 %	0 %	40 %	60 %	336252111
19	NC_015666	CGATG	2	10	18166	18175	20 %	20 %	40 %	20 %	336252112
20	NC_015666	CGAGT	2	10	19325	19334	20 %	20 %	40 %	20 %	336252113
21	NC_015666	CCGCG	2	10	29836	29845	0 %	0 %	40 %	60 %	336252122
22	NC_015666	GTCGC	2	10	33995	34004	0 %	20 %	40 %	40 %	336252124
23	NC_015666	CTGCG	2	10	36599	36608	0 %	20 %	40 %	40 %	336252130
24	NC_015666	CGCGT	2	10	37445	37454	0 %	20 %	40 %	40 %	336252130
25	NC_015666	ACCGA	3	15	37764	37778	40 %	0 %	20 %	40 %	336252130
26	NC_015666	GTTCG	2	10	39703	39712	0 %	40 %	40 %	20 %	336252132
27	NC_015666	GCGCC	2	10	39763	39772	0 %	0 %	40 %	60 %	336252132
28	NC_015666	TCGTC	2	10	45229	45238	0 %	40 %	20 %	40 %	336252138
29	NC_015666	GTTCG	2	10	49708	49717	0 %	40 %	40 %	20 %	336252142
30	NC_015666	GGGCT	2	10	50618	50627	0 %	20 %	60 %	20 %	336252143
31	NC_015666	GTCGT	2	10	52323	52332	0 %	40 %	40 %	20 %	336252145
32	NC_015666	ATCGA	2	10	53303	53312	40 %	20 %	20 %	20 %	336252146
33	NC_015666	ACCGG	2	10	53923	53932	20 %	0 %	40 %	40 %	336252148
34	NC_015666	TTCGG	2	10	54006	54015	0 %	40 %	40 %	20 %	336252149
35	NC_015666	GCGAC	2	10	54722	54731	20 %	0 %	40 %	40 %	336252150
36	NC_015666	CTCGT	2	10	56784	56793	0 %	40 %	20 %	40 %	336252154
37	NC_015666	GCAGC	2	10	58839	58848	20 %	0 %	40 %	40 %	336252156
38	NC_015666	GATCG	2	10	58862	58871	20 %	20 %	40 %	20 %	336252156
39	NC_015666	CGGCG	2	10	59377	59386	0 %	0 %	60 %	40 %	336252157
40	NC_015666	CGGAA	2	10	59645	59654	40 %	0 %	40 %	20 %	336252157
41	NC_015666	TTCGA	2	10	60865	60874	20 %	40 %	20 %	20 %	336252157
42	NC_015666	GACGA	2	10	61150	61159	40 %	0 %	40 %	20 %	336252157
43	NC_015666	TCGCG	2	10	61343	61352	0 %	20 %	40 %	40 %	336252158
44	NC_015666	ACGGA	2	10	64087	64096	40 %	0 %	40 %	20 %	336252161
45	NC_015666	GATCC	2	10	64284	64293	20 %	20 %	20 %	40 %	336252162
46	NC_015666	TCGCC	2	10	67435	67444	0 %	20 %	20 %	60 %	336252165
47	NC_015666	CACGA	2	10	68291	68300	40 %	0 %	20 %	40 %	336252166
48	NC_015666	TCGGC	2	10	70289	70298	0 %	20 %	40 %	40 %	336252169
49	NC_015666	CGCGA	2	10	72628	72637	20 %	0 %	40 %	40 %	336252171
50	NC_015666	GGCAG	2	10	73312	73321	20 %	0 %	60 %	20 %	336252171
51	NC_015666	AGGCG	2	10	74528	74537	20 %	0 %	60 %	20 %	336252173
52	NC_015666	TCGAG	2	10	77598	77607	20 %	20 %	40 %	20 %	336252176
53	NC_015666	TCCGG	2	10	77705	77714	0 %	20 %	40 %	40 %	336252176
54	NC_015666	GGCGA	2	10	83437	83446	20 %	0 %	60 %	20 %	336252181
55	NC_015666	CGTCA	2	10	83737	83746	20 %	20 %	20 %	40 %	336252181
56	NC_015666	GGGCT	2	10	86207	86216	0 %	20 %	60 %	20 %	336252184
57	NC_015666	CGGCG	2	10	86727	86736	0 %	0 %	60 %	40 %	336252184
58	NC_015666	GAAAC	2	10	90660	90669	60 %	0 %	20 %	20 %	336252187
59	NC_015666	GCTCG	2	10	91387	91396	0 %	20 %	40 %	40 %	336252187
60	NC_015666	TCGAG	2	10	92112	92121	20 %	20 %	40 %	20 %	336252188
61	NC_015666	CGACG	2	10	92169	92178	20 %	0 %	40 %	40 %	336252188
62	NC_015666	GCCCG	2	10	92851	92860	0 %	0 %	40 %	60 %	336252188
63	NC_015666	GCGCG	2	10	93497	93506	0 %	0 %	60 %	40 %	336252188
64	NC_015666	CGCGG	2	10	93799	93808	0 %	0 %	60 %	40 %	336252189
65	NC_015666	CCGTC	2	10	94769	94778	0 %	20 %	20 %	60 %	336252191
66	NC_015666	TCGGA	2	10	95390	95399	20 %	20 %	40 %	20 %	336252192
67	NC_015666	ACCGT	2	10	95453	95462	20 %	20 %	20 %	40 %	336252192
68	NC_015666	CGATC	2	10	97783	97792	20 %	20 %	20 %	40 %	336252194
69	NC_015666	CGAGC	2	10	99182	99191	20 %	0 %	40 %	40 %	336252198
70	NC_015666	TCGGC	2	10	102580	102589	0 %	20 %	40 %	40 %	336252201
71	NC_015666	GCTCG	2	10	103086	103095	0 %	20 %	40 %	40 %	336252201
72	NC_015666	GGACG	2	10	104327	104336	20 %	0 %	60 %	20 %	336252203
73	NC_015666	GTCGA	2	10	104475	104484	20 %	20 %	40 %	20 %	336252203
74	NC_015666	GTCGG	2	10	104808	104817	0 %	20 %	60 %	20 %	336252203
75	NC_015666	GCCGG	2	10	105809	105818	0 %	0 %	60 %	40 %	336252205
76	NC_015666	GCAGC	2	10	112862	112871	20 %	0 %	40 %	40 %	336252213
77	NC_015666	AGCGC	2	10	113491	113500	20 %	0 %	40 %	40 %	336252214
78	NC_015666	GTCGC	2	10	114775	114784	0 %	20 %	40 %	40 %	336252216
79	NC_015666	AGTCC	2	10	116568	116577	20 %	20 %	20 %	40 %	336252217
80	NC_015666	GCCGA	2	10	121393	121402	20 %	0 %	40 %	40 %	336252222
81	NC_015666	ACCGC	2	10	123767	123776	20 %	0 %	20 %	60 %	336252224
82	NC_015666	CGGCG	2	10	124219	124228	0 %	0 %	60 %	40 %	336252225
83	NC_015666	CTGCG	2	10	127223	127232	0 %	20 %	40 %	40 %	336252228
84	NC_015666	GCGTC	2	10	128053	128062	0 %	20 %	40 %	40 %	336252228
85	NC_015666	GACGA	2	10	129368	129377	40 %	0 %	40 %	20 %	336252229
86	NC_015666	GTTCG	2	10	130927	130936	0 %	40 %	40 %	20 %	336252230
87	NC_015666	CGGCG	2	10	131422	131431	0 %	0 %	60 %	40 %	336252231
88	NC_015666	TCCGG	2	10	134829	134838	0 %	20 %	40 %	40 %	336252236
89	NC_015666	GGCGG	2	10	134862	134871	0 %	0 %	80 %	20 %	336252236
90	NC_015666	TCGTG	2	10	135184	135193	0 %	40 %	40 %	20 %	336252236
91	NC_015666	GCTCG	2	10	135810	135819	0 %	20 %	40 %	40 %	336252237
92	NC_015666	AGCCG	2	10	136343	136352	20 %	0 %	40 %	40 %	336252238
93	NC_015666	AGCGA	2	10	138571	138580	40 %	0 %	40 %	20 %	336252241
94	NC_015666	CGCGC	2	10	140800	140809	0 %	0 %	40 %	60 %	336252245
95	NC_015666	GGGCG	2	10	141309	141318	0 %	0 %	80 %	20 %	336252246
96	NC_015666	CGGCC	2	10	145035	145044	0 %	0 %	40 %	60 %	336252249
97	NC_015666	CCGCC	2	10	146283	146292	0 %	0 %	20 %	80 %	336252251
98	NC_015666	CACCG	2	10	148971	148980	20 %	0 %	20 %	60 %	336252254
99	NC_015666	CGTCG	2	10	150903	150912	0 %	20 %	40 %	40 %	336252256
100	NC_015666	AGCCC	2	10	151049	151058	20 %	0 %	20 %	60 %	336252256
101	NC_015666	CCGGC	2	10	151879	151888	0 %	0 %	40 %	60 %	336252257
102	NC_015666	GTCGC	2	10	153670	153679	0 %	20 %	40 %	40 %	336252258
103	NC_015666	GGACG	2	10	154470	154479	20 %	0 %	60 %	20 %	336252259
104	NC_015666	GACGA	2	10	155095	155104	40 %	0 %	40 %	20 %	336252259
105	NC_015666	GCAAC	2	10	158146	158155	40 %	0 %	20 %	40 %	336252261
106	NC_015666	TCGGC	2	10	158701	158710	0 %	20 %	40 %	40 %	336252262
107	NC_015666	CGTTC	2	10	159521	159530	0 %	40 %	20 %	40 %	336252263
108	NC_015666	CGGCC	2	10	163420	163429	0 %	0 %	40 %	60 %	336252267
109	NC_015666	CGGAA	2	10	163548	163557	40 %	0 %	40 %	20 %	336252267
110	NC_015666	GCGCC	2	10	163926	163935	0 %	0 %	40 %	60 %	336252267
111	NC_015666	CGATC	2	10	165105	165114	20 %	20 %	20 %	40 %	336252269
112	NC_015666	CCCGT	2	10	167795	167804	0 %	20 %	20 %	60 %	336252273
113	NC_015666	CGCGT	2	10	169454	169463	0 %	20 %	40 %	40 %	336252276
114	NC_015666	AGCGC	2	10	171386	171395	20 %	0 %	40 %	40 %	336252278
115	NC_015666	CGTTT	2	10	180255	180264	0 %	60 %	20 %	20 %	336252285
116	NC_015666	TGCGC	2	10	182922	182931	0 %	20 %	40 %	40 %	336252288
117	NC_015666	CGAAA	2	10	185840	185849	60 %	0 %	20 %	20 %	336252291
118	NC_015666	CGACC	2	10	186105	186114	20 %	0 %	20 %	60 %	336252292
119	NC_015666	ACTCG	2	10	188138	188147	20 %	20 %	20 %	40 %	336252295
120	NC_015666	CGAGC	2	10	188450	188459	20 %	0 %	40 %	40 %	336252295
121	NC_015666	GCTGG	2	10	188585	188594	0 %	20 %	60 %	20 %	336252295
122	NC_015666	CCCGA	2	10	197582	197591	20 %	0 %	20 %	60 %	336252305
123	NC_015666	GCCGT	2	10	198188	198197	0 %	20 %	40 %	40 %	336252306
124	NC_015666	GCGTC	2	10	199980	199989	0 %	20 %	40 %	40 %	336252308
125	NC_015666	GCGCG	2	10	204660	204669	0 %	0 %	60 %	40 %	336252311
126	NC_015666	CCTGC	2	10	204761	204770	0 %	20 %	20 %	60 %	336252311
127	NC_015666	GGGAC	2	10	206491	206500	20 %	0 %	60 %	20 %	336252312
128	NC_015666	GGATC	2	10	206797	206806	20 %	20 %	40 %	20 %	336252312
129	NC_015666	TCCGG	2	10	209617	209626	0 %	20 %	40 %	40 %	336252315
130	NC_015666	GCCGA	2	10	209693	209702	20 %	0 %	40 %	40 %	336252315
131	NC_015666	CGGCG	2	10	211227	211236	0 %	0 %	60 %	40 %	336252317
132	NC_015666	CGTCG	2	10	212368	212377	0 %	20 %	40 %	40 %	336252318
133	NC_015666	CGCGG	2	10	218028	218037	0 %	0 %	60 %	40 %	336252323
134	NC_015666	GGACG	2	10	218196	218205	20 %	0 %	60 %	20 %	336252323
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249	NC_015666	ACCGC	2	10	411863	411872	20 %	0 %	20 %	60 %	336252508
250	NC_015666	CCAGC	2	10	413482	413491	20 %	0 %	20 %	60 %	336252510
251	NC_015666	CGGCC	2	10	413649	413658	0 %	0 %	40 %	60 %	336252510
252	NC_015666	TCACT	2	10	415615	415624	20 %	40 %	0 %	40 %	336252512
253	NC_015666	GAACA	2	10	416360	416369	60 %	0 %	20 %	20 %	336252513
254	NC_015666	GTCGG	2	10	428531	428540	0 %	20 %	60 %	20 %	336252520
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256	NC_015666	GCTCG	2	10	430241	430250	0 %	20 %	40 %	40 %	336252523
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259	NC_015666	TCGAC	2	10	432966	432975	20 %	20 %	20 %	40 %	336252525
260	NC_015666	TCGAC	2	10	433419	433428	20 %	20 %	20 %	40 %	336252525
261	NC_015666	CGCGG	2	10	434174	434183	0 %	0 %	60 %	40 %	336252526
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263	NC_015666	CGCCC	2	10	440462	440471	0 %	0 %	20 %	80 %	336252532
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