MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 70408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015666	GAC	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252097
2	NC_015666	CGA	2	6	149	154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252097
3	NC_015666	CGT	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252097
4	NC_015666	GAG	2	6	213	218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252097
5	NC_015666	CTA	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252097
6	NC_015666	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252097
7	NC_015666	AGC	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252097
8	NC_015666	CGC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252097
9	NC_015666	CGG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
10	NC_015666	GCG	2	6	478	483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
11	NC_015666	CTC	2	6	528	533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
12	NC_015666	CGG	2	6	539	544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
13	NC_015666	TCC	2	6	562	567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
14	NC_015666	CGA	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252098
15	NC_015666	CGC	2	6	624	629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
16	NC_015666	CTG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
17	NC_015666	CCT	2	6	653	658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
18	NC_015666	GTG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252098
19	NC_015666	TCG	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
20	NC_015666	GTC	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
21	NC_015666	TCG	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
22	NC_015666	CGA	2	6	872	877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252098
23	NC_015666	CGC	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
24	NC_015666	GAT	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252098
25	NC_015666	TCG	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
26	NC_015666	CGC	2	6	1100	1105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
27	NC_015666	CGG	2	6	1109	1114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
28	NC_015666	CGA	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252098
29	NC_015666	CCT	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
30	NC_015666	TCG	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
31	NC_015666	TCG	3	9	1229	1237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
32	NC_015666	CTG	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
33	NC_015666	CGG	2	6	1304	1309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
34	NC_015666	TCC	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
35	NC_015666	CTC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252098
36	NC_015666	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252098
37	NC_015666	CGG	2	6	1628	1633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252098
38	NC_015666	CTT	2	6	1634	1639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252098
39	NC_015666	CGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
40	NC_015666	CGC	2	6	1657	1662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
41	NC_015666	CGT	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252098
42	NC_015666	CGA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252098
43	NC_015666	CCG	2	6	1786	1791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252098
44	NC_015666	CGA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252098
45	NC_015666	TCG	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252099
46	NC_015666	GCC	2	6	2041	2046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252099
47	NC_015666	AGC	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252099
48	NC_015666	GGT	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252099
49	NC_015666	TCG	2	6	2189	2194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252099
50	NC_015666	CGA	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252099
51	NC_015666	GAG	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252099
52	NC_015666	CGA	2	6	2279	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252099
53	NC_015666	CAG	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252099
54	NC_015666	GCG	3	9	2521	2529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252100
55	NC_015666	CGC	2	6	2629	2634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252100
56	NC_015666	CCG	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252100
57	NC_015666	GTC	2	6	2690	2695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252100
58	NC_015666	TCG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252100
59	NC_015666	CGT	2	6	2821	2826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252100
60	NC_015666	CGA	2	6	2836	2841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252100
61	NC_015666	CGT	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252100
62	NC_015666	GAC	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252100
63	NC_015666	CCG	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252100
64	NC_015666	CGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252100
65	NC_015666	CGG	2	6	3123	3128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
66	NC_015666	CGA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252101
67	NC_015666	GCG	2	6	3177	3182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
68	NC_015666	TCG	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
69	NC_015666	CGA	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252101
70	NC_015666	CGG	2	6	3272	3277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
71	NC_015666	CGG	2	6	3296	3301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
72	NC_015666	GCT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
73	NC_015666	CGA	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252101
74	NC_015666	TCG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
75	NC_015666	CGG	2	6	3533	3538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
76	NC_015666	TCG	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
77	NC_015666	GAG	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252101
78	NC_015666	GGC	2	6	3693	3698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252101
79	NC_015666	GCC	2	6	3734	3739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252101
80	NC_015666	TCG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
81	NC_015666	TCG	2	6	3829	3834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252101
82	NC_015666	CGA	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252101
83	NC_015666	GCG	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252102
84	NC_015666	TCG	2	6	4008	4013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252102
85	NC_015666	ACG	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252102
86	NC_015666	GAC	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252102
87	NC_015666	CGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252102
88	NC_015666	TCG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252102
89	NC_015666	CCG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252102
90	NC_015666	CGC	2	6	4219	4224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252102
91	NC_015666	CGT	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252102
92	NC_015666	CGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252102
93	NC_015666	CGG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252102
94	NC_015666	GGC	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252102
95	NC_015666	GCC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252102
96	NC_015666	GGT	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252102
97	NC_015666	CGA	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252102
98	NC_015666	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252102
99	NC_015666	CGG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252102
100	NC_015666	CGA	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252102
101	NC_015666	GTC	2	6	4970	4975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252102
102	NC_015666	CGA	2	6	5080	5085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252102
103	NC_015666	GTC	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
104	NC_015666	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
105	NC_015666	GCG	2	6	5275	5280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252103
106	NC_015666	TCG	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
107	NC_015666	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252103
108	NC_015666	AGC	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252103
109	NC_015666	CGT	3	9	5438	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
110	NC_015666	CGA	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252103
111	NC_015666	GTC	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
112	NC_015666	TCG	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252103
113	NC_015666	CGG	2	6	5914	5919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252104
114	NC_015666	AGG	2	6	6053	6058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252104
115	NC_015666	CGA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252104
116	NC_015666	TCG	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
117	NC_015666	CGT	2	6	6123	6128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
118	NC_015666	ACG	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252104
119	NC_015666	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252104
120	NC_015666	GAC	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252104
121	NC_015666	CTA	2	6	6399	6404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252104
122	NC_015666	CTC	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252104
123	NC_015666	GTC	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
124	NC_015666	TCG	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
125	NC_015666	ACA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252104
126	NC_015666	CGA	2	6	6576	6581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252104
127	NC_015666	CGT	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
128	NC_015666	CGA	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252104
129	NC_015666	CCG	2	6	6800	6805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252104
130	NC_015666	TCG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
131	NC_015666	CTG	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252104
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133	NC_015666	GGA	2	6	6897	6902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252104
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246	NC_015666	CTC	2	6	12397	12402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252108
247	NC_015666	TCG	2	6	12437	12442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252108
248	NC_015666	CGT	2	6	12501	12506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252108
249	NC_015666	TCT	2	6	12525	12530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252108
250	NC_015666	CTT	2	6	12537	12542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252108
251	NC_015666	CGT	2	6	12570	12575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252108
252	NC_015666	GCG	2	6	13207	13212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252109
253	NC_015666	GAG	2	6	13272	13277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252109
254	NC_015666	TCG	2	6	13282	13287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252109
255	NC_015666	CGT	2	6	13289	13294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252109
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369	NC_015666	GCC	3	9	20196	20204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
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373	NC_015666	GGC	2	6	20289	20294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
374	NC_015666	GAC	2	6	20307	20312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
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377	NC_015666	CGC	2	6	20342	20347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252114
378	NC_015666	CCT	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252114
379	NC_015666	CGG	2	6	20456	20461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
380	NC_015666	CGG	2	6	20480	20485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252114
381	NC_015666	CGA	2	6	20513	20518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
382	NC_015666	CGA	2	6	20570	20575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252114
383	NC_015666	TCG	2	6	20624	20629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
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385	NC_015666	CTC	2	6	20751	20756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252114
386	NC_015666	CGT	2	6	20844	20849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252114
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498	NC_015666	TCC	2	6	27297	27302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252120
499	NC_015666	GTA	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252120
500	NC_015666	TCG	3	9	27324	27332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252120

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