MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 6924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	CTC	2	6	69	74	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
2	NC_015658	TCA	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251751
3	NC_015658	CTC	2	6	114	119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
4	NC_015658	GCA	2	6	187	192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
5	NC_015658	CTT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
6	NC_015658	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
7	NC_015658	CGA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
8	NC_015658	AGT	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
9	NC_015658	TAG	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
10	NC_015658	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
11	NC_015658	TTC	2	6	735	740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
12	NC_015658	GTC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251752
13	NC_015658	CTG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251753
14	NC_015658	GAC	3	9	4264	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
15	NC_015658	ATC	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251753
16	NC_015658	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
17	NC_015658	AAC	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
18	NC_015658	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336251754
19	NC_015658	CGG	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251754
20	NC_015658	ATC	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
21	NC_015658	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
22	NC_015658	AGG	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251754
23	NC_015658	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251754
24	NC_015658	ACT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
25	NC_015658	CCA	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251755
26	NC_015658	CGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
27	NC_015658	GTC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
28	NC_015658	ACG	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
29	NC_015658	GTC	3	9	5951	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
30	NC_015658	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
31	NC_015658	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
32	NC_015658	TCG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
33	NC_015658	ACG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
34	NC_015658	TTC	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251755
35	NC_015658	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
36	NC_015658	TGC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
37	NC_015658	TCG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
38	NC_015658	GAT	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
39	NC_015658	GTC	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
40	NC_015658	CGA	3	9	6992	7000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
41	NC_015658	TCG	2	6	7048	7053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
42	NC_015658	CTG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
43	NC_015658	TGG	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251756
44	NC_015658	TCG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
45	NC_015658	TCG	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
46	NC_015658	TGA	2	6	7391	7396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
47	NC_015658	GAC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
48	NC_015658	CGA	3	9	7738	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
49	NC_015658	CGA	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
50	NC_015658	GTC	3	9	7764	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251757
51	NC_015658	GAC	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
52	NC_015658	CGA	2	6	7805	7810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
53	NC_015658	GAG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
54	NC_015658	CGG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251757
55	NC_015658	CGA	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
56	NC_015658	ACT	2	6	7931	7936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
57	NC_015658	TCC	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251757
58	NC_015658	GAG	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
59	NC_015658	GAT	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251757
60	NC_015658	GAC	3	9	8039	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
61	NC_015658	CGA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
62	NC_015658	CGA	2	6	8231	8236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
63	NC_015658	CGA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
64	NC_015658	CGA	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
65	NC_015658	GTC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251757
66	NC_015658	ACT	2	6	8489	8494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
67	NC_015658	ACG	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
68	NC_015658	CCG	2	6	8616	8621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
69	NC_015658	AAC	2	6	8625	8630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251757
70	NC_015658	CCT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251757
71	NC_015658	CGA	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
72	NC_015658	CGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
73	NC_015658	CAT	2	6	8801	8806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
74	NC_015658	CGC	2	6	8836	8841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251757
75	NC_015658	GAC	2	6	8883	8888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
76	NC_015658	CGA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
77	NC_015658	GAG	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
78	NC_015658	GTC	2	6	9734	9739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
79	NC_015658	GCC	2	6	9813	9818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251758
80	NC_015658	CGA	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
81	NC_015658	TGA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251758
82	NC_015658	CTA	2	6	9949	9954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251758
83	NC_015658	CGT	2	6	9970	9975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
84	NC_015658	CTG	2	6	10010	10015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
85	NC_015658	TGA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251758
86	NC_015658	GCC	2	6	10118	10123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251758
87	NC_015658	TGG	2	6	10182	10187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251758
88	NC_015658	TCC	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251758
89	NC_015658	ATT	2	6	10247	10252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336251758
90	NC_015658	CGC	2	6	10278	10283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251758
91	NC_015658	CGA	2	6	10390	10395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
92	NC_015658	TCG	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
93	NC_015658	ACG	2	6	10437	10442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
94	NC_015658	TCG	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
95	NC_015658	ACG	2	6	10451	10456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
96	NC_015658	GCG	2	6	10516	10521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251758
97	NC_015658	GTC	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
98	NC_015658	ACG	2	6	10598	10603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
99	NC_015658	CGA	2	6	10714	10719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251758
100	NC_015658	GGA	2	6	10840	10845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251758
101	NC_015658	CCA	2	6	10853	10858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251758
102	NC_015658	GTC	2	6	10908	10913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251758
103	NC_015658	GTG	2	6	11137	11142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251759
104	NC_015658	TCT	2	6	11162	11167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251759
105	NC_015658	GAG	2	6	11185	11190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
106	NC_015658	GAG	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
107	NC_015658	GAG	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
108	NC_015658	CGG	2	6	11277	11282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251759
109	NC_015658	CGC	2	6	11285	11290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251759
110	NC_015658	GAC	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
111	NC_015658	GAA	2	6	11416	11421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251759
112	NC_015658	CGA	2	6	11427	11432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
113	NC_015658	CGA	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
114	NC_015658	TCG	2	6	11494	11499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251759
115	NC_015658	CGA	2	6	11523	11528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
116	NC_015658	CGA	3	9	11625	11633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
117	NC_015658	TCT	2	6	11669	11674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251759
118	NC_015658	CGA	2	6	11690	11695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
119	NC_015658	GAG	2	6	11704	11709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
120	NC_015658	GAT	2	6	11760	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251759
121	NC_015658	CGA	2	6	11772	11777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
122	NC_015658	GAG	2	6	11839	11844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
123	NC_015658	GTC	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251759
124	NC_015658	GAG	2	6	11851	11856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251759
125	NC_015658	ACG	2	6	11867	11872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251759
126	NC_015658	CGT	3	9	11883	11891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251759
127	NC_015658	TCG	2	6	11930	11935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251759
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369	NC_015658	GAA	2	6	30726	30731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251776
370	NC_015658	GAG	2	6	30873	30878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251776
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494	NC_015658	GTA	2	6	39861	39866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251782
495	NC_015658	CAA	2	6	39909	39914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251782
496	NC_015658	ACG	2	6	39944	39949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251782
497	NC_015658	TCG	2	6	39970	39975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251782
498	NC_015658	CGT	2	6	39992	39997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251782
499	NC_015658	TCG	2	6	40045	40050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251782
500	NC_015658	CGG	2	6	40125	40130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251782

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