MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	CTG	2	6	14	19	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668452
2	NC_015513	GTG	2	6	20	25	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668452
3	NC_015513	CCA	2	6	55	60	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668452
4	NC_015513	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668452
5	NC_015513	GAG	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668452
6	NC_015513	CTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668452
7	NC_015513	TGG	2	6	364	369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668452
8	NC_015513	GCA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668452
9	NC_015513	ATG	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668452
10	NC_015513	CAG	2	6	432	437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668452
11	NC_015513	CAC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668452
12	NC_015513	CAG	2	6	991	996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668453
13	NC_015513	GTA	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668453
14	NC_015513	CCA	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668453
15	NC_015513	CCA	3	9	1179	1187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668453
16	NC_015513	TCC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668453
17	NC_015513	ATT	2	6	1408	1413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668453
18	NC_015513	CAT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668453
19	NC_015513	GGT	2	6	1920	1925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668454
20	NC_015513	GTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668454
21	NC_015513	CCG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
22	NC_015513	GGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668454
23	NC_015513	TCC	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668454
24	NC_015513	ACC	2	6	2480	2485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668454
25	NC_015513	GTA	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668454
26	NC_015513	GTT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668454
27	NC_015513	TTC	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668454
28	NC_015513	TAA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668454
29	NC_015513	GTT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668454
30	NC_015513	CCA	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668454
31	NC_015513	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
32	NC_015513	GCC	2	6	3064	3069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
33	NC_015513	TGT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668454
34	NC_015513	AAG	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668454
35	NC_015513	GCC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
36	NC_015513	ACC	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668454
37	NC_015513	GCC	2	6	3238	3243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
38	NC_015513	GTC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668454
39	NC_015513	CTT	3	9	3270	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668454
40	NC_015513	CGC	2	6	3408	3413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
41	NC_015513	GCC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
42	NC_015513	GGC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668454
43	NC_015513	ATA	2	6	3692	3697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668454
44	NC_015513	ATC	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668454
45	NC_015513	ATC	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668454
46	NC_015513	CTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668454
47	NC_015513	TGG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668454
48	NC_015513	TGC	2	6	4263	4268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668454
49	NC_015513	GCA	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668454
50	NC_015513	GCA	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668454
51	NC_015513	CTT	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668455
52	NC_015513	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668455
53	NC_015513	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668455
54	NC_015513	GTT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668455
55	NC_015513	AAT	2	6	5098	5103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668455
56	NC_015513	CAA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668455
57	NC_015513	TCA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668455
58	NC_015513	AAT	2	6	5369	5374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332668455
59	NC_015513	GTT	2	6	5443	5448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668456
60	NC_015513	TTC	2	6	5534	5539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668456
61	NC_015513	TTG	2	6	5547	5552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668456
62	NC_015513	TGC	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668456
63	NC_015513	TGT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668456
64	NC_015513	GTC	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668456
65	NC_015513	TCA	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668456
66	NC_015513	CAA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668456
67	NC_015513	TTG	2	6	6033	6038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668456
68	NC_015513	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668456
69	NC_015513	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668456
70	NC_015513	GCA	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668456
71	NC_015513	GGC	2	6	6339	6344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668456
72	NC_015513	CAG	2	6	6419	6424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668456
73	NC_015513	ATG	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668456
74	NC_015513	CGA	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668457
75	NC_015513	CTG	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668457
76	NC_015513	TCA	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668457
77	NC_015513	AGA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668457
78	NC_015513	CTG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668457
79	NC_015513	GAC	3	9	7135	7143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668457
80	NC_015513	TCC	2	6	7179	7184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332668457
81	NC_015513	ACC	2	6	7191	7196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668457
82	NC_015513	TGA	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668457
83	NC_015513	GAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668457
84	NC_015513	GAG	3	9	7440	7448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668457
85	NC_015513	TTG	2	6	7620	7625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668458
86	NC_015513	TTG	2	6	7741	7746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668458
87	NC_015513	AGC	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668458
88	NC_015513	TTG	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668458
89	NC_015513	TCA	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668458
90	NC_015513	ATG	3	9	8062	8070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668458
91	NC_015513	ATT	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668458
92	NC_015513	GCG	2	6	8293	8298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668458
93	NC_015513	CAT	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668458
94	NC_015513	CCA	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668458
95	NC_015513	TGA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668458
96	NC_015513	TAC	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668458
97	NC_015513	GGT	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668458
98	NC_015513	CTT	2	6	8522	8527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668458
99	NC_015513	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668458
100	NC_015513	ACG	2	6	8599	8604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668458
101	NC_015513	GTT	2	6	8928	8933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668459
102	NC_015513	GTC	2	6	8969	8974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668459
103	NC_015513	CTT	3	9	8997	9005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668459
104	NC_015513	TGA	2	6	9182	9187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668459
105	NC_015513	TTC	2	6	9317	9322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668459
106	NC_015513	GTC	2	6	9545	9550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668459
107	NC_015513	CCA	2	6	9580	9585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668459
108	NC_015513	AAC	2	6	10073	10078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668460
109	NC_015513	GTT	2	6	10205	10210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668460
110	NC_015513	GCT	2	6	10233	10238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668460
111	NC_015513	ACG	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
112	NC_015513	ACC	2	6	10320	10325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668460
113	NC_015513	GGA	2	6	10416	10421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668460
114	NC_015513	GTG	2	6	10608	10613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668460
115	NC_015513	TCA	2	6	10693	10698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668460
116	NC_015513	GCA	2	6	10717	10722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
117	NC_015513	CAG	2	6	10748	10753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
118	NC_015513	GCT	2	6	10762	10767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668460
119	NC_015513	TGC	2	6	10768	10773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668460
120	NC_015513	GCC	2	6	10839	10844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668460
121	NC_015513	AGC	2	6	11016	11021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
122	NC_015513	GCA	2	6	11061	11066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
123	NC_015513	CAA	2	6	11091	11096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668460
124	NC_015513	CAT	3	9	11102	11110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668460
125	NC_015513	GCA	2	6	11128	11133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668460
126	NC_015513	CGC	2	6	11174	11179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668460
127	NC_015513	CAA	2	6	11204	11209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668460
128	NC_015513	AAC	2	6	11362	11367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668460
129	NC_015513	ACT	2	6	11402	11407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668460
130	NC_015513	GAA	2	6	11612	11617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668461
131	NC_015513	CGC	2	6	11636	11641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668461
132	NC_015513	AGC	2	6	11687	11692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668461
133	NC_015513	CTG	2	6	11693	11698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668461
134	NC_015513	ACA	2	6	11724	11729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668461
135	NC_015513	GTT	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668461
136	NC_015513	ACC	2	6	11985	11990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668461
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138	NC_015513	GAT	2	6	12269	12274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668461
139	NC_015513	CCG	2	6	12319	12324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668461
140	NC_015513	CGA	3	9	12379	12387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668461
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147	NC_015513	GTT	2	6	12741	12746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668461
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153	NC_015513	CAT	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668461
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162	NC_015513	ACG	2	6	13282	13287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668462
163	NC_015513	CGT	2	6	13292	13297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668462
164	NC_015513	CGT	2	6	13314	13319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668462
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232	NC_015513	TGA	2	6	18445	18450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668464
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238	NC_015513	TGC	2	6	19076	19081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668465
239	NC_015513	ACG	2	6	19157	19162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668465
240	NC_015513	CGA	2	6	19254	19259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332668465
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242	NC_015513	AGG	2	6	19328	19333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332668465
243	NC_015513	TCA	2	6	19430	19435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668465
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246	NC_015513	GGT	2	6	19624	19629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668465
247	NC_015513	ACA	3	9	19733	19741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668465
248	NC_015513	ATC	2	6	19831	19836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668465
249	NC_015513	ACC	2	6	19837	19842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668465
250	NC_015513	GGC	2	6	19989	19994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332668465
251	NC_015513	TAC	2	6	20173	20178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668465
252	NC_015513	CAT	2	6	20211	20216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668465
253	NC_015513	AGA	2	6	20245	20250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332668465
254	NC_015513	ACA	2	6	20252	20257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668465
255	NC_015513	CAA	3	9	20340	20348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668465
256	NC_015513	GGT	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332668465
257	NC_015513	CGC	2	6	20484	20489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668465
258	NC_015513	ATC	2	6	20620	20625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668465
259	NC_015513	CAC	2	6	20694	20699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668465
260	NC_015513	TGC	2	6	20807	20812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668465
261	NC_015513	CTT	2	6	20840	20845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668465
262	NC_015513	ACA	2	6	21092	21097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668465
263	NC_015513	CCA	2	6	21125	21130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332668465
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271	NC_015513	TAT	2	6	21841	21846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332668465
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380	NC_015513	GTC	2	6	30874	30879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332668470
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498	NC_015513	CAA	2	6	41740	41745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332668478
499	NC_015513	TTG	2	6	41848	41853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332668478
500	NC_015513	GTA	2	6	41926	41931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668478

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