MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 1785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	GCA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661769
2	NC_015511	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
3	NC_015511	GAG	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
4	NC_015511	GGA	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661769
5	NC_015511	TCC	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661769
6	NC_015511	GGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661769
7	NC_015511	GAG	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661770
8	NC_015511	TGG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
9	NC_015511	ATG	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661770
10	NC_015511	TGC	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
11	NC_015511	CGG	2	6	1731	1736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
12	NC_015511	TGC	3	9	1757	1765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
13	NC_015511	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
14	NC_015511	GGC	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661770
15	NC_015511	GGT	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661770
16	NC_015511	TCG	3	9	2150	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661770
17	NC_015511	GGC	3	9	2279	2287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
18	NC_015511	CGA	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
19	NC_015511	GTT	2	6	2345	2350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
20	NC_015511	GTT	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
21	NC_015511	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
22	NC_015511	GGT	2	6	2571	2576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661771
23	NC_015511	CCG	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
24	NC_015511	CTC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
25	NC_015511	CGA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
26	NC_015511	GCA	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
27	NC_015511	GCC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661771
28	NC_015511	TGT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661771
29	NC_015511	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661771
30	NC_015511	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661771
31	NC_015511	GGA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
32	NC_015511	GCT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661771
33	NC_015511	TCC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661771
34	NC_015511	GGA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661771
35	NC_015511	GGT	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
36	NC_015511	AGC	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
37	NC_015511	TGG	2	6	4277	4282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
38	NC_015511	CGG	2	6	4310	4315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661772
39	NC_015511	TGA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661772
40	NC_015511	TGG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661772
41	NC_015511	GAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
42	NC_015511	GCA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
43	NC_015511	GTT	2	6	4669	4674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
44	NC_015511	TCA	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
45	NC_015511	GCA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661772
46	NC_015511	GTT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661772
47	NC_015511	CAT	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661772
48	NC_015511	TCC	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
49	NC_015511	CAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
50	NC_015511	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661772
51	NC_015511	TGC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
52	NC_015511	TGC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661772
53	NC_015511	GAG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661772
54	NC_015511	CTC	2	6	5422	5427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661772
55	NC_015511	CAA	3	9	5536	5544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661772
56	NC_015511	ACT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661773
57	NC_015511	CAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661773
58	NC_015511	TGC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661775
59	NC_015511	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
60	NC_015511	ACT	2	6	6986	6991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
61	NC_015511	CAG	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661775
62	NC_015511	CCT	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
63	NC_015511	TAC	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
64	NC_015511	CAT	2	6	7305	7310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661775
65	NC_015511	TCC	2	6	7321	7326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661775
66	NC_015511	TAA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661775
67	NC_015511	CGA	2	6	8291	8296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661776
68	NC_015511	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
69	NC_015511	ACC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661776
70	NC_015511	TAT	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661776
71	NC_015511	GAA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
72	NC_015511	AGA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661776
73	NC_015511	TTC	3	9	8586	8594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661777
74	NC_015511	AGG	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661777
75	NC_015511	GGC	2	6	8943	8948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
76	NC_015511	TGC	3	9	8953	8961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
77	NC_015511	TAA	2	6	9035	9040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661778
78	NC_015511	TTC	2	6	9103	9108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661778
79	NC_015511	AGG	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661778
80	NC_015511	CGC	2	6	9169	9174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661778
81	NC_015511	GTA	2	6	9215	9220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661778
82	NC_015511	GGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661778
83	NC_015511	TCC	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661778
84	NC_015511	CAA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661778
85	NC_015511	ATC	2	6	9488	9493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661778
86	NC_015511	TGC	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661778
87	NC_015511	ATT	2	6	9780	9785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661779
88	NC_015511	CAG	2	6	9808	9813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
89	NC_015511	GGC	2	6	9919	9924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
90	NC_015511	CAG	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
91	NC_015511	GCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
92	NC_015511	GGC	2	6	10033	10038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
93	NC_015511	CGG	2	6	10046	10051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
94	NC_015511	GGC	2	6	10090	10095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
95	NC_015511	CTT	2	6	10111	10116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661779
96	NC_015511	GGT	2	6	10132	10137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661779
97	NC_015511	GAG	2	6	10240	10245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
98	NC_015511	GGC	2	6	10282	10287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661779
99	NC_015511	GGA	2	6	10290	10295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661779
100	NC_015511	TGA	2	6	10426	10431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661779
101	NC_015511	CAG	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661779
102	NC_015511	GCG	2	6	10672	10677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661780
103	NC_015511	GCA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661780
104	NC_015511	TCG	2	6	10849	10854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661780
105	NC_015511	CGG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661780
106	NC_015511	TGT	3	9	11188	11196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661781
107	NC_015511	TCA	2	6	11273	11278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
108	NC_015511	TCT	2	6	11312	11317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661781
109	NC_015511	ATC	2	6	11366	11371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
110	NC_015511	CCA	2	6	11415	11420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
111	NC_015511	CAC	2	6	11532	11537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
112	NC_015511	ATC	2	6	11692	11697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
113	NC_015511	CCA	2	6	11793	11798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
114	NC_015511	ATC	2	6	11944	11949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
115	NC_015511	ATC	2	6	12070	12075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
116	NC_015511	TAC	2	6	12124	12129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
117	NC_015511	CCA	2	6	12171	12176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
118	NC_015511	CAA	2	6	12208	12213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661781
119	NC_015511	ACT	2	6	12244	12249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
120	NC_015511	ACC	2	6	12296	12301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
121	NC_015511	CCA	2	6	12423	12428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
122	NC_015511	CCA	2	6	12549	12554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
123	NC_015511	TAC	2	6	12628	12633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
124	NC_015511	ACC	2	6	12674	12679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
125	NC_015511	CCA	2	6	12801	12806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661781
126	NC_015511	CAT	2	6	12951	12956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
127	NC_015511	ACT	2	6	13126	13131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
128	NC_015511	GTA	2	6	13210	13215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661781
129	NC_015511	CTG	2	6	13216	13221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661781
130	NC_015511	TCA	2	6	13326	13331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
131	NC_015511	CGG	2	6	13332	13337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661781
132	NC_015511	TCG	2	6	13349	13354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661781
133	NC_015511	GGC	2	6	13392	13397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661781
134	NC_015511	GCT	2	6	13427	13432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661781
135	NC_015511	GTG	2	6	13453	13458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661781
136	NC_015511	TGC	2	6	13525	13530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661781
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138	NC_015511	CAG	2	6	13552	13557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661781
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142	NC_015511	GTT	2	6	13671	13676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661781
143	NC_015511	CTC	2	6	13756	13761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661781
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145	NC_015511	GTA	2	6	13945	13950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661781
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152	NC_015511	TGC	2	6	14448	14453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661781
153	NC_015511	CCG	2	6	14888	14893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661781
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157	NC_015511	CTT	2	6	15303	15308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661781
158	NC_015511	TCA	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
159	NC_015511	TCA	2	6	15446	15451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661781
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163	NC_015511	TTC	2	6	15877	15882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661782
164	NC_015511	TAT	2	6	16014	16019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661782
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238	NC_015511	TCA	2	6	22916	22921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
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242	NC_015511	GTT	2	6	23238	23243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661784
243	NC_015511	TTC	2	6	23422	23427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661784
244	NC_015511	CAT	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
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248	NC_015511	CAG	2	6	23928	23933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
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250	NC_015511	CCA	2	6	23991	23996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661784
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252	NC_015511	GCA	2	6	24021	24026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
253	NC_015511	CAG	3	9	24090	24098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
254	NC_015511	GTA	2	6	24129	24134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661784
255	NC_015511	TAC	2	6	24169	24174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661784
256	NC_015511	CAG	3	9	24286	24294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661784
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