MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 5020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	GGCAA	2	10	3544	3553	40 %	0 %	40 %	20 %	332662003
2	NC_015510	CCAAT	2	10	3993	4002	40 %	20 %	0 %	40 %	332662003
3	NC_015510	CCGAA	2	10	6569	6578	40 %	0 %	20 %	40 %	332662006
4	NC_015510	GCTTG	2	10	7925	7934	0 %	40 %	40 %	20 %	332662007
5	NC_015510	AATGG	2	10	9642	9651	40 %	20 %	40 %	0 %	332662009
6	NC_015510	AGCTC	2	10	13836	13845	20 %	20 %	20 %	40 %	332662014
7	NC_015510	CCAAA	2	10	14419	14428	60 %	0 %	0 %	40 %	332662014
8	NC_015510	CAAAA	2	10	16958	16967	80 %	0 %	0 %	20 %	332662015
9	NC_015510	GGGTA	2	10	18120	18129	20 %	20 %	60 %	0 %	332662016
10	NC_015510	AATCC	2	10	19183	19192	40 %	20 %	0 %	40 %	332662018
11	NC_015510	CGGCG	2	10	19482	19491	0 %	0 %	60 %	40 %	332662018
12	NC_015510	GTAGG	2	10	21058	21067	20 %	20 %	60 %	0 %	332662020
13	NC_015510	TAAGG	2	10	21380	21389	40 %	20 %	40 %	0 %	332662020
14	NC_015510	GGTAT	2	10	21966	21975	20 %	40 %	40 %	0 %	332662021
15	NC_015510	ACCGC	2	10	22123	22132	20 %	0 %	20 %	60 %	332662021
16	NC_015510	GGGTA	2	10	23016	23025	20 %	20 %	60 %	0 %	332662022
17	NC_015510	ACATT	2	10	26173	26182	40 %	40 %	0 %	20 %	332662026
18	NC_015510	CTTTG	2	10	27928	27937	0 %	60 %	20 %	20 %	332662026
19	NC_015510	GTTTT	2	10	29776	29785	0 %	80 %	20 %	0 %	332662028
20	NC_015510	TTTTC	2	10	30342	30351	0 %	80 %	0 %	20 %	332662029
21	NC_015510	AAGAA	2	10	30790	30799	80 %	0 %	20 %	0 %	332662030
22	NC_015510	CAAAC	2	10	31841	31850	60 %	0 %	0 %	40 %	332662031
23	NC_015510	GGCCA	2	10	32042	32051	20 %	0 %	40 %	40 %	332662031
24	NC_015510	TAAAA	2	10	33550	33559	80 %	20 %	0 %	0 %	332662034
25	NC_015510	CGATC	2	10	34336	34345	20 %	20 %	20 %	40 %	332662034
26	NC_015510	CAGCC	2	10	35504	35513	20 %	0 %	20 %	60 %	332662037
27	NC_015510	GCAAT	2	10	37814	37823	40 %	20 %	20 %	20 %	332662039
28	NC_015510	AGACA	2	10	38471	38480	60 %	0 %	20 %	20 %	332662040
29	NC_015510	AAAAC	2	10	38695	38704	80 %	0 %	0 %	20 %	332662040
30	NC_015510	TTCCA	2	10	38800	38809	20 %	40 %	0 %	40 %	332662040
31	NC_015510	CCTTT	2	10	40588	40597	0 %	60 %	0 %	40 %	332662042
32	NC_015510	ACCAA	2	10	43162	43171	60 %	0 %	0 %	40 %	332662044
33	NC_015510	GGGTT	2	10	48076	48085	0 %	40 %	60 %	0 %	332662047
34	NC_015510	AGCGC	2	10	49444	49453	20 %	0 %	40 %	40 %	332662050
35	NC_015510	CTGTC	2	10	50658	50667	0 %	40 %	20 %	40 %	332662052
36	NC_015510	GAGCA	2	10	51478	51487	40 %	0 %	40 %	20 %	332662053
37	NC_015510	ATTTT	2	10	55457	55466	20 %	80 %	0 %	0 %	332662058
38	NC_015510	ATTCA	2	10	55489	55498	40 %	40 %	0 %	20 %	332662058
39	NC_015510	TTTGA	2	10	56603	56612	20 %	60 %	20 %	0 %	332662059
40	NC_015510	TGGGG	2	10	57896	57905	0 %	20 %	80 %	0 %	332662061
41	NC_015510	AAATT	2	10	58105	58114	60 %	40 %	0 %	0 %	332662061
42	NC_015510	AATGG	2	10	58355	58364	40 %	20 %	40 %	0 %	332662061
43	NC_015510	TCCAA	2	10	58393	58402	40 %	20 %	0 %	40 %	332662061
44	NC_015510	TAAAA	2	10	60468	60477	80 %	20 %	0 %	0 %	332662062
45	NC_015510	TGATT	2	10	61117	61126	20 %	60 %	20 %	0 %	332662063
46	NC_015510	CAATT	2	10	63176	63185	40 %	40 %	0 %	20 %	332662063
47	NC_015510	TTGTT	3	15	63269	63283	0 %	80 %	20 %	0 %	332662063
48	NC_015510	CAAAA	2	10	64489	64498	80 %	0 %	0 %	20 %	332662064
49	NC_015510	GTTGA	2	10	66000	66009	20 %	40 %	40 %	0 %	332662065
50	NC_015510	TCCTT	2	10	66474	66483	0 %	60 %	0 %	40 %	332662066
51	NC_015510	AATTG	2	10	66751	66760	40 %	40 %	20 %	0 %	332662066
52	NC_015510	GTGTT	2	10	67308	67317	0 %	60 %	40 %	0 %	332662067
53	NC_015510	AGAAT	2	10	71262	71271	60 %	20 %	20 %	0 %	332662072
54	NC_015510	TGAAT	2	10	71294	71303	40 %	40 %	20 %	0 %	332662072
55	NC_015510	GGATT	2	10	76977	76986	20 %	40 %	40 %	0 %	332662077
56	NC_015510	TCGAT	2	10	78475	78484	20 %	40 %	20 %	20 %	332662077
57	NC_015510	GATCC	2	10	78859	78868	20 %	20 %	20 %	40 %	332662078
58	NC_015510	AGGTC	2	10	83253	83262	20 %	20 %	40 %	20 %	332662080
59	NC_015510	GCCGG	2	10	84838	84847	0 %	0 %	60 %	40 %	332662081
60	NC_015510	AGAGC	2	10	90798	90807	40 %	0 %	40 %	20 %	332662085
61	NC_015510	TCCAT	2	10	93919	93928	20 %	40 %	0 %	40 %	332662087
62	NC_015510	CCAAC	2	10	94350	94359	40 %	0 %	0 %	60 %	332662087
63	NC_015510	ACCGC	2	10	100130	100139	20 %	0 %	20 %	60 %	332662093
64	NC_015510	GTTTT	2	10	100755	100764	0 %	80 %	20 %	0 %	332662094
65	NC_015510	ACCGT	2	10	103343	103352	20 %	20 %	20 %	40 %	332662095
66	NC_015510	CGCTG	2	10	105291	105300	0 %	20 %	40 %	40 %	332662096
67	NC_015510	CGGGC	2	10	106945	106954	0 %	0 %	60 %	40 %	332662096
68	NC_015510	CGTTG	2	10	107102	107111	0 %	40 %	40 %	20 %	332662096
69	NC_015510	TCACC	2	10	107126	107135	20 %	20 %	0 %	60 %	332662096
70	NC_015510	AATCA	2	10	108465	108474	60 %	20 %	0 %	20 %	332662097
71	NC_015510	TTGGA	2	10	109994	110003	20 %	40 %	40 %	0 %	332662097
72	NC_015510	GCTTA	2	10	110551	110560	20 %	40 %	20 %	20 %	332662097
73	NC_015510	AGCAA	2	10	113257	113266	60 %	0 %	20 %	20 %	332662099
74	NC_015510	ATTGG	2	10	114499	114508	20 %	40 %	40 %	0 %	332662101
75	NC_015510	GCCCT	2	10	114647	114656	0 %	20 %	20 %	60 %	332662101
76	NC_015510	ACACC	2	10	114864	114873	40 %	0 %	0 %	60 %	332662101
77	NC_015510	TTTTG	2	10	115035	115044	0 %	80 %	20 %	0 %	332662101
78	NC_015510	CATTT	2	10	120152	120161	20 %	60 %	0 %	20 %	332662106
79	NC_015510	GCATT	2	10	122428	122437	20 %	40 %	20 %	20 %	332662107
80	NC_015510	TTTTG	2	10	122510	122519	0 %	80 %	20 %	0 %	332662107
81	NC_015510	CCTTT	2	10	124309	124318	0 %	60 %	0 %	40 %	332662108
82	NC_015510	GCCAC	2	10	124657	124666	20 %	0 %	20 %	60 %	332662109
83	NC_015510	ACTGC	2	10	125144	125153	20 %	20 %	20 %	40 %	332662109
84	NC_015510	CAAAT	2	10	125502	125511	60 %	20 %	0 %	20 %	332662110
85	NC_015510	GGTCA	2	10	126069	126078	20 %	20 %	40 %	20 %	332662110
86	NC_015510	GGTAA	2	10	126458	126467	40 %	20 %	40 %	0 %	332662111
87	NC_015510	CAGAC	2	10	126558	126567	40 %	0 %	20 %	40 %	332662111
88	NC_015510	AATCC	2	10	128186	128195	40 %	20 %	0 %	40 %	332662112
89	NC_015510	GGATT	2	10	128689	128698	20 %	40 %	40 %	0 %	332662113
90	NC_015510	TACCC	2	10	129001	129010	20 %	20 %	0 %	60 %	332662113
91	NC_015510	GTTTG	2	10	138310	138319	0 %	60 %	40 %	0 %	332662124
92	NC_015510	TACAA	2	10	140039	140048	60 %	20 %	0 %	20 %	332662126
93	NC_015510	GATCA	2	10	142088	142097	40 %	20 %	20 %	20 %	332662128
94	NC_015510	CAGTG	2	10	143357	143366	20 %	20 %	40 %	20 %	332662130
95	NC_015510	TTTTC	2	10	143433	143442	0 %	80 %	0 %	20 %	332662130
96	NC_015510	CTTTT	2	10	143587	143596	0 %	80 %	0 %	20 %	332662130
97	NC_015510	TACTT	2	10	144429	144438	20 %	60 %	0 %	20 %	332662130
98	NC_015510	TCAAA	2	10	145711	145720	60 %	20 %	0 %	20 %	332662131
99	NC_015510	CCATT	2	10	147216	147225	20 %	40 %	0 %	40 %	332662133
100	NC_015510	TGCCT	2	10	149281	149290	0 %	40 %	20 %	40 %	332662133
101	NC_015510	CCGGC	2	10	150253	150262	0 %	0 %	40 %	60 %	332662134
102	NC_015510	CGATC	2	10	151083	151092	20 %	20 %	20 %	40 %	332662135
103	NC_015510	GTATC	2	10	151284	151293	20 %	40 %	20 %	20 %	332662135
104	NC_015510	CTTCC	2	10	151330	151339	0 %	40 %	0 %	60 %	332662135
105	NC_015510	CTCCG	2	10	151840	151849	0 %	20 %	20 %	60 %	332662135
106	NC_015510	CGCCT	2	10	152484	152493	0 %	20 %	20 %	60 %	332662136
107	NC_015510	GTTGA	2	10	152873	152882	20 %	40 %	40 %	0 %	332662136
108	NC_015510	CAATA	2	10	154338	154347	60 %	20 %	0 %	20 %	332662137
109	NC_015510	TGGTT	2	10	156095	156104	0 %	60 %	40 %	0 %	332662139
110	NC_015510	AAACT	2	10	156715	156724	60 %	20 %	0 %	20 %	332662139
111	NC_015510	CTGGG	2	10	159289	159298	0 %	20 %	60 %	20 %	332662142
112	NC_015510	TGAAA	2	10	162222	162231	60 %	20 %	20 %	0 %	332662144
113	NC_015510	TGGCC	2	10	162402	162411	0 %	20 %	40 %	40 %	332662144
114	NC_015510	TATCT	2	10	163957	163966	20 %	60 %	0 %	20 %	332662146
115	NC_015510	TCGGA	2	10	164147	164156	20 %	20 %	40 %	20 %	332662146
116	NC_015510	AGCAG	2	10	166122	166131	40 %	0 %	40 %	20 %	332662149
117	NC_015510	CGGGG	2	10	167203	167212	0 %	0 %	80 %	20 %	332662150
118	NC_015510	CAAAG	2	10	167882	167891	60 %	0 %	20 %	20 %	332662150
119	NC_015510	CTTTT	2	10	168486	168495	0 %	80 %	0 %	20 %	332662151
120	NC_015510	CGCGC	2	10	168689	168698	0 %	0 %	40 %	60 %	332662152
121	NC_015510	CTGAC	2	10	171968	171977	20 %	20 %	20 %	40 %	332662154
122	NC_015510	CCCCT	2	10	172251	172260	0 %	20 %	0 %	80 %	332662154
123	NC_015510	GATTT	2	10	172859	172868	20 %	60 %	20 %	0 %	332662154
124	NC_015510	CGCAG	2	10	173271	173280	20 %	0 %	40 %	40 %	332662154
125	NC_015510	GTTCT	2	10	173856	173865	0 %	60 %	20 %	20 %	332662155
126	NC_015510	CGCAG	2	10	174936	174945	20 %	0 %	40 %	40 %	332662156
127	NC_015510	CTTTT	2	10	174953	174962	0 %	80 %	0 %	20 %	332662156
128	NC_015510	AATTG	2	10	178250	178259	40 %	40 %	20 %	0 %	332662162
129	NC_015510	GAAAA	2	10	178856	178865	80 %	0 %	20 %	0 %	332662162
130	NC_015510	AAGAA	2	10	179538	179547	80 %	0 %	20 %	0 %	332662163
131	NC_015510	TTTTA	2	10	182473	182482	20 %	80 %	0 %	0 %	332662165
132	NC_015510	CAGAG	2	10	183316	183325	40 %	0 %	40 %	20 %	332662165
133	NC_015510	GACAA	2	10	184346	184355	60 %	0 %	20 %	20 %	332662166
134	NC_015510	ATCGG	2	10	184498	184507	20 %	20 %	40 %	20 %	332662166
135	NC_015510	TGGCC	2	10	184842	184851	0 %	20 %	40 %	40 %	332662167
136	NC_015510	CTGAC	2	10	186425	186434	20 %	20 %	20 %	40 %	332662167
137	NC_015510	ACCAA	2	10	187643	187652	60 %	0 %	0 %	40 %	332662167
138	NC_015510	TTGGT	2	10	188481	188490	0 %	60 %	40 %	0 %	332662168
139	NC_015510	CGGTG	2	10	188848	188857	0 %	20 %	60 %	20 %	332662168
140	NC_015510	GCGCT	2	10	189763	189772	0 %	20 %	40 %	40 %	332662169
141	NC_015510	ACTGG	2	10	190266	190275	20 %	20 %	40 %	20 %	332662169
142	NC_015510	ATTTT	2	10	190301	190310	20 %	80 %	0 %	0 %	332662169
143	NC_015510	ACCGA	2	10	191308	191317	40 %	0 %	20 %	40 %	332662170
144	NC_015510	CTATA	2	10	197355	197364	40 %	40 %	0 %	20 %	332662174
145	NC_015510	TACCC	2	10	197769	197778	20 %	20 %	0 %	60 %	332662174
146	NC_015510	ATTTT	2	10	197846	197855	20 %	80 %	0 %	0 %	332662174
147	NC_015510	GTATT	2	10	198611	198620	20 %	60 %	20 %	0 %	332662174
148	NC_015510	CAATC	2	10	199318	199327	40 %	20 %	0 %	40 %	332662174
149	NC_015510	TCAAG	2	10	200572	200581	40 %	20 %	20 %	20 %	332662174
150	NC_015510	TTCTT	2	10	201053	201062	0 %	80 %	0 %	20 %	332662175
151	NC_015510	GAATG	2	10	204264	204273	40 %	20 %	40 %	0 %	332662178
152	NC_015510	CTGGC	2	10	205783	205792	0 %	20 %	40 %	40 %	332662179
153	NC_015510	CCATT	2	10	210294	210303	20 %	40 %	0 %	40 %	332662183
154	NC_015510	CGGTT	2	10	210471	210480	0 %	40 %	40 %	20 %	332662183
155	NC_015510	GCCAT	2	10	210884	210893	20 %	20 %	20 %	40 %	332662183
156	NC_015510	CTACC	2	10	211139	211148	20 %	20 %	0 %	60 %	332662183
157	NC_015510	CAGTG	2	10	211853	211862	20 %	20 %	40 %	20 %	332662184
158	NC_015510	TTGAT	2	10	212842	212851	20 %	60 %	20 %	0 %	332662184
159	NC_015510	GCATC	2	10	214228	214237	20 %	20 %	20 %	40 %	332662186
160	NC_015510	CAAAC	2	10	215691	215700	60 %	0 %	0 %	40 %	332662187
161	NC_015510	GGATG	2	10	219074	219083	20 %	20 %	60 %	0 %	332662190
162	NC_015510	GGTTT	2	10	219249	219258	0 %	60 %	40 %	0 %	332662190
163	NC_015510	TGCCC	2	10	222900	222909	0 %	20 %	20 %	60 %	332662191
164	NC_015510	CCATT	2	10	226665	226674	20 %	40 %	0 %	40 %	332662196
165	NC_015510	CCAAC	2	10	228597	228606	40 %	0 %	0 %	60 %	332662197
166	NC_015510	TGGCC	2	10	229536	229545	0 %	20 %	40 %	40 %	332662198
167	NC_015510	TTGGA	2	10	229553	229562	20 %	40 %	40 %	0 %	332662198
168	NC_015510	TGCCA	2	10	230371	230380	20 %	20 %	20 %	40 %	332662199
169	NC_015510	CTTCA	2	10	231005	231014	20 %	40 %	0 %	40 %	332662200
170	NC_015510	CTGCG	2	10	232130	232139	0 %	20 %	40 %	40 %	332662200
171	NC_015510	TTTGA	2	10	232238	232247	20 %	60 %	20 %	0 %	332662200
172	NC_015510	CAACG	2	10	236417	236426	40 %	0 %	20 %	40 %	332662202
173	NC_015510	CCAAA	2	10	238927	238936	60 %	0 %	0 %	40 %	332662202
174	NC_015510	TCGGC	2	10	238992	239001	0 %	20 %	40 %	40 %	332662202
175	NC_015510	CAGGA	2	10	240018	240027	40 %	0 %	40 %	20 %	332662202
176	NC_015510	TACCT	2	10	240165	240174	20 %	40 %	0 %	40 %	332662202
177	NC_015510	GTGAA	2	10	240460	240469	40 %	20 %	40 %	0 %	332662202
178	NC_015510	CATTG	2	10	241106	241115	20 %	40 %	20 %	20 %	332662204
179	NC_015510	AGCTG	2	10	242742	242751	20 %	20 %	40 %	20 %	332662205
180	NC_015510	CACGG	2	10	243652	243661	20 %	0 %	40 %	40 %	332662205
181	NC_015510	TACAG	2	10	245352	245361	40 %	20 %	20 %	20 %	332662206
182	NC_015510	TTCCA	2	10	247588	247597	20 %	40 %	0 %	40 %	332662208
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184	NC_015510	CGATT	2	10	250301	250310	20 %	40 %	20 %	20 %	332662210
185	NC_015510	AAAAC	2	10	252737	252746	80 %	0 %	0 %	20 %	332662211
186	NC_015510	GCCTC	2	10	253792	253801	0 %	20 %	20 %	60 %	332662211
187	NC_015510	TGCCG	2	10	254280	254289	0 %	20 %	40 %	40 %	332662211
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189	NC_015510	TCCAG	2	10	259349	259358	20 %	20 %	20 %	40 %	332662212
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193	NC_015510	TCCGA	2	10	267777	267786	20 %	20 %	20 %	40 %	332662218
194	NC_015510	TCCAT	2	10	268982	268991	20 %	40 %	0 %	40 %	332662219
195	NC_015510	AGCAA	2	10	269023	269032	60 %	0 %	20 %	20 %	332662219
196	NC_015510	GCTGG	2	10	269654	269663	0 %	20 %	60 %	20 %	332662220
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198	NC_015510	TCGAA	2	10	272932	272941	40 %	20 %	20 %	20 %	332662221
199	NC_015510	CAGTG	2	10	273326	273335	20 %	20 %	40 %	20 %	332662221
200	NC_015510	CCTAC	2	10	275550	275559	20 %	20 %	0 %	60 %	332662224
201	NC_015510	CTGGC	2	10	276731	276740	0 %	20 %	40 %	40 %	332662225
202	NC_015510	CAAAA	2	10	277446	277455	80 %	0 %	0 %	20 %	332662225
203	NC_015510	CAAGG	2	10	281110	281119	40 %	0 %	40 %	20 %	332662226
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205	NC_015510	TGAAA	2	10	285296	285305	60 %	20 %	20 %	0 %	332662228
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231	NC_015510	ACAGC	2	10	340461	340470	40 %	0 %	20 %	40 %	332662271
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252	NC_015510	CTTTT	2	10	375971	375980	0 %	80 %	0 %	20 %	332662302
253	NC_015510	ATCAA	2	10	376095	376104	60 %	20 %	0 %	20 %	332662302
254	NC_015510	GGCAT	2	10	378727	378736	20 %	20 %	40 %	20 %	332662304
255	NC_015510	GCCCG	2	10	379074	379083	0 %	0 %	40 %	60 %	332662304
256	NC_015510	GACAA	2	10	379129	379138	60 %	0 %	20 %	20 %	332662304
257	NC_015510	AACGT	2	10	380755	380764	40 %	20 %	20 %	20 %	332662305
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259	NC_015510	ATTGA	2	10	381736	381745	40 %	40 %	20 %	0 %	332662305
260	NC_015510	GATGT	2	10	385099	385108	20 %	40 %	40 %	0 %	332662308
261	NC_015510	GGCCA	2	10	385306	385315	20 %	0 %	40 %	40 %	332662308
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263	NC_015510	ACCGC	2	10	393985	393994	20 %	0 %	20 %	60 %	332662309
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