MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 95995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	CAA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
2	NC_015510	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
3	NC_015510	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
4	NC_015510	ACT	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
5	NC_015510	TAC	2	6	463	468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
6	NC_015510	AAT	2	6	469	474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662000
7	NC_015510	CTT	2	6	641	646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662000
8	NC_015510	TCG	2	6	757	762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662000
9	NC_015510	ATC	2	6	781	786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662000
10	NC_015510	GAA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
11	NC_015510	CGG	2	6	1025	1030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662000
12	NC_015510	ATG	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662000
13	NC_015510	ACA	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
14	NC_015510	ACA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662000
15	NC_015510	TCG	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662000
16	NC_015510	GTG	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662000
17	NC_015510	ATT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662000
18	NC_015510	TGG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662000
19	NC_015510	GAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662000
20	NC_015510	TTC	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
21	NC_015510	CTT	2	6	1830	1835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
22	NC_015510	TGA	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
23	NC_015510	GTT	2	6	1928	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662001
24	NC_015510	AGT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
25	NC_015510	TGA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
26	NC_015510	ATG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662001
27	NC_015510	TTC	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662001
28	NC_015510	GTT	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662002
29	NC_015510	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662002
30	NC_015510	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662002
31	NC_015510	CTG	2	6	2783	2788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662002
32	NC_015510	CTT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662002
33	NC_015510	CGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662002
34	NC_015510	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662003
35	NC_015510	ATC	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662003
36	NC_015510	CAA	2	6	3371	3376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
37	NC_015510	CAA	3	9	3476	3484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
38	NC_015510	GGC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662003
39	NC_015510	GAA	2	6	3843	3848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662003
40	NC_015510	AAC	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
41	NC_015510	GAA	2	6	3921	3926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662003
42	NC_015510	CAG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
43	NC_015510	GCA	3	9	3982	3990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
44	NC_015510	CAA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662003
45	NC_015510	TAT	2	6	4110	4115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332662003
46	NC_015510	CAG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
47	NC_015510	TTG	2	6	4278	4283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662003
48	NC_015510	GGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662003
49	NC_015510	AGC	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662003
50	NC_015510	CTT	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662003
51	NC_015510	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662004
52	NC_015510	TGA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662004
53	NC_015510	ACC	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662004
54	NC_015510	CGG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662004
55	NC_015510	GGA	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332662004
56	NC_015510	ACG	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662004
57	NC_015510	CAA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662004
58	NC_015510	CTT	2	6	5356	5361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662005
59	NC_015510	AGA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662005
60	NC_015510	CGG	2	6	5575	5580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662005
61	NC_015510	ATC	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662005
62	NC_015510	TGA	2	6	6112	6117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
63	NC_015510	ACA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
64	NC_015510	AAC	2	6	6254	6259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
65	NC_015510	TGG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662006
66	NC_015510	GCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662006
67	NC_015510	CCA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662006
68	NC_015510	CAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662006
69	NC_015510	AGA	2	6	6760	6765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662006
70	NC_015510	GAT	2	6	6854	6859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
71	NC_015510	TTG	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662006
72	NC_015510	AAC	2	6	7059	7064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662006
73	NC_015510	GAT	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
74	NC_015510	ATG	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662006
75	NC_015510	CAG	2	6	7193	7198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662006
76	NC_015510	TTC	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662006
77	NC_015510	GCT	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
78	NC_015510	CAG	2	6	7614	7619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662007
79	NC_015510	AGC	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662007
80	NC_015510	AGC	2	6	7876	7881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662007
81	NC_015510	TCG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
82	NC_015510	CCA	2	6	8005	8010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662007
83	NC_015510	TGT	2	6	8022	8027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662007
84	NC_015510	TGT	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662007
85	NC_015510	ATC	2	6	8207	8212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662007
86	NC_015510	GAA	2	6	8266	8271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662007
87	NC_015510	TGC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662007
88	NC_015510	GAA	3	9	8366	8374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662007
89	NC_015510	ATG	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662007
90	NC_015510	TGA	2	6	8391	8396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662007
91	NC_015510	TTC	2	6	8420	8425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662007
92	NC_015510	GAA	2	6	8452	8457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662008
93	NC_015510	GCC	2	6	8712	8717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662009
94	NC_015510	ATG	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662009
95	NC_015510	GCT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662009
96	NC_015510	GAT	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662009
97	NC_015510	CAG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662009
98	NC_015510	ATC	2	6	9480	9485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332662009
99	NC_015510	ACC	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
100	NC_015510	ACC	2	6	9900	9905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
101	NC_015510	CTC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662009
102	NC_015510	AAG	2	6	10045	10050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662009
103	NC_015510	ACA	2	6	10054	10059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662009
104	NC_015510	GTG	2	6	10061	10066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662009
105	NC_015510	AAT	2	6	10109	10114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662009
106	NC_015510	GCC	2	6	10146	10151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662009
107	NC_015510	AAG	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662009
108	NC_015510	GAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662009
109	NC_015510	ACC	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
110	NC_015510	TGT	2	6	10297	10302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662009
111	NC_015510	GCA	2	6	10312	10317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662009
112	NC_015510	ACG	2	6	10376	10381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662009
113	NC_015510	TGA	2	6	10384	10389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662009
114	NC_015510	ACC	2	6	10416	10421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332662009
115	NC_015510	GCC	2	6	10506	10511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662009
116	NC_015510	AAT	2	6	10517	10522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662009
117	NC_015510	TAA	2	6	10599	10604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332662009
118	NC_015510	CAA	2	6	10627	10632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662009
119	NC_015510	CAA	2	6	10753	10758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662009
120	NC_015510	GTA	2	6	10808	10813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662009
121	NC_015510	GTC	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332662010
122	NC_015510	TCC	2	6	10922	10927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332662010
123	NC_015510	AGA	2	6	10939	10944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332662010
124	NC_015510	CTT	2	6	11349	11354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662011
125	NC_015510	CCG	2	6	11412	11417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332662011
126	NC_015510	CGG	2	6	11469	11474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662011
127	NC_015510	CAA	2	6	11525	11530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662011
128	NC_015510	GTG	2	6	11676	11681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332662011
129	NC_015510	TCT	3	9	11799	11807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332662011
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137	NC_015510	GTA	2	6	12143	12148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332662012
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142	NC_015510	AGC	2	6	12682	12687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662012
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249	NC_015510	CGA	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662022
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251	NC_015510	CAA	2	6	23562	23567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332662023
252	NC_015510	TGT	2	6	23615	23620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332662023
253	NC_015510	GCG	2	6	24097	24102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662024
254	NC_015510	AGC	2	6	24309	24314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662024
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256	NC_015510	GCG	2	6	24367	24372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332662024
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261	NC_015510	CAG	2	6	24620	24625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332662025
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