MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 22742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774952
2	NC_014922	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
3	NC_014922	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
4	NC_014922	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774952
5	NC_014922	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774952
6	NC_014922	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
7	NC_014922	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774952
8	NC_014922	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774952
9	NC_014922	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
10	NC_014922	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774952
11	NC_014922	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
12	NC_014922	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
13	NC_014922	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
14	NC_014922	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
15	NC_014922	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
16	NC_014922	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774953
17	NC_014922	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
18	NC_014922	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
19	NC_014922	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
20	NC_014922	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
21	NC_014922	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
22	NC_014922	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774953
23	NC_014922	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774953
24	NC_014922	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
25	NC_014922	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
26	NC_014922	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
27	NC_014922	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
28	NC_014922	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774953
29	NC_014922	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
30	NC_014922	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
31	NC_014922	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774953
32	NC_014922	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
33	NC_014922	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
34	NC_014922	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
35	NC_014922	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774953
36	NC_014922	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
37	NC_014922	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
38	NC_014922	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
39	NC_014922	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774953
40	NC_014922	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
41	NC_014922	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
42	NC_014922	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
43	NC_014922	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
44	NC_014922	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
45	NC_014922	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
46	NC_014922	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
47	NC_014922	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
48	NC_014922	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
49	NC_014922	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
50	NC_014922	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774954
51	NC_014922	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
52	NC_014922	GAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774954
53	NC_014922	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
54	NC_014922	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
55	NC_014922	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774955
56	NC_014922	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774955
57	NC_014922	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774955
58	NC_014922	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774955
59	NC_014922	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774955
60	NC_014922	AAG	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774956
61	NC_014922	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
62	NC_014922	AGG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774956
63	NC_014922	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774956
64	NC_014922	TGT	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774956
65	NC_014922	AGC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774956
66	NC_014922	ATT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
67	NC_014922	TAT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
68	NC_014922	TGC	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774957
69	NC_014922	TGA	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
70	NC_014922	CAA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
71	NC_014922	AGA	2	6	8807	8812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
72	NC_014922	CAG	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
73	NC_014922	AGC	2	6	8906	8911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
74	NC_014922	CAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
75	NC_014922	ATA	2	6	8926	8931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774957
76	NC_014922	GAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
77	NC_014922	ATG	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
78	NC_014922	GAT	2	6	9228	9233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
79	NC_014922	GAA	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
80	NC_014922	AGA	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
81	NC_014922	CCA	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774958
82	NC_014922	ATA	2	6	9420	9425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
83	NC_014922	AAT	2	6	9556	9561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
84	NC_014922	ATT	2	6	9660	9665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
85	NC_014922	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
86	NC_014922	ATA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
87	NC_014922	GCT	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
88	NC_014922	TTG	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774959
89	NC_014922	TGA	2	6	9849	9854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774959
90	NC_014922	TGC	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
91	NC_014922	CAA	2	6	10058	10063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774959
92	NC_014922	AGA	2	6	10194	10199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774959
93	NC_014922	TAT	2	6	10380	10385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
94	NC_014922	TAT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
95	NC_014922	TCG	2	6	10702	10707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774960
96	NC_014922	GCG	2	6	10832	10837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774960
97	NC_014922	ATA	2	6	10878	10883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774960
98	NC_014922	ACA	2	6	11242	11247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774960
99	NC_014922	TCA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
100	NC_014922	TTC	2	6	11651	11656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774961
101	NC_014922	ATT	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774961
102	NC_014922	TCT	2	6	11730	11735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774961
103	NC_014922	ATG	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774961
104	NC_014922	ATT	2	6	11795	11800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774961
105	NC_014922	TAA	2	6	11860	11865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774961
106	NC_014922	ATC	2	6	11876	11881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
107	NC_014922	TCA	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
108	NC_014922	AAT	2	6	11999	12004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774961
109	NC_014922	ACT	2	6	12026	12031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
110	NC_014922	CAA	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774961
111	NC_014922	GGT	2	6	12149	12154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774961
112	NC_014922	CTG	2	6	12312	12317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774962
113	NC_014922	ACG	2	6	12334	12339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774962
114	NC_014922	AAT	2	6	12539	12544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774962
115	NC_014922	GTC	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774962
116	NC_014922	ACC	2	6	12655	12660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774962
117	NC_014922	TGA	2	6	12794	12799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774962
118	NC_014922	CTT	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774963
119	NC_014922	GAT	2	6	13117	13122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774963
120	NC_014922	ACG	2	6	13208	13213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774963
121	NC_014922	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774963
122	NC_014922	AAT	2	6	13418	13423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
123	NC_014922	GCT	2	6	13488	13493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774963
124	NC_014922	TTG	2	6	13526	13531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774963
125	NC_014922	AAT	2	6	13580	13585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
126	NC_014922	TTC	2	6	13793	13798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774963
127	NC_014922	GTT	2	6	13822	13827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774963
128	NC_014922	GCA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774963
129	NC_014922	GAT	2	6	13873	13878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774963
130	NC_014922	ATA	2	6	13885	13890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
131	NC_014922	AAT	2	6	13948	13953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774963
132	NC_014922	CTT	2	6	14061	14066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774964
133	NC_014922	CTT	2	6	14109	14114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774964
134	NC_014922	CCA	2	6	14153	14158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774964
135	NC_014922	AAT	2	6	14209	14214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774964
136	NC_014922	GCT	2	6	14228	14233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774964
137	NC_014922	ATA	2	6	14363	14368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774964
138	NC_014922	AAG	2	6	14418	14423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774964
139	NC_014922	AAG	2	6	14456	14461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774964
140	NC_014922	CAC	2	6	14538	14543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774964
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142	NC_014922	AAC	2	6	14674	14679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774964
143	NC_014922	AGT	2	6	14722	14727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774964
144	NC_014922	AAT	2	6	14767	14772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774964
145	NC_014922	AGA	2	6	14783	14788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774964
146	NC_014922	ATC	2	6	14902	14907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774964
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150	NC_014922	TCT	2	6	15296	15301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774964
151	NC_014922	CAA	2	6	15366	15371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774964
152	NC_014922	TTC	2	6	15382	15387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774964
153	NC_014922	CAA	2	6	15520	15525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774964
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159	NC_014922	TAA	2	6	16293	16298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774965
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161	NC_014922	CTA	2	6	16433	16438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774965
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163	NC_014922	ATT	2	6	16854	16859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774966
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165	NC_014922	TTA	2	6	17100	17105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774966
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249	NC_014922	CTT	2	6	23933	23938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774971
250	NC_014922	TAA	2	6	23973	23978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774971
251	NC_014922	TAA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774972
252	NC_014922	CCA	2	6	24502	24507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774972
253	NC_014922	CCA	2	6	24568	24573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774972
254	NC_014922	ACC	2	6	24643	24648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774972
255	NC_014922	GAT	2	6	24904	24909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774972
256	NC_014922	ACC	2	6	24910	24915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774972
257	NC_014922	CAA	2	6	25011	25016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774972
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