MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	AGAGG	2	10	1505	1514	40 %	0 %	60 %	0 %	332309248
2	NC_014810	ATTTA	2	10	4088	4097	40 %	60 %	0 %	0 %	315452432
3	NC_014810	GCGTG	2	10	4639	4648	0 %	20 %	60 %	20 %	315452432
4	NC_014810	GACTT	2	10	9928	9937	20 %	40 %	20 %	20 %	315452441
5	NC_014810	CCCTC	2	10	10799	10808	0 %	20 %	0 %	80 %	315452442
6	NC_014810	AATCT	3	15	13242	13256	40 %	40 %	0 %	20 %	315452446
7	NC_014810	CTTTT	2	10	13496	13505	0 %	80 %	0 %	20 %	315452447
8	NC_014810	CGCCC	2	10	18483	18492	0 %	0 %	20 %	80 %	332309251
9	NC_014810	ATGGG	2	10	18701	18710	20 %	20 %	60 %	0 %	332309251
10	NC_014810	TTGAA	2	10	23173	23182	40 %	40 %	20 %	0 %	315452455
11	NC_014810	CTAGG	2	10	26110	26119	20 %	20 %	40 %	20 %	315452463
12	NC_014810	TCCAC	2	10	27018	27027	20 %	20 %	0 %	60 %	315452464
13	NC_014810	GAGCG	2	10	27876	27885	20 %	0 %	60 %	20 %	315452465
14	NC_014810	TAGCC	2	10	28314	28323	20 %	20 %	20 %	40 %	315452465
15	NC_014810	GATCA	2	10	28468	28477	40 %	20 %	20 %	20 %	315452465
16	NC_014810	GCGGG	2	10	29993	30002	0 %	0 %	80 %	20 %	315452465
17	NC_014810	CCCTA	2	10	32618	32627	20 %	20 %	0 %	60 %	315452467
18	NC_014810	GTTTG	2	10	33121	33130	0 %	60 %	40 %	0 %	315452467
19	NC_014810	CTTGC	2	10	36247	36256	0 %	40 %	20 %	40 %	315452470
20	NC_014810	ATTTT	2	10	39378	39387	20 %	80 %	0 %	0 %	315452473
21	NC_014810	GCTTG	2	10	40010	40019	0 %	40 %	40 %	20 %	315452473
22	NC_014810	GGGGT	2	10	40222	40231	0 %	20 %	80 %	0 %	315452473
23	NC_014810	CTCTT	2	10	45629	45638	0 %	60 %	0 %	40 %	315452477
24	NC_014810	CTTGG	2	10	47821	47830	0 %	40 %	40 %	20 %	315452479
25	NC_014810	TTGAT	2	10	48596	48605	20 %	60 %	20 %	0 %	315452479
26	NC_014810	ACCCC	2	10	49384	49393	20 %	0 %	0 %	80 %	315452480
27	NC_014810	CTGCC	2	10	49415	49424	0 %	20 %	20 %	60 %	315452480
28	NC_014810	GGCGT	2	10	53784	53793	0 %	20 %	60 %	20 %	315452486
29	NC_014810	AAGAG	2	10	56745	56754	60 %	0 %	40 %	0 %	315452492
30	NC_014810	CTCTT	2	10	59526	59535	0 %	60 %	0 %	40 %	315452495
31	NC_014810	TAAGT	2	10	62284	62293	40 %	40 %	20 %	0 %	315452499
32	NC_014810	CTTTT	2	10	63079	63088	0 %	80 %	0 %	20 %	315452499
33	NC_014810	AAAAG	2	10	64450	64459	80 %	0 %	20 %	0 %	315452501
34	NC_014810	GCCCT	2	10	65494	65503	0 %	20 %	20 %	60 %	315452502
35	NC_014810	AAAAG	2	10	65867	65876	80 %	0 %	20 %	0 %	315452503
36	NC_014810	GTTTA	2	10	67705	67714	20 %	60 %	20 %	0 %	315452505
37	NC_014810	TAGTG	2	10	67835	67844	20 %	40 %	40 %	0 %	315452505
38	NC_014810	GGCTT	2	10	74209	74218	0 %	40 %	40 %	20 %	315452512
39	NC_014810	AAAGC	2	10	75193	75202	60 %	0 %	20 %	20 %	315452513
40	NC_014810	GGCTT	2	10	76308	76317	0 %	40 %	40 %	20 %	315452514
41	NC_014810	GATTT	2	10	77252	77261	20 %	60 %	20 %	0 %	315452514
42	NC_014810	TCCCT	2	10	78110	78119	0 %	40 %	0 %	60 %	315452514
43	NC_014810	GCGCC	2	10	78679	78688	0 %	0 %	40 %	60 %	315452515
44	NC_014810	AAGCC	2	10	79212	79221	40 %	0 %	20 %	40 %	315452516
45	NC_014810	AACCC	2	10	79467	79476	40 %	0 %	0 %	60 %	315452517
46	NC_014810	CTTTG	2	10	79884	79893	0 %	60 %	20 %	20 %	315452518
47	NC_014810	CCACT	2	10	79937	79946	20 %	20 %	0 %	60 %	315452518
48	NC_014810	AAACC	2	10	81116	81125	60 %	0 %	0 %	40 %	315452519
49	NC_014810	TTTGC	2	10	82733	82742	0 %	60 %	20 %	20 %	315452521
50	NC_014810	ACCCC	2	10	88972	88981	20 %	0 %	0 %	80 %	315452527
51	NC_014810	CAAGA	2	10	89198	89207	60 %	0 %	20 %	20 %	315452527
52	NC_014810	AGTGG	2	10	89455	89464	20 %	20 %	60 %	0 %	315452528
53	NC_014810	TTTGA	2	10	90205	90214	20 %	60 %	20 %	0 %	315452529
54	NC_014810	TTTGG	2	10	90721	90730	0 %	60 %	40 %	0 %	315452529
55	NC_014810	AATCA	2	10	98111	98120	60 %	20 %	0 %	20 %	315452536
56	NC_014810	ACGCC	2	10	98719	98728	20 %	0 %	20 %	60 %	315452537
57	NC_014810	TTTGG	2	10	99263	99272	0 %	60 %	40 %	0 %	315452537
58	NC_014810	ATGGC	2	10	101243	101252	20 %	20 %	40 %	20 %	315452539
59	NC_014810	GGGCA	2	10	103523	103532	20 %	0 %	60 %	20 %	315452542
60	NC_014810	CAAAG	2	10	104462	104471	60 %	0 %	20 %	20 %	315452542
61	NC_014810	GGGGC	2	10	105397	105406	0 %	0 %	80 %	20 %	315452542
62	NC_014810	GTGGG	2	10	106526	106535	0 %	20 %	80 %	0 %	315452544
63	NC_014810	CATGG	2	10	107072	107081	20 %	20 %	40 %	20 %	315452544
64	NC_014810	GCGAT	2	10	107951	107960	20 %	20 %	40 %	20 %	315452545
65	NC_014810	TGGCA	2	10	111802	111811	20 %	20 %	40 %	20 %	315452550
66	NC_014810	CCTGT	2	10	114501	114510	0 %	40 %	20 %	40 %	315452553
67	NC_014810	AGCGA	2	10	114683	114692	40 %	0 %	40 %	20 %	315452553
68	NC_014810	CGATG	2	10	114802	114811	20 %	20 %	40 %	20 %	315452553
69	NC_014810	ATCGC	2	10	115344	115353	20 %	20 %	20 %	40 %	315452553
70	NC_014810	CGTGG	2	10	115691	115700	0 %	20 %	60 %	20 %	315452553
71	NC_014810	TGGTG	2	10	127165	127174	0 %	40 %	60 %	0 %	315452562
72	NC_014810	AGGCG	2	10	128452	128461	20 %	0 %	60 %	20 %	315452564
73	NC_014810	CCGCG	2	10	128821	128830	0 %	0 %	40 %	60 %	315452564
74	NC_014810	CCCCG	2	10	129554	129563	0 %	0 %	20 %	80 %	315452564
75	NC_014810	GAGCG	2	10	129703	129712	20 %	0 %	60 %	20 %	315452564
76	NC_014810	AATTT	2	10	132400	132409	40 %	60 %	0 %	0 %	315452568
77	NC_014810	AAAAG	2	10	132948	132957	80 %	0 %	20 %	0 %	315452568
78	NC_014810	AGTTT	2	10	136287	136296	20 %	60 %	20 %	0 %	315452573
79	NC_014810	TTGCA	2	10	136625	136634	20 %	40 %	20 %	20 %	315452573
80	NC_014810	GATTT	2	10	138264	138273	20 %	60 %	20 %	0 %	315452575
81	NC_014810	AAAAT	2	10	141260	141269	80 %	20 %	0 %	0 %	315452577
82	NC_014810	GTTTT	2	10	144797	144806	0 %	80 %	20 %	0 %	315452579
83	NC_014810	GTTTT	2	10	150598	150607	0 %	80 %	20 %	0 %	315452584
84	NC_014810	TGAAA	2	10	152280	152289	60 %	20 %	20 %	0 %	315452588
85	NC_014810	AAAGT	2	10	156572	156581	60 %	20 %	20 %	0 %	315452591
86	NC_014810	AAAGA	2	10	159616	159625	80 %	0 %	20 %	0 %	315452594
87	NC_014810	GACCT	2	10	159646	159655	20 %	20 %	20 %	40 %	315452594
88	NC_014810	GCAGG	2	10	162450	162459	20 %	0 %	60 %	20 %	315452598
89	NC_014810	ATTGA	2	10	163367	163376	40 %	40 %	20 %	0 %	315452599
90	NC_014810	AGAGC	2	10	164059	164068	40 %	0 %	40 %	20 %	315452599
91	NC_014810	AGATC	2	10	168470	168479	40 %	20 %	20 %	20 %	315452604
92	NC_014810	GCTCA	2	10	168672	168681	20 %	20 %	20 %	40 %	315452604
93	NC_014810	ACAAG	2	10	169505	169514	60 %	0 %	20 %	20 %	315452604
94	NC_014810	TATCC	2	10	169657	169666	20 %	40 %	0 %	40 %	315452604
95	NC_014810	GATCA	2	10	172815	172824	40 %	20 %	20 %	20 %	315452607
96	NC_014810	AACGC	2	10	177526	177535	40 %	0 %	20 %	40 %	315452612
97	NC_014810	CCTTA	2	10	186726	186735	20 %	40 %	0 %	40 %	315452622
98	NC_014810	GGCAC	2	10	190229	190238	20 %	0 %	40 %	40 %	315452626
99	NC_014810	TTGCG	2	10	191729	191738	0 %	40 %	40 %	20 %	315452628
100	NC_014810	TCCCA	2	10	196276	196285	20 %	20 %	0 %	60 %	315452633
101	NC_014810	ATTTT	2	10	198372	198381	20 %	80 %	0 %	0 %	315452637
102	NC_014810	GCTAT	2	10	201519	201528	20 %	40 %	20 %	20 %	315452639
103	NC_014810	ATGGA	2	10	203171	203180	40 %	20 %	40 %	0 %	315452641
104	NC_014810	AGGCG	2	10	203299	203308	20 %	0 %	60 %	20 %	315452641
105	NC_014810	ACCAC	2	10	204179	204188	40 %	0 %	0 %	60 %	315452642
106	NC_014810	GGTGT	2	10	206724	206733	0 %	40 %	60 %	0 %	315452644
107	NC_014810	ATCGG	2	10	209399	209408	20 %	20 %	40 %	20 %	315452647
108	NC_014810	AAAAT	2	10	210170	210179	80 %	20 %	0 %	0 %	315452648
109	NC_014810	GAAAA	2	10	210606	210615	80 %	0 %	20 %	0 %	315452648
110	NC_014810	GGGGC	2	10	212357	212366	0 %	0 %	80 %	20 %	315452650
111	NC_014810	AATCG	2	10	213711	213720	40 %	20 %	20 %	20 %	315452652
112	NC_014810	ATAAA	2	10	214330	214339	80 %	20 %	0 %	0 %	315452652
113	NC_014810	TCTCT	2	10	215773	215782	0 %	60 %	0 %	40 %	315452655
114	NC_014810	CCATT	2	10	217880	217889	20 %	40 %	0 %	40 %	315452657
115	NC_014810	AAATC	2	10	218690	218699	60 %	20 %	0 %	20 %	315452658
116	NC_014810	CAATA	2	10	218738	218747	60 %	20 %	0 %	20 %	315452658
117	NC_014810	TGCAC	2	10	218961	218970	20 %	20 %	20 %	40 %	315452658
118	NC_014810	AAATG	2	10	219226	219235	60 %	20 %	20 %	0 %	315452659
119	NC_014810	CCACT	2	10	220396	220405	20 %	20 %	0 %	60 %	315452660
120	NC_014810	CTAAA	2	10	221429	221438	60 %	20 %	0 %	20 %	315452661
121	NC_014810	ACACC	2	10	222084	222093	40 %	0 %	0 %	60 %	315452662
122	NC_014810	TAATG	2	10	224644	224653	40 %	40 %	20 %	0 %	315452664
123	NC_014810	GTCTA	2	10	228608	228617	20 %	40 %	20 %	20 %	315452670
124	NC_014810	CAGAA	2	10	230756	230765	60 %	0 %	20 %	20 %	315452674
125	NC_014810	GATGA	2	10	232247	232256	40 %	20 %	40 %	0 %	315452676
126	NC_014810	TGATG	2	10	233655	233664	20 %	40 %	40 %	0 %	315452677
127	NC_014810	CGCCA	2	10	234109	234118	20 %	0 %	20 %	60 %	315452677
128	NC_014810	TAGAA	2	10	240622	240631	60 %	20 %	20 %	0 %	315452682
129	NC_014810	AGGGC	2	10	242131	242140	20 %	0 %	60 %	20 %	315452684
130	NC_014810	ATTCT	2	10	243907	243916	20 %	60 %	0 %	20 %	315452686
131	NC_014810	TGGGT	2	10	244976	244985	0 %	40 %	60 %	0 %	315452686
132	NC_014810	GGGGT	2	10	245954	245963	0 %	20 %	80 %	0 %	315452687
133	NC_014810	TCCTT	2	10	246647	246656	0 %	60 %	0 %	40 %	315452688
134	NC_014810	GAGTA	2	10	248128	248137	40 %	20 %	40 %	0 %	315452689
135	NC_014810	GCTTT	2	10	248596	248605	0 %	60 %	20 %	20 %	315452690
136	NC_014810	TTCCA	2	10	248637	248646	20 %	40 %	0 %	40 %	315452690
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149	NC_014810	ACAAA	2	10	261734	261743	80 %	0 %	0 %	20 %	315452701
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169	NC_014810	ATCAA	2	10	291336	291345	60 %	20 %	0 %	20 %	315452722
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241	NC_014810	CTCAT	2	10	418713	418722	20 %	40 %	0 %	40 %	315452852
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245	NC_014810	GGAGT	2	10	423944	423953	20 %	20 %	60 %	0 %	315452857
246	NC_014810	TTTTA	2	10	424321	424330	20 %	80 %	0 %	0 %	315452857
247	NC_014810	AGAGC	2	10	429978	429987	40 %	0 %	40 %	20 %	315452862
248	NC_014810	ATCGC	2	10	431321	431330	20 %	20 %	20 %	40 %	315452863
249	NC_014810	GCAAA	2	10	434403	434412	60 %	0 %	20 %	20 %	315452867
250	NC_014810	AAAGT	2	10	434933	434942	60 %	20 %	20 %	0 %	315452867
251	NC_014810	AAGAC	2	10	436581	436590	60 %	0 %	20 %	20 %	315452870
252	NC_014810	TTTGT	2	10	437796	437805	0 %	80 %	20 %	0 %	315452872
253	NC_014810	GCGCT	2	10	439417	439426	0 %	20 %	40 %	40 %	315452872
254	NC_014810	AAGTT	2	10	440212	440221	40 %	40 %	20 %	0 %	315452873
255	NC_014810	TGGAA	2	10	440667	440676	40 %	20 %	40 %	0 %	315452873
256	NC_014810	TCTTT	2	10	442524	442533	0 %	80 %	0 %	20 %	315452874
257	NC_014810	GGGCG	2	10	443023	443032	0 %	0 %	80 %	20 %	315452874
258	NC_014810	CAGAG	2	10	443142	443151	40 %	0 %	40 %	20 %	315452874
259	NC_014810	AAATT	2	10	443300	443309	60 %	40 %	0 %	0 %	315452874
260	NC_014810	AAGTT	2	10	443367	443376	40 %	40 %	20 %	0 %	315452874
261	NC_014810	CTAAG	2	10	445646	445655	40 %	20 %	20 %	20 %	315452877
262	NC_014810	CTCCC	2	10	447314	447323	0 %	20 %	0 %	80 %	315452879
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264	NC_014810	AAGAT	2	10	448136	448145	60 %	20 %	20 %	0 %	315452881
265	NC_014810	AAGAT	2	10	448781	448790	60 %	20 %	20 %	0 %	315452881
266	NC_014810	GCAAA	2	10	449484	449493	60 %	0 %	20 %	20 %	315452881
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