MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014735	AATC	2	8	407	414	50 %	25 %	0 %	25 %	313117185
2	NC_014735	ATAA	2	8	879	886	75 %	25 %	0 %	0 %	313117185
3	NC_014735	AGTA	2	8	1215	1222	50 %	25 %	25 %	0 %	313117186
4	NC_014735	CAAG	2	8	1479	1486	50 %	0 %	25 %	25 %	313117186
5	NC_014735	TCCT	2	8	1642	1649	0 %	50 %	0 %	50 %	313117186
6	NC_014735	CAAT	2	8	1827	1834	50 %	25 %	0 %	25 %	313117186
7	NC_014735	TTTC	2	8	2019	2026	0 %	75 %	0 %	25 %	313117186
8	NC_014735	CAGA	2	8	3044	3051	50 %	0 %	25 %	25 %	313117187
9	NC_014735	GCTG	2	8	3990	3997	0 %	25 %	50 %	25 %	313117188
10	NC_014735	CAGA	2	8	4625	4632	50 %	0 %	25 %	25 %	313117189
11	NC_014735	GGCG	2	8	5533	5540	0 %	0 %	75 %	25 %	313117191
12	NC_014735	CGGT	2	8	5816	5823	0 %	25 %	50 %	25 %	313117191
13	NC_014735	ACCA	2	8	5898	5905	50 %	0 %	0 %	50 %	313117191
14	NC_014735	GTCA	2	8	6339	6346	25 %	25 %	25 %	25 %	313117192
15	NC_014735	ACGA	2	8	6358	6365	50 %	0 %	25 %	25 %	313117192
16	NC_014735	ATGG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	50 %	0 %	313117192
17	NC_014735	CGAC	2	8	6491	6498	25 %	0 %	25 %	50 %	313117192
18	NC_014735	TGAC	2	8	7096	7103	25 %	25 %	25 %	25 %	313117193
19	NC_014735	CGGC	2	8	7949	7956	0 %	0 %	50 %	50 %	313117195
20	NC_014735	ACCG	2	8	7984	7991	25 %	0 %	25 %	50 %	313117195
21	NC_014735	TGCG	2	8	9149	9156	0 %	25 %	50 %	25 %	313117196
22	NC_014735	GCAC	2	8	11478	11485	25 %	0 %	25 %	50 %	313117199
23	NC_014735	TTCC	2	8	12296	12303	0 %	50 %	0 %	50 %	313117201
24	NC_014735	AGTC	2	8	12386	12393	25 %	25 %	25 %	25 %	313117201
25	NC_014735	CGAC	2	8	12921	12928	25 %	0 %	25 %	50 %	313117202
26	NC_014735	ATGG	2	8	13108	13115	25 %	25 %	50 %	0 %	313117202
27	NC_014735	CGGT	2	8	14695	14702	0 %	25 %	50 %	25 %	313117203
28	NC_014735	CGTT	2	8	15341	15348	0 %	50 %	25 %	25 %	313117204
29	NC_014735	GATC	2	8	15381	15388	25 %	25 %	25 %	25 %	313117204
30	NC_014735	AACA	2	8	16019	16026	75 %	0 %	0 %	25 %	313117204
31	NC_014735	CAGC	2	8	16370	16377	25 %	0 %	25 %	50 %	313117204
32	NC_014735	TCTG	2	8	16808	16815	0 %	50 %	25 %	25 %	313117204
33	NC_014735	AAAG	2	8	18347	18354	75 %	0 %	25 %	0 %	313117206
34	NC_014735	CCCA	2	8	18406	18413	25 %	0 %	0 %	75 %	313117206
35	NC_014735	CAGA	2	8	18567	18574	50 %	0 %	25 %	25 %	313117206
36	NC_014735	CGAA	2	8	20500	20507	50 %	0 %	25 %	25 %	313117207
37	NC_014735	CAGC	2	8	20545	20552	25 %	0 %	25 %	50 %	313117207
38	NC_014735	ACCG	2	8	20571	20578	25 %	0 %	25 %	50 %	313117207
39	NC_014735	ACCA	2	8	20658	20665	50 %	0 %	0 %	50 %	313117207
40	NC_014735	GAAC	2	8	21477	21484	50 %	0 %	25 %	25 %	313117208
41	NC_014735	TCAG	2	8	21757	21764	25 %	25 %	25 %	25 %	313117209
42	NC_014735	CAGT	2	8	21821	21828	25 %	25 %	25 %	25 %	313117209
43	NC_014735	CGGT	2	8	21851	21858	0 %	25 %	50 %	25 %	313117209
44	NC_014735	AAGC	2	8	21884	21891	50 %	0 %	25 %	25 %	313117209
45	NC_014735	TGGA	2	8	22416	22423	25 %	25 %	50 %	0 %	313117210
46	NC_014735	CCGA	2	8	22650	22657	25 %	0 %	25 %	50 %	313117210
47	NC_014735	GAAT	2	8	22758	22765	50 %	25 %	25 %	0 %	313117210
48	NC_014735	GACA	2	8	22881	22888	50 %	0 %	25 %	25 %	313117211
49	NC_014735	TCGT	2	8	23160	23167	0 %	50 %	25 %	25 %	313117211
50	NC_014735	GTAC	2	8	23821	23828	25 %	25 %	25 %	25 %	313117211
51	NC_014735	AACG	2	8	24074	24081	50 %	0 %	25 %	25 %	313117211
52	NC_014735	GTTC	2	8	24406	24413	0 %	50 %	25 %	25 %	313117212
53	NC_014735	CGAC	2	8	24530	24537	25 %	0 %	25 %	50 %	313117212
54	NC_014735	CGTG	2	8	25775	25782	0 %	25 %	50 %	25 %	313117214
55	NC_014735	ATCC	2	8	26005	26012	25 %	25 %	0 %	50 %	313117215
56	NC_014735	ATCA	2	8	26294	26301	50 %	25 %	0 %	25 %	313117215
57	NC_014735	CCAC	2	8	26486	26493	25 %	0 %	0 %	75 %	313117216
58	NC_014735	TCGT	2	8	26540	26547	0 %	50 %	25 %	25 %	313117216
59	NC_014735	ATTG	2	8	26629	26636	25 %	50 %	25 %	0 %	313117216
60	NC_014735	GGTG	2	8	26652	26659	0 %	25 %	75 %	0 %	313117216
61	NC_014735	CCGG	2	8	26782	26789	0 %	0 %	50 %	50 %	313117216
62	NC_014735	CGAC	2	8	26925	26932	25 %	0 %	25 %	50 %	313117216
63	NC_014735	CCGC	2	8	28894	28901	0 %	0 %	25 %	75 %	313117218
64	NC_014735	CCGA	2	8	29042	29049	25 %	0 %	25 %	50 %	313117218
65	NC_014735	GACG	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	313117218
66	NC_014735	CCAA	2	8	29761	29768	50 %	0 %	0 %	50 %	313117218
67	NC_014735	TACT	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	313117218
68	NC_014735	GATC	2	8	30233	30240	25 %	25 %	25 %	25 %	313117218
69	NC_014735	GCGA	2	8	32872	32879	25 %	0 %	50 %	25 %	313117220
70	NC_014735	CTGC	2	8	33515	33522	0 %	25 %	25 %	50 %	313117220
71	NC_014735	CGAC	2	8	34009	34016	25 %	0 %	25 %	50 %	313117220
72	NC_014735	TCGG	2	8	34556	34563	0 %	25 %	50 %	25 %	313117221
73	NC_014735	GTGA	2	8	34589	34596	25 %	25 %	50 %	0 %	313117221
74	NC_014735	TCTG	2	8	34894	34901	0 %	50 %	25 %	25 %	313117221
75	NC_014735	CTCG	2	8	35078	35085	0 %	25 %	25 %	50 %	313117221
76	NC_014735	TTCC	2	8	35625	35632	0 %	50 %	0 %	50 %	313117222
77	NC_014735	TCCA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	0 %	50 %	313117222
78	NC_014735	CAAG	2	8	36452	36459	50 %	0 %	25 %	25 %	313117223
79	NC_014735	ACCG	2	8	37607	37614	25 %	0 %	25 %	50 %	313117224
80	NC_014735	CCTT	2	8	38370	38377	0 %	50 %	0 %	50 %	313117224
81	NC_014735	GAAT	2	8	39052	39059	50 %	25 %	25 %	0 %	313117224
82	NC_014735	GCCG	2	8	39331	39338	0 %	0 %	50 %	50 %	313117224
83	NC_014735	AGGT	2	8	39948	39955	25 %	25 %	50 %	0 %	313117225
84	NC_014735	GCGA	2	8	40073	40080	25 %	0 %	50 %	25 %	313117225
85	NC_014735	GCCC	2	8	40099	40106	0 %	0 %	25 %	75 %	313117225
86	NC_014735	GAGC	2	8	40304	40311	25 %	0 %	50 %	25 %	313117225
87	NC_014735	GGCC	2	8	41833	41840	0 %	0 %	50 %	50 %	313117227
88	NC_014735	AGGA	2	8	41889	41896	50 %	0 %	50 %	0 %	313117227
89	NC_014735	CGGT	2	8	41920	41927	0 %	25 %	50 %	25 %	313117227
90	NC_014735	AGCG	2	8	42073	42080	25 %	0 %	50 %	25 %	313117227
91	NC_014735	GCCA	2	8	42088	42095	25 %	0 %	25 %	50 %	313117227
92	NC_014735	CTGC	2	8	42588	42595	0 %	25 %	25 %	50 %	313117227
93	NC_014735	GCGT	2	8	42912	42919	0 %	25 %	50 %	25 %	313117228
94	NC_014735	ACCA	2	8	43068	43075	50 %	0 %	0 %	50 %	313117228
95	NC_014735	GGAT	2	8	43357	43364	25 %	25 %	50 %	0 %	313117228
96	NC_014735	TGAC	2	8	44203	44210	25 %	25 %	25 %	25 %	313117229
97	NC_014735	GACG	2	8	44351	44358	25 %	0 %	50 %	25 %	313117229
98	NC_014735	GCGA	2	8	45232	45239	25 %	0 %	50 %	25 %	313117229
99	NC_014735	GGGT	2	8	45778	45785	0 %	25 %	75 %	0 %	313117230
100	NC_014735	CAGT	2	8	46304	46311	25 %	25 %	25 %	25 %	313117230
101	NC_014735	CGTC	2	8	47143	47150	0 %	25 %	25 %	50 %	313117231
102	NC_014735	GTCG	2	8	47152	47159	0 %	25 %	50 %	25 %	313117231
103	NC_014735	AACC	2	8	47211	47218	50 %	0 %	0 %	50 %	313117231
104	NC_014735	TACG	2	8	47222	47229	25 %	25 %	25 %	25 %	313117231
105	NC_014735	GCGT	2	8	47817	47824	0 %	25 %	50 %	25 %	313117231
106	NC_014735	TCAC	2	8	48153	48160	25 %	25 %	0 %	50 %	313117231
107	NC_014735	GTCC	2	8	48615	48622	0 %	25 %	25 %	50 %	313117232
108	NC_014735	TCGT	2	8	48682	48689	0 %	50 %	25 %	25 %	313117232
109	NC_014735	CAAT	2	8	48690	48697	50 %	25 %	0 %	25 %	313117232
110	NC_014735	TGGA	2	8	48811	48818	25 %	25 %	50 %	0 %	313117232
111	NC_014735	AGCG	2	8	48997	49004	25 %	0 %	50 %	25 %	313117232
112	NC_014735	CGAC	2	8	49117	49124	25 %	0 %	25 %	50 %	313117232
113	NC_014735	TCTG	2	8	49185	49192	0 %	50 %	25 %	25 %	313117232
114	NC_014735	GTTG	2	8	49303	49310	0 %	50 %	50 %	0 %	313117232
115	NC_014735	CCAT	2	8	50372	50379	25 %	25 %	0 %	50 %	313117233
116	NC_014735	GACG	2	8	50535	50542	25 %	0 %	50 %	25 %	313117233
117	NC_014735	GGGT	2	8	51817	51824	0 %	25 %	75 %	0 %	313117234
118	NC_014735	TTCG	2	8	51982	51989	0 %	50 %	25 %	25 %	313117234
119	NC_014735	TCCA	2	8	52483	52490	25 %	25 %	0 %	50 %	313117234
120	NC_014735	CGGC	2	8	52718	52725	0 %	0 %	50 %	50 %	313117234
121	NC_014735	CGGA	2	8	53239	53246	25 %	0 %	50 %	25 %	313117234
122	NC_014735	CCTT	2	8	54119	54126	0 %	50 %	0 %	50 %	313117235
123	NC_014735	ACGA	2	8	54131	54138	50 %	0 %	25 %	25 %	313117235
124	NC_014735	CTCG	2	8	54172	54179	0 %	25 %	25 %	50 %	313117235
125	NC_014735	GAAC	2	8	55693	55700	50 %	0 %	25 %	25 %	313117236
126	NC_014735	ATAG	2	8	55841	55848	50 %	25 %	25 %	0 %	313117236
127	NC_014735	AGTC	2	8	55984	55991	25 %	25 %	25 %	25 %	313117236
128	NC_014735	TCCG	2	8	56233	56240	0 %	25 %	25 %	50 %	313117236
129	NC_014735	ATCA	2	8	56780	56787	50 %	25 %	0 %	25 %	313117236
130	NC_014735	GGGA	2	8	56821	56828	25 %	0 %	75 %	0 %	313117236
131	NC_014735	CCTC	2	8	57098	57105	0 %	25 %	0 %	75 %	313117237
132	NC_014735	TTCG	2	8	57185	57192	0 %	50 %	25 %	25 %	313117237
133	NC_014735	CGAC	2	8	57236	57243	25 %	0 %	25 %	50 %	313117237
134	NC_014735	GCTC	2	8	57303	57310	0 %	25 %	25 %	50 %	313117237
135	NC_014735	AAGC	2	8	58481	58488	50 %	0 %	25 %	25 %	313117237
136	NC_014735	CGAC	2	8	58946	58953	25 %	0 %	25 %	50 %	313117237
137	NC_014735	CTCG	2	8	59553	59560	0 %	25 %	25 %	50 %	313117238
138	NC_014735	GCAA	2	8	59704	59711	50 %	0 %	25 %	25 %	313117238
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