MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 6873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014735	CTT	2	6	59480	59485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117238
1002	NC_014735	CTCG	2	8	59553	59560	0 %	25 %	25 %	50 %	313117238
1003	NC_014735	GAC	2	6	59566	59571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117238
1004	NC_014735	GAA	2	6	59646	59651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117238
1005	NC_014735	GCAA	2	8	59704	59711	50 %	0 %	25 %	25 %	313117238
1006	NC_014735	TCC	2	6	59731	59736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117238
1007	NC_014735	GCA	2	6	59779	59784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117238
1008	NC_014735	CAGT	2	8	59828	59835	25 %	25 %	25 %	25 %	313117238
1009	NC_014735	CCAG	2	8	59850	59857	25 %	0 %	25 %	50 %	313117238
1010	NC_014735	CT	3	6	60078	60083	0 %	50 %	0 %	50 %	313117239
1011	NC_014735	TCG	2	6	60105	60110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117239
1012	NC_014735	CT	3	6	60137	60142	0 %	50 %	0 %	50 %	313117239
1013	NC_014735	AGCA	2	8	60235	60242	50 %	0 %	25 %	25 %	313117239
1014	NC_014735	GGAGCA	2	12	60246	60257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313117239
1015	NC_014735	GCC	2	6	60290	60295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117239
1016	NC_014735	CTG	2	6	60302	60307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117239
1017	NC_014735	TC	3	6	60366	60371	0 %	50 %	0 %	50 %	313117239
1018	NC_014735	GTC	2	6	60386	60391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117239
1019	NC_014735	GCT	2	6	60400	60405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117239
1020	NC_014735	AGTC	2	8	60433	60440	25 %	25 %	25 %	25 %	313117239
1021	NC_014735	GGC	2	6	60442	60447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117239
1022	NC_014735	CGT	2	6	60468	60473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117239
1023	NC_014735	GGTCTC	2	12	60500	60511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117240
1024	NC_014735	TTC	2	6	60585	60590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117240
1025	NC_014735	CGA	2	6	60688	60693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117240
1026	NC_014735	CGG	2	6	60728	60733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117240
1027	NC_014735	GA	3	6	60834	60839	50 %	0 %	50 %	0 %	313117240
1028	NC_014735	ACG	2	6	60840	60845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117240
1029	NC_014735	AG	3	6	61018	61023	50 %	0 %	50 %	0 %	313117241
1030	NC_014735	AGTC	2	8	61822	61829	25 %	25 %	25 %	25 %	313117242
1031	NC_014735	TCC	2	6	61833	61838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117242
1032	NC_014735	TTAC	3	12	61853	61864	25 %	50 %	0 %	25 %	313117242
1033	NC_014735	TTA	2	6	61872	61877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313117242
1034	NC_014735	GAAC	2	8	61880	61887	50 %	0 %	25 %	25 %	313117242
1035	NC_014735	TCC	2	6	61905	61910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117242
1036	NC_014735	CGG	2	6	62032	62037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117242
1037	NC_014735	TCG	2	6	62097	62102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117242
1038	NC_014735	TCGCGT	2	12	62157	62168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117242
1039	NC_014735	CCG	2	6	62217	62222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117242
1040	NC_014735	CCG	2	6	62346	62351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117242
1041	NC_014735	CAC	2	6	62359	62364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117242
1042	NC_014735	TCAAAC	2	12	62373	62384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313117242
1043	NC_014735	TCG	3	9	62406	62414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117242
1044	NC_014735	GCG	2	6	62417	62422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117242
1045	NC_014735	AGCGG	2	10	62429	62438	20 %	0 %	60 %	20 %	313117242
1046	NC_014735	TGG	2	6	62490	62495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117242
1047	NC_014735	CTCG	2	8	62507	62514	0 %	25 %	25 %	50 %	313117242
1048	NC_014735	CAGA	2	8	62566	62573	50 %	0 %	25 %	25 %	313117243
1049	NC_014735	CAA	2	6	62681	62686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117243
1050	NC_014735	TCCG	2	8	62711	62718	0 %	25 %	25 %	50 %	313117243
1051	NC_014735	GT	3	6	62735	62740	0 %	50 %	50 %	0 %	313117243
1052	NC_014735	CAGA	2	8	62755	62762	50 %	0 %	25 %	25 %	313117243
1053	NC_014735	ACCGG	2	10	62796	62805	20 %	0 %	40 %	40 %	313117243
1054	NC_014735	GCA	2	6	62835	62840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1055	NC_014735	TGAAA	2	10	62856	62865	60 %	20 %	20 %	0 %	313117243
1056	NC_014735	GAC	3	9	62872	62880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1057	NC_014735	CTC	2	6	62890	62895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117243
1058	NC_014735	CGA	3	9	62922	62930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1059	NC_014735	AGC	2	6	62957	62962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1060	NC_014735	CGA	2	6	63012	63017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1061	NC_014735	GAG	2	6	63073	63078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117243
1062	NC_014735	TCT	3	9	63098	63106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117243
1063	NC_014735	TCC	2	6	63155	63160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117243
1064	NC_014735	ACG	2	6	63161	63166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1065	NC_014735	GACG	2	8	63216	63223	25 %	0 %	50 %	25 %	313117243
1066	NC_014735	CGA	2	6	63230	63235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117243
1067	NC_014735	CG	3	6	63268	63273	0 %	0 %	50 %	50 %	313117243
1068	NC_014735	GGT	2	6	63280	63285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117243
1069	NC_014735	GAC	2	6	63386	63391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117244
1070	NC_014735	CAG	2	6	63433	63438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117244
1071	NC_014735	CCG	2	6	63460	63465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117244
1072	NC_014735	TAC	2	6	63519	63524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117244
1073	NC_014735	ACA	2	6	63577	63582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117244
1074	NC_014735	CGT	2	6	63607	63612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117244
1075	NC_014735	TAC	2	6	63753	63758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117244
1076	NC_014735	ACG	2	6	63795	63800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117244
1077	NC_014735	CGA	2	6	63803	63808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117244
1078	NC_014735	A	6	6	63852	63857	100 %	0 %	0 %	0 %	313117244
1079	NC_014735	GAG	2	6	63934	63939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117245
1080	NC_014735	CT	3	6	63960	63965	0 %	50 %	0 %	50 %	313117245
1081	NC_014735	CGGCGA	2	12	64019	64030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	313117245
1082	NC_014735	GGT	2	6	64044	64049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117245
1083	NC_014735	GAA	2	6	64068	64073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117245
1084	NC_014735	ACC	2	6	64075	64080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117245
1085	NC_014735	AACG	2	8	64083	64090	50 %	0 %	25 %	25 %	313117245
1086	NC_014735	CGT	2	6	64122	64127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1087	NC_014735	GCG	2	6	64264	64269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117245
1088	NC_014735	CAG	2	6	64281	64286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1089	NC_014735	CGA	2	6	64295	64300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1090	NC_014735	GA	3	6	64317	64322	50 %	0 %	50 %	0 %	313117245
1091	NC_014735	CCG	2	6	64325	64330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117245
1092	NC_014735	TTC	2	6	64335	64340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117245
1093	NC_014735	CCGA	2	8	64438	64445	25 %	0 %	25 %	50 %	313117245
1094	NC_014735	GA	3	6	64453	64458	50 %	0 %	50 %	0 %	313117245
1095	NC_014735	AC	3	6	64463	64468	50 %	0 %	0 %	50 %	313117245
1096	NC_014735	CGA	2	6	64478	64483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1097	NC_014735	ATA	2	6	64492	64497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117245
1098	NC_014735	CGA	2	6	64535	64540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1099	NC_014735	CGA	2	6	64547	64552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1100	NC_014735	TCG	2	6	64562	64567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1101	NC_014735	ACGT	2	8	64594	64601	25 %	25 %	25 %	25 %	313117245
1102	NC_014735	CCG	2	6	64645	64650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117245
1103	NC_014735	CGA	3	9	64784	64792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1104	NC_014735	AG	3	6	64820	64825	50 %	0 %	50 %	0 %	313117245
1105	NC_014735	CGA	2	6	64835	64840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117245
1106	NC_014735	CGG	2	6	64850	64855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117245
1107	NC_014735	CAA	2	6	65160	65165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117246
1108	NC_014735	TCA	2	6	65183	65188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117246
1109	NC_014735	GAC	2	6	65263	65268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117246
1110	NC_014735	AAT	2	6	65292	65297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313117246
1111	NC_014735	TCT	2	6	65324	65329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117246
1112	NC_014735	CGACAG	2	12	65373	65384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117246
1113	NC_014735	AGA	2	6	65496	65501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117246
1114	NC_014735	TCG	2	6	65507	65512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117246
1115	NC_014735	GAG	2	6	65524	65529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117246
1116	NC_014735	TCAC	2	8	65568	65575	25 %	25 %	0 %	50 %	313117247
1117	NC_014735	CGT	2	6	65622	65627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117247
1118	NC_014735	GT	3	6	65670	65675	0 %	50 %	50 %	0 %	313117247
1119	NC_014735	GTA	2	6	65694	65699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117247
1120	NC_014735	CGGT	2	8	65737	65744	0 %	25 %	50 %	25 %	313117247
1121	NC_014735	TCT	2	6	65761	65766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117247
1122	NC_014735	GCG	2	6	65816	65821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117247
1123	NC_014735	CCT	2	6	65834	65839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117247
1124	NC_014735	CGA	2	6	65858	65863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117247
1125	NC_014735	ACGA	2	8	65904	65911	50 %	0 %	25 %	25 %	313117247
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1243	NC_014735	CCG	3	9	71823	71831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117252
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1245	NC_014735	GAC	3	9	71995	72003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117252
1246	NC_014735	CCA	2	6	72009	72014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117252
1247	NC_014735	AGG	2	6	72044	72049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117252
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1249	NC_014735	GTCG	2	8	72066	72073	0 %	25 %	50 %	25 %	313117252
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1495	NC_014735	CCA	2	6	84121	84126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117261
1496	NC_014735	CCGG	2	8	84134	84141	0 %	0 %	50 %	50 %	313117261
1497	NC_014735	CGA	2	6	84177	84182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117261
1498	NC_014735	GAC	2	6	84187	84192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117261
1499	NC_014735	TCG	2	6	84215	84220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117261
1500	NC_014735	CGC	2	6	84231	84236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117261

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