MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	T	7	7	2939	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
2	NC_014731	G	6	6	2984	2989	0 %	0 %	100 %	0 %	313116829
3	NC_014731	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	313116829
4	NC_014731	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
5	NC_014731	G	6	6	5335	5340	0 %	0 %	100 %	0 %	313116830
6	NC_014731	A	6	6	5543	5548	100 %	0 %	0 %	0 %	313116830
7	NC_014731	T	6	6	13350	13355	0 %	100 %	0 %	0 %	313116837
8	NC_014731	T	6	6	15999	16004	0 %	100 %	0 %	0 %	313116838
9	NC_014731	C	6	6	25647	25652	0 %	0 %	0 %	100 %	313116845
10	NC_014731	G	6	6	32099	32104	0 %	0 %	100 %	0 %	313116850
11	NC_014731	C	6	6	33485	33490	0 %	0 %	0 %	100 %	313116852
12	NC_014731	T	6	6	62313	62318	0 %	100 %	0 %	0 %	313116877
13	NC_014731	C	6	6	62927	62932	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
14	NC_014731	C	6	6	63647	63652	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
15	NC_014731	C	6	6	63757	63762	0 %	0 %	0 %	100 %	313116878
16	NC_014731	A	6	6	65367	65372	100 %	0 %	0 %	0 %	313116880
17	NC_014731	G	6	6	65610	65615	0 %	0 %	100 %	0 %	313116880
18	NC_014731	C	6	6	72913	72918	0 %	0 %	0 %	100 %	313116888
19	NC_014731	A	6	6	83354	83359	100 %	0 %	0 %	0 %	313116896
20	NC_014731	G	6	6	89049	89054	0 %	0 %	100 %	0 %	313116901
21	NC_014731	G	6	6	95780	95785	0 %	0 %	100 %	0 %	313116909
22	NC_014731	G	6	6	103706	103711	0 %	0 %	100 %	0 %	313116919
23	NC_014731	G	6	6	108450	108455	0 %	0 %	100 %	0 %	313116926
24	NC_014731	A	6	6	118397	118402	100 %	0 %	0 %	0 %	313116933
25	NC_014731	G	6	6	119863	119868	0 %	0 %	100 %	0 %	313116934
26	NC_014731	G	6	6	129547	129552	0 %	0 %	100 %	0 %	313116944
27	NC_014731	G	6	6	134030	134035	0 %	0 %	100 %	0 %	313116946
28	NC_014731	A	7	7	140047	140053	100 %	0 %	0 %	0 %	313116951
29	NC_014731	C	6	6	151543	151548	0 %	0 %	0 %	100 %	313116961
30	NC_014731	T	6	6	153396	153401	0 %	100 %	0 %	0 %	313116963
31	NC_014731	G	6	6	164012	164017	0 %	0 %	100 %	0 %	313116976
32	NC_014731	A	6	6	170256	170261	100 %	0 %	0 %	0 %	313116980
33	NC_014731	T	6	6	173853	173858	0 %	100 %	0 %	0 %	313116983
34	NC_014731	A	6	6	175913	175918	100 %	0 %	0 %	0 %	313116986
35	NC_014731	G	6	6	187668	187673	0 %	0 %	100 %	0 %	313116996
36	NC_014731	C	6	6	189421	189426	0 %	0 %	0 %	100 %	313116998
37	NC_014731	T	6	6	190074	190079	0 %	100 %	0 %	0 %	313116999
38	NC_014731	T	6	6	198248	198253	0 %	100 %	0 %	0 %	313117007
39	NC_014731	C	6	6	210998	211003	0 %	0 %	0 %	100 %	313117020
40	NC_014731	C	8	8	213179	213186	0 %	0 %	0 %	100 %	313117022
41	NC_014731	G	6	6	219318	219323	0 %	0 %	100 %	0 %	313117033
42	NC_014731	G	6	6	227599	227604	0 %	0 %	100 %	0 %	313117040
43	NC_014731	G	6	6	228772	228777	0 %	0 %	100 %	0 %	313117041
44	NC_014731	G	6	6	236430	236435	0 %	0 %	100 %	0 %	313117047
45	NC_014731	T	6	6	237262	237267	0 %	100 %	0 %	0 %	313117048
46	NC_014731	C	6	6	258620	258625	0 %	0 %	0 %	100 %	313117064
47	NC_014731	A	6	6	259744	259749	100 %	0 %	0 %	0 %	313117066
48	NC_014731	A	6	6	259752	259757	100 %	0 %	0 %	0 %	313117066
49	NC_014731	G	6	6	264908	264913	0 %	0 %	100 %	0 %	313117070
50	NC_014731	C	6	6	266976	266981	0 %	0 %	0 %	100 %	313117072
51	NC_014731	G	6	6	280845	280850	0 %	0 %	100 %	0 %	313117083
52	NC_014731	T	6	6	286902	286907	0 %	100 %	0 %	0 %	313117087
53	NC_014731	A	6	6	304722	304727	100 %	0 %	0 %	0 %	313117101
54	NC_014731	G	6	6	324598	324603	0 %	0 %	100 %	0 %	313117120
55	NC_014731	A	6	6	328369	328374	100 %	0 %	0 %	0 %	313117123
56	NC_014731	T	6	6	332541	332546	0 %	100 %	0 %	0 %	313117125
57	NC_014731	C	6	6	335096	335101	0 %	0 %	0 %	100 %	313117128
58	NC_014731	T	6	6	337822	337827	0 %	100 %	0 %	0 %	313117131

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.