MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 6305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014731	GTG	2	6	206278	206283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117016
4002	NC_014731	GGT	2	6	206329	206334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117016
4003	NC_014731	CTCG	2	8	206351	206358	0 %	25 %	25 %	50 %	313117016
4004	NC_014731	TGG	2	6	206386	206391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117016
4005	NC_014731	CGA	2	6	206432	206437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4006	NC_014731	GGTG	2	8	206477	206484	0 %	25 %	75 %	0 %	313117016
4007	NC_014731	TCG	2	6	206488	206493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4008	NC_014731	ACGA	2	8	206520	206527	50 %	0 %	25 %	25 %	313117016
4009	NC_014731	CAC	2	6	206558	206563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117016
4010	NC_014731	GATC	2	8	206660	206667	25 %	25 %	25 %	25 %	313117016
4011	NC_014731	GACC	2	8	206786	206793	25 %	0 %	25 %	50 %	313117016
4012	NC_014731	CAG	2	6	206817	206822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4013	NC_014731	TCG	2	6	206833	206838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4014	NC_014731	CCG	2	6	206901	206906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117016
4015	NC_014731	TCG	2	6	206938	206943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4016	NC_014731	GCAA	3	12	206944	206955	50 %	0 %	25 %	25 %	313117016
4017	NC_014731	CA	3	6	207002	207007	50 %	0 %	0 %	50 %	313117016
4018	NC_014731	GCC	2	6	207108	207113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117016
4019	NC_014731	TGA	2	6	207158	207163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117016
4020	NC_014731	TGA	2	6	207209	207214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117016
4021	NC_014731	CGT	2	6	207224	207229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4022	NC_014731	TC	3	6	207308	207313	0 %	50 %	0 %	50 %	313117016
4023	NC_014731	GC	3	6	207343	207348	0 %	0 %	50 %	50 %	313117016
4024	NC_014731	GAT	2	6	207354	207359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117016
4025	NC_014731	GCC	2	6	207382	207387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117016
4026	NC_014731	TGAT	2	8	207445	207452	25 %	50 %	25 %	0 %	313117016
4027	NC_014731	CCG	2	6	207599	207604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117016
4028	NC_014731	CGT	2	6	207614	207619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4029	NC_014731	GAC	2	6	207621	207626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117016
4030	NC_014731	TGA	2	6	207653	207658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117016
4031	NC_014731	ACC	2	6	208003	208008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117017
4032	NC_014731	CGCA	2	8	208020	208027	25 %	0 %	25 %	50 %	313117017
4033	NC_014731	GAC	2	6	208051	208056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4034	NC_014731	CTA	2	6	208104	208109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117017
4035	NC_014731	CAA	2	6	208114	208119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117017
4036	NC_014731	GAC	3	9	208126	208134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4037	NC_014731	CGA	2	6	208146	208151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4038	NC_014731	AGTCA	2	10	208208	208217	40 %	20 %	20 %	20 %	313117017
4039	NC_014731	CTGG	2	8	208250	208257	0 %	25 %	50 %	25 %	313117017
4040	NC_014731	GAC	2	6	208267	208272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4041	NC_014731	CAA	2	6	208275	208280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117017
4042	NC_014731	CGA	2	6	208305	208310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4043	NC_014731	GAA	2	6	208335	208340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117017
4044	NC_014731	ACG	2	6	208355	208360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4045	NC_014731	TC	3	6	208380	208385	0 %	50 %	0 %	50 %	313117017
4046	NC_014731	AG	3	6	208404	208409	50 %	0 %	50 %	0 %	313117017
4047	NC_014731	CAG	2	6	208471	208476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4048	NC_014731	GTGC	2	8	208477	208484	0 %	25 %	50 %	25 %	313117017
4049	NC_014731	CGA	2	6	208497	208502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4050	NC_014731	AAGA	2	8	208525	208532	75 %	0 %	25 %	0 %	313117017
4051	NC_014731	ACA	2	6	208559	208564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117017
4052	NC_014731	CGG	2	6	208565	208570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117017
4053	NC_014731	ACT	2	6	208664	208669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117017
4054	NC_014731	GAG	2	6	208678	208683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117017
4055	NC_014731	AGCG	2	8	208715	208722	25 %	0 %	50 %	25 %	313117017
4056	NC_014731	TCC	2	6	208763	208768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117017
4057	NC_014731	GT	3	6	208797	208802	0 %	50 %	50 %	0 %	313117017
4058	NC_014731	GAA	2	6	208804	208809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117017
4059	NC_014731	GAG	2	6	208987	208992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117017
4060	NC_014731	CGTGTT	2	12	209006	209017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313117017
4061	NC_014731	TCG	2	6	209068	209073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4062	NC_014731	GAC	2	6	209079	209084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4063	NC_014731	CGGTG	2	10	209103	209112	0 %	20 %	60 %	20 %	313117017
4064	NC_014731	CGA	2	6	209119	209124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117017
4065	NC_014731	GA	3	6	209223	209228	50 %	0 %	50 %	0 %	313117017
4066	NC_014731	GTCACC	2	12	209349	209360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313117018
4067	NC_014731	ACC	2	6	209363	209368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117018
4068	NC_014731	CTA	2	6	209413	209418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117018
4069	NC_014731	ACC	2	6	209442	209447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117018
4070	NC_014731	TGT	2	6	209537	209542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117018
4071	NC_014731	GTG	2	6	209964	209969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117019
4072	NC_014731	CGA	2	6	209982	209987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117019
4073	NC_014731	CCG	2	6	210011	210016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117019
4074	NC_014731	TTC	2	6	210028	210033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117019
4075	NC_014731	ACG	2	6	210056	210061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117019
4076	NC_014731	GCC	2	6	210071	210076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117019
4077	NC_014731	CGG	2	6	210077	210082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117019
4078	NC_014731	TGC	2	6	210087	210092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117019
4079	NC_014731	TGA	2	6	210099	210104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117019
4080	NC_014731	TCG	2	6	210249	210254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117020
4081	NC_014731	GGT	2	6	210311	210316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117020
4082	NC_014731	GAG	2	6	210323	210328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117020
4083	NC_014731	GAT	2	6	210557	210562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117020
4084	NC_014731	CTG	2	6	210638	210643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117020
4085	NC_014731	CCGT	2	8	210657	210664	0 %	25 %	25 %	50 %	313117020
4086	NC_014731	TCA	2	6	210702	210707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117020
4087	NC_014731	CGTC	2	8	210791	210798	0 %	25 %	25 %	50 %	313117020
4088	NC_014731	TTCT	2	8	210830	210837	0 %	75 %	0 %	25 %	313117020
4089	NC_014731	GAATC	2	10	210850	210859	40 %	20 %	20 %	20 %	313117020
4090	NC_014731	GTC	3	9	210894	210902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117020
4091	NC_014731	TCG	2	6	210924	210929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117020
4092	NC_014731	ATC	2	6	210930	210935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117020
4093	NC_014731	CG	3	6	210943	210948	0 %	0 %	50 %	50 %	313117020
4094	NC_014731	AAC	2	6	210993	210998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117020
4095	NC_014731	C	6	6	210998	211003	0 %	0 %	0 %	100 %	313117020
4096	NC_014731	GGC	2	6	211004	211009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117020
4097	NC_014731	TGA	2	6	211027	211032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117020
4098	NC_014731	CCGTC	2	10	211099	211108	0 %	20 %	20 %	60 %	313117020
4099	NC_014731	GAG	2	6	211115	211120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117020
4100	NC_014731	TCG	2	6	211125	211130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117020
4101	NC_014731	CCA	2	6	211270	211275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117021
4102	NC_014731	CCG	2	6	211293	211298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117021
4103	NC_014731	CTG	2	6	211305	211310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117021
4104	NC_014731	CAT	2	6	211315	211320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117021
4105	NC_014731	CT	3	6	211324	211329	0 %	50 %	0 %	50 %	313117021
4106	NC_014731	ATTTCT	2	12	211393	211404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313117021
4107	NC_014731	CTC	2	6	211421	211426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117021
4108	NC_014731	GTT	2	6	211454	211459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117021
4109	NC_014731	GCA	2	6	211472	211477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117021
4110	NC_014731	GGAA	2	8	211558	211565	50 %	0 %	50 %	0 %	313117021
4111	NC_014731	TGA	2	6	211573	211578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117021
4112	NC_014731	GCG	2	6	211588	211593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117021
4113	NC_014731	CTC	2	6	211604	211609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117021
4114	NC_014731	GAG	2	6	211616	211621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117021
4115	NC_014731	GAGT	2	8	211658	211665	25 %	25 %	50 %	0 %	313117021
4116	NC_014731	GTT	2	6	211935	211940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117022
4117	NC_014731	GAG	2	6	211975	211980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117022
4118	NC_014731	CGA	2	6	211984	211989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4119	NC_014731	CGA	2	6	212034	212039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4120	NC_014731	GAC	2	6	212041	212046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4121	NC_014731	GA	4	8	212056	212063	50 %	0 %	50 %	0 %	313117022
4122	NC_014731	CGA	3	9	212112	212120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4123	NC_014731	GTC	2	6	212170	212175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4124	NC_014731	GTC	2	6	212182	212187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4125	NC_014731	GAT	2	6	212239	212244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117022
4126	NC_014731	GAC	2	6	212275	212280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4127	NC_014731	AGG	2	6	212300	212305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117022
4128	NC_014731	CGA	2	6	212341	212346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4129	NC_014731	ATC	2	6	212393	212398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117022
4130	NC_014731	CGA	2	6	212406	212411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4131	NC_014731	CCG	2	6	212419	212424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117022
4132	NC_014731	TCCAC	2	10	212436	212445	20 %	20 %	0 %	60 %	313117022
4133	NC_014731	GAC	2	6	212460	212465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4134	NC_014731	CGA	2	6	212499	212504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4135	NC_014731	AGC	2	6	212507	212512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
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4137	NC_014731	TCG	2	6	212529	212534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117022
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4139	NC_014731	ACG	2	6	212564	212569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4140	NC_014731	ACCG	2	8	212572	212579	25 %	0 %	25 %	50 %	313117022
4141	NC_014731	TTC	2	6	212590	212595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117022
4142	NC_014731	GTC	2	6	212678	212683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4143	NC_014731	TCGGT	2	10	212729	212738	0 %	40 %	40 %	20 %	313117022
4144	NC_014731	GGCG	2	8	212748	212755	0 %	0 %	75 %	25 %	313117022
4145	NC_014731	AGC	2	6	212783	212788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4146	NC_014731	GAGGAC	2	12	212803	212814	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313117022
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4148	NC_014731	CCGA	2	8	212878	212885	25 %	0 %	25 %	50 %	313117022
4149	NC_014731	CAG	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4150	NC_014731	ACCA	2	8	212996	213003	50 %	0 %	0 %	50 %	313117022
4151	NC_014731	CGT	2	6	213037	213042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4152	NC_014731	ACCC	2	8	213095	213102	25 %	0 %	0 %	75 %	313117022
4153	NC_014731	GAG	2	6	213163	213168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117022
4154	NC_014731	C	8	8	213179	213186	0 %	0 %	0 %	100 %	313117022
4155	NC_014731	GAG	2	6	213187	213192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117022
4156	NC_014731	AGCC	2	8	213196	213203	25 %	0 %	25 %	50 %	313117022
4157	NC_014731	ACG	2	6	213206	213211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4158	NC_014731	CGG	2	6	213235	213240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117022
4159	NC_014731	GAC	2	6	213286	213291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117022
4160	NC_014731	CGTC	2	8	213300	213307	0 %	25 %	25 %	50 %	313117022
4161	NC_014731	CG	3	6	213358	213363	0 %	0 %	50 %	50 %	313117023
4162	NC_014731	ACG	2	6	213438	213443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117023
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4166	NC_014731	CGT	2	6	213629	213634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117023
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4181	NC_014731	GAC	2	6	214370	214375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117024
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4184	NC_014731	ACTC	2	8	214494	214501	25 %	25 %	0 %	50 %	313117025
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4192	NC_014731	TCG	2	6	214961	214966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117026
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4200	NC_014731	CA	3	6	215171	215176	50 %	0 %	0 %	50 %	313117026
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4205	NC_014731	GTC	3	9	215356	215364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117027
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4214	NC_014731	TCA	2	6	215609	215614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117027
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4220	NC_014731	GCGCG	2	10	215889	215898	0 %	0 %	60 %	40 %	313117027
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4228	NC_014731	GGAGT	2	10	216428	216437	20 %	20 %	60 %	0 %	313117027
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4230	NC_014731	CGC	2	6	216561	216566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117028
4231	NC_014731	ACG	2	6	216588	216593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117028
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4233	NC_014731	ACGACC	2	12	216636	216647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	313117028
4234	NC_014731	TTCG	2	8	216685	216692	0 %	50 %	25 %	25 %	313117028
4235	NC_014731	TCG	2	6	216735	216740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117028
4236	NC_014731	GAA	2	6	216751	216756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117028
4237	NC_014731	CCCT	2	8	216838	216845	0 %	25 %	0 %	75 %	313117029
4238	NC_014731	GAT	2	6	216868	216873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117029
4239	NC_014731	ACG	2	6	216887	216892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
4240	NC_014731	GCA	2	6	216939	216944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
4241	NC_014731	GAAC	2	8	217003	217010	50 %	0 %	25 %	25 %	313117029
4242	NC_014731	CGG	2	6	217100	217105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117029
4243	NC_014731	CGT	2	6	217112	217117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117029
4244	NC_014731	CGA	2	6	217151	217156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117029
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4246	NC_014731	ACGA	2	8	217289	217296	50 %	0 %	25 %	25 %	313117029
4247	NC_014731	GACGA	2	10	217360	217369	40 %	0 %	40 %	20 %	313117029
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4250	NC_014731	AC	3	6	217497	217502	50 %	0 %	0 %	50 %	313117030
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4265	NC_014731	GTC	2	6	218683	218688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117032
4266	NC_014731	TCG	2	6	218723	218728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117032
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4273	NC_014731	ACG	2	6	219023	219028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117032
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4350	NC_014731	CGA	2	6	221561	221566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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4353	NC_014731	GAA	2	6	221627	221632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117036
4354	NC_014731	GAAC	2	8	221649	221656	50 %	0 %	25 %	25 %	313117036
4355	NC_014731	CGG	2	6	221660	221665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117036
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4357	NC_014731	CCG	2	6	221682	221687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117036
4358	NC_014731	CGTC	2	8	221737	221744	0 %	25 %	25 %	50 %	313117036
4359	NC_014731	CGA	2	6	221771	221776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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4361	NC_014731	GGTG	2	8	221807	221814	0 %	25 %	75 %	0 %	313117036
4362	NC_014731	GGA	2	6	221846	221851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117036
4363	NC_014731	TGGGAC	2	12	221868	221879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313117036
4364	NC_014731	CGA	2	6	221993	221998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117036
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4366	NC_014731	CG	3	6	222019	222024	0 %	0 %	50 %	50 %	313117036
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4481	NC_014731	GCG	2	6	227501	227506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117040
4482	NC_014731	ACCG	2	8	227507	227514	25 %	0 %	25 %	50 %	313117040
4483	NC_014731	TCG	2	6	227541	227546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117040
4484	NC_014731	CGG	3	9	227592	227600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117040
4485	NC_014731	G	6	6	227599	227604	0 %	0 %	100 %	0 %	313117040
4486	NC_014731	GTC	2	6	227606	227611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117040
4487	NC_014731	GGT	2	6	227615	227620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117040
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4489	NC_014731	GCC	2	6	227696	227701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117040
4490	NC_014731	GTC	2	6	227708	227713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117040
4491	NC_014731	CGT	2	6	227716	227721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117040
4492	NC_014731	TC	3	6	227748	227753	0 %	50 %	0 %	50 %	313117040
4493	NC_014731	CGC	2	6	227842	227847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117040
4494	NC_014731	CGT	2	6	227851	227856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117040
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