MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 6305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014731	TGACGC	2	12	158277	158288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313116969
3002	NC_014731	CGG	2	6	158371	158376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116969
3003	NC_014731	ACG	2	6	158391	158396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116969
3004	NC_014731	CGC	2	6	158434	158439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116969
3005	NC_014731	GGC	2	6	158446	158451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116969
3006	NC_014731	GT	3	6	158489	158494	0 %	50 %	50 %	0 %	313116969
3007	NC_014731	GTTG	2	8	158530	158537	0 %	50 %	50 %	0 %	313116969
3008	NC_014731	TTC	2	6	158567	158572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116969
3009	NC_014731	GGACGC	2	12	158585	158596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	313116969
3010	NC_014731	CGT	2	6	158710	158715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116969
3011	NC_014731	CGACT	2	10	158731	158740	20 %	20 %	20 %	40 %	313116969
3012	NC_014731	CGG	2	6	158751	158756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116969
3013	NC_014731	TCGG	2	8	158763	158770	0 %	25 %	50 %	25 %	313116969
3014	NC_014731	CCG	2	6	158784	158789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116969
3015	NC_014731	GTCA	2	8	158807	158814	25 %	25 %	25 %	25 %	313116969
3016	NC_014731	CGT	2	6	158878	158883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116969
3017	NC_014731	GTGCG	2	10	158947	158956	0 %	20 %	60 %	20 %	313116969
3018	NC_014731	GCG	2	6	158976	158981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116969
3019	NC_014731	CCG	2	6	159108	159113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116969
3020	NC_014731	GTG	2	6	159199	159204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116970
3021	NC_014731	GCGT	2	8	159230	159237	0 %	25 %	50 %	25 %	313116970
3022	NC_014731	GGAG	2	8	159254	159261	25 %	0 %	75 %	0 %	313116970
3023	NC_014731	CGC	2	6	159326	159331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116970
3024	NC_014731	ACCG	2	8	159402	159409	25 %	0 %	25 %	50 %	313116970
3025	NC_014731	GAC	2	6	159523	159528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3026	NC_014731	CGT	2	6	159541	159546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3027	NC_014731	CGT	2	6	159573	159578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3028	NC_014731	GGCGT	2	10	159580	159589	0 %	20 %	60 %	20 %	313116971
3029	NC_014731	AAC	2	6	159626	159631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116971
3030	NC_014731	GAA	2	6	159640	159645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116971
3031	NC_014731	GTC	2	6	159708	159713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3032	NC_014731	CGG	2	6	159720	159725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116971
3033	NC_014731	ATGG	2	8	159726	159733	25 %	25 %	50 %	0 %	313116971
3034	NC_014731	GGT	2	6	159814	159819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116971
3035	NC_014731	GAC	2	6	159861	159866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3036	NC_014731	CGT	2	6	159867	159872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3037	NC_014731	AC	3	6	159957	159962	50 %	0 %	0 %	50 %	313116971
3038	NC_014731	AC	3	6	159969	159974	50 %	0 %	0 %	50 %	313116971
3039	NC_014731	CGC	2	6	160010	160015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116971
3040	NC_014731	CGT	4	12	160038	160049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116971
3041	NC_014731	ACC	2	6	160131	160136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116972
3042	NC_014731	CTG	2	6	160146	160151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3043	NC_014731	GTC	2	6	160170	160175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3044	NC_014731	GTGA	2	8	160233	160240	25 %	25 %	50 %	0 %	313116972
3045	NC_014731	GAC	2	6	160296	160301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3046	NC_014731	TGC	2	6	160321	160326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3047	NC_014731	GTT	2	6	160328	160333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116972
3048	NC_014731	CGTG	2	8	160358	160365	0 %	25 %	50 %	25 %	313116972
3049	NC_014731	CGGT	2	8	160366	160373	0 %	25 %	50 %	25 %	313116972
3050	NC_014731	TCG	2	6	160387	160392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3051	NC_014731	CGA	2	6	160442	160447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116972
3052	NC_014731	GAAA	2	8	160453	160460	75 %	0 %	25 %	0 %	313116972
3053	NC_014731	TGGC	2	8	160529	160536	0 %	25 %	50 %	25 %	313116972
3054	NC_014731	GGT	2	6	160633	160638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116973
3055	NC_014731	GTAC	2	8	160646	160653	25 %	25 %	25 %	25 %	313116973
3056	NC_014731	CGT	3	9	160691	160699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116973
3057	NC_014731	GGT	2	6	160721	160726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116973
3058	NC_014731	CTCG	2	8	160775	160782	0 %	25 %	25 %	50 %	313116973
3059	NC_014731	TCGA	2	8	160795	160802	25 %	25 %	25 %	25 %	313116973
3060	NC_014731	CGCC	2	8	160822	160829	0 %	0 %	25 %	75 %	313116973
3061	NC_014731	CCG	2	6	160893	160898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116973
3062	NC_014731	GCG	2	6	160908	160913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116973
3063	NC_014731	CGG	2	6	161025	161030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116973
3064	NC_014731	AGAC	2	8	161036	161043	50 %	0 %	25 %	25 %	313116973
3065	NC_014731	GCT	2	6	161069	161074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116973
3066	NC_014731	CCG	2	6	161145	161150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116973
3067	NC_014731	GCG	2	6	161169	161174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116973
3068	NC_014731	TGT	2	6	161191	161196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116973
3069	NC_014731	CCCA	2	8	161236	161243	25 %	0 %	0 %	75 %	313116973
3070	NC_014731	TC	3	6	161267	161272	0 %	50 %	0 %	50 %	313116973
3071	NC_014731	CCG	2	6	161377	161382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116973
3072	NC_014731	CGTCG	2	10	161412	161421	0 %	20 %	40 %	40 %	313116973
3073	NC_014731	TCG	2	6	161563	161568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116973
3074	NC_014731	TACC	2	8	161573	161580	25 %	25 %	0 %	50 %	313116973
3075	NC_014731	CCGC	2	8	161589	161596	0 %	0 %	25 %	75 %	313116973
3076	NC_014731	TCGAA	2	10	161619	161628	40 %	20 %	20 %	20 %	313116973
3077	NC_014731	TCG	2	6	161677	161682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116973
3078	NC_014731	TGGG	2	8	161734	161741	0 %	25 %	75 %	0 %	313116973
3079	NC_014731	TCG	2	6	161764	161769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116973
3080	NC_014731	AT	3	6	161865	161870	50 %	50 %	0 %	0 %	313116974
3081	NC_014731	CGC	2	6	161894	161899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116974
3082	NC_014731	TCGG	2	8	161903	161910	0 %	25 %	50 %	25 %	313116974
3083	NC_014731	GA	3	6	161965	161970	50 %	0 %	50 %	0 %	313116975
3084	NC_014731	CGA	2	6	162002	162007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3085	NC_014731	CGA	2	6	162066	162071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3086	NC_014731	AGCG	2	8	162076	162083	25 %	0 %	50 %	25 %	313116975
3087	NC_014731	CGA	2	6	162102	162107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3088	NC_014731	CGG	2	6	162115	162120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116975
3089	NC_014731	GTC	2	6	162155	162160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3090	NC_014731	CAGC	2	8	162200	162207	25 %	0 %	25 %	50 %	313116975
3091	NC_014731	ACTCG	2	10	162226	162235	20 %	20 %	20 %	40 %	313116975
3092	NC_014731	GGC	2	6	162239	162244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116975
3093	NC_014731	CG	3	6	162258	162263	0 %	0 %	50 %	50 %	313116975
3094	NC_014731	CGA	2	6	162280	162285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3095	NC_014731	ACC	2	6	162320	162325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116975
3096	NC_014731	GAG	2	6	162332	162337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116975
3097	NC_014731	ACGG	2	8	162359	162366	25 %	0 %	50 %	25 %	313116975
3098	NC_014731	GAC	2	6	162416	162421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3099	NC_014731	CGA	3	9	162429	162437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3100	NC_014731	AC	3	6	162500	162505	50 %	0 %	0 %	50 %	313116975
3101	NC_014731	ATG	2	6	162647	162652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116975
3102	NC_014731	CGC	2	6	162675	162680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116975
3103	NC_014731	TCCA	2	8	162735	162742	25 %	25 %	0 %	50 %	313116975
3104	NC_014731	GTC	2	6	162761	162766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3105	NC_014731	CGG	2	6	162802	162807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116975
3106	NC_014731	ACC	2	6	162837	162842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116975
3107	NC_014731	CA	3	6	162932	162937	50 %	0 %	0 %	50 %	313116975
3108	NC_014731	TGA	2	6	163002	163007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116975
3109	NC_014731	CGG	2	6	163024	163029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116975
3110	NC_014731	GTC	2	6	163043	163048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116975
3111	NC_014731	GCAA	2	8	163254	163261	50 %	0 %	25 %	25 %	313116976
3112	NC_014731	CGG	2	6	163333	163338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116976
3113	NC_014731	AACCGC	2	12	163340	163351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	313116976
3114	NC_014731	CGG	2	6	163466	163471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116976
3115	NC_014731	CGT	2	6	163520	163525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116976
3116	NC_014731	TGG	2	6	163594	163599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116976
3117	NC_014731	AAG	2	6	163636	163641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116976
3118	NC_014731	AGT	2	6	163694	163699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116976
3119	NC_014731	GAT	2	6	163749	163754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116976
3120	NC_014731	ACG	2	6	163759	163764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116976
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3122	NC_014731	CGG	2	6	163934	163939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116976
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3243	NC_014731	TCGG	2	8	171353	171360	0 %	25 %	50 %	25 %	313116981
3244	NC_014731	CGA	2	6	171454	171459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116981
3245	NC_014731	ACGT	2	8	171531	171538	25 %	25 %	25 %	25 %	313116981
3246	NC_014731	CGG	2	6	171551	171556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116981
3247	NC_014731	TTC	2	6	171596	171601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116981
3248	NC_014731	CTG	2	6	171638	171643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116981
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3250	NC_014731	GTC	2	6	171734	171739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116981
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3252	NC_014731	TCG	2	6	171771	171776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116981
3253	NC_014731	CGT	2	6	171781	171786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116981
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3264	NC_014731	CGT	2	6	172384	172389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116981
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3272	NC_014731	GCT	2	6	173024	173029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116982
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3275	NC_014731	CT	3	6	173111	173116	0 %	50 %	0 %	50 %	313116982
3276	NC_014731	GTGG	2	8	173215	173222	0 %	25 %	75 %	0 %	313116982
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3284	NC_014731	TACTCG	3	18	173707	173724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313116983
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3315	NC_014731	GTC	2	6	174798	174803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116984
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3349	NC_014731	GCACA	2	10	176511	176520	40 %	0 %	20 %	40 %	313116986
3350	NC_014731	TCG	2	6	176532	176537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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3352	NC_014731	TCG	2	6	176636	176641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
3353	NC_014731	GAC	2	6	176672	176677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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3355	NC_014731	CGC	2	6	176815	176820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116986
3356	NC_014731	GCGG	2	8	176825	176832	0 %	0 %	75 %	25 %	313116986
3357	NC_014731	GAAC	2	8	176911	176918	50 %	0 %	25 %	25 %	313116986
3358	NC_014731	TGC	2	6	176923	176928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
3359	NC_014731	TTG	2	6	176942	176947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116986
3360	NC_014731	GCG	2	6	176950	176955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116986
3361	NC_014731	GAC	2	6	177022	177027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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3363	NC_014731	CGT	2	6	177078	177083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116986
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3484	NC_014731	CGA	2	6	182727	182732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116990
3485	NC_014731	GTC	2	6	182791	182796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116990
3486	NC_014731	GTGTCG	2	12	182804	182815	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	313116990
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3488	NC_014731	CAA	2	6	182972	182977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116991
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3491	NC_014731	GAC	2	6	183027	183032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116991
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