MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 6305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014731	TAC	2	6	57356	57361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116872
1002	NC_014731	GAT	2	6	57373	57378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116872
1003	NC_014731	TCG	2	6	57411	57416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116872
1004	NC_014731	GCTGT	2	10	57446	57455	0 %	40 %	40 %	20 %	313116872
1005	NC_014731	AGT	2	6	58086	58091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116873
1006	NC_014731	GAG	3	9	58111	58119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116873
1007	NC_014731	AGCC	2	8	58122	58129	25 %	0 %	25 %	50 %	313116873
1008	NC_014731	TCA	2	6	58157	58162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116873
1009	NC_014731	ACGA	2	8	58166	58173	50 %	0 %	25 %	25 %	313116873
1010	NC_014731	GCG	2	6	58193	58198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116873
1011	NC_014731	GAA	2	6	58201	58206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116873
1012	NC_014731	GCC	2	6	58216	58221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116873
1013	NC_014731	GAC	2	6	58222	58227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116873
1014	NC_014731	CAC	2	6	58261	58266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116873
1015	NC_014731	GTG	2	6	58268	58273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116873
1016	NC_014731	GA	3	6	58279	58284	50 %	0 %	50 %	0 %	313116873
1017	NC_014731	TCCC	2	8	58296	58303	0 %	25 %	0 %	75 %	313116874
1018	NC_014731	GA	3	6	58304	58309	50 %	0 %	50 %	0 %	313116874
1019	NC_014731	GAG	2	6	58339	58344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116874
1020	NC_014731	CCA	2	6	58350	58355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116874
1021	NC_014731	GCG	2	6	58367	58372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116874
1022	NC_014731	ATG	2	6	58373	58378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116874
1023	NC_014731	CCG	2	6	58380	58385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116874
1024	NC_014731	GAG	2	6	58387	58392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116874
1025	NC_014731	GAG	2	6	58423	58428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116874
1026	NC_014731	CGC	2	6	58456	58461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116874
1027	NC_014731	GAT	2	6	58471	58476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116874
1028	NC_014731	GAAC	2	8	58489	58496	50 %	0 %	25 %	25 %	313116874
1029	NC_014731	CGA	2	6	58528	58533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1030	NC_014731	GCA	2	6	58554	58559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1031	NC_014731	GCC	2	6	58604	58609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116874
1032	NC_014731	GAA	2	6	58636	58641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116874
1033	NC_014731	CAT	2	6	58648	58653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116874
1034	NC_014731	CAC	2	6	58750	58755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116874
1035	NC_014731	GCG	2	6	58758	58763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116874
1036	NC_014731	GT	3	6	58845	58850	0 %	50 %	50 %	0 %	313116874
1037	NC_014731	GAA	2	6	58864	58869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116874
1038	NC_014731	ACG	2	6	58871	58876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1039	NC_014731	TGA	2	6	58947	58952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116874
1040	NC_014731	GAT	2	6	58969	58974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116874
1041	NC_014731	TCG	2	6	58983	58988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1042	NC_014731	CGA	2	6	59082	59087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1043	NC_014731	CGT	3	9	59136	59144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116874
1044	NC_014731	CAC	2	6	59179	59184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116874
1045	NC_014731	GCT	2	6	59194	59199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1046	NC_014731	GAT	2	6	59222	59227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116875
1047	NC_014731	AGT	2	6	59293	59298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116875
1048	NC_014731	CCG	2	6	59328	59333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1049	NC_014731	CG	3	6	59332	59337	0 %	0 %	50 %	50 %	313116875
1050	NC_014731	TCA	2	6	59338	59343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116875
1051	NC_014731	ATG	2	6	59373	59378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116875
1052	NC_014731	GAC	2	6	59390	59395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1053	NC_014731	GAA	2	6	59396	59401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116875
1054	NC_014731	CGT	2	6	59402	59407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1055	NC_014731	CAG	2	6	59414	59419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1056	NC_014731	CGA	2	6	59464	59469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1057	NC_014731	GCC	2	6	59472	59477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1058	NC_014731	GTC	2	6	59486	59491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1059	NC_014731	ATG	2	6	59556	59561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116875
1060	NC_014731	ATC	2	6	59619	59624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116875
1061	NC_014731	GCG	2	6	59631	59636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116875
1062	NC_014731	TGA	2	6	59638	59643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116875
1063	NC_014731	GAC	3	9	59684	59692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1064	NC_014731	ACC	2	6	59703	59708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116875
1065	NC_014731	GGAA	2	8	59709	59716	50 %	0 %	50 %	0 %	313116875
1066	NC_014731	GCC	2	6	59721	59726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1067	NC_014731	AAGC	2	8	59767	59774	50 %	0 %	25 %	25 %	313116875
1068	NC_014731	GCC	2	6	59820	59825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1069	NC_014731	GAC	2	6	59831	59836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116875
1070	NC_014731	CGC	2	6	59903	59908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1071	NC_014731	CCG	2	6	60065	60070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116875
1072	NC_014731	GCC	2	6	60131	60136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
1073	NC_014731	CCGG	2	8	60328	60335	0 %	0 %	50 %	50 %	313116876
1074	NC_014731	ACCC	2	8	60339	60346	25 %	0 %	0 %	75 %	313116876
1075	NC_014731	CGC	2	6	60423	60428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
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1077	NC_014731	CGAG	2	8	60623	60630	25 %	0 %	50 %	25 %	313116876
1078	NC_014731	AATCG	2	10	60631	60640	40 %	20 %	20 %	20 %	313116876
1079	NC_014731	CGA	2	6	60645	60650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116876
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1081	NC_014731	CGC	2	6	60670	60675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
1082	NC_014731	GCG	2	6	60683	60688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116876
1083	NC_014731	GA	3	6	60743	60748	50 %	0 %	50 %	0 %	313116876
1084	NC_014731	ACGA	2	8	60749	60756	50 %	0 %	25 %	25 %	313116876
1085	NC_014731	GCCGT	2	10	60788	60797	0 %	20 %	40 %	40 %	313116876
1086	NC_014731	CTT	2	6	60879	60884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116876
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1089	NC_014731	GCG	2	6	60974	60979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116876
1090	NC_014731	GTC	2	6	60988	60993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116876
1091	NC_014731	CCG	2	6	61157	61162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
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1093	NC_014731	CCG	2	6	61307	61312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
1094	NC_014731	TGG	2	6	61320	61325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116876
1095	NC_014731	TAC	2	6	61335	61340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116876
1096	NC_014731	CAT	2	6	61341	61346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116876
1097	NC_014731	CGC	2	6	61347	61352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
1098	NC_014731	CCG	2	6	61408	61413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116876
1099	NC_014731	CT	3	6	61577	61582	0 %	50 %	0 %	50 %	313116877
1100	NC_014731	CG	3	6	61584	61589	0 %	0 %	50 %	50 %	313116877
1101	NC_014731	GTCGGC	2	12	61593	61604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313116877
1102	NC_014731	ACG	2	6	61687	61692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1103	NC_014731	CGA	2	6	61712	61717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116877
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1105	NC_014731	ACGT	2	8	61771	61778	25 %	25 %	25 %	25 %	313116877
1106	NC_014731	ACG	2	6	61804	61809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1107	NC_014731	CCG	2	6	61835	61840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116877
1108	NC_014731	TCCG	2	8	61956	61963	0 %	25 %	25 %	50 %	313116877
1109	NC_014731	AAG	2	6	61978	61983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116877
1110	NC_014731	CGA	2	6	62012	62017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1111	NC_014731	TCG	2	6	62024	62029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1112	NC_014731	GTA	2	6	62034	62039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116877
1113	NC_014731	GCT	2	6	62060	62065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1114	NC_014731	CGT	2	6	62075	62080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1115	NC_014731	CGTG	2	8	62126	62133	0 %	25 %	50 %	25 %	313116877
1116	NC_014731	GTG	2	6	62143	62148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116877
1117	NC_014731	TGC	2	6	62158	62163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1118	NC_014731	TCG	2	6	62189	62194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
1119	NC_014731	ACGG	2	8	62242	62249	25 %	0 %	50 %	25 %	313116877
1120	NC_014731	GTT	3	9	62282	62290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116877
1121	NC_014731	AG	3	6	62298	62303	50 %	0 %	50 %	0 %	313116877
1122	NC_014731	T	6	6	62313	62318	0 %	100 %	0 %	0 %	313116877
1123	NC_014731	CAT	2	6	62340	62345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116877
1124	NC_014731	TGT	2	6	62420	62425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116877
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1126	NC_014731	GTC	2	6	62514	62519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116877
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1248	NC_014731	CGC	2	6	67328	67333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116883
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1360	NC_014731	CG	3	6	72401	72406	0 %	0 %	50 %	50 %	313116887
1361	NC_014731	CCGC	2	8	72418	72425	0 %	0 %	25 %	75 %	313116887
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1364	NC_014731	GTC	2	6	72539	72544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116887
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1367	NC_014731	CGC	2	6	72680	72685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116888
1368	NC_014731	CGT	2	6	72722	72727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116888
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1496	NC_014731	TCG	2	6	78596	78601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116893
1497	NC_014731	CAGT	2	8	78602	78609	25 %	25 %	25 %	25 %	313116893
1498	NC_014731	TCG	2	6	78631	78636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116893
1499	NC_014731	CGA	2	6	78641	78646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116893
1500	NC_014731	CCG	2	6	78670	78675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116893

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