MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 6305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014731	GCC	2	6	26822	26827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116845
502	NC_014731	GACG	2	8	26839	26846	25 %	0 %	50 %	25 %	313116845
503	NC_014731	CGA	2	6	26994	26999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116846
504	NC_014731	GGC	2	6	27009	27014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116846
505	NC_014731	CCG	2	6	27020	27025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116846
506	NC_014731	CGA	2	6	27084	27089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116846
507	NC_014731	CCA	2	6	27128	27133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116846
508	NC_014731	CGA	2	6	27159	27164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116846
509	NC_014731	CGG	2	6	27322	27327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116846
510	NC_014731	GACGG	2	10	27350	27359	20 %	0 %	60 %	20 %	313116846
511	NC_014731	TTCGGT	2	12	27374	27385	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313116846
512	NC_014731	ATG	2	6	27393	27398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116846
513	NC_014731	TGGC	2	8	27488	27495	0 %	25 %	50 %	25 %	313116846
514	NC_014731	GC	3	6	27523	27528	0 %	0 %	50 %	50 %	313116846
515	NC_014731	GGT	2	6	27545	27550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116846
516	NC_014731	CCA	2	6	27567	27572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116846
517	NC_014731	CGG	2	6	27583	27588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116846
518	NC_014731	GCT	2	6	27609	27614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116846
519	NC_014731	CGA	2	6	27646	27651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116846
520	NC_014731	GTG	2	6	27661	27666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116846
521	NC_014731	TCG	2	6	28121	28126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116847
522	NC_014731	CGA	2	6	28161	28166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116847
523	NC_014731	TGG	2	6	28171	28176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116847
524	NC_014731	ACA	2	6	28187	28192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116847
525	NC_014731	CTCAG	2	10	28237	28246	20 %	20 %	20 %	40 %	313116847
526	NC_014731	ACG	2	6	28256	28261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116847
527	NC_014731	AAC	2	6	28307	28312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116847
528	NC_014731	CGT	2	6	28377	28382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116847
529	NC_014731	CGC	2	6	28383	28388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116847
530	NC_014731	CGA	2	6	28425	28430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116847
531	NC_014731	TCGAA	2	10	28484	28493	40 %	20 %	20 %	20 %	313116847
532	NC_014731	ACT	2	6	28502	28507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116847
533	NC_014731	AAC	2	6	28516	28521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116847
534	NC_014731	CGG	2	6	28662	28667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116847
535	NC_014731	CCA	2	6	28697	28702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116847
536	NC_014731	GCG	2	6	28709	28714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116847
537	NC_014731	GCG	2	6	28730	28735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116847
538	NC_014731	TGAC	2	8	28808	28815	25 %	25 %	25 %	25 %	313116847
539	NC_014731	TGA	2	6	28971	28976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116847
540	NC_014731	AAC	2	6	29029	29034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116847
541	NC_014731	TGC	2	6	29647	29652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116848
542	NC_014731	TC	3	6	29665	29670	0 %	50 %	0 %	50 %	313116848
543	NC_014731	TGA	2	6	30437	30442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116849
544	NC_014731	CTC	2	6	30474	30479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116849
545	NC_014731	CAT	2	6	30488	30493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116849
546	NC_014731	TCG	2	6	30520	30525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
547	NC_014731	GCC	2	6	30588	30593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
548	NC_014731	CGT	2	6	30641	30646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
549	NC_014731	CGA	2	6	30662	30667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116849
550	NC_014731	ATC	2	6	30709	30714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116849
551	NC_014731	GAG	2	6	30738	30743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116849
552	NC_014731	GAACG	2	10	30765	30774	40 %	0 %	40 %	20 %	313116849
553	NC_014731	TTC	2	6	30777	30782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116849
554	NC_014731	TTG	2	6	30796	30801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116849
555	NC_014731	CGC	2	6	30852	30857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
556	NC_014731	GAA	2	6	30858	30863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313116849
557	NC_014731	TCG	2	6	30913	30918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
558	NC_014731	TGC	2	6	31014	31019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
559	NC_014731	GTA	2	6	31044	31049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116849
560	NC_014731	CCG	2	6	31060	31065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
561	NC_014731	TTCGA	2	10	31105	31114	20 %	40 %	20 %	20 %	313116849
562	NC_014731	TCG	2	6	31129	31134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
563	NC_014731	CTT	2	6	31149	31154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116849
564	NC_014731	CGT	2	6	31193	31198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
565	NC_014731	CCT	2	6	31205	31210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116849
566	NC_014731	GTA	2	6	31287	31292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116849
567	NC_014731	GGC	2	6	31314	31319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116849
568	NC_014731	TCCA	2	8	31357	31364	25 %	25 %	0 %	50 %	313116849
569	NC_014731	CCG	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
570	NC_014731	ACG	2	6	31442	31447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116849
571	NC_014731	TCG	2	6	31469	31474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
572	NC_014731	CAC	2	6	31505	31510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313116849
573	NC_014731	CCG	2	6	31540	31545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
574	NC_014731	GCC	2	6	31557	31562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116849
575	NC_014731	ATC	2	6	31567	31572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116849
576	NC_014731	TC	4	8	31571	31578	0 %	50 %	0 %	50 %	313116849
577	NC_014731	CTG	2	6	31607	31612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116849
578	NC_014731	TCC	2	6	31778	31783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116850
579	NC_014731	CGT	2	6	31794	31799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
580	NC_014731	TCG	3	9	31834	31842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
581	NC_014731	AGG	2	6	31852	31857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116850
582	NC_014731	TCG	2	6	31864	31869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
583	NC_014731	CGA	2	6	31903	31908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116850
584	NC_014731	GTC	2	6	32001	32006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
585	NC_014731	TCG	2	6	32047	32052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
586	NC_014731	G	6	6	32099	32104	0 %	0 %	100 %	0 %	313116850
587	NC_014731	CTT	2	6	32108	32113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313116850
588	NC_014731	AGT	2	6	32146	32151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116850
589	NC_014731	GTCC	2	8	32245	32252	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
590	NC_014731	GTCGGC	2	12	32253	32264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	313116850
591	NC_014731	TCG	2	6	32326	32331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
592	NC_014731	GTGG	2	8	32361	32368	0 %	25 %	75 %	0 %	313116850
593	NC_014731	GCC	2	6	32371	32376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116850
594	NC_014731	CTC	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116850
595	NC_014731	TCCG	2	8	32434	32441	0 %	25 %	25 %	50 %	313116850
596	NC_014731	TGA	2	6	32580	32585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116850
597	NC_014731	TCC	2	6	32658	32663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313116850
598	NC_014731	CGA	2	6	32666	32671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116850
599	NC_014731	GAC	2	6	32673	32678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116850
600	NC_014731	GTC	2	6	32692	32697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116850
601	NC_014731	GGC	2	6	32761	32766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116851
602	NC_014731	GGA	2	6	32817	32822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116851
603	NC_014731	CGA	2	6	32852	32857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116851
604	NC_014731	GTC	2	6	32883	32888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116851
605	NC_014731	CTG	2	6	32901	32906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116851
606	NC_014731	CAA	2	6	33212	33217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116852
607	NC_014731	GGA	2	6	33236	33241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116852
608	NC_014731	CTG	2	6	33245	33250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116852
609	NC_014731	ATC	2	6	33255	33260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313116852
610	NC_014731	CTG	2	6	33384	33389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116852
611	NC_014731	TC	3	6	33455	33460	0 %	50 %	0 %	50 %	313116852
612	NC_014731	C	6	6	33485	33490	0 %	0 %	0 %	100 %	313116852
613	NC_014731	CGTC	2	8	33554	33561	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
614	NC_014731	GCC	2	6	33631	33636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313116852
615	NC_014731	TCG	2	6	33671	33676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116852
616	NC_014731	TGC	2	6	33715	33720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116852
617	NC_014731	CGA	2	6	33728	33733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116852
618	NC_014731	CGA	3	9	33791	33799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116852
619	NC_014731	CTGC	2	8	33800	33807	0 %	25 %	25 %	50 %	313116852
620	NC_014731	ACGA	2	8	33903	33910	50 %	0 %	25 %	25 %	313116852
621	NC_014731	TGT	2	6	34026	34031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313116852
622	NC_014731	CAA	3	9	34046	34054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313116852
623	NC_014731	CGA	2	6	34124	34129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313116852
624	NC_014731	GGT	2	6	34134	34139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313116852
625	NC_014731	GGC	2	6	34164	34169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313116852
626	NC_014731	TGA	2	6	34187	34192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116852
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631	NC_014731	GAG	2	6	34475	34480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313116853
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641	NC_014731	GAT	2	6	34799	34804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313116853
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751	NC_014731	GCT	2	6	41100	41105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313116859
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