MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 6305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014731	GGTG	2	8	315172	315179	0 %	25 %	75 %	0 %	313117110
6002	NC_014731	GCTG	2	8	315238	315245	0 %	25 %	50 %	25 %	313117110
6003	NC_014731	ACT	2	6	315270	315275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117110
6004	NC_014731	GAGC	2	8	315361	315368	25 %	0 %	50 %	25 %	313117110
6005	NC_014731	CGA	2	6	315454	315459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6006	NC_014731	CGA	2	6	315463	315468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6007	NC_014731	GAC	2	6	315494	315499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6008	NC_014731	CTCG	2	8	315507	315514	0 %	25 %	25 %	50 %	313117110
6009	NC_014731	TTC	2	6	315515	315520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117110
6010	NC_014731	TTC	2	6	315620	315625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117110
6011	NC_014731	ACC	2	6	315657	315662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117110
6012	NC_014731	GTC	2	6	315668	315673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6013	NC_014731	CGA	2	6	315676	315681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6014	NC_014731	GAG	2	6	315836	315841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117110
6015	NC_014731	GAC	2	6	315899	315904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6016	NC_014731	GAG	2	6	315911	315916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117110
6017	NC_014731	GTG	2	6	315923	315928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117110
6018	NC_014731	ACGA	2	8	316072	316079	50 %	0 %	25 %	25 %	313117110
6019	NC_014731	GCCG	2	8	316142	316149	0 %	0 %	50 %	50 %	313117110
6020	NC_014731	AAG	2	6	316211	316216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117110
6021	NC_014731	GTC	2	6	316222	316227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6022	NC_014731	CGA	2	6	316270	316275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6023	NC_014731	CG	3	6	316326	316331	0 %	0 %	50 %	50 %	313117110
6024	NC_014731	CTT	2	6	316400	316405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117110
6025	NC_014731	CAA	2	6	316407	316412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117110
6026	NC_014731	TCG	2	6	316569	316574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6027	NC_014731	AAGA	2	8	316629	316636	75 %	0 %	25 %	0 %	313117110
6028	NC_014731	TCA	2	6	316665	316670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117110
6029	NC_014731	GAT	2	6	316675	316680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117110
6030	NC_014731	GAC	2	6	316694	316699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6031	NC_014731	GAACGG	2	12	316706	316717	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313117110
6032	NC_014731	GGA	2	6	316729	316734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117110
6033	NC_014731	GAA	2	6	316741	316746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117110
6034	NC_014731	ACG	2	6	316760	316765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117110
6035	NC_014731	CCGA	2	8	316778	316785	25 %	0 %	25 %	50 %	313117110
6036	NC_014731	ATC	2	6	316961	316966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117110
6037	NC_014731	CGTG	2	8	316972	316979	0 %	25 %	50 %	25 %	313117110
6038	NC_014731	AC	3	6	316981	316986	50 %	0 %	0 %	50 %	313117110
6039	NC_014731	AG	3	6	316996	317001	50 %	0 %	50 %	0 %	313117110
6040	NC_014731	CAACT	2	10	317018	317027	40 %	20 %	0 %	40 %	313117110
6041	NC_014731	TCAG	2	8	317042	317049	25 %	25 %	25 %	25 %	313117110
6042	NC_014731	CGG	2	6	317451	317456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117111
6043	NC_014731	GCTTG	2	10	317463	317472	0 %	40 %	40 %	20 %	313117111
6044	NC_014731	TG	3	6	317553	317558	0 %	50 %	50 %	0 %	313117111
6045	NC_014731	CCATC	2	10	317664	317673	20 %	20 %	0 %	60 %	313117111
6046	NC_014731	TCG	2	6	317682	317687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6047	NC_014731	CAG	3	9	317689	317697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6048	NC_014731	CTC	2	6	317710	317715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117111
6049	NC_014731	AG	3	6	317728	317733	50 %	0 %	50 %	0 %	313117111
6050	NC_014731	TCC	2	6	317756	317761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117111
6051	NC_014731	TCG	2	6	317810	317815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6052	NC_014731	GAC	2	6	317821	317826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6053	NC_014731	GCC	2	6	317827	317832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117111
6054	NC_014731	TGC	2	6	317837	317842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6055	NC_014731	TGA	2	6	317862	317867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117111
6056	NC_014731	CGA	2	6	317919	317924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6057	NC_014731	TCCCCG	2	12	317970	317981	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	313117111
6058	NC_014731	AGG	2	6	317996	318001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117111
6059	NC_014731	TGA	2	6	318060	318065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117111
6060	NC_014731	TCC	2	6	318080	318085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117111
6061	NC_014731	CGT	2	6	318090	318095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6062	NC_014731	CGAAC	2	10	318114	318123	40 %	0 %	20 %	40 %	313117111
6063	NC_014731	CTC	2	6	318133	318138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117111
6064	NC_014731	TCT	2	6	318221	318226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117111
6065	NC_014731	CTT	2	6	318237	318242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117111
6066	NC_014731	CTG	2	6	318250	318255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6067	NC_014731	GTGGTT	2	12	318322	318333	0 %	50 %	50 %	0 %	313117111
6068	NC_014731	TC	3	6	318399	318404	0 %	50 %	0 %	50 %	313117111
6069	NC_014731	GTGGAA	2	12	318410	318421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313117111
6070	NC_014731	TCC	2	6	318490	318495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313117111
6071	NC_014731	TGC	2	6	318583	318588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6072	NC_014731	TAG	2	6	318790	318795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117111
6073	NC_014731	TGC	2	6	318813	318818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6074	NC_014731	CAG	2	6	318829	318834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117111
6075	NC_014731	GAT	2	6	319495	319500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117112
6076	NC_014731	ATCC	2	8	319522	319529	25 %	25 %	0 %	50 %	313117112
6077	NC_014731	CAGC	2	8	319540	319547	25 %	0 %	25 %	50 %	313117112
6078	NC_014731	CGA	2	6	319617	319622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117112
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6080	NC_014731	GTA	2	6	319714	319719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117112
6081	NC_014731	TCA	2	6	319826	319831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117112
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6083	NC_014731	TTC	2	6	319861	319866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313117112
6084	NC_014731	CGTG	2	8	319914	319921	0 %	25 %	50 %	25 %	313117112
6085	NC_014731	GAC	2	6	319949	319954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117112
6086	NC_014731	GTC	2	6	319984	319989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117112
6087	NC_014731	GTT	2	6	320044	320049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117112
6088	NC_014731	CAC	2	6	320052	320057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117112
6089	NC_014731	TCG	2	6	320127	320132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117112
6090	NC_014731	CCA	2	6	320169	320174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117112
6091	NC_014731	AGG	2	6	320216	320221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117112
6092	NC_014731	TAGA	2	8	320230	320237	50 %	25 %	25 %	0 %	313117112
6093	NC_014731	GAA	2	6	320296	320301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313117112
6094	NC_014731	GAT	2	6	320392	320397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313117112
6095	NC_014731	GTC	2	6	320434	320439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117112
6096	NC_014731	CCCG	2	8	320445	320452	0 %	0 %	25 %	75 %	313117112
6097	NC_014731	GA	4	8	320509	320516	50 %	0 %	50 %	0 %	313117112
6098	NC_014731	GACTG	2	10	320523	320532	20 %	20 %	40 %	20 %	313117112
6099	NC_014731	GAG	2	6	320551	320556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313117112
6100	NC_014731	GTT	2	6	320683	320688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313117112
6101	NC_014731	CGA	2	6	320964	320969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117113
6102	NC_014731	GTTC	2	8	320991	320998	0 %	50 %	25 %	25 %	313117113
6103	NC_014731	CGG	2	6	321010	321015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117113
6104	NC_014731	CCA	2	6	321039	321044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313117113
6105	NC_014731	GCT	2	6	321049	321054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117113
6106	NC_014731	GCATGC	2	12	321087	321098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313117113
6107	NC_014731	TC	3	6	321336	321341	0 %	50 %	0 %	50 %	313117114
6108	NC_014731	GGC	2	6	321393	321398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117114
6109	NC_014731	CAT	2	6	321408	321413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117114
6110	NC_014731	CGA	2	6	321414	321419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117114
6111	NC_014731	CGG	2	6	321435	321440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313117114
6112	NC_014731	CGA	2	6	321455	321460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117114
6113	NC_014731	GACG	2	8	321534	321541	25 %	0 %	50 %	25 %	313117114
6114	NC_014731	TCA	2	6	321608	321613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117114
6115	NC_014731	ACCGAA	2	12	321622	321633	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313117114
6116	NC_014731	AAC	2	6	321673	321678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313117114
6117	NC_014731	CCG	2	6	321680	321685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313117114
6118	NC_014731	ACT	2	6	321717	321722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117114
6119	NC_014731	TCA	2	6	321773	321778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117114
6120	NC_014731	GAC	3	9	321793	321801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117114
6121	NC_014731	GCA	2	6	321940	321945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117114
6122	NC_014731	AC	3	6	322061	322066	50 %	0 %	0 %	50 %	313117115
6123	NC_014731	CGAT	2	8	322087	322094	25 %	25 %	25 %	25 %	313117115
6124	NC_014731	TCG	2	6	322117	322122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117115
6125	NC_014731	TCG	2	6	322138	322143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117115
6126	NC_014731	GTTCG	2	10	322149	322158	0 %	40 %	40 %	20 %	313117115
6127	NC_014731	GC	3	6	322195	322200	0 %	0 %	50 %	50 %	313117115
6128	NC_014731	CGA	2	6	322247	322252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117115
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6131	NC_014731	CGGA	2	8	322428	322435	25 %	0 %	50 %	25 %	313117115
6132	NC_014731	AAATC	2	10	322477	322486	60 %	20 %	0 %	20 %	313117115
6133	NC_014731	GTG	2	6	322608	322613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313117115
6134	NC_014731	ACT	2	6	322673	322678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117115
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6141	NC_014731	GAC	2	6	323052	323057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313117116
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6153	NC_014731	TGC	2	6	323632	323637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117117
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6230	NC_014731	TA	3	6	332371	332376	50 %	50 %	0 %	0 %	313117125
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6233	NC_014731	TCG	2	6	332559	332564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117125
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6237	NC_014731	TCG	2	6	332911	332916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313117126
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6240	NC_014731	TCA	2	6	333040	333045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313117126
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