MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 1816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	CGACG	2	10	1339	1348	20 %	0 %	40 %	40 %	313124790
2	NC_014729	GAACG	2	10	1406	1415	40 %	0 %	40 %	20 %	313124790
3	NC_014729	TCGGG	2	10	4462	4471	0 %	20 %	60 %	20 %	313124795
4	NC_014729	AACTC	2	10	4838	4847	40 %	20 %	0 %	40 %	313124796
5	NC_014729	AACGC	2	10	5660	5669	40 %	0 %	20 %	40 %	313124797
6	NC_014729	CACGG	2	10	9732	9741	20 %	0 %	40 %	40 %	313124801
7	NC_014729	GTCGT	2	10	12209	12218	0 %	40 %	40 %	20 %	313124806
8	NC_014729	TCGAA	2	10	13868	13877	40 %	20 %	20 %	20 %	313124807
9	NC_014729	CGCAC	2	10	15928	15937	20 %	0 %	20 %	60 %	313124811
10	NC_014729	GCGCG	2	10	18119	18128	0 %	0 %	60 %	40 %	313124814
11	NC_014729	GAGGT	2	10	18285	18294	20 %	20 %	60 %	0 %	313124814
12	NC_014729	GACTG	2	10	19324	19333	20 %	20 %	40 %	20 %	313124815
13	NC_014729	CTGTT	2	10	20709	20718	0 %	60 %	20 %	20 %	313124819
14	NC_014729	CGTTC	2	10	24219	24228	0 %	40 %	20 %	40 %	313124821
15	NC_014729	AAGCA	2	10	25476	25485	60 %	0 %	20 %	20 %	313124823
16	NC_014729	CACCG	2	10	26405	26414	20 %	0 %	20 %	60 %	313124824
17	NC_014729	TGACT	2	10	27300	27309	20 %	40 %	20 %	20 %	313124824
18	NC_014729	AACGC	2	10	28157	28166	40 %	0 %	20 %	40 %	313124825
19	NC_014729	CAGAC	2	10	30305	30314	40 %	0 %	20 %	40 %	313124827
20	NC_014729	CCCGA	2	10	32725	32734	20 %	0 %	20 %	60 %	313124828
21	NC_014729	GGCGG	2	10	38322	38331	0 %	0 %	80 %	20 %	313124833
22	NC_014729	GTGAC	2	10	41357	41366	20 %	20 %	40 %	20 %	313124838
23	NC_014729	CGAGT	2	10	42752	42761	20 %	20 %	40 %	20 %	313124840
24	NC_014729	GGCCC	2	10	44303	44312	0 %	0 %	40 %	60 %	313124841
25	NC_014729	CATCG	2	10	45045	45054	20 %	20 %	20 %	40 %	313124843
26	NC_014729	CTCGC	2	10	46684	46693	0 %	20 %	20 %	60 %	313124845
27	NC_014729	TCAGT	2	10	49075	49084	20 %	40 %	20 %	20 %	313124847
28	NC_014729	CGAGA	2	10	49339	49348	40 %	0 %	40 %	20 %	313124847
29	NC_014729	CGCTC	2	10	50948	50957	0 %	20 %	20 %	60 %	313124848
30	NC_014729	CGGAT	2	10	52708	52717	20 %	20 %	40 %	20 %	313124849
31	NC_014729	CCGTC	2	10	56847	56856	0 %	20 %	20 %	60 %	313124855
32	NC_014729	GCCTC	2	10	63815	63824	0 %	20 %	20 %	60 %	313124860
33	NC_014729	CGGTC	2	10	68743	68752	0 %	20 %	40 %	40 %	313124864
34	NC_014729	CCGGA	2	10	69593	69602	20 %	0 %	40 %	40 %	313124865
35	NC_014729	GCGAC	2	10	70739	70748	20 %	0 %	40 %	40 %	313124866
36	NC_014729	CGACG	3	15	71833	71847	20 %	0 %	40 %	40 %	313124867
37	NC_014729	AGCGA	2	10	73155	73164	40 %	0 %	40 %	20 %	313124869
38	NC_014729	GACGT	2	10	78241	78250	20 %	20 %	40 %	20 %	313124875
39	NC_014729	CGGTG	2	10	79948	79957	0 %	20 %	60 %	20 %	313124877
40	NC_014729	CAGCG	2	10	83184	83193	20 %	0 %	40 %	40 %	313124880
41	NC_014729	CCGTC	2	10	87595	87604	0 %	20 %	20 %	60 %	313124886
42	NC_014729	CGGAC	2	10	89547	89556	20 %	0 %	40 %	40 %	313124888
43	NC_014729	GCCGC	2	10	90277	90286	0 %	0 %	40 %	60 %	313124889
44	NC_014729	TCACG	2	10	93189	93198	20 %	20 %	20 %	40 %	313124893
45	NC_014729	TGCGA	2	10	93684	93693	20 %	20 %	40 %	20 %	313124895
46	NC_014729	CGTCG	2	10	95386	95395	0 %	20 %	40 %	40 %	313124897
47	NC_014729	TGACG	2	10	97996	98005	20 %	20 %	40 %	20 %	313124900
48	NC_014729	GGGTC	2	10	99739	99748	0 %	20 %	60 %	20 %	313124902
49	NC_014729	AACGA	2	10	101035	101044	60 %	0 %	20 %	20 %	313124903
50	NC_014729	CGAGT	2	10	101351	101360	20 %	20 %	40 %	20 %	313124903
51	NC_014729	TCGAG	2	10	102060	102069	20 %	20 %	40 %	20 %	313124904
52	NC_014729	TCACG	2	10	102510	102519	20 %	20 %	20 %	40 %	313124905
53	NC_014729	TCGTC	2	10	106182	106191	0 %	40 %	20 %	40 %	313124909
54	NC_014729	CGAAC	2	10	106617	106626	40 %	0 %	20 %	40 %	313124909
55	NC_014729	CTCGA	2	10	110827	110836	20 %	20 %	20 %	40 %	313124915
56	NC_014729	CGACG	2	10	111195	111204	20 %	0 %	40 %	40 %	313124915
57	NC_014729	TGCGT	2	10	111837	111846	0 %	40 %	40 %	20 %	313124916
58	NC_014729	TGGTC	2	10	111929	111938	0 %	40 %	40 %	20 %	313124916
59	NC_014729	AGTCG	2	10	113413	113422	20 %	20 %	40 %	20 %	313124919
60	NC_014729	GGCGA	2	10	113435	113444	20 %	0 %	60 %	20 %	313124919
61	NC_014729	GCGAT	2	10	114166	114175	20 %	20 %	40 %	20 %	313124920
62	NC_014729	GGCAG	2	10	115593	115602	20 %	0 %	60 %	20 %	313124922
63	NC_014729	CACGT	2	10	116395	116404	20 %	20 %	20 %	40 %	313124922
64	NC_014729	GACGC	2	10	117187	117196	20 %	0 %	40 %	40 %	313124923
65	NC_014729	CCAAC	2	10	120607	120616	40 %	0 %	0 %	60 %	313124928
66	NC_014729	GACGG	2	10	122245	122254	20 %	0 %	60 %	20 %	313124929
67	NC_014729	CGGTC	2	10	122614	122623	0 %	20 %	40 %	40 %	313124929
68	NC_014729	GCCGG	2	10	123411	123420	0 %	0 %	60 %	40 %	313124930
69	NC_014729	GAACG	2	10	126953	126962	40 %	0 %	40 %	20 %	313124933
70	NC_014729	TCCGA	2	10	127495	127504	20 %	20 %	20 %	40 %	313124933
71	NC_014729	ATCCG	2	10	128667	128676	20 %	20 %	20 %	40 %	313124934
72	NC_014729	CGGCG	2	10	135139	135148	0 %	0 %	60 %	40 %	313124944
73	NC_014729	TCAGG	2	10	136658	136667	20 %	20 %	40 %	20 %	313124946
74	NC_014729	TCGCC	2	10	139307	139316	0 %	20 %	20 %	60 %	313124946
75	NC_014729	TCCGT	2	10	139561	139570	0 %	40 %	20 %	40 %	313124946
76	NC_014729	CCGAC	2	10	146164	146173	20 %	0 %	20 %	60 %	313124954
77	NC_014729	ACCGT	2	10	146632	146641	20 %	20 %	20 %	40 %	313124955
78	NC_014729	CGGTG	2	10	151269	151278	0 %	20 %	60 %	20 %	313124957
79	NC_014729	ACCCA	2	10	151529	151538	40 %	0 %	0 %	60 %	313124957
80	NC_014729	CGAAA	2	10	152961	152970	60 %	0 %	20 %	20 %	313124959
81	NC_014729	CCGAA	2	10	153856	153865	40 %	0 %	20 %	40 %	313124960
82	NC_014729	AAGAC	2	10	159722	159731	60 %	0 %	20 %	20 %	313124967
83	NC_014729	GGCGA	2	10	160693	160702	20 %	0 %	60 %	20 %	313124967
84	NC_014729	GTTCG	2	10	160793	160802	0 %	40 %	40 %	20 %	313124967
85	NC_014729	ACCCG	2	10	162315	162324	20 %	0 %	20 %	60 %	313124968
86	NC_014729	GAACA	2	10	169864	169873	60 %	0 %	20 %	20 %	313124977
87	NC_014729	CGATC	2	10	171981	171990	20 %	20 %	20 %	40 %	313124979
88	NC_014729	CGAGA	2	10	174696	174705	40 %	0 %	40 %	20 %	313124981
89	NC_014729	TCTCA	2	10	175137	175146	20 %	40 %	0 %	40 %	313124982
90	NC_014729	TCCGT	2	10	175512	175521	0 %	40 %	20 %	40 %	313124982
91	NC_014729	CGAGA	2	10	177224	177233	40 %	0 %	40 %	20 %	313124983
92	NC_014729	CGACG	2	10	179703	179712	20 %	0 %	40 %	40 %	313124986
93	NC_014729	CATCG	2	10	181603	181612	20 %	20 %	20 %	40 %	313124987
94	NC_014729	TCGAC	2	10	182166	182175	20 %	20 %	20 %	40 %	313124987
95	NC_014729	GTTCG	2	10	183494	183503	0 %	40 %	40 %	20 %	313124989
96	NC_014729	TGGCG	2	10	186105	186114	0 %	20 %	60 %	20 %	313124993
97	NC_014729	GGACT	2	10	188048	188057	20 %	20 %	40 %	20 %	313124994
98	NC_014729	TGGTC	2	10	188238	188247	0 %	40 %	40 %	20 %	313124994
99	NC_014729	CCAGT	2	10	189652	189661	20 %	20 %	20 %	40 %	313124996
100	NC_014729	ACCGA	2	10	191480	191489	40 %	0 %	20 %	40 %	313124997
101	NC_014729	GTGCG	2	10	193150	193159	0 %	20 %	60 %	20 %	313124998
102	NC_014729	TCTGT	2	10	193689	193698	0 %	60 %	20 %	20 %	313124998
103	NC_014729	CGTCG	2	10	195687	195696	0 %	20 %	40 %	40 %	313125000
104	NC_014729	GTCGC	2	10	195763	195772	0 %	20 %	40 %	40 %	313125000
105	NC_014729	CCGAG	2	10	197027	197036	20 %	0 %	40 %	40 %	313125001
106	NC_014729	CGACG	2	10	198642	198651	20 %	0 %	40 %	40 %	313125003
107	NC_014729	TGCAG	2	10	199934	199943	20 %	20 %	40 %	20 %	313125004
108	NC_014729	GTTCG	2	10	200140	200149	0 %	40 %	40 %	20 %	313125004
109	NC_014729	CGTCT	2	10	202779	202788	0 %	40 %	20 %	40 %	313125007
110	NC_014729	ACGTC	2	10	204571	204580	20 %	20 %	20 %	40 %	313125008
111	NC_014729	ACGCG	2	10	206239	206248	20 %	0 %	40 %	40 %	313125011
112	NC_014729	GAATC	2	10	206530	206539	40 %	20 %	20 %	20 %	313125011
113	NC_014729	GGATT	2	10	207911	207920	20 %	40 %	40 %	0 %	313125011
114	NC_014729	ACTCG	2	10	208054	208063	20 %	20 %	20 %	40 %	313125011
115	NC_014729	ATCGG	2	10	208616	208625	20 %	20 %	40 %	20 %	313125011
116	NC_014729	TCGAA	2	10	209361	209370	40 %	20 %	20 %	20 %	313125013
117	NC_014729	AGTCG	2	10	209698	209707	20 %	20 %	40 %	20 %	313125014
118	NC_014729	GTTTC	2	10	209798	209807	0 %	60 %	20 %	20 %	313125014
119	NC_014729	CGACT	2	10	210761	210770	20 %	20 %	20 %	40 %	313125015
120	NC_014729	CCGAC	2	10	213930	213939	20 %	0 %	20 %	60 %	313125018
121	NC_014729	CTCGT	2	10	214228	214237	0 %	40 %	20 %	40 %	313125019
122	NC_014729	ACGCG	2	10	215096	215105	20 %	0 %	40 %	40 %	313125019
123	NC_014729	GTCGA	2	10	217669	217678	20 %	20 %	40 %	20 %	313125021
124	NC_014729	TGGTC	2	10	217770	217779	0 %	40 %	40 %	20 %	313125021
125	NC_014729	CGGCG	2	10	219654	219663	0 %	0 %	60 %	40 %	313125024
126	NC_014729	GTAGG	2	10	220284	220293	20 %	20 %	60 %	0 %	313125024
127	NC_014729	GACTC	2	10	224274	224283	20 %	20 %	20 %	40 %	313125027
128	NC_014729	AACCG	2	10	226766	226775	40 %	0 %	20 %	40 %	313125028
129	NC_014729	GGCAA	2	10	228689	228698	40 %	0 %	40 %	20 %	313125030
130	NC_014729	GACGC	2	10	229176	229185	20 %	0 %	40 %	40 %	313125030
131	NC_014729	CTTCT	2	10	230060	230069	0 %	60 %	0 %	40 %	313125031
132	NC_014729	CGGCG	2	10	230441	230450	0 %	0 %	60 %	40 %	313125032
133	NC_014729	AGTCG	2	10	231068	231077	20 %	20 %	40 %	20 %	313125032
134	NC_014729	ATCGA	2	10	236606	236615	40 %	20 %	20 %	20 %	313125039
135	NC_014729	CGATC	2	10	237046	237055	20 %	20 %	20 %	40 %	313125039
136	NC_014729	GCCGA	2	10	238116	238125	20 %	0 %	40 %	40 %	313125041
137	NC_014729	ACCGC	2	10	238257	238266	20 %	0 %	20 %	60 %	313125041
138	NC_014729	TCGGT	2	10	238656	238665	0 %	40 %	40 %	20 %	313125042
139	NC_014729	CGAAC	2	10	239905	239914	40 %	0 %	20 %	40 %	313125042
140	NC_014729	CGTCG	2	10	240804	240813	0 %	20 %	40 %	40 %	313125043
141	NC_014729	CTGTG	2	10	242699	242708	0 %	40 %	40 %	20 %	313125045
142	NC_014729	GTTGG	2	10	242778	242787	0 %	40 %	60 %	0 %	313125045
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147	NC_014729	TCGAT	2	10	251406	251415	20 %	40 %	20 %	20 %	313125054
148	NC_014729	TCGGT	2	10	252497	252506	0 %	40 %	40 %	20 %	313125055
149	NC_014729	ATCCT	2	10	255011	255020	20 %	40 %	0 %	40 %	313125059
150	NC_014729	GTTCG	2	10	258763	258772	0 %	40 %	40 %	20 %	313125063
151	NC_014729	CCGCG	2	10	261294	261303	0 %	0 %	40 %	60 %	313125066
152	NC_014729	GAGAT	2	10	270079	270088	40 %	20 %	40 %	0 %	313125075
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155	NC_014729	TCGTG	2	10	276392	276401	0 %	40 %	40 %	20 %	313125081
156	NC_014729	GTTCG	2	10	276987	276996	0 %	40 %	40 %	20 %	313125082
157	NC_014729	TCCTG	2	10	277774	277783	0 %	40 %	20 %	40 %	313125082
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166	NC_014729	TGGAC	2	10	290568	290577	20 %	20 %	40 %	20 %	313125093
167	NC_014729	CGGCG	2	10	290794	290803	0 %	0 %	60 %	40 %	313125093
168	NC_014729	CCTCG	2	10	294863	294872	0 %	20 %	20 %	60 %	313125096
169	NC_014729	CGAAG	2	10	296135	296144	40 %	0 %	40 %	20 %	313125097
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172	NC_014729	CCGTC	2	10	309244	309253	0 %	20 %	20 %	60 %	313125103
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243	NC_014729	CTCGA	2	10	414990	414999	20 %	20 %	20 %	40 %	313125215
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246	NC_014729	CGGTG	2	10	417082	417091	0 %	20 %	60 %	20 %	313125219
247	NC_014729	AGTCC	2	10	417594	417603	20 %	20 %	20 %	40 %	313125220
248	NC_014729	GACGA	2	10	421510	421519	40 %	0 %	40 %	20 %	313125224
249	NC_014729	GCGAG	2	10	422643	422652	20 %	0 %	60 %	20 %	313125225
250	NC_014729	GTGCC	2	10	424222	424231	0 %	20 %	40 %	40 %	313125226
251	NC_014729	GTGAC	2	10	426081	426090	20 %	20 %	40 %	20 %	313125229
252	NC_014729	GCCGC	2	10	427202	427211	0 %	0 %	40 %	60 %	313125230
253	NC_014729	GCGTC	2	10	429548	429557	0 %	20 %	40 %	40 %	313125233
254	NC_014729	TGCGG	2	10	433998	434007	0 %	20 %	60 %	20 %	313125238
255	NC_014729	AACGG	2	10	434560	434569	40 %	0 %	40 %	20 %	313125239
256	NC_014729	CTCGT	2	10	435118	435127	0 %	40 %	20 %	40 %	313125239
257	NC_014729	ACCGC	2	10	435510	435519	20 %	0 %	20 %	60 %	313125239
258	NC_014729	ACCGA	2	10	442080	442089	40 %	0 %	20 %	40 %	313125246
259	NC_014729	AGACG	2	10	442713	442722	40 %	0 %	40 %	20 %	313125247
260	NC_014729	GATCT	2	10	443141	443150	20 %	40 %	20 %	20 %	313125248
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262	NC_014729	CGACG	2	10	450747	450756	20 %	0 %	40 %	40 %	313125257
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