MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 46990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	GCC	2	6	143	148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
2	NC_014729	CGG	2	6	163	168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
3	NC_014729	CTT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124789
4	NC_014729	CGG	2	6	352	357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
5	NC_014729	CAG	2	6	429	434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
6	NC_014729	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
7	NC_014729	CAC	2	6	467	472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124789
8	NC_014729	TCA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124789
9	NC_014729	CGA	2	6	499	504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
10	NC_014729	ACG	2	6	616	621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
11	NC_014729	CAT	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124789
12	NC_014729	CGC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124789
13	NC_014729	ACG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
14	NC_014729	ACG	2	6	831	836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
15	NC_014729	GAC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
16	NC_014729	ACG	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
17	NC_014729	CCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124789
18	NC_014729	GAC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124789
19	NC_014729	GGC	2	6	1025	1030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124789
20	NC_014729	GAG	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124789
21	NC_014729	GCC	2	6	1118	1123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124790
22	NC_014729	TTC	2	6	1190	1195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124790
23	NC_014729	CAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124790
24	NC_014729	GAG	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124790
25	NC_014729	TCG	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124790
26	NC_014729	ACG	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124790
27	NC_014729	CTC	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124790
28	NC_014729	CCG	2	6	1583	1588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124790
29	NC_014729	CCT	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124790
30	NC_014729	TCC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124791
31	NC_014729	GAA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124791
32	NC_014729	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
33	NC_014729	TCC	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124791
34	NC_014729	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124791
35	NC_014729	CGC	2	6	1872	1877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124791
36	NC_014729	GGT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124791
37	NC_014729	GCG	2	6	1891	1896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124791
38	NC_014729	TCG	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
39	NC_014729	CTG	2	6	1918	1923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124791
40	NC_014729	TGG	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124792
41	NC_014729	CGT	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
42	NC_014729	TCG	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
43	NC_014729	CTG	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
44	NC_014729	TCA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124792
45	NC_014729	CGC	2	6	2200	2205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124792
46	NC_014729	CGA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124792
47	NC_014729	CGT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
48	NC_014729	TCG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
49	NC_014729	CAC	2	6	2377	2382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124792
50	NC_014729	TCG	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124792
51	NC_014729	CGC	3	9	2426	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124792
52	NC_014729	GCC	2	6	2606	2611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
53	NC_014729	ACT	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124793
54	NC_014729	CGT	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
55	NC_014729	CAC	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124793
56	NC_014729	GAC	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124793
57	NC_014729	CGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
58	NC_014729	CGA	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124793
59	NC_014729	GCC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
60	NC_014729	CGC	2	6	2920	2925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
61	NC_014729	GAA	2	6	2974	2979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124793
62	NC_014729	GGC	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
63	NC_014729	TCG	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
64	NC_014729	GGA	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313124793
65	NC_014729	GTC	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124793
66	NC_014729	CGC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124793
67	NC_014729	CGG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
68	NC_014729	GAA	3	9	3167	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124793
69	NC_014729	GGC	3	9	3376	3384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
70	NC_014729	GCG	2	6	3401	3406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124793
71	NC_014729	CCT	2	6	3420	3425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124793
72	NC_014729	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124794
73	NC_014729	TCT	2	6	3673	3678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124794
74	NC_014729	ACC	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124794
75	NC_014729	CCG	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
76	NC_014729	CGC	3	9	3797	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
77	NC_014729	CTT	2	6	3824	3829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124794
78	NC_014729	CGT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124794
79	NC_014729	TCA	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124794
80	NC_014729	CGT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124794
81	NC_014729	CGC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124794
82	NC_014729	GTC	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124795
83	NC_014729	GCG	2	6	4170	4175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124795
84	NC_014729	GTC	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124795
85	NC_014729	TCA	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124795
86	NC_014729	CGG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124795
87	NC_014729	CGC	2	6	4743	4748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124796
88	NC_014729	TCG	3	9	4787	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
89	NC_014729	CGG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124796
90	NC_014729	CGT	3	9	4818	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
91	NC_014729	CAC	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124796
92	NC_014729	TCG	2	6	4862	4867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124796
93	NC_014729	CAT	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124796
94	NC_014729	GCG	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124797
95	NC_014729	AGT	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124797
96	NC_014729	TCC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
97	NC_014729	CAC	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124797
98	NC_014729	CCT	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
99	NC_014729	GTC	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124797
100	NC_014729	TGG	2	6	5345	5350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124797
101	NC_014729	TCG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124797
102	NC_014729	CGC	2	6	5416	5421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124797
103	NC_014729	CGG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124797
104	NC_014729	GTT	2	6	5485	5490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313124797
105	NC_014729	GAA	2	6	5522	5527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124797
106	NC_014729	CCT	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
107	NC_014729	ACC	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124797
108	NC_014729	TCG	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124797
109	NC_014729	CGA	2	6	5731	5736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124797
110	NC_014729	GCG	2	6	5784	5789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124797
111	NC_014729	CGT	2	6	5830	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124797
112	NC_014729	GGC	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124797
113	NC_014729	CTC	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124797
114	NC_014729	CAT	2	6	5914	5919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124797
115	NC_014729	ATC	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124797
116	NC_014729	TCG	2	6	6170	6175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124798
117	NC_014729	CCG	2	6	6200	6205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124798
118	NC_014729	CGT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124798
119	NC_014729	TCA	3	9	6255	6263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124798
120	NC_014729	TCC	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124798
121	NC_014729	GCG	2	6	6281	6286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124798
122	NC_014729	GTC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124798
123	NC_014729	GAA	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124798
124	NC_014729	CGT	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124798
125	NC_014729	GAT	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124798
126	NC_014729	CGA	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124798
127	NC_014729	AGT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313124798
128	NC_014729	GCG	2	6	6611	6616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124798
129	NC_014729	TTC	2	6	6655	6660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313124798
130	NC_014729	GCC	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124798
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255	NC_014729	CGC	2	6	14146	14151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124808
256	NC_014729	GCG	2	6	14217	14222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124808
257	NC_014729	GAC	2	6	14280	14285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124808
258	NC_014729	TCG	2	6	14286	14291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124808
259	NC_014729	TCG	2	6	14340	14345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124808
260	NC_014729	ACG	2	6	14358	14363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124808
261	NC_014729	TCG	2	6	14758	14763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124809
262	NC_014729	TCC	2	6	14767	14772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124809
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264	NC_014729	CCG	2	6	14871	14876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124809
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270	NC_014729	CGG	2	6	15225	15230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124810
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272	NC_014729	TCG	2	6	15364	15369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124811
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279	NC_014729	CGG	2	6	15714	15719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124811
280	NC_014729	GAC	2	6	15732	15737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124811
281	NC_014729	CGT	2	6	15764	15769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124811
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283	NC_014729	CCG	2	6	15833	15838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124811
284	NC_014729	TCG	2	6	15913	15918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124811
285	NC_014729	GTC	2	6	15919	15924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124811
286	NC_014729	TCG	2	6	16047	16052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124811
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288	NC_014729	TCC	2	6	16117	16122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313124811
289	NC_014729	GGT	2	6	16137	16142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313124811
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291	NC_014729	CGG	2	6	16235	16240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313124811
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330	NC_014729	GTC	2	6	18374	18379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124814
331	NC_014729	TCG	2	6	18573	18578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124814
332	NC_014729	CGA	2	6	18616	18621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124814
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349	NC_014729	GCT	2	6	20021	20026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124816
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360	NC_014729	ACG	2	6	20573	20578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124818
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363	NC_014729	GTC	2	6	20762	20767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124819
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370	NC_014729	CGC	2	6	21035	21040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313124820
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372	NC_014729	AAC	3	9	22630	22638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124821
373	NC_014729	ACC	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313124821
374	NC_014729	CGA	2	6	22694	22699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
375	NC_014729	CGA	2	6	22712	22717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
376	NC_014729	CGT	2	6	22802	22807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313124821
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378	NC_014729	CAA	2	6	22815	22820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313124821
379	NC_014729	CGA	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
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381	NC_014729	GCA	2	6	22948	22953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313124821
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407	NC_014729	GAA	2	6	24428	24433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313124822
408	NC_014729	ATC	2	6	24575	24580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313124822
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