MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 1990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	TAATT	2	10	268	277	40 %	60 %	0 %	0 %	312142409
2	NC_014654	CTGAT	2	10	402	411	20 %	40 %	20 %	20 %	312142409
3	NC_014654	CAATA	2	10	1477	1486	60 %	20 %	0 %	20 %	312142409
4	NC_014654	AAAAC	2	10	1827	1836	80 %	0 %	0 %	20 %	312142410
5	NC_014654	TGCAA	2	10	1969	1978	40 %	20 %	20 %	20 %	312142410
6	NC_014654	AATTT	2	10	2139	2148	40 %	60 %	0 %	0 %	312142410
7	NC_014654	GAAGA	2	10	17764	17773	60 %	0 %	40 %	0 %	312142417
8	NC_014654	CTTTA	2	10	22534	22543	20 %	60 %	0 %	20 %	312142422
9	NC_014654	GCAAA	2	10	23411	23420	60 %	0 %	20 %	20 %	312142423
10	NC_014654	TAAAG	2	10	25877	25886	60 %	20 %	20 %	0 %	312142426
11	NC_014654	AATTT	2	10	26358	26367	40 %	60 %	0 %	0 %	312142427
12	NC_014654	GAAAA	2	10	26477	26486	80 %	0 %	20 %	0 %	312142428
13	NC_014654	ATATT	2	10	29198	29207	40 %	60 %	0 %	0 %	312142430
14	NC_014654	TAATT	2	10	29274	29283	40 %	60 %	0 %	0 %	312142430
15	NC_014654	ATTTT	2	10	29909	29918	20 %	80 %	0 %	0 %	312142430
16	NC_014654	AGAGG	2	10	34376	34385	40 %	0 %	60 %	0 %	312142434
17	NC_014654	TTAAA	2	10	36399	36408	60 %	40 %	0 %	0 %	312142435
18	NC_014654	TCCTA	2	10	37494	37503	20 %	40 %	0 %	40 %	312142435
19	NC_014654	TATAG	2	10	39962	39971	40 %	40 %	20 %	0 %	312142438
20	NC_014654	ATAAA	2	10	43032	43041	80 %	20 %	0 %	0 %	312142441
21	NC_014654	AGAAA	2	10	43369	43378	80 %	0 %	20 %	0 %	312142441
22	NC_014654	TGAAT	2	10	43786	43795	40 %	40 %	20 %	0 %	312142441
23	NC_014654	ATCTT	2	10	43858	43867	20 %	60 %	0 %	20 %	312142441
24	NC_014654	TTAAT	2	10	44058	44067	40 %	60 %	0 %	0 %	312142441
25	NC_014654	ATTGT	2	10	44226	44235	20 %	60 %	20 %	0 %	312142441
26	NC_014654	TCAAT	2	10	44577	44586	40 %	40 %	0 %	20 %	312142441
27	NC_014654	AAAGC	2	10	47117	47126	60 %	0 %	20 %	20 %	312142442
28	NC_014654	AAAGA	2	10	47769	47778	80 %	0 %	20 %	0 %	312142443
29	NC_014654	TGAAA	2	10	51392	51401	60 %	20 %	20 %	0 %	312142446
30	NC_014654	GTTTA	2	10	52442	52451	20 %	60 %	20 %	0 %	312142447
31	NC_014654	TGAAT	2	10	52758	52767	40 %	40 %	20 %	0 %	312142447
32	NC_014654	AAAAT	2	10	56726	56735	80 %	20 %	0 %	0 %	312142451
33	NC_014654	ATATT	2	10	57128	57137	40 %	60 %	0 %	0 %	312142451
34	NC_014654	AATTT	2	10	61181	61190	40 %	60 %	0 %	0 %	312142452
35	NC_014654	ATTAT	2	10	63375	63384	40 %	60 %	0 %	0 %	312142453
36	NC_014654	AAAAG	2	10	64719	64728	80 %	0 %	20 %	0 %	312142454
37	NC_014654	TAGTT	2	10	66718	66727	20 %	60 %	20 %	0 %	312142456
38	NC_014654	TTTAT	2	10	69562	69571	20 %	80 %	0 %	0 %	312142459
39	NC_014654	ATATA	2	10	69808	69817	60 %	40 %	0 %	0 %	312142459
40	NC_014654	ATATT	2	10	70048	70057	40 %	60 %	0 %	0 %	312142459
41	NC_014654	TAAAT	2	10	70070	70079	60 %	40 %	0 %	0 %	312142460
42	NC_014654	TAAAA	2	10	70165	70174	80 %	20 %	0 %	0 %	312142460
43	NC_014654	TAAAA	2	10	70276	70285	80 %	20 %	0 %	0 %	312142460
44	NC_014654	AATAT	2	10	70524	70533	60 %	40 %	0 %	0 %	312142460
45	NC_014654	AATAA	2	10	71258	71267	80 %	20 %	0 %	0 %	312142461
46	NC_014654	ACTTT	2	10	72087	72096	20 %	60 %	0 %	20 %	312142462
47	NC_014654	TATGA	2	10	72774	72783	40 %	40 %	20 %	0 %	312142462
48	NC_014654	AAAAC	2	10	73188	73197	80 %	0 %	0 %	20 %	312142463
49	NC_014654	TTAAT	2	10	75313	75322	40 %	60 %	0 %	0 %	312142464
50	NC_014654	GAACA	2	10	78319	78328	60 %	0 %	20 %	20 %	312142467
51	NC_014654	TTCCT	2	10	79233	79242	0 %	60 %	0 %	40 %	312142468
52	NC_014654	TAATT	2	10	80449	80458	40 %	60 %	0 %	0 %	312142469
53	NC_014654	GAATA	2	10	81892	81901	60 %	20 %	20 %	0 %	312142471
54	NC_014654	TAAAA	2	10	82300	82309	80 %	20 %	0 %	0 %	312142472
55	NC_014654	AAAGA	2	10	83612	83621	80 %	0 %	20 %	0 %	312142472
56	NC_014654	ATATT	2	10	83828	83837	40 %	60 %	0 %	0 %	312142472
57	NC_014654	TTCAA	2	10	85944	85953	40 %	40 %	0 %	20 %	312142473
58	NC_014654	TCAAA	2	10	86512	86521	60 %	20 %	0 %	20 %	312142474
59	NC_014654	TGGAG	2	10	89252	89261	20 %	20 %	60 %	0 %	312142479
60	NC_014654	AGAAA	2	10	90271	90280	80 %	0 %	20 %	0 %	312142480
61	NC_014654	CATTA	2	10	92952	92961	40 %	40 %	0 %	20 %	312142483
62	NC_014654	ATCTT	2	10	95455	95464	20 %	60 %	0 %	20 %	312142485
63	NC_014654	CATTA	2	10	97833	97842	40 %	40 %	0 %	20 %	312142486
64	NC_014654	TAAAT	2	10	97886	97895	60 %	40 %	0 %	0 %	312142487
65	NC_014654	TAATC	2	10	98386	98395	40 %	40 %	0 %	20 %	312142487
66	NC_014654	AACTG	2	10	99183	99192	40 %	20 %	20 %	20 %	312142487
67	NC_014654	ATTTT	2	10	99527	99536	20 %	80 %	0 %	0 %	312142487
68	NC_014654	TTTTG	2	10	103633	103642	0 %	80 %	20 %	0 %	312142489
69	NC_014654	TCATA	2	10	103949	103958	40 %	40 %	0 %	20 %	312142489
70	NC_014654	GGGTT	2	10	104178	104187	0 %	40 %	60 %	0 %	312142489
71	NC_014654	CTTTT	2	10	104486	104495	0 %	80 %	0 %	20 %	312142490
72	NC_014654	GCATG	2	10	110282	110291	20 %	20 %	40 %	20 %	312142493
73	NC_014654	GCTTT	2	10	111431	111440	0 %	60 %	20 %	20 %	312142494
74	NC_014654	ATTTT	2	10	111450	111459	20 %	80 %	0 %	0 %	312142494
75	NC_014654	TGAAG	2	10	111597	111606	40 %	20 %	40 %	0 %	312142494
76	NC_014654	AAAAC	2	10	111868	111877	80 %	0 %	0 %	20 %	312142495
77	NC_014654	TGAGA	2	10	112163	112172	40 %	20 %	40 %	0 %	312142495
78	NC_014654	TTTTA	2	10	112317	112326	20 %	80 %	0 %	0 %	312142495
79	NC_014654	TCCAA	2	10	113239	113248	40 %	20 %	0 %	40 %	312142496
80	NC_014654	ATATA	2	10	113891	113900	60 %	40 %	0 %	0 %	312142496
81	NC_014654	TCTCT	2	10	113958	113967	0 %	60 %	0 %	40 %	312142496
82	NC_014654	ATCTT	2	10	114360	114369	20 %	60 %	0 %	20 %	312142497
83	NC_014654	TCTTT	2	10	116517	116526	0 %	80 %	0 %	20 %	312142498
84	NC_014654	AATTA	2	10	123021	123030	60 %	40 %	0 %	0 %	312142507
85	NC_014654	AATTT	2	10	123587	123596	40 %	60 %	0 %	0 %	312142507
86	NC_014654	AAAAG	2	10	124158	124167	80 %	0 %	20 %	0 %	312142508
87	NC_014654	TCAGC	2	10	124944	124953	20 %	20 %	20 %	40 %	312142510
88	NC_014654	GTTTT	2	10	126348	126357	0 %	80 %	20 %	0 %	312142511
89	NC_014654	AAATT	2	10	127818	127827	60 %	40 %	0 %	0 %	312142513
90	NC_014654	AGATG	2	10	128453	128462	40 %	20 %	40 %	0 %	312142513
91	NC_014654	AGTTT	2	10	128473	128482	20 %	60 %	20 %	0 %	312142513
92	NC_014654	TTTAA	2	10	130670	130679	40 %	60 %	0 %	0 %	312142514
93	NC_014654	ATTTT	2	10	130908	130917	20 %	80 %	0 %	0 %	312142514
94	NC_014654	TGAGT	2	10	131134	131143	20 %	40 %	40 %	0 %	312142514
95	NC_014654	AAAAT	2	10	131474	131483	80 %	20 %	0 %	0 %	312142515
96	NC_014654	ATAAA	2	10	132359	132368	80 %	20 %	0 %	0 %	312142515
97	NC_014654	TTAAT	2	10	132546	132555	40 %	60 %	0 %	0 %	312142516
98	NC_014654	GAAAT	2	10	133747	133756	60 %	20 %	20 %	0 %	312142517
99	NC_014654	CAGAC	2	10	136707	136716	40 %	0 %	20 %	40 %	312142519
100	NC_014654	TATAC	2	10	139455	139464	40 %	40 %	0 %	20 %	312142521
101	NC_014654	TTTTC	2	10	145338	145347	0 %	80 %	0 %	20 %	312142526
102	NC_014654	ATTAT	2	10	145521	145530	40 %	60 %	0 %	0 %	312142527
103	NC_014654	TTAAA	2	10	145947	145956	60 %	40 %	0 %	0 %	312142527
104	NC_014654	CTGTT	2	10	147727	147736	0 %	60 %	20 %	20 %	312142529
105	NC_014654	CTGTT	2	10	147808	147817	0 %	60 %	20 %	20 %	312142529
106	NC_014654	GATTT	2	10	150490	150499	20 %	60 %	20 %	0 %	312142531
107	NC_014654	GGATT	2	10	150894	150903	20 %	40 %	40 %	0 %	312142532
108	NC_014654	TCAAA	2	10	152642	152651	60 %	20 %	0 %	20 %	312142532
109	NC_014654	AATTT	2	10	153198	153207	40 %	60 %	0 %	0 %	312142533
110	NC_014654	TAAAT	2	10	153370	153379	60 %	40 %	0 %	0 %	312142534
111	NC_014654	GAATT	2	10	153926	153935	40 %	40 %	20 %	0 %	312142535
112	NC_014654	TGATT	2	10	155310	155319	20 %	60 %	20 %	0 %	312142536
113	NC_014654	AGCTT	2	10	155348	155357	20 %	40 %	20 %	20 %	312142536
114	NC_014654	AGAAA	2	10	155911	155920	80 %	0 %	20 %	0 %	312142537
115	NC_014654	AATTT	2	10	156822	156831	40 %	60 %	0 %	0 %	312142537
116	NC_014654	CTAAA	2	10	157222	157231	60 %	20 %	0 %	20 %	312142537
117	NC_014654	ATAAA	2	10	158086	158095	80 %	20 %	0 %	0 %	312142537
118	NC_014654	ATAAA	2	10	158125	158134	80 %	20 %	0 %	0 %	312142537
119	NC_014654	AAATA	2	10	159179	159188	80 %	20 %	0 %	0 %	312142539
120	NC_014654	ATATG	2	10	159649	159658	40 %	40 %	20 %	0 %	312142540
121	NC_014654	GAAAA	2	10	166438	166447	80 %	0 %	20 %	0 %	312142546
122	NC_014654	AAAGT	2	10	166476	166485	60 %	20 %	20 %	0 %	312142546
123	NC_014654	ATTTA	2	10	166987	166996	40 %	60 %	0 %	0 %	312142546
124	NC_014654	ATGAG	2	10	168434	168443	40 %	20 %	40 %	0 %	312142547
125	NC_014654	ATAAA	2	10	168587	168596	80 %	20 %	0 %	0 %	312142547
126	NC_014654	TTTTA	2	10	174320	174329	20 %	80 %	0 %	0 %	312142552
127	NC_014654	ATAAA	2	10	178341	178350	80 %	20 %	0 %	0 %	312142557
128	NC_014654	ATTTT	2	10	180868	180877	20 %	80 %	0 %	0 %	312142559
129	NC_014654	TATTC	2	10	181077	181086	20 %	60 %	0 %	20 %	312142559
130	NC_014654	AATAT	2	10	181739	181748	60 %	40 %	0 %	0 %	312142560
131	NC_014654	CTATG	2	10	187655	187664	20 %	40 %	20 %	20 %	312142563
132	NC_014654	AAATT	2	10	189909	189918	60 %	40 %	0 %	0 %	312142566
133	NC_014654	TAAAT	2	10	191611	191620	60 %	40 %	0 %	0 %	312142567
134	NC_014654	GATAA	2	10	191639	191648	60 %	20 %	20 %	0 %	312142567
135	NC_014654	AGAGT	2	10	193305	193314	40 %	20 %	40 %	0 %	312142568
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