MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 60669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014654	TA	3	6	114719	114724	50 %	50 %	0 %	0 %	312142497
2502	NC_014654	CTG	2	6	114791	114796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142497
2503	NC_014654	GAA	2	6	114805	114810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142497
2504	NC_014654	CTA	2	6	114850	114855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142497
2505	NC_014654	A	7	7	114969	114975	100 %	0 %	0 %	0 %	312142497
2506	NC_014654	TGA	2	6	114981	114986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142497
2507	NC_014654	A	6	6	115002	115007	100 %	0 %	0 %	0 %	312142497
2508	NC_014654	CAG	2	6	115023	115028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142497
2509	NC_014654	AG	3	6	115027	115032	50 %	0 %	50 %	0 %	312142497
2510	NC_014654	AGA	2	6	115050	115055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142497
2511	NC_014654	CATA	2	8	115152	115159	50 %	25 %	0 %	25 %	312142497
2512	NC_014654	ACA	2	6	115171	115176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312142497
2513	NC_014654	A	7	7	115207	115213	100 %	0 %	0 %	0 %	312142497
2514	NC_014654	AGC	2	6	115248	115253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142497
2515	NC_014654	A	6	6	115256	115261	100 %	0 %	0 %	0 %	312142497
2516	NC_014654	ATTT	2	8	115264	115271	25 %	75 %	0 %	0 %	312142497
2517	NC_014654	ATT	2	6	115276	115281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142497
2518	NC_014654	ATTT	2	8	115371	115378	25 %	75 %	0 %	0 %	312142497
2519	NC_014654	ATC	2	6	115547	115552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142498
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2521	NC_014654	CTGT	2	8	115624	115631	0 %	50 %	25 %	25 %	312142498
2522	NC_014654	CTT	2	6	115714	115719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142498
2523	NC_014654	ATT	2	6	115721	115726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
2524	NC_014654	ATA	2	6	115734	115739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142498
2525	NC_014654	TCAA	2	8	115770	115777	50 %	25 %	0 %	25 %	312142498
2526	NC_014654	ATT	2	6	115778	115783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
2527	NC_014654	ATT	2	6	115799	115804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
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2529	NC_014654	T	6	6	115850	115855	0 %	100 %	0 %	0 %	312142498
2530	NC_014654	TAT	2	6	115882	115887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
2531	NC_014654	GCTG	2	8	115915	115922	0 %	25 %	50 %	25 %	312142498
2532	NC_014654	T	6	6	115924	115929	0 %	100 %	0 %	0 %	312142498
2533	NC_014654	TTC	2	6	115946	115951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142498
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2539	NC_014654	ATC	2	6	116084	116089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142498
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2542	NC_014654	TCAT	2	8	116232	116239	25 %	50 %	0 %	25 %	312142498
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2545	NC_014654	ATT	2	6	116282	116287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
2546	NC_014654	T	7	7	116292	116298	0 %	100 %	0 %	0 %	312142498
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2550	NC_014654	CTGG	2	8	116411	116418	0 %	25 %	50 %	25 %	312142498
2551	NC_014654	TTA	2	6	116464	116469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
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2553	NC_014654	TAT	2	6	116501	116506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142498
2554	NC_014654	TCTTT	2	10	116517	116526	0 %	80 %	0 %	20 %	312142498
2555	NC_014654	TCA	2	6	116556	116561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312142498
2556	NC_014654	CAG	2	6	116587	116592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312142498
2557	NC_014654	ATA	2	6	116622	116627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142498
2558	NC_014654	ATA	2	6	116636	116641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142498
2559	NC_014654	AATA	2	8	116681	116688	75 %	25 %	0 %	0 %	312142498
2560	NC_014654	ACTA	2	8	116705	116712	50 %	25 %	0 %	25 %	312142498
2561	NC_014654	CTT	2	6	116767	116772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142498
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2564	NC_014654	ATTA	2	8	116846	116853	50 %	50 %	0 %	0 %	312142498
2565	NC_014654	CTT	2	6	116860	116865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312142498
2566	NC_014654	TGT	2	6	116882	116887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142498
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2568	NC_014654	TA	3	6	116978	116983	50 %	50 %	0 %	0 %	312142498
2569	NC_014654	TA	3	6	117025	117030	50 %	50 %	0 %	0 %	312142498
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2583	NC_014654	AGAT	2	8	117915	117922	50 %	25 %	25 %	0 %	312142499
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2587	NC_014654	TTAA	2	8	118130	118137	50 %	50 %	0 %	0 %	312142499
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2591	NC_014654	ATGT	2	8	118359	118366	25 %	50 %	25 %	0 %	312142499
2592	NC_014654	GTG	2	6	118396	118401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142499
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2595	NC_014654	A	6	6	118586	118591	100 %	0 %	0 %	0 %	312142499
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2599	NC_014654	GTA	2	6	119088	119093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142500
2600	NC_014654	TAT	2	6	119120	119125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142500
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2603	NC_014654	AGTT	2	8	119266	119273	25 %	50 %	25 %	0 %	312142500
2604	NC_014654	TGA	3	9	119276	119284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142500
2605	NC_014654	ATTC	2	8	119331	119338	25 %	50 %	0 %	25 %	312142500
2606	NC_014654	CAAT	2	8	119357	119364	50 %	25 %	0 %	25 %	312142500
2607	NC_014654	TAT	2	6	119372	119377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142500
2608	NC_014654	TAGAAA	2	12	119401	119412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312142500
2609	NC_014654	GGA	2	6	119417	119422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312142500
2610	NC_014654	ATG	2	6	119437	119442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142500
2611	NC_014654	TATTAA	2	12	119451	119462	50 %	50 %	0 %	0 %	312142500
2612	NC_014654	ATT	2	6	119491	119496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312142501
2613	NC_014654	GAT	2	6	119560	119565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142501
2614	NC_014654	CAGG	2	8	119635	119642	25 %	0 %	50 %	25 %	312142501
2615	NC_014654	TA	3	6	119701	119706	50 %	50 %	0 %	0 %	312142501
2616	NC_014654	GCT	2	6	119743	119748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312142501
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2618	NC_014654	GAT	2	6	119875	119880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142501
2619	NC_014654	TAA	2	6	119901	119906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312142501
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2621	NC_014654	A	6	6	119970	119975	100 %	0 %	0 %	0 %	312142501
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2623	NC_014654	TGT	2	6	119985	119990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312142501
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2993	NC_014654	ATG	2	6	137008	137013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142519
2994	NC_014654	TGA	2	6	137024	137029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142519
2995	NC_014654	TGG	2	6	137139	137144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142519
2996	NC_014654	CAGT	2	8	137153	137160	25 %	25 %	25 %	25 %	312142519
2997	NC_014654	GGT	2	6	137163	137168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312142519
2998	NC_014654	AT	3	6	137231	137236	50 %	50 %	0 %	0 %	312142519
2999	NC_014654	ATG	2	6	137281	137286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312142519
3000	NC_014654	AGA	2	6	137366	137371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312142519

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