MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 30724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014560	TGA	2	6	223265	223270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184015
4002	NC_014560	ATA	2	6	223350	223355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184015
4003	NC_014560	TGG	2	6	223393	223398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184015
4004	NC_014560	G	6	6	223484	223489	0 %	0 %	100 %	0 %	308184015
4005	NC_014560	TGA	2	6	223508	223513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184015
4006	NC_014560	TGG	2	6	223516	223521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184015
4007	NC_014560	TAA	2	6	223523	223528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184015
4008	NC_014560	AG	3	6	223551	223556	50 %	0 %	50 %	0 %	308184015
4009	NC_014560	TGGG	2	8	223558	223565	0 %	25 %	75 %	0 %	308184015
4010	NC_014560	AGGG	2	8	223595	223602	25 %	0 %	75 %	0 %	308184015
4011	NC_014560	GTTTTG	2	12	223755	223766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184015
4012	NC_014560	CAC	2	6	223782	223787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184015
4013	NC_014560	A	6	6	223795	223800	100 %	0 %	0 %	0 %	308184015
4014	NC_014560	TGA	2	6	223811	223816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184015
4015	NC_014560	T	6	6	223821	223826	0 %	100 %	0 %	0 %	308184015
4016	NC_014560	GTT	2	6	223839	223844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184015
4017	NC_014560	GA	3	6	223907	223912	50 %	0 %	50 %	0 %	308184015
4018	NC_014560	CCG	2	6	223997	224002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308184015
4019	NC_014560	AC	3	6	224021	224026	50 %	0 %	0 %	50 %	308184015
4020	NC_014560	TAA	2	6	224051	224056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184015
4021	NC_014560	C	7	7	224066	224072	0 %	0 %	0 %	100 %	308184015
4022	NC_014560	CTT	2	6	224084	224089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184015
4023	NC_014560	CCA	2	6	224230	224235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184015
4024	NC_014560	CTTT	2	8	224251	224258	0 %	75 %	0 %	25 %	308184015
4025	NC_014560	GAT	2	6	224405	224410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184016
4026	NC_014560	TTG	2	6	224432	224437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184016
4027	NC_014560	G	7	7	224447	224453	0 %	0 %	100 %	0 %	308184016
4028	NC_014560	AGA	2	6	224509	224514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184016
4029	NC_014560	TGT	2	6	224554	224559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184016
4030	NC_014560	TGG	2	6	224588	224593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184016
4031	NC_014560	CTT	2	6	224685	224690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184016
4032	NC_014560	TCTT	2	8	224706	224713	0 %	75 %	0 %	25 %	308184016
4033	NC_014560	ATT	2	6	224783	224788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184016
4034	NC_014560	AGG	2	6	224810	224815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308184016
4035	NC_014560	CGG	2	6	224877	224882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308184016
4036	NC_014560	TGA	2	6	224883	224888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184016
4037	NC_014560	TGG	2	6	224931	224936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184016
4038	NC_014560	TCAT	2	8	224953	224960	25 %	50 %	0 %	25 %	308184016
4039	NC_014560	AGA	2	6	224971	224976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184016
4040	NC_014560	TAT	2	6	224998	225003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184016
4041	NC_014560	GAC	2	6	225055	225060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308184016
4042	NC_014560	TATC	2	8	225061	225068	25 %	50 %	0 %	25 %	308184016
4043	NC_014560	CGC	2	6	225147	225152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308184016
4044	NC_014560	A	7	7	225343	225349	100 %	0 %	0 %	0 %	308184016
4045	NC_014560	TTATTT	2	12	225387	225398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	308184016
4046	NC_014560	T	7	7	225417	225423	0 %	100 %	0 %	0 %	308184016
4047	NC_014560	AGAT	2	8	225453	225460	50 %	25 %	25 %	0 %	308184016
4048	NC_014560	ATTG	2	8	225539	225546	25 %	50 %	25 %	0 %	308184016
4049	NC_014560	ACC	2	6	225551	225556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184016
4050	NC_014560	A	6	6	225557	225562	100 %	0 %	0 %	0 %	308184016
4051	NC_014560	TGC	2	6	225576	225581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308184016
4052	NC_014560	GGC	2	6	225590	225595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308184016
4053	NC_014560	TCA	2	6	225687	225692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184016
4054	NC_014560	CTG	2	6	225750	225755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308184016
4055	NC_014560	ACC	2	6	225807	225812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308184016
4056	NC_014560	CCACC	2	10	225876	225885	20 %	0 %	0 %	80 %	308184016
4057	NC_014560	GTT	2	6	225965	225970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184016
4058	NC_014560	T	6	6	225991	225996	0 %	100 %	0 %	0 %	308184016
4059	NC_014560	AGA	2	6	226036	226041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184017
4060	NC_014560	TTACA	2	10	226063	226072	40 %	40 %	0 %	20 %	308184017
4061	NC_014560	GTTT	2	8	226075	226082	0 %	75 %	25 %	0 %	308184017
4062	NC_014560	TGT	3	9	226122	226130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184017
4063	NC_014560	G	6	6	226145	226150	0 %	0 %	100 %	0 %	308184017
4064	NC_014560	GTT	2	6	226183	226188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184017
4065	NC_014560	GCG	2	6	226241	226246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308184017
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4068	NC_014560	GTG	3	9	226430	226438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184017
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4070	NC_014560	ATTG	2	8	226531	226538	25 %	50 %	25 %	0 %	308184017
4071	NC_014560	T	6	6	226621	226626	0 %	100 %	0 %	0 %	308184017
4072	NC_014560	GCG	2	6	226637	226642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308184017
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4074	NC_014560	TGT	3	9	226776	226784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184017
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4076	NC_014560	GTT	2	6	226835	226840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308184018
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4080	NC_014560	A	6	6	227150	227155	100 %	0 %	0 %	0 %	308184018
4081	NC_014560	AG	3	6	227173	227178	50 %	0 %	50 %	0 %	308184018
4082	NC_014560	TTA	2	6	227198	227203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308184018
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4085	NC_014560	TTGA	2	8	227489	227496	25 %	50 %	25 %	0 %	308184018
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4089	NC_014560	CGAT	2	8	227592	227599	25 %	25 %	25 %	25 %	308184018
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4091	NC_014560	GTG	2	6	227741	227746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184018
4092	NC_014560	TGG	2	6	227803	227808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308184018
4093	NC_014560	A	6	6	227849	227854	100 %	0 %	0 %	0 %	308184018
4094	NC_014560	CT	3	6	227864	227869	0 %	50 %	0 %	50 %	308184018
4095	NC_014560	AGA	2	6	227875	227880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184018
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4097	NC_014560	A	6	6	227998	228003	100 %	0 %	0 %	0 %	308184019
4098	NC_014560	AG	3	6	228022	228027	50 %	0 %	50 %	0 %	308184019
4099	NC_014560	ATCA	2	8	228089	228096	50 %	25 %	0 %	25 %	308184019
4100	NC_014560	A	6	6	228122	228127	100 %	0 %	0 %	0 %	308184019
4101	NC_014560	AAT	2	6	228203	228208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308184019
4102	NC_014560	TAATTA	2	12	228256	228267	50 %	50 %	0 %	0 %	308184019
4103	NC_014560	G	8	8	228269	228276	0 %	0 %	100 %	0 %	308184019
4104	NC_014560	AGA	2	6	228282	228287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184019
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4106	NC_014560	GAT	2	6	228490	228495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184020
4107	NC_014560	AAG	2	6	228503	228508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184020
4108	NC_014560	CTTT	2	8	228628	228635	0 %	75 %	0 %	25 %	308184020
4109	NC_014560	ATTG	2	8	228664	228671	25 %	50 %	25 %	0 %	308184020
4110	NC_014560	ATG	2	6	228683	228688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184020
4111	NC_014560	A	6	6	228691	228696	100 %	0 %	0 %	0 %	308184020
4112	NC_014560	ATG	2	6	228794	228799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184020
4113	NC_014560	ATG	2	6	228881	228886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308184020
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4115	NC_014560	A	6	6	229021	229026	100 %	0 %	0 %	0 %	308184020
4116	NC_014560	GAA	2	6	229057	229062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308184020
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4119	NC_014560	AGG	2	6	229351	229356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308184021
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4121	NC_014560	GA	3	6	229414	229419	50 %	0 %	50 %	0 %	308184021
4122	NC_014560	TGAG	2	8	229436	229443	25 %	25 %	50 %	0 %	308184021
4123	NC_014560	CAT	2	6	229474	229479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308184021
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4500	NC_014560	CTT	2	6	248495	248500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308184041

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