MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 63487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	CAG	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
2	NC_014532	AGG	2	6	325	330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543590
3	NC_014532	CTG	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
4	NC_014532	GCC	2	6	443	448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
5	NC_014532	GGT	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543590
6	NC_014532	CGC	3	9	553	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
7	NC_014532	CAG	2	6	618	623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
8	NC_014532	CGT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
9	NC_014532	TCG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
10	NC_014532	GGC	2	6	804	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543590
11	NC_014532	CGC	2	6	864	869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
12	NC_014532	GTG	2	6	882	887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543590
13	NC_014532	TCG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
14	NC_014532	CGA	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
15	NC_014532	TTC	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
16	NC_014532	TTC	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
17	NC_014532	CAG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543590
18	NC_014532	GCC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543590
19	NC_014532	TGA	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543590
20	NC_014532	ATG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543590
21	NC_014532	CTT	2	6	1256	1261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543590
22	NC_014532	AGA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543590
23	NC_014532	GAA	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543590
24	NC_014532	CTG	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
25	NC_014532	TAC	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543590
26	NC_014532	TGT	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543590
27	NC_014532	CGG	2	6	1577	1582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543590
28	NC_014532	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543590
29	NC_014532	CTG	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543590
30	NC_014532	GCT	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
31	NC_014532	GTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543591
32	NC_014532	GCG	2	6	1831	1836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543591
33	NC_014532	GGA	2	6	2041	2046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
34	NC_014532	AGC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
35	NC_014532	CCT	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543591
36	NC_014532	GCA	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
37	NC_014532	TGC	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
38	NC_014532	CTG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
39	NC_014532	TGG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543591
40	NC_014532	CAA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543591
41	NC_014532	AGG	3	9	2664	2672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
42	NC_014532	GAG	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
43	NC_014532	CAG	2	6	2800	2805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543591
44	NC_014532	GAG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543591
45	NC_014532	GTC	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543591
46	NC_014532	GAA	2	6	3128	3133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543592
47	NC_014532	GCC	2	6	3169	3174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543592
48	NC_014532	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543592
49	NC_014532	CCT	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543592
50	NC_014532	CGG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543592
51	NC_014532	CTC	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543592
52	NC_014532	CAG	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543592
53	NC_014532	TGG	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543592
54	NC_014532	CTG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543592
55	NC_014532	GAT	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543592
56	NC_014532	TCT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543592
57	NC_014532	GCT	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543592
58	NC_014532	ATG	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543592
59	NC_014532	TCA	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
60	NC_014532	CAC	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
61	NC_014532	TGG	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
62	NC_014532	GTG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
63	NC_014532	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
64	NC_014532	CGG	2	6	4368	4373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
65	NC_014532	CGA	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543593
66	NC_014532	GGT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
67	NC_014532	GAG	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
68	NC_014532	GGC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
69	NC_014532	CAC	2	6	4542	4547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
70	NC_014532	CGA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543593
71	NC_014532	GGC	2	6	4723	4728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
72	NC_014532	TCG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
73	NC_014532	CAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
74	NC_014532	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
75	NC_014532	CAA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
76	NC_014532	GAA	2	6	4974	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
77	NC_014532	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
78	NC_014532	ATC	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
79	NC_014532	TCC	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543593
80	NC_014532	CAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543593
81	NC_014532	GCC	2	6	5197	5202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
82	NC_014532	GGT	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
83	NC_014532	TCG	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
84	NC_014532	GTC	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
85	NC_014532	GAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
86	NC_014532	ATC	3	9	5542	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543593
87	NC_014532	TGC	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
88	NC_014532	CTT	3	9	5601	5609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
89	NC_014532	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
90	NC_014532	ACC	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
91	NC_014532	GCC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
92	NC_014532	GAG	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
93	NC_014532	GAG	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543593
94	NC_014532	TTC	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543593
95	NC_014532	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543593
96	NC_014532	TGA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
97	NC_014532	ACC	2	6	6331	6336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543593
98	NC_014532	CGC	2	6	6352	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543593
99	NC_014532	TGC	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
100	NC_014532	GGC	2	6	6387	6392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543593
101	NC_014532	ATG	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543593
102	NC_014532	CGT	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543593
103	NC_014532	TGG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543593
104	NC_014532	AGC	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543594
105	NC_014532	GCG	2	6	6714	6719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543594
106	NC_014532	GAC	2	6	6808	6813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543594
107	NC_014532	CGG	2	6	6994	6999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543594
108	NC_014532	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543594
109	NC_014532	CGA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543595
110	NC_014532	CTT	2	6	7544	7549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
111	NC_014532	AAC	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543595
112	NC_014532	TGT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543595
113	NC_014532	TCT	2	6	7775	7780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
114	NC_014532	CGA	2	6	7823	7828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543595
115	NC_014532	TCG	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543595
116	NC_014532	GAA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543595
117	NC_014532	GTG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543595
118	NC_014532	CTT	2	6	8028	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543595
119	NC_014532	GGC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543595
120	NC_014532	AGG	2	6	8185	8190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543595
121	NC_014532	CGT	2	6	8384	8389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543595
122	NC_014532	AGT	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543595
123	NC_014532	CGA	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543596
124	NC_014532	CGG	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543596
125	NC_014532	GTT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543596
126	NC_014532	CCA	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543596
127	NC_014532	GGC	2	6	8990	8995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543596
128	NC_014532	AGC	2	6	9104	9109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543596
129	NC_014532	CGT	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
130	NC_014532	GTC	2	6	9199	9204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
131	NC_014532	CGA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543596
132	NC_014532	ACT	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543596
133	NC_014532	GGC	2	6	9318	9323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543596
134	NC_014532	TGC	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
135	NC_014532	CAT	2	6	9396	9401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543596
136	NC_014532	TCG	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
137	NC_014532	GTC	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
138	NC_014532	GCT	3	9	9579	9587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
139	NC_014532	GTC	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
140	NC_014532	TGC	2	6	9770	9775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543596
141	NC_014532	GCG	2	6	9881	9886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543597
142	NC_014532	CCG	2	6	10030	10035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543597
143	NC_014532	TGA	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543597
144	NC_014532	AGC	2	6	10125	10130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543597
145	NC_014532	GCT	2	6	10235	10240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543597
146	NC_014532	GAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543597
147	NC_014532	GTC	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543597
148	NC_014532	TCA	2	6	10356	10361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543597
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150	NC_014532	TTG	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543597
151	NC_014532	ACC	2	6	10641	10646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543597
152	NC_014532	TGG	2	6	10647	10652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543597
153	NC_014532	CAG	2	6	10847	10852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543597
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155	NC_014532	CTC	2	6	10912	10917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543597
156	NC_014532	GAT	2	6	10927	10932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543597
157	NC_014532	ATG	2	6	10935	10940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543597
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159	NC_014532	GAA	2	6	11393	11398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543598
160	NC_014532	CAG	2	6	11531	11536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543598
161	NC_014532	TCG	2	6	11562	11567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543598
162	NC_014532	TTG	2	6	11598	11603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543598
163	NC_014532	GCG	2	6	11604	11609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543598
164	NC_014532	GCG	2	6	11616	11621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543598
165	NC_014532	TCG	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543598
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172	NC_014532	CGG	2	6	12238	12243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543598
173	NC_014532	GCT	3	9	12277	12285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543598
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182	NC_014532	TCG	2	6	12549	12554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543598
183	NC_014532	CAG	2	6	12605	12610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543598
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241	NC_014532	GGC	3	9	16167	16175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543601
242	NC_014532	ACC	2	6	16325	16330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543601
243	NC_014532	GCC	2	6	16332	16337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543601
244	NC_014532	CTG	2	6	16345	16350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543601
245	NC_014532	CCG	2	6	16405	16410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543602
246	NC_014532	CCG	2	6	16414	16419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543602
247	NC_014532	GCG	2	6	16420	16425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543602
248	NC_014532	TCC	2	6	16581	16586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543602
249	NC_014532	AGC	2	6	16590	16595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543602
250	NC_014532	AGC	2	6	16716	16721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543602
251	NC_014532	TGC	2	6	16732	16737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543602
252	NC_014532	CGG	2	6	16744	16749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543602
253	NC_014532	GAT	2	6	16783	16788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543602
254	NC_014532	ACC	2	6	16800	16805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543602
255	NC_014532	TTC	2	6	16812	16817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543602
256	NC_014532	AGC	2	6	16818	16823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543602
257	NC_014532	CGG	2	6	16920	16925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543602
258	NC_014532	GTC	3	9	17042	17050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543602
259	NC_014532	GTC	2	6	17072	17077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543602
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377	NC_014532	CGG	2	6	24659	24664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543608
378	NC_014532	TTC	2	6	24698	24703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543608
379	NC_014532	CTG	2	6	24725	24730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
380	NC_014532	CCT	2	6	24732	24737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543608
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399	NC_014532	ACC	2	6	25776	25781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543609
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401	NC_014532	TCT	2	6	25945	25950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543609
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403	NC_014532	CGC	2	6	26125	26130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543609
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481	NC_014532	CGA	2	6	31371	31376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543614
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499	NC_014532	CGC	2	6	32900	32905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543615
500	NC_014532	TGG	2	6	32911	32916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543615

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