MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014532	CGCC	2	8	168177	168184	0 %	0 %	25 %	75 %	307543733
3502	NC_014532	CAC	2	6	168197	168202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543733
3503	NC_014532	CGG	2	6	168220	168225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543733
3504	NC_014532	CGG	2	6	168238	168243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543733
3505	NC_014532	CCGGC	2	10	168269	168278	0 %	0 %	40 %	60 %	307543733
3506	NC_014532	GTC	2	6	168302	168307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3507	NC_014532	GCT	2	6	168328	168333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3508	NC_014532	GAT	2	6	168338	168343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543733
3509	NC_014532	TTGC	2	8	168365	168372	0 %	50 %	25 %	25 %	307543733
3510	NC_014532	GGC	2	6	168375	168380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543733
3511	NC_014532	GGT	2	6	168545	168550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543733
3512	NC_014532	GCG	2	6	168660	168665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543733
3513	NC_014532	GGC	2	6	168725	168730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543733
3514	NC_014532	CCTGC	2	10	168812	168821	0 %	20 %	20 %	60 %	307543733
3515	NC_014532	GTG	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543733
3516	NC_014532	GACC	2	8	168844	168851	25 %	0 %	25 %	50 %	307543733
3517	NC_014532	TCG	3	9	168918	168926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543733
3518	NC_014532	GCC	2	6	168929	168934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543733
3519	NC_014532	TGC	2	6	169253	169258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3520	NC_014532	GCC	2	6	169337	169342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543734
3521	NC_014532	TC	3	6	169427	169432	0 %	50 %	0 %	50 %	307543734
3522	NC_014532	TTCG	2	8	169456	169463	0 %	50 %	25 %	25 %	307543734
3523	NC_014532	GC	3	6	169486	169491	0 %	0 %	50 %	50 %	307543734
3524	NC_014532	GCC	2	6	169515	169520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543734
3525	NC_014532	CGT	2	6	169558	169563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3526	NC_014532	GCCG	2	8	169572	169579	0 %	0 %	50 %	50 %	307543734
3527	NC_014532	TTC	2	6	169591	169596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543734
3528	NC_014532	CGA	2	6	169602	169607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3529	NC_014532	CAG	2	6	169642	169647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3530	NC_014532	AGC	2	6	169742	169747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3531	NC_014532	TCG	2	6	169757	169762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543734
3532	NC_014532	CGC	2	6	169788	169793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543734
3533	NC_014532	CCA	2	6	169812	169817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543734
3534	NC_014532	TCGC	2	8	169891	169898	0 %	25 %	25 %	50 %	307543734
3535	NC_014532	GAG	2	6	169900	169905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543734
3536	NC_014532	CGA	2	6	169985	169990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3537	NC_014532	GGT	2	6	170039	170044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543735
3538	NC_014532	GAG	2	6	170055	170060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543735
3539	NC_014532	GGC	2	6	170140	170145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543735
3540	NC_014532	G	6	6	170240	170245	0 %	0 %	100 %	0 %	307543735
3541	NC_014532	GCCT	2	8	170301	170308	0 %	25 %	25 %	50 %	307543735
3542	NC_014532	CGA	2	6	170309	170314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3543	NC_014532	AAG	2	6	170400	170405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543735
3544	NC_014532	CCG	2	6	170425	170430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543735
3545	NC_014532	GCCG	2	8	170441	170448	0 %	0 %	50 %	50 %	307543735
3546	NC_014532	CGC	2	6	170498	170503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543735
3547	NC_014532	CGTG	2	8	170504	170511	0 %	25 %	50 %	25 %	307543735
3548	NC_014532	CGA	2	6	170522	170527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3549	NC_014532	TGC	2	6	170536	170541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3550	NC_014532	ACG	2	6	170542	170547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3551	NC_014532	CCA	2	6	170549	170554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543735
3552	NC_014532	GGC	2	6	170573	170578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543735
3553	NC_014532	AGG	2	6	170590	170595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543735
3554	NC_014532	CTGG	2	8	170615	170622	0 %	25 %	50 %	25 %	307543735
3555	NC_014532	CGG	2	6	170635	170640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543735
3556	NC_014532	CAC	3	9	170675	170683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543735
3557	NC_014532	ACG	2	6	170719	170724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3558	NC_014532	TCAC	2	8	170791	170798	25 %	25 %	0 %	50 %	307543735
3559	NC_014532	GCG	2	6	170801	170806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543735
3560	NC_014532	CGA	2	6	171038	171043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543735
3561	NC_014532	CGC	2	6	171200	171205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543736
3562	NC_014532	CAT	2	6	171263	171268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543736
3563	NC_014532	GCT	2	6	171409	171414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543736
3564	NC_014532	CGAC	2	8	171428	171435	25 %	0 %	25 %	50 %	307543736
3565	NC_014532	CGG	2	6	171479	171484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543736
3566	NC_014532	GCCG	2	8	171506	171513	0 %	0 %	50 %	50 %	307543736
3567	NC_014532	GGGGCT	2	12	171536	171547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	307543736
3568	NC_014532	TGG	2	6	171562	171567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543736
3569	NC_014532	GCC	2	6	171582	171587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543736
3570	NC_014532	CTG	2	6	171627	171632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543736
3571	NC_014532	GCC	2	6	171843	171848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543736
3572	NC_014532	CTG	2	6	171861	171866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543736
3573	NC_014532	TGC	2	6	171874	171879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543736
3574	NC_014532	CGG	2	6	171892	171897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543736
3575	NC_014532	CACGCC	2	12	171920	171931	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	307543736
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3577	NC_014532	CAA	2	6	171992	171997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543736
3578	NC_014532	CGA	2	6	172079	172084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543736
3579	NC_014532	ACC	3	9	172111	172119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543736
3580	NC_014532	GCC	2	6	172266	172271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543737
3581	NC_014532	GCCAG	2	10	172282	172291	20 %	0 %	40 %	40 %	307543737
3582	NC_014532	GAG	2	6	172335	172340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543737
3583	NC_014532	GCC	2	6	172356	172361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543737
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3586	NC_014532	TCA	2	6	172453	172458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543737
3587	NC_014532	CCG	2	6	172477	172482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543737
3588	NC_014532	GGC	2	6	172526	172531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543737
3589	NC_014532	GAT	2	6	172532	172537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543737
3590	NC_014532	GAA	2	6	172574	172579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543737
3591	NC_014532	CGA	2	6	172706	172711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543737
3592	NC_014532	GCCTGC	2	12	172720	172731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	307543737
3593	NC_014532	TCG	2	6	172753	172758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543737
3594	NC_014532	GC	3	6	172777	172782	0 %	0 %	50 %	50 %	307543737
3595	NC_014532	GCA	2	6	172823	172828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543737
3596	NC_014532	GGA	2	6	172973	172978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543737
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3598	NC_014532	CGC	2	6	173000	173005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543737
3599	NC_014532	TCG	2	6	173092	173097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543737
3600	NC_014532	GCCC	2	8	173127	173134	0 %	0 %	25 %	75 %	307543737
3601	NC_014532	CGA	2	6	173156	173161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543737
3602	NC_014532	AGG	2	6	173302	173307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543738
3603	NC_014532	GGGT	2	8	173373	173380	0 %	25 %	75 %	0 %	307543738
3604	NC_014532	TGG	2	6	173416	173421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543738
3605	NC_014532	GAG	2	6	173490	173495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543738
3606	NC_014532	TGG	2	6	173521	173526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543738
3607	NC_014532	GTG	2	6	173541	173546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543738
3608	NC_014532	CCA	2	6	173582	173587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543738
3609	NC_014532	CTGC	2	8	173630	173637	0 %	25 %	25 %	50 %	307543738
3610	NC_014532	TGC	2	6	173662	173667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543738
3611	NC_014532	TCT	3	9	173740	173748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543738
3612	NC_014532	GGT	2	6	173753	173758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543738
3613	NC_014532	GTT	2	6	173768	173773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543738
3614	NC_014532	TCGC	2	8	173822	173829	0 %	25 %	25 %	50 %	307543738
3615	NC_014532	TCA	2	6	173865	173870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543739
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3617	NC_014532	CTG	3	9	173951	173959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543739
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3620	NC_014532	TGA	2	6	174057	174062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543739
3621	NC_014532	TGGGC	2	10	174127	174136	0 %	20 %	60 %	20 %	307543739
3622	NC_014532	CGG	2	6	174148	174153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543739
3623	NC_014532	GAT	2	6	174157	174162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543739
3624	NC_014532	CGG	2	6	174166	174171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543739
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3728	NC_014532	TGCCG	2	10	178093	178102	0 %	20 %	40 %	40 %	307543742
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3733	NC_014532	CGAT	2	8	178659	178666	25 %	25 %	25 %	25 %	307543742
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3736	NC_014532	GA	3	6	178781	178786	50 %	0 %	50 %	0 %	307543742
3737	NC_014532	ACCG	2	8	178859	178866	25 %	0 %	25 %	50 %	307543742
3738	NC_014532	TGT	2	6	178872	178877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543742
3739	NC_014532	GCT	2	6	178906	178911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
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3741	NC_014532	GGA	2	6	178984	178989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543742
3742	NC_014532	CTG	2	6	179018	179023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
3743	NC_014532	GTC	2	6	179164	179169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
3744	NC_014532	TGC	2	6	179295	179300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543742
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3746	NC_014532	GGT	2	6	179380	179385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543742
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3750	NC_014532	CCG	2	6	179634	179639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543742
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3861	NC_014532	TCT	2	6	185417	185422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543747
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3865	NC_014532	CGG	2	6	185525	185530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543747
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3885	NC_014532	CGG	2	6	186547	186552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543748
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3979	NC_014532	GTC	2	6	190947	190952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543751
3980	NC_014532	ATC	2	6	191252	191257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
3981	NC_014532	GC	3	6	191277	191282	0 %	0 %	50 %	50 %	307543752
3982	NC_014532	CGGT	2	8	191387	191394	0 %	25 %	50 %	25 %	307543752
3983	NC_014532	AGA	2	6	191505	191510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543752
3984	NC_014532	GAAG	2	8	191569	191576	50 %	0 %	50 %	0 %	307543752
3985	NC_014532	CGA	2	6	191583	191588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543752
3986	NC_014532	ACA	2	6	191627	191632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543752
3987	NC_014532	CTT	2	6	191709	191714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543752
3988	NC_014532	GCCTG	2	10	191780	191789	0 %	20 %	40 %	40 %	307543752
3989	NC_014532	ACGA	2	8	191800	191807	50 %	0 %	25 %	25 %	307543752
3990	NC_014532	CAA	2	6	191832	191837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543752
3991	NC_014532	TAC	2	6	191956	191961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
3992	NC_014532	AAGCC	2	10	191967	191976	40 %	0 %	20 %	40 %	307543752
3993	NC_014532	CAT	2	6	192066	192071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
3994	NC_014532	ACG	2	6	192109	192114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543752
3995	NC_014532	TCA	2	6	192149	192154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543752
3996	NC_014532	TG	3	6	192165	192170	0 %	50 %	50 %	0 %	307543752
3997	NC_014532	GCC	2	6	192202	192207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543752
3998	NC_014532	TGA	2	6	192228	192233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543752
3999	NC_014532	CCG	2	6	192257	192262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543752
4000	NC_014532	CTAC	2	8	192272	192279	25 %	25 %	0 %	50 %	307543752

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