MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014532	GCC	2	6	120983	120988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543693
2502	NC_014532	GAG	2	6	120989	120994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543693
2503	NC_014532	CTTT	2	8	121000	121007	0 %	75 %	0 %	25 %	307543693
2504	NC_014532	CCTGG	2	10	121042	121051	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
2505	NC_014532	GCC	2	6	121072	121077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543693
2506	NC_014532	CAG	2	6	121192	121197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543693
2507	NC_014532	CGC	2	6	121276	121281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543693
2508	NC_014532	ATC	2	6	121370	121375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543693
2509	NC_014532	ATGACT	2	12	121421	121432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	307543693
2510	NC_014532	CTT	2	6	121448	121453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543693
2511	NC_014532	ATC	2	6	121465	121470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543693
2512	NC_014532	ATC	2	6	121622	121627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543693
2513	NC_014532	GCT	2	6	121641	121646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543693
2514	NC_014532	ATC	2	6	121666	121671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543693
2515	NC_014532	CG	3	6	121682	121687	0 %	0 %	50 %	50 %	307543693
2516	NC_014532	GC	3	6	121693	121698	0 %	0 %	50 %	50 %	307543693
2517	NC_014532	CA	3	6	121773	121778	50 %	0 %	0 %	50 %	307543693
2518	NC_014532	AAG	2	6	121789	121794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543693
2519	NC_014532	CAC	2	6	121820	121825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543693
2520	NC_014532	TGCCG	2	10	121851	121860	0 %	20 %	40 %	40 %	307543693
2521	NC_014532	CAGCGT	2	12	121888	121899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	307543693
2522	NC_014532	CCAA	2	8	121905	121912	50 %	0 %	0 %	50 %	307543693
2523	NC_014532	TTA	2	6	121936	121941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307543693
2524	NC_014532	GTG	2	6	121952	121957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543693
2525	NC_014532	GTG	2	6	121997	122002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543693
2526	NC_014532	AG	3	6	122025	122030	50 %	0 %	50 %	0 %	307543693
2527	NC_014532	CGCA	2	8	122154	122161	25 %	0 %	25 %	50 %	307543693
2528	NC_014532	GAA	2	6	122229	122234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543693
2529	NC_014532	TGG	2	6	122645	122650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543694
2530	NC_014532	GAT	2	6	122727	122732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543694
2531	NC_014532	CGC	2	6	122786	122791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543694
2532	NC_014532	GCG	2	6	122792	122797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543694
2533	NC_014532	CT	3	6	122825	122830	0 %	50 %	0 %	50 %	307543694
2534	NC_014532	TGT	2	6	122942	122947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543694
2535	NC_014532	TGC	3	9	122954	122962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543694
2536	NC_014532	GAT	2	6	123183	123188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543694
2537	NC_014532	CAC	2	6	123208	123213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543694
2538	NC_014532	CGA	2	6	123272	123277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543694
2539	NC_014532	AGG	2	6	123283	123288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543694
2540	NC_014532	AAG	2	6	123325	123330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543694
2541	NC_014532	A	6	6	123358	123363	100 %	0 %	0 %	0 %	307543694
2542	NC_014532	GGT	2	6	123411	123416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543694
2543	NC_014532	AAC	2	6	123417	123422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543694
2544	NC_014532	TATT	2	8	123423	123430	25 %	75 %	0 %	0 %	307543694
2545	NC_014532	CGT	2	6	123433	123438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543694
2546	NC_014532	GCC	2	6	123440	123445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543694
2547	NC_014532	CCA	2	6	123471	123476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543694
2548	NC_014532	CGG	2	6	123503	123508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543694
2549	NC_014532	TGA	2	6	123608	123613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543694
2550	NC_014532	GAT	2	6	123623	123628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543694
2551	NC_014532	GATGCA	2	12	123653	123664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	307543694
2552	NC_014532	GAA	2	6	123711	123716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543694
2553	NC_014532	GC	3	6	123771	123776	0 %	0 %	50 %	50 %	307543694
2554	NC_014532	GCA	2	6	123780	123785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543694
2555	NC_014532	TGG	2	6	123839	123844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543694
2556	NC_014532	GAA	2	6	123881	123886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543694
2557	NC_014532	TGG	2	6	123952	123957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543694
2558	NC_014532	AGGGA	2	10	123985	123994	40 %	0 %	60 %	0 %	307543694
2559	NC_014532	ATG	2	6	124111	124116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543695
2560	NC_014532	GTTG	2	8	124134	124141	0 %	50 %	50 %	0 %	307543695
2561	NC_014532	GGC	2	6	124213	124218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543695
2562	NC_014532	GGT	2	6	124338	124343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543695
2563	NC_014532	GGAG	2	8	124344	124351	25 %	0 %	75 %	0 %	307543695
2564	NC_014532	ATCAG	2	10	124370	124379	40 %	20 %	20 %	20 %	307543695
2565	NC_014532	TGG	2	6	124407	124412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543695
2566	NC_014532	TGC	2	6	124437	124442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543695
2567	NC_014532	GAT	2	6	124474	124479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543695
2568	NC_014532	AAG	2	6	124507	124512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543695
2569	NC_014532	TGA	2	6	124554	124559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543695
2570	NC_014532	TGGC	2	8	124710	124717	0 %	25 %	50 %	25 %	307543695
2571	NC_014532	GC	3	6	124783	124788	0 %	0 %	50 %	50 %	307543695
2572	NC_014532	AAC	2	6	124924	124929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543695
2573	NC_014532	GC	4	8	124941	124948	0 %	0 %	50 %	50 %	307543695
2574	NC_014532	AAT	2	6	124973	124978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307543696
2575	NC_014532	AAGA	2	8	124983	124990	75 %	0 %	25 %	0 %	307543696
2576	NC_014532	TGC	2	6	125186	125191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543696
2577	NC_014532	GGC	2	6	125283	125288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543696
2578	NC_014532	CCAAG	2	10	125324	125333	40 %	0 %	20 %	40 %	307543696
2579	NC_014532	CAA	2	6	125337	125342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543696
2580	NC_014532	T	6	6	125420	125425	0 %	100 %	0 %	0 %	307543696
2581	NC_014532	TCG	2	6	125468	125473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543696
2582	NC_014532	AGG	2	6	125650	125655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543696
2583	NC_014532	GGGCG	2	10	125688	125697	0 %	0 %	80 %	20 %	307543696
2584	NC_014532	AAC	2	6	125947	125952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543696
2585	NC_014532	GGT	2	6	125982	125987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543696
2586	NC_014532	CTC	2	6	127155	127160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543697
2587	NC_014532	CAG	2	6	127266	127271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543697
2588	NC_014532	CGT	2	6	127322	127327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543697
2589	NC_014532	GGCTG	2	10	127395	127404	0 %	20 %	60 %	20 %	307543697
2590	NC_014532	TTC	2	6	127422	127427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543697
2591	NC_014532	CTTC	2	8	127502	127509	0 %	50 %	0 %	50 %	307543697
2592	NC_014532	ACC	2	6	127537	127542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543697
2593	NC_014532	GTA	2	6	127632	127637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543697
2594	NC_014532	CGT	2	6	127703	127708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543697
2595	NC_014532	TCG	2	6	127765	127770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543697
2596	NC_014532	GTG	2	6	127804	127809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543697
2597	NC_014532	GTG	2	6	127819	127824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543697
2598	NC_014532	CCA	2	6	127835	127840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543697
2599	NC_014532	TGT	2	6	127990	127995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543697
2600	NC_014532	GGC	2	6	128013	128018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543697
2601	NC_014532	CGC	2	6	128039	128044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543697
2602	NC_014532	CAG	2	6	128046	128051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543697
2603	NC_014532	CAT	2	6	128213	128218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543698
2604	NC_014532	GGA	2	6	128273	128278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543698
2605	NC_014532	CG	3	6	128461	128466	0 %	0 %	50 %	50 %	307543698
2606	NC_014532	GGC	2	6	128503	128508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543698
2607	NC_014532	CGA	2	6	128567	128572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543698
2608	NC_014532	GGA	2	6	128573	128578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543698
2609	NC_014532	GC	3	6	128592	128597	0 %	0 %	50 %	50 %	307543698
2610	NC_014532	GGA	2	6	128645	128650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543698
2611	NC_014532	TGCC	2	8	128654	128661	0 %	25 %	25 %	50 %	307543698
2612	NC_014532	CGC	2	6	128755	128760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543698
2613	NC_014532	GCATG	2	10	129027	129036	20 %	20 %	40 %	20 %	307543699
2614	NC_014532	GAC	2	6	129050	129055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543699
2615	NC_014532	CTG	2	6	129080	129085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543699
2616	NC_014532	CCAT	2	8	129105	129112	25 %	25 %	0 %	50 %	307543699
2617	NC_014532	CTG	2	6	129134	129139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543699
2618	NC_014532	ACC	2	6	129140	129145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543699
2619	NC_014532	CGT	2	6	129197	129202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543699
2620	NC_014532	GCCCC	2	10	129205	129214	0 %	0 %	20 %	80 %	307543699
2621	NC_014532	CGG	2	6	129514	129519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543700
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2741	NC_014532	GGA	2	6	134294	134299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543703
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2861	NC_014532	GTC	2	6	138880	138885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543708
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2864	NC_014532	CCG	2	6	139185	139190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543709
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2884	NC_014532	GAT	2	6	139986	139991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543710
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2889	NC_014532	GAT	2	6	140148	140153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543710
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2961	NC_014532	GCT	2	6	144240	144245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543713
2962	NC_014532	GCAC	2	8	144256	144263	25 %	0 %	25 %	50 %	307543713
2963	NC_014532	ATC	2	6	144295	144300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543713
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2973	NC_014532	CTTCT	2	10	144829	144838	0 %	60 %	0 %	40 %	307543714
2974	NC_014532	CGA	2	6	144881	144886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543714
2975	NC_014532	CAA	2	6	144905	144910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543714
2976	NC_014532	TC	3	6	144931	144936	0 %	50 %	0 %	50 %	307543714
2977	NC_014532	GCA	2	6	144944	144949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543714
2978	NC_014532	GGA	2	6	144956	144961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543714
2979	NC_014532	CAT	2	6	145001	145006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543714
2980	NC_014532	GC	3	6	145012	145017	0 %	0 %	50 %	50 %	307543714
2981	NC_014532	TGG	2	6	145144	145149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543714
2982	NC_014532	TC	3	6	145160	145165	0 %	50 %	0 %	50 %	307543714
2983	NC_014532	GGAAAC	2	12	145268	145279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307543714
2984	NC_014532	CTCG	2	8	145343	145350	0 %	25 %	25 %	50 %	307543714
2985	NC_014532	AGG	2	6	145351	145356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543714
2986	NC_014532	GAA	2	6	145368	145373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543714
2987	NC_014532	GAG	2	6	145446	145451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543714
2988	NC_014532	GGC	3	9	145458	145466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543714
2989	NC_014532	GAC	2	6	145467	145472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543714
2990	NC_014532	AGA	2	6	145601	145606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543714
2991	NC_014532	CGTC	2	8	145610	145617	0 %	25 %	25 %	50 %	307543714
2992	NC_014532	ACC	2	6	145630	145635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543714
2993	NC_014532	GAA	2	6	146086	146091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543715
2994	NC_014532	ATG	2	6	146093	146098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543715
2995	NC_014532	TTC	2	6	146182	146187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543715
2996	NC_014532	CTC	2	6	146211	146216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543715
2997	NC_014532	GGA	2	6	146265	146270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543715
2998	NC_014532	TGC	2	6	146315	146320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543715
2999	NC_014532	CAT	2	6	146328	146333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543715
3000	NC_014532	CCA	2	6	146342	146347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543715

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