MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 81984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014532	CGA	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543608
502	NC_014532	GCC	2	6	24653	24658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543608
503	NC_014532	CGG	2	6	24659	24664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543608
504	NC_014532	TTC	2	6	24698	24703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543608
505	NC_014532	CTG	2	6	24725	24730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
506	NC_014532	CCT	2	6	24732	24737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307543608
507	NC_014532	GC	3	6	24738	24743	0 %	0 %	50 %	50 %	307543608
508	NC_014532	GCG	2	6	24747	24752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543608
509	NC_014532	CCGTGG	2	12	24756	24767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	307543608
510	NC_014532	GCC	2	6	24774	24779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543608
511	NC_014532	CGTT	2	8	24788	24795	0 %	50 %	25 %	25 %	307543608
512	NC_014532	CTGG	2	8	24850	24857	0 %	25 %	50 %	25 %	307543608
513	NC_014532	GCA	2	6	24890	24895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543608
514	NC_014532	GGA	2	6	24907	24912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543608
515	NC_014532	GTGA	2	8	24974	24981	25 %	25 %	50 %	0 %	307543608
516	NC_014532	TTG	2	6	24995	25000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543608
517	NC_014532	GGCG	2	8	25001	25008	0 %	0 %	75 %	25 %	307543608
518	NC_014532	GCT	2	6	25054	25059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
519	NC_014532	AGGCG	2	10	25192	25201	20 %	0 %	60 %	20 %	307543608
520	NC_014532	CGGCG	2	10	25261	25270	0 %	0 %	60 %	40 %	307543608
521	NC_014532	TCG	2	6	25281	25286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
522	NC_014532	GCCG	2	8	25327	25334	0 %	0 %	50 %	50 %	307543608
523	NC_014532	TGG	2	6	25416	25421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543608
524	NC_014532	GGC	2	6	25444	25449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543608
525	NC_014532	CGA	2	6	25468	25473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543608
526	NC_014532	CGG	2	6	25476	25481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543608
527	NC_014532	GGCC	2	8	25501	25508	0 %	0 %	50 %	50 %	307543608
528	NC_014532	GGT	2	6	25513	25518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543608
529	NC_014532	GCT	2	6	25567	25572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543608
530	NC_014532	GTGA	2	8	25579	25586	25 %	25 %	50 %	0 %	307543608
531	NC_014532	AGC	2	6	25635	25640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543609
532	NC_014532	GCG	2	6	25659	25664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543609
533	NC_014532	CAC	2	6	25679	25684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543609
534	NC_014532	CGA	2	6	25687	25692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543609
535	NC_014532	GTC	2	6	25724	25729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543609
536	NC_014532	ACC	2	6	25776	25781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543609
537	NC_014532	GGC	2	6	25934	25939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543609
538	NC_014532	TCT	2	6	25945	25950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307543609
539	NC_014532	GCCGC	2	10	25962	25971	0 %	0 %	40 %	60 %	307543609
540	NC_014532	CGG	2	6	26086	26091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543609
541	NC_014532	CGC	2	6	26125	26130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543609
542	NC_014532	TCG	2	6	26220	26225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543609
543	NC_014532	GCG	3	9	26229	26237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543609
544	NC_014532	GCC	2	6	26512	26517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543610
545	NC_014532	TC	3	6	26547	26552	0 %	50 %	0 %	50 %	307543610
546	NC_014532	CAA	2	6	26562	26567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307543610
547	NC_014532	CGA	2	6	26652	26657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
548	NC_014532	CGC	2	6	26679	26684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543610
549	NC_014532	CGG	2	6	26687	26692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
550	NC_014532	GGC	2	6	26718	26723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
551	NC_014532	CGTG	2	8	26790	26797	0 %	25 %	50 %	25 %	307543610
552	NC_014532	GGT	2	6	26811	26816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543610
553	NC_014532	CGC	5	15	26835	26849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543610
554	NC_014532	CGA	2	6	26901	26906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
555	NC_014532	GGCG	2	8	26962	26969	0 %	0 %	75 %	25 %	307543610
556	NC_014532	GGT	2	6	26998	27003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543610
557	NC_014532	GCCT	2	8	27085	27092	0 %	25 %	25 %	50 %	307543610
558	NC_014532	GGC	2	6	27096	27101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
559	NC_014532	GCG	2	6	27110	27115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
560	NC_014532	TGG	2	6	27206	27211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543610
561	NC_014532	ACG	2	6	27212	27217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
562	NC_014532	TCA	2	6	27218	27223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543610
563	NC_014532	CGA	2	6	27234	27239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
564	NC_014532	CGC	2	6	27246	27251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543610
565	NC_014532	GAG	2	6	27268	27273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543610
566	NC_014532	GGCC	2	8	27312	27319	0 %	0 %	50 %	50 %	307543610
567	NC_014532	AAG	2	6	27322	27327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543610
568	NC_014532	GA	3	6	27353	27358	50 %	0 %	50 %	0 %	307543610
569	NC_014532	GCA	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
570	NC_014532	AGC	2	6	27437	27442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543610
571	NC_014532	AAG	2	6	27490	27495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307543610
572	NC_014532	GCG	2	6	27596	27601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
573	NC_014532	GCG	2	6	27632	27637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543610
574	NC_014532	TGA	2	6	27773	27778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543610
575	NC_014532	GCC	2	6	27841	27846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543610
576	NC_014532	TGG	2	6	27860	27865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543610
577	NC_014532	GGAA	2	8	27935	27942	50 %	0 %	50 %	0 %	307543610
578	NC_014532	GCC	2	6	28601	28606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543611
579	NC_014532	TCG	2	6	28632	28637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543611
580	NC_014532	AGG	2	6	28653	28658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543611
581	NC_014532	ACG	2	6	28659	28664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543611
582	NC_014532	GCC	2	6	28677	28682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543611
583	NC_014532	GC	3	6	28699	28704	0 %	0 %	50 %	50 %	307543611
584	NC_014532	GCA	2	6	28849	28854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543611
585	NC_014532	CGT	2	6	28876	28881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543611
586	NC_014532	GGC	2	6	28958	28963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543611
587	NC_014532	CG	3	6	28972	28977	0 %	0 %	50 %	50 %	307543611
588	NC_014532	CGG	2	6	28995	29000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543611
589	NC_014532	CGT	2	6	29022	29027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543611
590	NC_014532	GTG	2	6	29028	29033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543611
591	NC_014532	GCTG	2	8	29342	29349	0 %	25 %	50 %	25 %	307543612
592	NC_014532	GCTC	2	8	29351	29358	0 %	25 %	25 %	50 %	307543612
593	NC_014532	GTT	2	6	29378	29383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307543612
594	NC_014532	GCC	2	6	29422	29427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543612
595	NC_014532	ATG	2	6	29428	29433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543612
596	NC_014532	ACC	2	6	29452	29457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543612
597	NC_014532	GC	3	6	29499	29504	0 %	0 %	50 %	50 %	307543612
598	NC_014532	CG	3	6	29505	29510	0 %	0 %	50 %	50 %	307543612
599	NC_014532	GCTT	2	8	29516	29523	0 %	50 %	25 %	25 %	307543612
600	NC_014532	CGG	2	6	29532	29537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543612
601	NC_014532	CAG	2	6	29562	29567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543612
602	NC_014532	TGG	2	6	29579	29584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543612
603	NC_014532	AACG	2	8	29748	29755	50 %	0 %	25 %	25 %	307543613
604	NC_014532	CCA	2	6	29767	29772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307543613
605	NC_014532	CTG	2	6	29787	29792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543613
606	NC_014532	GCA	2	6	29797	29802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543613
607	NC_014532	GCTG	2	8	29872	29879	0 %	25 %	50 %	25 %	307543613
608	NC_014532	AGC	2	6	29908	29913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543613
609	NC_014532	CCG	2	6	29929	29934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543613
610	NC_014532	CTG	2	6	29940	29945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543613
611	NC_014532	GGC	2	6	29950	29955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543613
612	NC_014532	CTG	2	6	30003	30008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543613
613	NC_014532	GC	3	6	30035	30040	0 %	0 %	50 %	50 %	307543613
614	NC_014532	GGT	2	6	30077	30082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307543613
615	NC_014532	CGA	2	6	30095	30100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543613
616	NC_014532	CGA	2	6	30140	30145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543613
617	NC_014532	CGAGAA	2	12	30191	30202	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	307543613
618	NC_014532	TGC	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543613
619	NC_014532	AGC	2	6	30259	30264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543613
620	NC_014532	TGA	2	6	30293	30298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543613
621	NC_014532	CGCCC	3	15	30363	30377	0 %	0 %	20 %	80 %	307543614
622	NC_014532	GCC	2	6	30445	30450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543614
623	NC_014532	CTG	2	6	30559	30564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543614
624	NC_014532	TGC	3	9	30566	30574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543614
625	NC_014532	GCG	2	6	30806	30811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543614
626	NC_014532	GCC	2	6	30843	30848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543614
627	NC_014532	GCT	2	6	30849	30854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543614
628	NC_014532	TGC	2	6	30878	30883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543614
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631	NC_014532	TGCCCA	2	12	30948	30959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307543614
632	NC_014532	GCC	2	6	30980	30985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543614
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703	NC_014532	GCT	2	6	34109	34114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543616
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739	NC_014532	GTC	2	6	35442	35447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543617
740	NC_014532	CGA	2	6	35465	35470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543617
741	NC_014532	AGCGG	2	10	35476	35485	20 %	0 %	60 %	20 %	307543617
742	NC_014532	GAG	2	6	35487	35492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543617
743	NC_014532	GGC	2	6	35519	35524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543617
744	NC_014532	TC	3	6	35554	35559	0 %	50 %	0 %	50 %	307543617
745	NC_014532	CCG	2	6	35657	35662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307543618
746	NC_014532	ACG	2	6	35699	35704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543618
747	NC_014532	GGA	2	6	35726	35731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307543618
748	NC_014532	CACC	2	8	35746	35753	25 %	0 %	0 %	75 %	307543618
749	NC_014532	GGC	2	6	35780	35785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543618
750	NC_014532	TGC	2	6	35805	35810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307543618
751	NC_014532	TCA	2	6	35827	35832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307543618
752	NC_014532	GAT	2	6	35849	35854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307543618
753	NC_014532	CAG	2	6	35855	35860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307543618
754	NC_014532	CGGC	2	8	35898	35905	0 %	0 %	50 %	50 %	307543618
755	NC_014532	GCCG	2	8	35927	35934	0 %	0 %	50 %	50 %	307543618
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824	NC_014532	GGC	2	6	38963	38968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307543620
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