MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014323	TGG	2	6	155226	155231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309490
3502	NC_014323	GCG	2	6	155232	155237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309490
3503	NC_014323	CAGC	2	8	155247	155254	25 %	0 %	25 %	50 %	300309490
3504	NC_014323	AGA	2	6	155283	155288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309490
3505	NC_014323	CAC	2	6	155314	155319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309490
3506	NC_014323	ACC	2	6	155372	155377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309490
3507	NC_014323	GC	3	6	155384	155389	0 %	0 %	50 %	50 %	300309490
3508	NC_014323	CCG	2	6	155442	155447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309490
3509	NC_014323	GTC	2	6	155489	155494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309490
3510	NC_014323	GGC	2	6	155504	155509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309490
3511	NC_014323	CGT	2	6	155512	155517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309490
3512	NC_014323	TCCT	2	8	155558	155565	0 %	50 %	0 %	50 %	300309490
3513	NC_014323	TCC	2	6	155579	155584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309490
3514	NC_014323	TCA	2	6	155625	155630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309490
3515	NC_014323	GGCC	2	8	155680	155687	0 %	0 %	50 %	50 %	300309490
3516	NC_014323	TCA	2	6	155697	155702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309490
3517	NC_014323	GAA	2	6	155818	155823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309490
3518	NC_014323	CGG	2	6	155856	155861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309490
3519	NC_014323	GTA	2	6	155895	155900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309490
3520	NC_014323	TTC	2	6	155951	155956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309490
3521	NC_014323	GTG	2	6	155969	155974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309490
3522	NC_014323	GAA	2	6	156019	156024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309490
3523	NC_014323	TAC	2	6	156053	156058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309490
3524	NC_014323	AATCA	2	10	156274	156283	60 %	20 %	0 %	20 %	300309491
3525	NC_014323	GCG	2	6	156287	156292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309491
3526	NC_014323	TGA	2	6	156337	156342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309491
3527	NC_014323	TGC	3	9	156387	156395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309491
3528	NC_014323	GGC	2	6	156407	156412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309491
3529	NC_014323	CTG	2	6	156431	156436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309491
3530	NC_014323	GCGCG	2	10	156469	156478	0 %	0 %	60 %	40 %	300309491
3531	NC_014323	GAA	2	6	156491	156496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309491
3532	NC_014323	GCC	2	6	156513	156518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309491
3533	NC_014323	GTT	2	6	156532	156537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309491
3534	NC_014323	GCA	2	6	156553	156558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309491
3535	NC_014323	CAG	2	6	156629	156634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309491
3536	NC_014323	CGC	2	6	156646	156651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309491
3537	NC_014323	TGG	2	6	156654	156659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309491
3538	NC_014323	TGA	2	6	156676	156681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309491
3539	NC_014323	GCG	2	6	156699	156704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309491
3540	NC_014323	ACG	2	6	156909	156914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3541	NC_014323	GGC	2	6	157013	157018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309492
3542	NC_014323	GCG	2	6	157043	157048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309492
3543	NC_014323	GTA	2	6	157058	157063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309492
3544	NC_014323	GCC	3	9	157118	157126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309492
3545	NC_014323	GC	3	6	157139	157144	0 %	0 %	50 %	50 %	300309492
3546	NC_014323	CG	3	6	157231	157236	0 %	0 %	50 %	50 %	300309492
3547	NC_014323	CTG	2	6	157261	157266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3548	NC_014323	CG	5	10	157309	157318	0 %	0 %	50 %	50 %	300309492
3549	NC_014323	GGC	2	6	157330	157335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309492
3550	NC_014323	GGC	2	6	157361	157366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309492
3551	NC_014323	GCA	2	6	157399	157404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3552	NC_014323	GGC	2	6	157409	157414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309492
3553	NC_014323	GC	3	6	157413	157418	0 %	0 %	50 %	50 %	300309492
3554	NC_014323	CAG	2	6	157439	157444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3555	NC_014323	GCTGT	2	10	157469	157478	0 %	40 %	40 %	20 %	300309492
3556	NC_014323	CCA	2	6	157561	157566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309492
3557	NC_014323	CTG	2	6	157607	157612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3558	NC_014323	ACC	2	6	157647	157652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309492
3559	NC_014323	CCAG	2	8	157657	157664	25 %	0 %	25 %	50 %	300309492
3560	NC_014323	GCA	2	6	157723	157728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3561	NC_014323	CGT	2	6	157729	157734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3562	NC_014323	TGC	2	6	157791	157796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3563	NC_014323	GTC	2	6	157817	157822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309492
3564	NC_014323	CTTG	2	8	157860	157867	0 %	50 %	25 %	25 %	300309493
3565	NC_014323	GC	3	6	157873	157878	0 %	0 %	50 %	50 %	300309493
3566	NC_014323	CGGCGC	2	12	157911	157922	0 %	0 %	50 %	50 %	300309493
3567	NC_014323	CAT	2	6	157933	157938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309493
3568	NC_014323	CAT	2	6	157945	157950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309493
3569	NC_014323	CCAG	2	8	157965	157972	25 %	0 %	25 %	50 %	300309493
3570	NC_014323	GCC	2	6	157985	157990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309493
3571	NC_014323	CGC	2	6	158007	158012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309493
3572	NC_014323	TGACCA	2	12	158091	158102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309493
3573	NC_014323	TCG	2	6	158147	158152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3574	NC_014323	TGC	2	6	158184	158189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3575	NC_014323	GCC	2	6	158204	158209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309493
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3577	NC_014323	GGC	2	6	158317	158322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309493
3578	NC_014323	CCAT	2	8	158330	158337	25 %	25 %	0 %	50 %	300309493
3579	NC_014323	CAG	2	6	158398	158403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3580	NC_014323	TCG	2	6	158414	158419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3581	NC_014323	GC	3	6	158528	158533	0 %	0 %	50 %	50 %	300309493
3582	NC_014323	CG	3	6	158538	158543	0 %	0 %	50 %	50 %	300309493
3583	NC_014323	TGG	2	6	158562	158567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309493
3584	NC_014323	TTC	2	6	158647	158652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309493
3585	NC_014323	GCA	2	6	158661	158666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3586	NC_014323	ACG	2	6	158700	158705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309493
3587	NC_014323	TGA	2	6	158769	158774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309493
3588	NC_014323	GC	3	6	158792	158797	0 %	0 %	50 %	50 %	300309493
3589	NC_014323	TCG	2	6	159182	159187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309494
3590	NC_014323	GCA	2	6	159188	159193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309494
3591	NC_014323	CGG	3	9	159207	159215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309494
3592	NC_014323	GCC	2	6	159221	159226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309494
3593	NC_014323	GGC	2	6	159235	159240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309494
3594	NC_014323	GGCC	2	8	159252	159259	0 %	0 %	50 %	50 %	300309494
3595	NC_014323	CTT	2	6	159282	159287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309494
3596	NC_014323	AGGT	2	8	159368	159375	25 %	25 %	50 %	0 %	300309494
3597	NC_014323	TGG	2	6	159396	159401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309494
3598	NC_014323	ATGG	2	8	159442	159449	25 %	25 %	50 %	0 %	300309494
3599	NC_014323	ATC	2	6	159476	159481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309494
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3601	NC_014323	CGA	2	6	159516	159521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309494
3602	NC_014323	TCA	2	6	159522	159527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309494
3603	NC_014323	GCC	2	6	159533	159538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309494
3604	NC_014323	CCA	2	6	159633	159638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309494
3605	NC_014323	GCC	2	6	159697	159702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309494
3606	NC_014323	GGT	2	6	159871	159876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309494
3607	NC_014323	GAA	2	6	159877	159882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309494
3608	NC_014323	TGG	2	6	159906	159911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309494
3609	NC_014323	TGT	2	6	160133	160138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309495
3610	NC_014323	TGC	2	6	160149	160154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309495
3611	NC_014323	TGA	2	6	160188	160193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309495
3612	NC_014323	CGGC	2	8	160295	160302	0 %	0 %	50 %	50 %	300309495
3613	NC_014323	AGC	2	6	160361	160366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309495
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3618	NC_014323	CGC	2	6	160545	160550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309495
3619	NC_014323	GCTG	2	8	160570	160577	0 %	25 %	50 %	25 %	300309495
3620	NC_014323	GGCC	2	8	160623	160630	0 %	0 %	50 %	50 %	300309495
3621	NC_014323	GGC	2	6	160672	160677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309495
3622	NC_014323	ACC	2	6	160702	160707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309495
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3864	NC_014323	GC	3	6	171729	171734	0 %	0 %	50 %	50 %	300309506
3865	NC_014323	AGGC	2	8	171749	171756	25 %	0 %	50 %	25 %	300309506
3866	NC_014323	GCG	2	6	171782	171787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309506
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3868	NC_014323	GCA	2	6	171878	171883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309507
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3973	NC_014323	CCG	2	6	175710	175715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309511
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3979	NC_014323	GCT	2	6	176038	176043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309512
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3981	NC_014323	TCG	2	6	176075	176080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309512
3982	NC_014323	CGA	2	6	176148	176153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309512
3983	NC_014323	CAA	2	6	176160	176165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309512
3984	NC_014323	TCC	2	6	176194	176199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309512
3985	NC_014323	GT	3	6	176207	176212	0 %	50 %	50 %	0 %	300309512
3986	NC_014323	CGGCCT	2	12	176213	176224	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	300309512
3987	NC_014323	GCGTC	2	10	176236	176245	0 %	20 %	40 %	40 %	300309512
3988	NC_014323	CAT	2	6	176247	176252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309512
3989	NC_014323	CG	3	6	176270	176275	0 %	0 %	50 %	50 %	300309512
3990	NC_014323	TGA	2	6	176276	176281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309512
3991	NC_014323	GCG	2	6	176350	176355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309512
3992	NC_014323	CCGC	2	8	176357	176364	0 %	0 %	25 %	75 %	300309512
3993	NC_014323	CGG	2	6	176387	176392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309512
3994	NC_014323	GCT	2	6	176394	176399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309512
3995	NC_014323	CGG	2	6	176418	176423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309512
3996	NC_014323	TGG	2	6	176462	176467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309512
3997	NC_014323	CCT	2	6	176525	176530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309512
3998	NC_014323	GCA	2	6	176633	176638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309512
3999	NC_014323	GCC	2	6	176648	176653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309512
4000	NC_014323	CTG	2	6	176732	176737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309512

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