MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 125019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014323	TGC	2	6	263042	263047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6002	NC_014323	GCTGGA	2	12	263100	263111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300309596
6003	NC_014323	TGA	2	6	263130	263135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309596
6004	NC_014323	CCG	2	6	263153	263158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309596
6005	NC_014323	CTG	2	6	263170	263175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6006	NC_014323	GGT	2	6	263181	263186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309596
6007	NC_014323	GGC	2	6	263245	263250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309596
6008	NC_014323	CTG	2	6	263347	263352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6009	NC_014323	GAA	2	6	263388	263393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309596
6010	NC_014323	GC	3	6	263399	263404	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6011	NC_014323	GAA	2	6	263422	263427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309596
6012	NC_014323	TCA	2	6	263456	263461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309596
6013	NC_014323	GCC	2	6	263551	263556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309596
6014	NC_014323	GTG	2	6	263572	263577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309596
6015	NC_014323	GCG	2	6	263642	263647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309596
6016	NC_014323	CGC	2	6	263658	263663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309596
6017	NC_014323	GC	3	6	263677	263682	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6018	NC_014323	CG	3	6	263691	263696	0 %	0 %	50 %	50 %	300309596
6019	NC_014323	CTG	2	6	263698	263703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309596
6020	NC_014323	GCC	2	6	263743	263748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309596
6021	NC_014323	GTT	2	6	263772	263777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300309596
6022	NC_014323	GCA	2	6	263981	263986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6023	NC_014323	A	6	6	264023	264028	100 %	0 %	0 %	0 %	300309597
6024	NC_014323	GCC	2	6	264068	264073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6025	NC_014323	AAGG	2	8	264122	264129	50 %	0 %	50 %	0 %	300309597
6026	NC_014323	GAA	2	6	264133	264138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309597
6027	NC_014323	CAA	2	6	264196	264201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300309597
6028	NC_014323	CGC	2	6	264208	264213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6029	NC_014323	TCA	2	6	264270	264275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309597
6030	NC_014323	AAG	2	6	264320	264325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309597
6031	NC_014323	GC	3	6	264422	264427	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6032	NC_014323	GCG	2	6	264432	264437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6033	NC_014323	CTT	2	6	264442	264447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309597
6034	NC_014323	CGC	2	6	264453	264458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6035	NC_014323	CAC	3	9	264535	264543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309597
6036	NC_014323	GTG	2	6	264557	264562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309597
6037	NC_014323	TCG	2	6	264585	264590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6038	NC_014323	CCA	2	6	264621	264626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309597
6039	NC_014323	TC	3	6	264649	264654	0 %	50 %	0 %	50 %	300309597
6040	NC_014323	TGACC	2	10	264670	264679	20 %	20 %	20 %	40 %	300309597
6041	NC_014323	CCG	2	6	264720	264725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6042	NC_014323	GTG	2	6	264728	264733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309597
6043	NC_014323	TCA	2	6	264756	264761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309597
6044	NC_014323	CTT	2	6	264793	264798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309597
6045	NC_014323	CTC	2	6	264799	264804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300309597
6046	NC_014323	CGC	2	6	264816	264821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6047	NC_014323	GC	3	6	264846	264851	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6048	NC_014323	AGA	2	6	264858	264863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309597
6049	NC_014323	GCG	2	6	264864	264869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6050	NC_014323	AAG	2	6	264881	264886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309597
6051	NC_014323	GCG	2	6	264939	264944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6052	NC_014323	CAT	2	6	264958	264963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309597
6053	NC_014323	GC	3	6	265109	265114	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6054	NC_014323	GCC	2	6	265178	265183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6055	NC_014323	CGC	2	6	265248	265253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6056	NC_014323	GAA	2	6	265318	265323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309597
6057	NC_014323	GCC	2	6	265397	265402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6058	NC_014323	CAC	2	6	265420	265425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309597
6059	NC_014323	CTT	2	6	265426	265431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300309597
6060	NC_014323	ACG	3	9	265464	265472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6061	NC_014323	GGC	2	6	265604	265609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6062	NC_014323	CGGC	2	8	265617	265624	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6063	NC_014323	TGC	2	6	265641	265646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6064	NC_014323	CGG	2	6	265660	265665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6065	NC_014323	GGT	2	6	265684	265689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309597
6066	NC_014323	CGC	2	6	265744	265749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6067	NC_014323	GGT	2	6	265772	265777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309597
6068	NC_014323	CTG	3	9	265784	265792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6069	NC_014323	TGG	2	6	265836	265841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309597
6070	NC_014323	GTGGGC	2	12	265844	265855	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	300309597
6071	NC_014323	GGC	2	6	265871	265876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6072	NC_014323	GCC	2	6	265886	265891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6073	NC_014323	CG	3	6	265895	265900	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6074	NC_014323	TGC	2	6	266052	266057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6075	NC_014323	GC	5	10	266075	266084	0 %	0 %	50 %	50 %	300309597
6076	NC_014323	GCC	2	6	266113	266118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309597
6077	NC_014323	TGGCC	2	10	266143	266152	0 %	20 %	40 %	40 %	300309597
6078	NC_014323	CAT	2	6	266155	266160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309597
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6080	NC_014323	GAT	2	6	266224	266229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309597
6081	NC_014323	CGG	2	6	266245	266250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309597
6082	NC_014323	GCA	2	6	266265	266270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309597
6083	NC_014323	GCT	2	6	266287	266292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309597
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6086	NC_014323	ATG	2	6	266360	266365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309597
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6088	NC_014323	TCG	2	6	266470	266475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6089	NC_014323	CCCG	2	8	266527	266534	0 %	0 %	25 %	75 %	300309598
6090	NC_014323	CTG	2	6	266541	266546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6091	NC_014323	GC	3	6	266549	266554	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6092	NC_014323	CCG	2	6	266563	266568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
6093	NC_014323	TCG	2	6	266614	266619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6094	NC_014323	GCT	2	6	266620	266625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6095	NC_014323	GC	3	6	266658	266663	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6096	NC_014323	TGC	2	6	266671	266676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6097	NC_014323	GGCC	2	8	266678	266685	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6098	NC_014323	CGG	2	6	266699	266704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309598
6099	NC_014323	CGCCAT	2	12	266741	266752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309598
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6101	NC_014323	CGC	2	6	266795	266800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
6102	NC_014323	TCGATG	2	12	266811	266822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300309598
6103	NC_014323	GAT	2	6	266828	266833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300309598
6104	NC_014323	CCG	2	6	266908	266913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
6105	NC_014323	GCA	2	6	266924	266929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6106	NC_014323	CG	3	6	266941	266946	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6107	NC_014323	CGC	2	6	266990	266995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
6108	NC_014323	AGG	2	6	266998	267003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300309598
6109	NC_014323	GATGA	2	10	267018	267027	40 %	20 %	40 %	0 %	300309598
6110	NC_014323	CTTC	2	8	267028	267035	0 %	50 %	0 %	50 %	300309598
6111	NC_014323	TCG	2	6	267040	267045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300309598
6112	NC_014323	CG	3	6	267115	267120	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6113	NC_014323	CGC	2	6	267164	267169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
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6115	NC_014323	CGGCGC	2	12	267212	267223	0 %	0 %	50 %	50 %	300309598
6116	NC_014323	ATC	2	6	267228	267233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300309598
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6118	NC_014323	GCC	2	6	267308	267313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309598
6119	NC_014323	GAAG	2	8	267335	267342	50 %	0 %	50 %	0 %	300309598
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6121	NC_014323	AAG	2	6	267803	267808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309599
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6242	NC_014323	CCA	2	6	272866	272871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300309602
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6483	NC_014323	AAG	2	6	281688	281693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300309610
6484	NC_014323	GCC	2	6	281706	281711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300309610
6485	NC_014323	ACATCG	2	12	281908	281919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300309610
6486	NC_014323	GCA	2	6	281954	281959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300309610
6487	NC_014323	CGG	2	6	281975	281980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300309610
6488	NC_014323	GGT	2	6	281990	281995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300309610
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6491	NC_014323	GAAGA	2	10	282075	282084	60 %	0 %	40 %	0 %	300309610
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6499	NC_014323	CTCACG	2	12	282294	282305	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300309610
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