MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 2566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014313	CCGTC	2	10	253	262	0 %	20 %	20 %	60 %	300021539
2	NC_014313	GCGCA	2	10	1068	1077	20 %	0 %	40 %	40 %	300021540
3	NC_014313	GCGCT	2	10	1359	1368	0 %	20 %	40 %	40 %	300021540
4	NC_014313	GGGGA	2	10	4518	4527	20 %	0 %	80 %	0 %	300021543
5	NC_014313	GGCGC	2	10	5264	5273	0 %	0 %	60 %	40 %	300021543
6	NC_014313	CGGGT	2	10	5733	5742	0 %	20 %	60 %	20 %	300021544
7	NC_014313	GTTTC	2	10	6151	6160	0 %	60 %	20 %	20 %	300021544
8	NC_014313	CGATC	2	10	6372	6381	20 %	20 %	20 %	40 %	300021544
9	NC_014313	GTGCT	2	10	6454	6463	0 %	40 %	40 %	20 %	300021544
10	NC_014313	AAATC	2	10	8444	8453	60 %	20 %	0 %	20 %	300021545
11	NC_014313	GGAGA	2	10	9925	9934	40 %	0 %	60 %	0 %	300021546
12	NC_014313	TCGGC	2	10	11845	11854	0 %	20 %	40 %	40 %	300021547
13	NC_014313	GCAGC	2	10	12200	12209	20 %	0 %	40 %	40 %	300021547
14	NC_014313	TCGCG	2	10	12803	12812	0 %	20 %	40 %	40 %	300021547
15	NC_014313	GATGC	2	10	13377	13386	20 %	20 %	40 %	20 %	300021547
16	NC_014313	GCTTT	2	10	13733	13742	0 %	60 %	20 %	20 %	300021548
17	NC_014313	CGGCG	2	10	14084	14093	0 %	0 %	60 %	40 %	300021548
18	NC_014313	GCCAA	2	10	15002	15011	40 %	0 %	20 %	40 %	300021549
19	NC_014313	CGCAA	2	10	15545	15554	40 %	0 %	20 %	40 %	300021550
20	NC_014313	CGGCG	2	10	17221	17230	0 %	0 %	60 %	40 %	300021551
21	NC_014313	CGGCG	2	10	17649	17658	0 %	0 %	60 %	40 %	300021552
22	NC_014313	CGCGC	2	10	18258	18267	0 %	0 %	40 %	60 %	300021553
23	NC_014313	TCGCG	2	10	19201	19210	0 %	20 %	40 %	40 %	300021553
24	NC_014313	GCGGG	2	10	19228	19237	0 %	0 %	80 %	20 %	300021553
25	NC_014313	CGGCG	2	10	19497	19506	0 %	0 %	60 %	40 %	300021553
26	NC_014313	CGTTC	2	10	19822	19831	0 %	40 %	20 %	40 %	300021554
27	NC_014313	CGCGG	2	10	23824	23833	0 %	0 %	60 %	40 %	300021557
28	NC_014313	GCGTC	2	10	25649	25658	0 %	20 %	40 %	40 %	300021559
29	NC_014313	GCGCG	2	10	27296	27305	0 %	0 %	60 %	40 %	300021561
30	NC_014313	GTCCG	2	10	27678	27687	0 %	20 %	40 %	40 %	300021561
31	NC_014313	CCGCG	2	10	32405	32414	0 %	0 %	40 %	60 %	300021566
32	NC_014313	GACCA	2	10	32670	32679	40 %	0 %	20 %	40 %	300021567
33	NC_014313	AAACG	2	10	35269	35278	60 %	0 %	20 %	20 %	300021569
34	NC_014313	GGTCG	2	10	36226	36235	0 %	20 %	60 %	20 %	300021571
35	NC_014313	GCGAT	2	10	37143	37152	20 %	20 %	40 %	20 %	300021572
36	NC_014313	GCGAA	2	10	38355	38364	40 %	0 %	40 %	20 %	300021573
37	NC_014313	CCGTC	2	10	44422	44431	0 %	20 %	20 %	60 %	300021577
38	NC_014313	GGCTT	2	10	44757	44766	0 %	40 %	40 %	20 %	300021577
39	NC_014313	GCCGG	2	10	45080	45089	0 %	0 %	60 %	40 %	300021577
40	NC_014313	GATCG	2	10	46824	46833	20 %	20 %	40 %	20 %	300021579
41	NC_014313	CGGCG	2	10	47724	47733	0 %	0 %	60 %	40 %	300021580
42	NC_014313	GCGCG	2	10	48763	48772	0 %	0 %	60 %	40 %	300021580
43	NC_014313	GGCCG	2	10	51128	51137	0 %	0 %	60 %	40 %	300021581
44	NC_014313	GTCGC	2	10	53658	53667	0 %	20 %	40 %	40 %	300021581
45	NC_014313	TCGGG	2	10	54631	54640	0 %	20 %	60 %	20 %	300021581
46	NC_014313	GCGCG	2	10	58663	58672	0 %	0 %	60 %	40 %	300021584
47	NC_014313	TCGCG	2	10	58700	58709	0 %	20 %	40 %	40 %	300021584
48	NC_014313	CGCGG	2	10	59235	59244	0 %	0 %	60 %	40 %	300021584
49	NC_014313	TGATC	2	10	62122	62131	20 %	40 %	20 %	20 %	300021585
50	NC_014313	AGCGC	2	10	62323	62332	20 %	0 %	40 %	40 %	300021585
51	NC_014313	GACGG	2	10	63092	63101	20 %	0 %	60 %	20 %	300021585
52	NC_014313	CGGTG	2	10	63412	63421	0 %	20 %	60 %	20 %	300021585
53	NC_014313	AGCCG	2	10	63911	63920	20 %	0 %	40 %	40 %	300021585
54	NC_014313	GCGCG	2	10	64420	64429	0 %	0 %	60 %	40 %	300021585
55	NC_014313	GCGTC	2	10	64711	64720	0 %	20 %	40 %	40 %	300021585
56	NC_014313	CCCGG	2	10	65830	65839	0 %	0 %	40 %	60 %	300021586
57	NC_014313	TCGCG	2	10	66756	66765	0 %	20 %	40 %	40 %	300021587
58	NC_014313	GTCGC	2	10	66928	66937	0 %	20 %	40 %	40 %	300021587
59	NC_014313	CGTTC	2	10	71631	71640	0 %	40 %	20 %	40 %	300021592
60	NC_014313	CGCTG	2	10	71646	71655	0 %	20 %	40 %	40 %	300021592
61	NC_014313	CGGCG	2	10	72342	72351	0 %	0 %	60 %	40 %	300021592
62	NC_014313	GCATC	2	10	72654	72663	20 %	20 %	20 %	40 %	300021592
63	NC_014313	GATGC	2	10	74600	74609	20 %	20 %	40 %	20 %	300021594
64	NC_014313	CAGGC	2	10	76712	76721	20 %	0 %	40 %	40 %	300021595
65	NC_014313	GCAGA	2	10	76971	76980	40 %	0 %	40 %	20 %	300021596
66	NC_014313	TGTCC	2	10	79428	79437	0 %	40 %	20 %	40 %	300021599
67	NC_014313	CTTGC	2	10	81114	81123	0 %	40 %	20 %	40 %	300021601
68	NC_014313	CGCTG	2	10	81258	81267	0 %	20 %	40 %	40 %	300021601
69	NC_014313	CGCGG	2	10	84475	84484	0 %	0 %	60 %	40 %	300021606
70	NC_014313	TACGC	2	10	85729	85738	20 %	20 %	20 %	40 %	300021607
71	NC_014313	GTTCA	2	10	86481	86490	20 %	40 %	20 %	20 %	300021607
72	NC_014313	GGCCG	2	10	90306	90315	0 %	0 %	60 %	40 %	300021613
73	NC_014313	GCGAG	2	10	93085	93094	20 %	0 %	60 %	20 %	300021616
74	NC_014313	CAAGC	2	10	93925	93934	40 %	0 %	20 %	40 %	300021617
75	NC_014313	TGGCG	2	10	94391	94400	0 %	20 %	60 %	20 %	300021618
76	NC_014313	GGTGT	2	10	94633	94642	0 %	40 %	60 %	0 %	300021618
77	NC_014313	CGGTG	2	10	94966	94975	0 %	20 %	60 %	20 %	300021618
78	NC_014313	ATCAG	2	10	97021	97030	40 %	20 %	20 %	20 %	300021620
79	NC_014313	GGATC	2	10	98949	98958	20 %	20 %	40 %	20 %	300021622
80	NC_014313	CGGAC	2	10	99086	99095	20 %	0 %	40 %	40 %	300021622
81	NC_014313	AAGAT	2	10	101683	101692	60 %	20 %	20 %	0 %	300021625
82	NC_014313	GGCCG	2	10	104205	104214	0 %	0 %	60 %	40 %	300021627
83	NC_014313	GGAAA	2	10	104467	104476	60 %	0 %	40 %	0 %	300021627
84	NC_014313	CGGCG	2	10	106459	106468	0 %	0 %	60 %	40 %	300021627
85	NC_014313	TTGCC	2	10	106533	106542	0 %	40 %	20 %	40 %	300021627
86	NC_014313	GCCGG	2	10	110052	110061	0 %	0 %	60 %	40 %	300021629
87	NC_014313	GTGCG	2	10	111232	111241	0 %	20 %	60 %	20 %	300021630
88	NC_014313	AATGG	2	10	111366	111375	40 %	20 %	40 %	0 %	300021630
89	NC_014313	AGTGA	2	10	112019	112028	40 %	20 %	40 %	0 %	300021630
90	NC_014313	GCGCT	2	10	113121	113130	0 %	20 %	40 %	40 %	300021631
91	NC_014313	GCGAT	2	10	114906	114915	20 %	20 %	40 %	20 %	300021633
92	NC_014313	GGCAA	2	10	121145	121154	40 %	0 %	40 %	20 %	300021639
93	NC_014313	CACGC	2	10	121637	121646	20 %	0 %	20 %	60 %	300021639
94	NC_014313	GCGCC	2	10	122746	122755	0 %	0 %	40 %	60 %	300021640
95	NC_014313	TCTCG	2	10	123415	123424	0 %	40 %	20 %	40 %	300021640
96	NC_014313	CTTTG	2	10	125274	125283	0 %	60 %	20 %	20 %	300021641
97	NC_014313	GCCGC	2	10	126477	126486	0 %	0 %	40 %	60 %	300021642
98	NC_014313	CGCAA	2	10	129964	129973	40 %	0 %	20 %	40 %	300021643
99	NC_014313	TGCTT	2	10	132389	132398	0 %	60 %	20 %	20 %	300021650
100	NC_014313	CGATC	2	10	132784	132793	20 %	20 %	20 %	40 %	300021651
101	NC_014313	ATACG	2	10	133677	133686	40 %	20 %	20 %	20 %	300021653
102	NC_014313	CAGCG	2	10	134949	134958	20 %	0 %	40 %	40 %	300021657
103	NC_014313	CGCTT	2	10	135489	135498	0 %	40 %	20 %	40 %	300021658
104	NC_014313	GATTT	2	10	137658	137667	20 %	60 %	20 %	0 %	300021662
105	NC_014313	GAATG	2	10	139517	139526	40 %	20 %	40 %	0 %	300021667
106	NC_014313	ACGCC	2	10	142786	142795	20 %	0 %	20 %	60 %	300021672
107	NC_014313	TCGCC	2	10	143121	143130	0 %	20 %	20 %	60 %	300021672
108	NC_014313	TCAAA	2	10	144797	144806	60 %	20 %	0 %	20 %	300021677
109	NC_014313	CAACT	2	10	146273	146282	40 %	20 %	0 %	40 %	300021681
110	NC_014313	AACAG	2	10	147889	147898	60 %	0 %	20 %	20 %	300021684
111	NC_014313	GGGAT	2	10	148656	148665	20 %	20 %	60 %	0 %	300021685
112	NC_014313	CGCGC	2	10	149334	149343	0 %	0 %	40 %	60 %	300021685
113	NC_014313	CAAGG	2	10	149345	149354	40 %	0 %	40 %	20 %	300021685
114	NC_014313	ATCGC	2	10	149550	149559	20 %	20 %	20 %	40 %	300021686
115	NC_014313	AAGCC	2	10	149715	149724	40 %	0 %	20 %	40 %	300021686
116	NC_014313	TGGTC	2	10	152009	152018	0 %	40 %	40 %	20 %	300021688
117	NC_014313	AGATT	2	10	153703	153712	40 %	40 %	20 %	0 %	300021692
118	NC_014313	GCGAT	2	10	154131	154140	20 %	20 %	40 %	20 %	300021692
119	NC_014313	TGCCG	2	10	154214	154223	0 %	20 %	40 %	40 %	300021692
120	NC_014313	CTTGG	2	10	154440	154449	0 %	40 %	40 %	20 %	300021692
121	NC_014313	GCAGC	2	10	158033	158042	20 %	0 %	40 %	40 %	300021696
122	NC_014313	ACGAC	2	10	159979	159988	40 %	0 %	20 %	40 %	300021698
123	NC_014313	TGACG	2	10	160129	160138	20 %	20 %	40 %	20 %	300021699
124	NC_014313	ACGGA	2	10	160188	160197	40 %	0 %	40 %	20 %	300021699
125	NC_014313	GGCGC	2	10	160685	160694	0 %	0 %	60 %	40 %	300021701
126	NC_014313	GCCGG	2	10	160815	160824	0 %	0 %	60 %	40 %	300021701
127	NC_014313	TGGAC	2	10	161149	161158	20 %	20 %	40 %	20 %	300021701
128	NC_014313	GATTG	2	10	161305	161314	20 %	40 %	40 %	0 %	300021701
129	NC_014313	GCCAA	2	10	164475	164484	40 %	0 %	20 %	40 %	300021706
130	NC_014313	TTCGC	2	10	165241	165250	0 %	40 %	20 %	40 %	300021706
131	NC_014313	CGATC	2	10	165640	165649	20 %	20 %	20 %	40 %	300021707
132	NC_014313	GCTAC	2	10	166133	166142	20 %	20 %	20 %	40 %	300021707
133	NC_014313	ACGTT	2	10	170236	170245	20 %	40 %	20 %	20 %	300021711
134	NC_014313	TCGCC	2	10	173312	173321	0 %	20 %	20 %	60 %	300021717
135	NC_014313	TCATC	2	10	173456	173465	20 %	40 %	0 %	40 %	300021717
136	NC_014313	GTACG	2	10	173664	173673	20 %	20 %	40 %	20 %	300021717
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249	NC_014313	CGGCG	2	10	303289	303298	0 %	0 %	60 %	40 %	300021829
250	NC_014313	CGGAT	2	10	304033	304042	20 %	20 %	40 %	20 %	300021830
251	NC_014313	GATCG	2	10	305672	305681	20 %	20 %	40 %	20 %	300021832
252	NC_014313	GACAT	2	10	306234	306243	40 %	20 %	20 %	20 %	300021832
253	NC_014313	GCGGT	2	10	306453	306462	0 %	20 %	60 %	20 %	300021833
254	NC_014313	GCACG	2	10	312171	312180	20 %	0 %	40 %	40 %	300021838
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256	NC_014313	GGCGC	2	10	315779	315788	0 %	0 %	60 %	40 %	300021841
257	NC_014313	CGATG	2	10	316388	316397	20 %	20 %	40 %	20 %	300021841
258	NC_014313	GCGCA	2	10	316506	316515	20 %	0 %	40 %	40 %	300021841
259	NC_014313	CGACG	2	10	319749	319758	20 %	0 %	40 %	40 %	300021844
260	NC_014313	TTTTC	2	10	320533	320542	0 %	80 %	0 %	20 %	300021845
261	NC_014313	GAAGA	2	10	321538	321547	60 %	0 %	40 %	0 %	300021846
262	NC_014313	GGAAT	2	10	323237	323246	40 %	20 %	40 %	0 %	300021848
263	NC_014313	GGCGG	2	10	323885	323894	0 %	0 %	80 %	20 %	300021849
264	NC_014313	CGCAG	2	10	327208	327217	20 %	0 %	40 %	40 %	300021854
265	NC_014313	CGCAG	2	10	328564	328573	20 %	0 %	40 %	40 %	300021855
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378	NC_014313	CGATC	2	10	498958	498967	20 %	20 %	20 %	40 %	300022007
379	NC_014313	GGCGC	2	10	501340	501349	0 %	0 %	60 %	40 %	300022009
380	NC_014313	CGGCG	2	10	501418	501427	0 %	0 %	60 %	40 %	300022009
381	NC_014313	TTTCC	2	10	503016	503025	0 %	60 %	0 %	40 %	300022011
382	NC_014313	TGAAG	2	10	504771	504780	40 %	20 %	40 %	0 %	300022012
383	NC_014313	GTCGG	2	10	505005	505014	0 %	20 %	60 %	20 %	300022012
384	NC_014313	GCGAG	2	10	508793	508802	20 %	0 %	60 %	20 %	300022014
385	NC_014313	GAGCA	2	10	509260	509269	40 %	0 %	40 %	20 %	300022014
386	NC_014313	GACGT	2	10	509457	509466	20 %	20 %	40 %	20 %	300022015
387	NC_014313	CGGCG	2	10	511864	511873	0 %	0 %	60 %	40 %	300022017
388	NC_014313	CGGTT	2	10	512757	512766	0 %	40 %	40 %	20 %	300022017
389	NC_014313	GTTGC	2	10	513038	513047	0 %	40 %	40 %	20 %	300022017
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391	NC_014313	GTGGC	2	10	514669	514678	0 %	20 %	60 %	20 %	300022019
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