MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 7836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014313	GCAG	2	8	623	630	25 %	0 %	50 %	25 %	300021540
2	NC_014313	GACG	2	8	1199	1206	25 %	0 %	50 %	25 %	300021540
3	NC_014313	AACG	2	8	1554	1561	50 %	0 %	25 %	25 %	300021540
4	NC_014313	CGCT	2	8	1995	2002	0 %	25 %	25 %	50 %	300021540
5	NC_014313	TGCA	2	8	2050	2057	25 %	25 %	25 %	25 %	300021540
6	NC_014313	GACA	2	8	2473	2480	50 %	0 %	25 %	25 %	300021541
7	NC_014313	CGGC	2	8	2976	2983	0 %	0 %	50 %	50 %	300021541
8	NC_014313	GACG	2	8	3007	3014	25 %	0 %	50 %	25 %	300021541
9	NC_014313	CGAG	2	8	3318	3325	25 %	0 %	50 %	25 %	300021541
10	NC_014313	CGGG	2	8	3328	3335	0 %	0 %	75 %	25 %	300021541
11	NC_014313	CGAT	2	8	3796	3803	25 %	25 %	25 %	25 %	300021542
12	NC_014313	GCGA	2	8	3888	3895	25 %	0 %	50 %	25 %	300021542
13	NC_014313	AGTG	2	8	4087	4094	25 %	25 %	50 %	0 %	300021542
14	NC_014313	TGCG	2	8	4380	4387	0 %	25 %	50 %	25 %	300021543
15	NC_014313	CGAT	2	8	4471	4478	25 %	25 %	25 %	25 %	300021543
16	NC_014313	GAGC	2	8	4592	4599	25 %	0 %	50 %	25 %	300021543
17	NC_014313	GATG	2	8	4699	4706	25 %	25 %	50 %	0 %	300021543
18	NC_014313	GCCG	2	8	5405	5412	0 %	0 %	50 %	50 %	300021543
19	NC_014313	GTCG	2	8	6009	6016	0 %	25 %	50 %	25 %	300021544
20	NC_014313	TACC	2	8	6438	6445	25 %	25 %	0 %	50 %	300021544
21	NC_014313	GAAC	2	8	7710	7717	50 %	0 %	25 %	25 %	300021544
22	NC_014313	CTGG	2	8	8480	8487	0 %	25 %	50 %	25 %	300021545
23	NC_014313	CGTC	2	8	8692	8699	0 %	25 %	25 %	50 %	300021545
24	NC_014313	GCTT	2	8	9222	9229	0 %	50 %	25 %	25 %	300021546
25	NC_014313	GGCG	2	8	9275	9282	0 %	0 %	75 %	25 %	300021546
26	NC_014313	GCTG	2	8	9431	9438	0 %	25 %	50 %	25 %	300021546
27	NC_014313	CGGT	2	8	9602	9609	0 %	25 %	50 %	25 %	300021546
28	NC_014313	GCCG	2	8	9618	9625	0 %	0 %	50 %	50 %	300021546
29	NC_014313	TGCT	2	8	10279	10286	0 %	50 %	25 %	25 %	300021546
30	NC_014313	TCGT	2	8	10361	10368	0 %	50 %	25 %	25 %	300021546
31	NC_014313	AGCG	2	8	11856	11863	25 %	0 %	50 %	25 %	300021547
32	NC_014313	GACG	2	8	12586	12593	25 %	0 %	50 %	25 %	300021547
33	NC_014313	CCAG	2	8	12961	12968	25 %	0 %	25 %	50 %	300021547
34	NC_014313	CAGC	2	8	13806	13813	25 %	0 %	25 %	50 %	300021548
35	NC_014313	CGTG	2	8	13902	13909	0 %	25 %	50 %	25 %	300021548
36	NC_014313	GATC	2	8	14871	14878	25 %	25 %	25 %	25 %	300021549
37	NC_014313	CGTG	2	8	14923	14930	0 %	25 %	50 %	25 %	300021549
38	NC_014313	GTCG	2	8	14944	14951	0 %	25 %	50 %	25 %	300021549
39	NC_014313	GATG	2	8	15265	15272	25 %	25 %	50 %	0 %	300021550
40	NC_014313	CATT	2	8	15568	15575	25 %	50 %	0 %	25 %	300021550
41	NC_014313	GCGA	2	8	15795	15802	25 %	0 %	50 %	25 %	300021550
42	NC_014313	CCAA	2	8	16441	16448	50 %	0 %	0 %	50 %	300021550
43	NC_014313	GCCG	2	8	16760	16767	0 %	0 %	50 %	50 %	300021551
44	NC_014313	CGAG	2	8	17667	17674	25 %	0 %	50 %	25 %	300021552
45	NC_014313	CGTC	2	8	17820	17827	0 %	25 %	25 %	50 %	300021552
46	NC_014313	ATCG	2	8	17947	17954	25 %	25 %	25 %	25 %	300021553
47	NC_014313	AAAG	2	8	17957	17964	75 %	0 %	25 %	0 %	300021553
48	NC_014313	CGAT	2	8	18910	18917	25 %	25 %	25 %	25 %	300021553
49	NC_014313	GGCT	2	8	19426	19433	0 %	25 %	50 %	25 %	300021553
50	NC_014313	CACG	2	8	19654	19661	25 %	0 %	25 %	50 %	300021554
51	NC_014313	GTCG	2	8	20047	20054	0 %	25 %	50 %	25 %	300021554
52	NC_014313	GACG	2	8	20432	20439	25 %	0 %	50 %	25 %	300021554
53	NC_014313	TCGG	2	8	21022	21029	0 %	25 %	50 %	25 %	300021555
54	NC_014313	CCGG	2	8	22062	22069	0 %	0 %	50 %	50 %	300021556
55	NC_014313	CGGC	2	8	22126	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	300021556
56	NC_014313	GTAC	2	8	22871	22878	25 %	25 %	25 %	25 %	300021557
57	NC_014313	TCGC	2	8	23168	23175	0 %	25 %	25 %	50 %	300021557
58	NC_014313	GCGG	2	8	23308	23315	0 %	0 %	75 %	25 %	300021557
59	NC_014313	GCAC	2	8	23651	23658	25 %	0 %	25 %	50 %	300021557
60	NC_014313	TGCG	2	8	23935	23942	0 %	25 %	50 %	25 %	300021557
61	NC_014313	TCGC	2	8	24020	24027	0 %	25 %	25 %	50 %	300021557
62	NC_014313	TGCC	2	8	24864	24871	0 %	25 %	25 %	50 %	300021558
63	NC_014313	CGGC	2	8	25094	25101	0 %	0 %	50 %	50 %	300021559
64	NC_014313	CTCG	2	8	26238	26245	0 %	25 %	25 %	50 %	300021560
65	NC_014313	GATC	2	8	26412	26419	25 %	25 %	25 %	25 %	300021560
66	NC_014313	TCGG	2	8	26937	26944	0 %	25 %	50 %	25 %	300021561
67	NC_014313	GGCA	2	8	27016	27023	25 %	0 %	50 %	25 %	300021561
68	NC_014313	CGTC	2	8	27577	27584	0 %	25 %	25 %	50 %	300021561
69	NC_014313	GGCG	2	8	27827	27834	0 %	0 %	75 %	25 %	300021561
70	NC_014313	GCCT	2	8	28293	28300	0 %	25 %	25 %	50 %	300021562
71	NC_014313	CCGA	2	8	28419	28426	25 %	0 %	25 %	50 %	300021563
72	NC_014313	GGCC	2	8	28708	28715	0 %	0 %	50 %	50 %	300021563
73	NC_014313	CGGG	2	8	30432	30439	0 %	0 %	75 %	25 %	300021564
74	NC_014313	GTCG	2	8	30448	30455	0 %	25 %	50 %	25 %	300021564
75	NC_014313	GAAG	2	8	30628	30635	50 %	0 %	50 %	0 %	300021564
76	NC_014313	GCGT	2	8	33552	33559	0 %	25 %	50 %	25 %	300021567
77	NC_014313	TCGG	2	8	33718	33725	0 %	25 %	50 %	25 %	300021567
78	NC_014313	GCCT	2	8	34804	34811	0 %	25 %	25 %	50 %	300021569
79	NC_014313	CTGC	2	8	35087	35094	0 %	25 %	25 %	50 %	300021569
80	NC_014313	GAAA	2	8	35832	35839	75 %	0 %	25 %	0 %	300021570
81	NC_014313	AGCA	2	8	35896	35903	50 %	0 %	25 %	25 %	300021570
82	NC_014313	GGGC	2	8	36072	36079	0 %	0 %	75 %	25 %	300021571
83	NC_014313	GCAC	2	8	36898	36905	25 %	0 %	25 %	50 %	300021572
84	NC_014313	ATCG	2	8	37397	37404	25 %	25 %	25 %	25 %	300021572
85	NC_014313	CATT	2	8	37516	37523	25 %	50 %	0 %	25 %	300021572
86	NC_014313	GCTG	2	8	38705	38712	0 %	25 %	50 %	25 %	300021574
87	NC_014313	GAGC	2	8	38951	38958	25 %	0 %	50 %	25 %	300021574
88	NC_014313	GAAG	2	8	39458	39465	50 %	0 %	50 %	0 %	300021574
89	NC_014313	CGGA	2	8	41712	41719	25 %	0 %	50 %	25 %	300021576
90	NC_014313	GGCG	2	8	42089	42096	0 %	0 %	75 %	25 %	300021576
91	NC_014313	CTGC	2	8	42576	42583	0 %	25 %	25 %	50 %	300021576
92	NC_014313	TTCG	2	8	44463	44470	0 %	50 %	25 %	25 %	300021577
93	NC_014313	TGGC	2	8	44479	44486	0 %	25 %	50 %	25 %	300021577
94	NC_014313	TGCG	2	8	44678	44685	0 %	25 %	50 %	25 %	300021577
95	NC_014313	CAGG	2	8	44878	44885	25 %	0 %	50 %	25 %	300021577
96	NC_014313	TGCG	2	8	44894	44901	0 %	25 %	50 %	25 %	300021577
97	NC_014313	AGCC	2	8	45203	45210	25 %	0 %	25 %	50 %	300021578
98	NC_014313	CGTC	2	8	45428	45435	0 %	25 %	25 %	50 %	300021578
99	NC_014313	GGCG	2	8	45597	45604	0 %	0 %	75 %	25 %	300021578
100	NC_014313	GGCG	2	8	45897	45904	0 %	0 %	75 %	25 %	300021578
101	NC_014313	TGCG	2	8	47699	47706	0 %	25 %	50 %	25 %	300021580
102	NC_014313	AGCG	2	8	47931	47938	25 %	0 %	50 %	25 %	300021580
103	NC_014313	ACGG	2	8	48399	48406	25 %	0 %	50 %	25 %	300021580
104	NC_014313	TTTC	2	8	48605	48612	0 %	75 %	0 %	25 %	300021580
105	NC_014313	AAGC	2	8	48878	48885	50 %	0 %	25 %	25 %	300021580
106	NC_014313	GATC	2	8	49214	49221	25 %	25 %	25 %	25 %	300021580
107	NC_014313	GCCG	2	8	49236	49243	0 %	0 %	50 %	50 %	300021580
108	NC_014313	CGCC	2	8	50080	50087	0 %	0 %	25 %	75 %	300021581
109	NC_014313	TCGA	2	8	50316	50323	25 %	25 %	25 %	25 %	300021581
110	NC_014313	GCGA	2	8	50717	50724	25 %	0 %	50 %	25 %	300021581
111	NC_014313	CTTC	2	8	50845	50852	0 %	50 %	0 %	50 %	300021581
112	NC_014313	CGAC	2	8	51394	51401	25 %	0 %	25 %	50 %	300021581
113	NC_014313	CATC	2	8	52114	52121	25 %	25 %	0 %	50 %	300021581
114	NC_014313	CTTC	2	8	52213	52220	0 %	50 %	0 %	50 %	300021581
115	NC_014313	GTCG	2	8	52613	52620	0 %	25 %	50 %	25 %	300021581
116	NC_014313	CGCC	2	8	52767	52774	0 %	0 %	25 %	75 %	300021581
117	NC_014313	TGGC	2	8	53524	53531	0 %	25 %	50 %	25 %	300021581
118	NC_014313	CGAG	2	8	53668	53675	25 %	0 %	50 %	25 %	300021581
119	NC_014313	GCGA	2	8	54115	54122	25 %	0 %	50 %	25 %	300021581
120	NC_014313	CGTC	2	8	54304	54311	0 %	25 %	25 %	50 %	300021581
121	NC_014313	TGCG	2	8	54312	54319	0 %	25 %	50 %	25 %	300021581
122	NC_014313	CGAA	2	8	55374	55381	50 %	0 %	25 %	25 %	300021582
123	NC_014313	GCAG	2	8	55458	55465	25 %	0 %	50 %	25 %	300021582
124	NC_014313	TGCG	2	8	55481	55488	0 %	25 %	50 %	25 %	300021582
125	NC_014313	CCGG	2	8	56575	56582	0 %	0 %	50 %	50 %	300021583
126	NC_014313	TTGT	2	8	57065	57072	0 %	75 %	25 %	0 %	300021583
127	NC_014313	GATG	2	8	57076	57083	25 %	25 %	50 %	0 %	300021583
128	NC_014313	AAAC	2	8	57191	57198	75 %	0 %	0 %	25 %	300021583
129	NC_014313	AGCG	2	8	57221	57228	25 %	0 %	50 %	25 %	300021583
130	NC_014313	TCGG	2	8	57291	57298	0 %	25 %	50 %	25 %	300021583
131	NC_014313	CGAC	2	8	57304	57311	25 %	0 %	25 %	50 %	300021583
132	NC_014313	GTCG	2	8	57908	57915	0 %	25 %	50 %	25 %	300021583
133	NC_014313	CGAT	2	8	58072	58079	25 %	25 %	25 %	25 %	300021583
134	NC_014313	GCGG	2	8	59306	59313	0 %	0 %	75 %	25 %	300021584
135	NC_014313	GAGC	2	8	59395	59402	25 %	0 %	50 %	25 %	300021584
136	NC_014313	GCCA	2	8	60326	60333	25 %	0 %	25 %	50 %	300021584
137	NC_014313	GGAC	2	8	63965	63972	25 %	0 %	50 %	25 %	300021585
138	NC_014313	CGAG	2	8	64831	64838	25 %	0 %	50 %	25 %	300021585
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140	NC_014313	GCGG	2	8	65641	65648	0 %	0 %	75 %	25 %	300021586
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