MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 75164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014313	CGG	2	6	20966	20971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021555
502	NC_014313	TCGG	2	8	21022	21029	0 %	25 %	50 %	25 %	300021555
503	NC_014313	GCC	2	6	21141	21146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021555
504	NC_014313	CAG	2	6	21195	21200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021555
505	NC_014313	TCG	2	6	21232	21237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021555
506	NC_014313	GCC	2	6	21246	21251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021555
507	NC_014313	CGT	2	6	21266	21271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021555
508	NC_014313	T	6	6	21345	21350	0 %	100 %	0 %	0 %	300021555
509	NC_014313	CTTTGC	2	12	21443	21454	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	300021555
510	NC_014313	GCT	2	6	21659	21664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021556
511	NC_014313	CGG	2	6	21730	21735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021556
512	NC_014313	GCG	2	6	21759	21764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021556
513	NC_014313	GCA	2	6	21785	21790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021556
514	NC_014313	CCG	2	6	21824	21829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021556
515	NC_014313	TCC	2	6	21913	21918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300021556
516	NC_014313	CG	3	6	21954	21959	0 %	0 %	50 %	50 %	300021556
517	NC_014313	GT	3	6	22035	22040	0 %	50 %	50 %	0 %	300021556
518	NC_014313	CCGG	2	8	22062	22069	0 %	0 %	50 %	50 %	300021556
519	NC_014313	CGGC	2	8	22126	22133	0 %	0 %	50 %	50 %	300021556
520	NC_014313	CTT	2	6	22167	22172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021556
521	NC_014313	TCA	2	6	22189	22194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021556
522	NC_014313	GTAC	2	8	22871	22878	25 %	25 %	25 %	25 %	300021557
523	NC_014313	CG	4	8	22899	22906	0 %	0 %	50 %	50 %	300021557
524	NC_014313	GCT	2	6	22913	22918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021557
525	NC_014313	TCT	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021557
526	NC_014313	TCGC	2	8	23168	23175	0 %	25 %	25 %	50 %	300021557
527	NC_014313	ATC	2	6	23215	23220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021557
528	NC_014313	CGC	2	6	23262	23267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021557
529	NC_014313	GCGG	2	8	23308	23315	0 %	0 %	75 %	25 %	300021557
530	NC_014313	GGC	2	6	23343	23348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021557
531	NC_014313	GCG	2	6	23356	23361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021557
532	NC_014313	GC	3	6	23442	23447	0 %	0 %	50 %	50 %	300021557
533	NC_014313	CTT	2	6	23479	23484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021557
534	NC_014313	CGG	2	6	23621	23626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021557
535	NC_014313	GCAC	2	8	23651	23658	25 %	0 %	25 %	50 %	300021557
536	NC_014313	CGG	2	6	23670	23675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021557
537	NC_014313	CGT	2	6	23808	23813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021557
538	NC_014313	CGCGG	2	10	23824	23833	0 %	0 %	60 %	40 %	300021557
539	NC_014313	CAC	2	6	23870	23875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300021557
540	NC_014313	AGC	2	6	23876	23881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021557
541	NC_014313	TGG	2	6	23882	23887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021557
542	NC_014313	TGCG	2	8	23935	23942	0 %	25 %	50 %	25 %	300021557
543	NC_014313	CG	4	8	24002	24009	0 %	0 %	50 %	50 %	300021557
544	NC_014313	CG	3	6	24014	24019	0 %	0 %	50 %	50 %	300021557
545	NC_014313	TCGC	2	8	24020	24027	0 %	25 %	25 %	50 %	300021557
546	NC_014313	ATC	2	6	24132	24137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021558
547	NC_014313	GAC	2	6	24207	24212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021558
548	NC_014313	GACGCG	2	12	24242	24253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300021558
549	NC_014313	CGG	2	6	24284	24289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021558
550	NC_014313	ACG	2	6	24310	24315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021558
551	NC_014313	GC	3	6	24354	24359	0 %	0 %	50 %	50 %	300021558
552	NC_014313	CAT	2	6	24383	24388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021558
553	NC_014313	TCA	2	6	24448	24453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300021558
554	NC_014313	GAA	2	6	24510	24515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021558
555	NC_014313	CAA	2	6	24563	24568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021558
556	NC_014313	CGG	2	6	24592	24597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021558
557	NC_014313	GTT	2	6	24738	24743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300021558
558	NC_014313	GCC	2	6	24777	24782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021558
559	NC_014313	AAG	2	6	24789	24794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021558
560	NC_014313	TGA	2	6	24826	24831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021558
561	NC_014313	TGCC	2	8	24864	24871	0 %	25 %	25 %	50 %	300021558
562	NC_014313	CGA	2	6	24932	24937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021558
563	NC_014313	GTG	2	6	24977	24982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021558
564	NC_014313	CAG	2	6	25026	25031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
565	NC_014313	CCG	2	6	25032	25037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021559
566	NC_014313	GAC	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
567	NC_014313	GTC	2	6	25062	25067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021559
568	NC_014313	CGC	2	6	25077	25082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021559
569	NC_014313	CGGC	2	8	25094	25101	0 %	0 %	50 %	50 %	300021559
570	NC_014313	CGA	2	6	25124	25129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
571	NC_014313	CGC	2	6	25138	25143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021559
572	NC_014313	CGG	2	6	25223	25228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021559
573	NC_014313	CG	3	6	25248	25253	0 %	0 %	50 %	50 %	300021559
574	NC_014313	GC	3	6	25314	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	300021559
575	NC_014313	ACG	2	6	25321	25326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
576	NC_014313	CGA	2	6	25337	25342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
577	NC_014313	CGA	2	6	25459	25464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
578	NC_014313	AGC	2	6	25480	25485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
579	NC_014313	GGC	2	6	25535	25540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021559
580	NC_014313	GC	3	6	25539	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	300021559
581	NC_014313	GCG	2	6	25608	25613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021559
582	NC_014313	GCGACG	2	12	25618	25629	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300021559
583	NC_014313	CGC	2	6	25634	25639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021559
584	NC_014313	GCGTC	2	10	25649	25658	0 %	20 %	40 %	40 %	300021559
585	NC_014313	CGC	2	6	25667	25672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021559
586	NC_014313	CTG	2	6	25722	25727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021559
587	NC_014313	GTT	2	6	25733	25738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300021559
588	NC_014313	CGA	3	9	25859	25867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021559
589	NC_014313	TCG	2	6	25876	25881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021559
590	NC_014313	GCC	2	6	25965	25970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021560
591	NC_014313	CG	3	6	26003	26008	0 %	0 %	50 %	50 %	300021560
592	NC_014313	CGC	2	6	26012	26017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021560
593	NC_014313	CGT	2	6	26039	26044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021560
594	NC_014313	CGA	2	6	26138	26143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021560
595	NC_014313	GC	3	6	26149	26154	0 %	0 %	50 %	50 %	300021560
596	NC_014313	CTCG	2	8	26238	26245	0 %	25 %	25 %	50 %	300021560
597	NC_014313	GTC	2	6	26256	26261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021560
598	NC_014313	ACG	2	6	26323	26328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021560
599	NC_014313	CGG	2	6	26354	26359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021560
600	NC_014313	GCC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021560
601	NC_014313	GATC	2	8	26412	26419	25 %	25 %	25 %	25 %	300021560
602	NC_014313	GCG	2	6	26432	26437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021560
603	NC_014313	GAT	2	6	26488	26493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021560
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605	NC_014313	ACC	2	6	26824	26829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300021561
606	NC_014313	CCT	2	6	26843	26848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300021561
607	NC_014313	CGA	2	6	26921	26926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021561
608	NC_014313	TCGG	2	8	26937	26944	0 %	25 %	50 %	25 %	300021561
609	NC_014313	CGA	2	6	26999	27004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021561
610	NC_014313	GGCA	2	8	27016	27023	25 %	0 %	50 %	25 %	300021561
611	NC_014313	GAT	2	6	27057	27062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021561
612	NC_014313	GC	3	6	27085	27090	0 %	0 %	50 %	50 %	300021561
613	NC_014313	ATG	2	6	27121	27126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021561
614	NC_014313	GCC	2	6	27138	27143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021561
615	NC_014313	GC	3	6	27246	27251	0 %	0 %	50 %	50 %	300021561
616	NC_014313	GCG	2	6	27278	27283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021561
617	NC_014313	GCGCG	2	10	27296	27305	0 %	0 %	60 %	40 %	300021561
618	NC_014313	CGA	2	6	27317	27322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021561
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620	NC_014313	CGA	2	6	27377	27382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021561
621	NC_014313	TCG	2	6	27457	27462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021561
622	NC_014313	GCG	2	6	27520	27525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021561
623	NC_014313	GCG	2	6	27532	27537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021561
624	NC_014313	CGTC	2	8	27577	27584	0 %	25 %	25 %	50 %	300021561
625	NC_014313	GGC	2	6	27585	27590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021561
626	NC_014313	GC	3	6	27589	27594	0 %	0 %	50 %	50 %	300021561
627	NC_014313	AAC	2	6	27636	27641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300021561
628	NC_014313	CGC	2	6	27665	27670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021561
629	NC_014313	GTCCG	2	10	27678	27687	0 %	20 %	40 %	40 %	300021561
630	NC_014313	GAC	2	6	27703	27708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021561
631	NC_014313	CGT	2	6	27716	27721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021561
632	NC_014313	GCG	2	6	27732	27737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021561
633	NC_014313	GCCGTG	2	12	27747	27758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300021561
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635	NC_014313	TGC	2	6	27794	27799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021561
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641	NC_014313	TCG	2	6	28057	28062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021562
642	NC_014313	CGT	2	6	28162	28167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021562
643	NC_014313	CGA	2	6	28214	28219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021562
644	NC_014313	GTC	2	6	28223	28228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021562
645	NC_014313	CGGATG	2	12	28248	28259	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300021562
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647	NC_014313	GCCT	2	8	28293	28300	0 %	25 %	25 %	50 %	300021562
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654	NC_014313	CGC	2	6	28582	28587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021563
655	NC_014313	GCC	2	6	28592	28597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021563
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658	NC_014313	GC	3	6	28640	28645	0 %	0 %	50 %	50 %	300021563
659	NC_014313	GAT	2	6	28663	28668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021563
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661	NC_014313	GGC	2	6	28733	28738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021563
662	NC_014313	CGC	2	6	28748	28753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021563
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723	NC_014313	ATCAAG	2	12	32373	32384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300021566
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731	NC_014313	CGA	2	6	32684	32689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021567
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743	NC_014313	CG	3	6	33341	33346	0 %	0 %	50 %	50 %	300021567
744	NC_014313	GCC	2	6	33394	33399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021567
745	NC_014313	CGG	2	6	33465	33470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021567
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748	NC_014313	GCA	2	6	33641	33646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021567
749	NC_014313	GC	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	300021567
750	NC_014313	TCGG	2	8	33718	33725	0 %	25 %	50 %	25 %	300021567
751	NC_014313	TCG	2	6	33769	33774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300021568
752	NC_014313	GAT	2	6	33806	33811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300021568
753	NC_014313	TCT	2	6	33817	33822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300021568
754	NC_014313	CGA	2	6	33877	33882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300021568
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781	NC_014313	GCC	2	6	35098	35103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300021569
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797	NC_014313	AAG	2	6	35953	35958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300021570
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815	NC_014313	GCGAT	2	10	37143	37152	20 %	20 %	40 %	20 %	300021572
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828	NC_014313	CGG	2	6	37677	37682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021572
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831	NC_014313	GGC	2	6	37960	37965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300021572
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835	NC_014313	TGG	2	6	38259	38264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300021573
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