MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	GTA	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
2	NC_014302	AAG	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883475
3	NC_014302	AGT	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
4	NC_014302	GAA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883475
5	NC_014302	GTC	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883475
6	NC_014302	GTG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883475
7	NC_014302	CAC	2	6	1644	1649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883475
8	NC_014302	GTA	2	6	1663	1668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883475
9	NC_014302	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883476
10	NC_014302	CTC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883476
11	NC_014302	GTC	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883476
12	NC_014302	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883476
13	NC_014302	TGA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883476
14	NC_014302	GTG	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883476
15	NC_014302	CTG	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883476
16	NC_014302	GAT	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
17	NC_014302	TAC	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883477
18	NC_014302	ATG	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
19	NC_014302	GAT	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883477
20	NC_014302	ATT	2	6	2597	2602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883477
21	NC_014302	AGA	3	9	3155	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883478
22	NC_014302	GTT	2	6	3192	3197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883478
23	NC_014302	CGC	2	6	4059	4064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883479
24	NC_014302	ATG	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883479
25	NC_014302	GAA	2	6	4374	4379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883479
26	NC_014302	ATT	2	6	4402	4407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883479
27	NC_014302	ACA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883479
28	NC_014302	CCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883479
29	NC_014302	CGA	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
30	NC_014302	TTA	2	6	4721	4726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883479
31	NC_014302	GGC	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883479
32	NC_014302	GAC	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
33	NC_014302	GAC	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883479
34	NC_014302	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883479
35	NC_014302	GCG	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883479
36	NC_014302	GCC	3	9	5008	5016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883479
37	NC_014302	GAA	3	9	5766	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
38	NC_014302	GAC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
39	NC_014302	GAA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
40	NC_014302	ACA	2	6	6024	6029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883480
41	NC_014302	GCG	2	6	6066	6071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883480
42	NC_014302	CAG	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
43	NC_014302	TGA	4	12	6185	6196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883480
44	NC_014302	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883480
45	NC_014302	AAT	2	6	6215	6220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883480
46	NC_014302	TTC	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883480
47	NC_014302	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883480
48	NC_014302	ACA	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883480
49	NC_014302	GAC	3	9	6555	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883480
50	NC_014302	TCA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
51	NC_014302	TCA	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
52	NC_014302	TTC	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
53	NC_014302	CAT	2	6	7529	7534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
54	NC_014302	TCA	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
55	NC_014302	TCT	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
56	NC_014302	GAT	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883481
57	NC_014302	CTT	2	6	7946	7951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
58	NC_014302	GGT	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883481
59	NC_014302	TAG	2	6	8015	8020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883481
60	NC_014302	CTA	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
61	NC_014302	CTG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883481
62	NC_014302	TTC	2	6	8223	8228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
63	NC_014302	TTC	2	6	8284	8289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
64	NC_014302	TCC	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883481
65	NC_014302	TGG	2	6	8382	8387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883481
66	NC_014302	TCC	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883481
67	NC_014302	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
68	NC_014302	ACC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883481
69	NC_014302	TCA	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
70	NC_014302	AGA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883481
71	NC_014302	ATC	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
72	NC_014302	TCT	2	6	8750	8755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883481
73	NC_014302	TCG	2	6	8803	8808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883481
74	NC_014302	TCA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
75	NC_014302	CAT	5	15	8873	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883481
76	NC_014302	ATT	2	6	8943	8948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883481
77	NC_014302	ACT	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883482
78	NC_014302	TCC	2	6	9231	9236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883482
79	NC_014302	GTA	2	6	9246	9251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883482
80	NC_014302	ATT	2	6	9264	9269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883482
81	NC_014302	CTT	2	6	9286	9291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
82	NC_014302	TTC	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
83	NC_014302	TTC	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
84	NC_014302	CTT	2	6	9369	9374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883483
85	NC_014302	CCT	2	6	9577	9582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883484
86	NC_014302	GTG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883484
87	NC_014302	TCC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883484
88	NC_014302	CAT	2	6	9724	9729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
89	NC_014302	ATC	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
90	NC_014302	TGA	2	6	9856	9861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
91	NC_014302	TCA	3	9	9990	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
92	NC_014302	TCA	2	6	10008	10013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
93	NC_014302	CGT	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883484
94	NC_014302	TCG	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883484
95	NC_014302	GAT	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
96	NC_014302	ACA	2	6	10198	10203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
97	NC_014302	AAC	2	6	10620	10625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
98	NC_014302	TGA	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
99	NC_014302	TCT	2	6	10761	10766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883484
100	NC_014302	CAA	2	6	10834	10839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
101	NC_014302	CAA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
102	NC_014302	GAT	2	6	10971	10976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
103	NC_014302	CCG	2	6	11013	11018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883484
104	NC_014302	CAG	2	6	11098	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883484
105	NC_014302	TTG	2	6	11130	11135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883484
106	NC_014302	GTA	2	6	11162	11167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883484
107	NC_014302	ATC	2	6	11186	11191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883484
108	NC_014302	CAA	2	6	11392	11397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883484
109	NC_014302	CAT	2	6	11695	11700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
110	NC_014302	CTA	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
111	NC_014302	TCA	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
112	NC_014302	CGA	2	6	11941	11946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883485
113	NC_014302	AAT	2	6	11947	11952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883485
114	NC_014302	TCA	2	6	11985	11990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
115	NC_014302	CAT	3	9	12001	12009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883485
116	NC_014302	CTC	2	6	14571	14576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883486
117	NC_014302	CGA	2	6	14621	14626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883486
118	NC_014302	TCA	2	6	14636	14641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883486
119	NC_014302	ATT	2	6	14963	14968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883487
120	NC_014302	GAC	2	6	15011	15016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883487
121	NC_014302	AGG	2	6	15064	15069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883487
122	NC_014302	AAG	2	6	15070	15075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883487
123	NC_014302	GGA	2	6	15140	15145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883487
124	NC_014302	GAG	2	6	15243	15248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883487
125	NC_014302	CGT	2	6	15313	15318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883487
126	NC_014302	CGG	2	6	15361	15366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883487
127	NC_014302	CAT	2	6	15384	15389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883487
128	NC_014302	CTG	3	9	15538	15546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883487
129	NC_014302	GAC	2	6	15564	15569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883487
130	NC_014302	GAA	2	6	15572	15577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883487
131	NC_014302	ATG	2	6	15625	15630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883487
132	NC_014302	AAG	2	6	15771	15776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883487
133	NC_014302	GAC	2	6	15807	15812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883487
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136	NC_014302	GAG	2	6	15894	15899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883487
137	NC_014302	CAG	2	6	16097	16102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883488
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.