MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	GA	3	6	716	721	50 %	0 %	50 %	0 %	299883391
2	NC_014300	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
3	NC_014300	GA	3	6	1458	1463	50 %	0 %	50 %	0 %	299883391
4	NC_014300	CG	3	6	1613	1618	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
5	NC_014300	CG	3	6	1687	1692	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
6	NC_014300	CG	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	299883392
7	NC_014300	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	299883392
8	NC_014300	TC	3	6	3849	3854	0 %	50 %	0 %	50 %	299883393
9	NC_014300	TG	3	6	4346	4351	0 %	50 %	50 %	0 %	299883394
10	NC_014300	TG	3	6	4358	4363	0 %	50 %	50 %	0 %	299883394
11	NC_014300	TC	3	6	5090	5095	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
12	NC_014300	TC	3	6	5180	5185	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
13	NC_014300	TC	3	6	5240	5245	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
14	NC_014300	TC	3	6	5270	5275	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
15	NC_014300	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	299883397
16	NC_014300	CG	3	6	6102	6107	0 %	0 %	50 %	50 %	299883397
17	NC_014300	AC	3	6	7246	7251	50 %	0 %	0 %	50 %	299883398
18	NC_014300	GA	3	6	7674	7679	50 %	0 %	50 %	0 %	299883399
19	NC_014300	GA	3	6	9998	10003	50 %	0 %	50 %	0 %	299883400
20	NC_014300	GA	3	6	10094	10099	50 %	0 %	50 %	0 %	299883400
21	NC_014300	AG	3	6	15714	15719	50 %	0 %	50 %	0 %	299883406
22	NC_014300	CG	3	6	15841	15846	0 %	0 %	50 %	50 %	299883406
23	NC_014300	TC	3	6	19893	19898	0 %	50 %	0 %	50 %	299883411
24	NC_014300	CG	3	6	20226	20231	0 %	0 %	50 %	50 %	299883411
25	NC_014300	AG	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	299883411
26	NC_014300	AT	3	6	21090	21095	50 %	50 %	0 %	0 %	299883412
27	NC_014300	GA	3	6	21300	21305	50 %	0 %	50 %	0 %	299883412
28	NC_014300	CT	3	6	21611	21616	0 %	50 %	0 %	50 %	299883412
29	NC_014300	CG	3	6	22486	22491	0 %	0 %	50 %	50 %	299883412
30	NC_014300	GT	3	6	25144	25149	0 %	50 %	50 %	0 %	299883413
31	NC_014300	CA	3	6	25748	25753	50 %	0 %	0 %	50 %	299883413
32	NC_014300	AG	3	6	28639	28644	50 %	0 %	50 %	0 %	299883415
33	NC_014300	CG	3	6	29079	29084	0 %	0 %	50 %	50 %	299883415
34	NC_014300	GT	3	6	29255	29260	0 %	50 %	50 %	0 %	299883415
35	NC_014300	GC	3	6	29959	29964	0 %	0 %	50 %	50 %	299883416
36	NC_014300	GC	3	6	30834	30839	0 %	0 %	50 %	50 %	299883419
37	NC_014300	TC	3	6	31724	31729	0 %	50 %	0 %	50 %	299883419
38	NC_014300	CG	3	6	35277	35282	0 %	0 %	50 %	50 %	299883423
39	NC_014300	AG	3	6	35756	35761	50 %	0 %	50 %	0 %	299883424
40	NC_014300	AG	3	6	37232	37237	50 %	0 %	50 %	0 %	299883425
41	NC_014300	GT	3	6	37781	37786	0 %	50 %	50 %	0 %	299883425
42	NC_014300	CG	3	6	39048	39053	0 %	0 %	50 %	50 %	299883426
43	NC_014300	AG	3	6	41084	41089	50 %	0 %	50 %	0 %	299883428
44	NC_014300	CT	3	6	41523	41528	0 %	50 %	0 %	50 %	299883429
45	NC_014300	GT	3	6	41687	41692	0 %	50 %	50 %	0 %	299883429
46	NC_014300	GC	3	6	41804	41809	0 %	0 %	50 %	50 %	299883429
47	NC_014300	CG	3	6	41988	41993	0 %	0 %	50 %	50 %	299883429
48	NC_014300	GA	3	6	43352	43357	50 %	0 %	50 %	0 %	299883430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.