MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	GCGCAC	2	12	2086	2097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298735502
2	NC_014256	CAAAAG	2	12	4187	4198	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298735504
3	NC_014256	AAAATA	2	12	6625	6636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298735506
4	NC_014256	GTCAAA	2	12	10053	10064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735509
5	NC_014256	AAAAGA	2	12	10538	10549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735509
6	NC_014256	TGATTT	2	12	10748	10759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735509
7	NC_014256	AGAAAA	2	12	12534	12545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735510
8	NC_014256	AAAAAG	2	12	13388	13399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735510
9	NC_014256	AAAAGA	2	12	15959	15970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735511
10	NC_014256	TCTTTA	2	12	18513	18524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735514
11	NC_014256	TTCCAA	2	12	18536	18547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735514
12	NC_014256	TTTCTT	2	12	20106	20117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735515
13	NC_014256	CGCTCG	2	12	20358	20369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	298735515
14	NC_014256	CCGCTT	2	12	22813	22824	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298735517
15	NC_014256	CACTTC	2	12	22937	22948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298735517
16	NC_014256	AAAATA	2	12	24204	24215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298735520
17	NC_014256	TAGCGA	2	12	24490	24501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735520
18	NC_014256	ATGACA	2	12	25536	25547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735521
19	NC_014256	TGAGCG	2	12	27027	27038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735522
20	NC_014256	TTAGAA	2	12	32462	32473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735526
21	NC_014256	GACGCT	2	12	34316	34327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298735528
22	NC_014256	TGATAA	2	12	38471	38482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735532
23	NC_014256	TAAACT	2	12	40259	40270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735534
24	NC_014256	AATTTT	2	12	42699	42710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735536
25	NC_014256	TCGCTC	2	12	44009	44020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298735539
26	NC_014256	GTGGAA	2	12	52252	52263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298735545
27	NC_014256	GTTTTT	2	12	52941	52952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735547
28	NC_014256	CTTATT	2	12	53390	53401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735547
29	NC_014256	GAAAAT	2	12	55279	55290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298735550
30	NC_014256	ATTTTG	2	12	58331	58342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735551
31	NC_014256	TAAGAC	2	12	58511	58522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735552
32	NC_014256	TTTTTA	2	12	62324	62335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298735556
33	NC_014256	TTAAAA	2	12	65645	65656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735559
34	NC_014256	TTGATT	2	12	65829	65840	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735559
35	NC_014256	ACTAAA	2	12	66861	66872	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735561
36	NC_014256	AAAGAC	2	12	68493	68504	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298735561
37	NC_014256	GGGATT	2	12	72167	72178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735565
38	NC_014256	TTACAA	2	12	72670	72681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735565
39	NC_014256	TGCGAT	2	12	73074	73085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735565
40	NC_014256	AGAAAA	2	12	75225	75236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735568
41	NC_014256	AGAGCA	2	12	75759	75770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298735569
42	NC_014256	GCTCTT	2	12	81020	81031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298735572
43	NC_014256	GATAAG	2	12	81136	81147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298735572
44	NC_014256	GTTGCG	2	12	83043	83054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298735575
45	NC_014256	AAGAAT	2	12	85096	85107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298735578
46	NC_014256	CTATAG	2	12	87207	87218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735581
47	NC_014256	TTGGGT	3	18	88056	88073	0 %	50 %	50 %	0 %	298735581
48	NC_014256	CAAGTT	2	12	88529	88540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735582
49	NC_014256	ATCAAT	2	12	90144	90155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735583
50	NC_014256	GTTTCT	2	12	90328	90339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298735583
51	NC_014256	GTTTTT	2	12	90341	90352	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735583
52	NC_014256	CGCTCC	2	12	94599	94610	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	298735591
53	NC_014256	GCCTGT	2	12	95862	95873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735593
54	NC_014256	CTTTTT	2	12	101419	101430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735599
55	NC_014256	ATGCGA	2	12	102124	102135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735601
56	NC_014256	ATCGCT	2	12	105172	105183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735606
57	NC_014256	ATCGCT	2	12	105715	105726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735606
58	NC_014256	ATGGTG	2	12	106445	106456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735608
59	NC_014256	ATGGTG	2	12	106487	106498	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735608
60	NC_014256	CTGTTG	2	12	106517	106528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	298735608
61	NC_014256	AATTAG	2	12	107031	107042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735609
62	NC_014256	CCCATG	2	12	108268	108279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298735610
63	NC_014256	GTGGGT	2	12	109870	109881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735611
64	NC_014256	GCGATG	2	12	110465	110476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735611
65	NC_014256	CTTGCA	2	12	110655	110666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735611
66	NC_014256	GCATTT	2	12	114587	114598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735618
67	NC_014256	AGAAAA	2	12	114731	114742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735618
68	NC_014256	TGAGCA	2	12	122490	122501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735625
69	NC_014256	CTAAGG	2	12	122730	122741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735625
70	NC_014256	GTGCCT	2	12	125606	125617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735628
71	NC_014256	GATTTT	2	12	125942	125953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735628
72	NC_014256	GTTTTT	2	12	129851	129862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735632
73	NC_014256	TTGCAT	2	12	129870	129881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735632
74	NC_014256	GGATTG	2	12	131463	131474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735633
75	NC_014256	TGGTTT	2	12	131606	131617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735633
76	NC_014256	AGGTTT	2	12	132877	132888	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298735634
77	NC_014256	GGTTTG	2	12	132902	132913	0 %	50 %	50 %	0 %	298735634
78	NC_014256	GGTTTG	3	18	132926	132943	0 %	50 %	50 %	0 %	298735634
79	NC_014256	TGGAGA	2	12	133240	133251	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298735634
80	NC_014256	GGGCAG	2	12	139042	139053	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	298735643
81	NC_014256	AGCGTC	2	12	143819	143830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298735647
82	NC_014256	TAGTTT	2	12	144425	144436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735647
83	NC_014256	CCAAAC	2	12	145971	145982	50 %	0 %	0 %	50 %	298735648
84	NC_014256	GCTTAG	2	12	148533	148544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735652
85	NC_014256	GATTTG	2	12	151567	151578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298735656
86	NC_014256	GTAAAG	2	12	155344	155355	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298735663
87	NC_014256	CAAGGG	2	12	158208	158219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	298735671
88	NC_014256	CAAAAC	2	12	160284	160295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735675
89	NC_014256	ATCACT	2	12	162482	162493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735680
90	NC_014256	ACACCA	2	12	165529	165540	50 %	0 %	0 %	50 %	298735686
91	NC_014256	TAGCTA	2	12	167736	167747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735689
92	NC_014256	CGAATA	2	12	169137	169148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735690
93	NC_014256	TTGCAA	2	12	170044	170055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735692
94	NC_014256	CGAATA	2	12	171148	171159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735693
95	NC_014256	TGCATA	2	12	171312	171323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735693
96	NC_014256	TAACCT	2	12	172270	172281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735694
97	NC_014256	AGAAAA	2	12	177091	177102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735698
98	NC_014256	CGTGAG	2	12	183052	183063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735702
99	NC_014256	CAAAAA	2	12	183421	183432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298735703
100	NC_014256	CCAAAA	2	12	184423	184434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735703
101	NC_014256	AAAATC	2	12	184717	184728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735704
102	NC_014256	CAACAC	2	12	187560	187571	50 %	0 %	0 %	50 %	298735705
103	NC_014256	GCTTTA	2	12	187870	187881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735705
104	NC_014256	CAAAGC	2	12	190966	190977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298735710
105	NC_014256	TTCATT	2	12	193771	193782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735711
106	NC_014256	TAAGCG	2	12	195147	195158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735713
107	NC_014256	TTGGTT	2	12	199866	199877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735721
108	NC_014256	AAAACA	2	12	200374	200385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298735722
109	NC_014256	AAGAAA	2	12	205181	205192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735726
110	NC_014256	AAATAC	2	12	208551	208562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735729
111	NC_014256	GCGCGA	2	12	211200	211211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	298735733
112	NC_014256	TCTTTT	2	12	213260	213271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735734
113	NC_014256	TTTTAA	2	12	213875	213886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735737
114	NC_014256	GGGCGA	2	12	214720	214731	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	298735738
115	NC_014256	AGCGTT	2	12	216052	216063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735738
116	NC_014256	CAAATC	2	12	225121	225132	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298735750
117	NC_014256	TGATAT	2	12	226165	226176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298735752
118	NC_014256	GCCCAC	2	12	226232	226243	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	298735752
119	NC_014256	GGGGCT	2	12	229038	229049	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	298735755
120	NC_014256	AAAGCG	2	12	231914	231925	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298735759
121	NC_014256	AAAAAG	2	12	232077	232088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735759
122	NC_014256	TTAGGG	2	12	235288	235299	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735762
123	NC_014256	GGCTAT	2	12	239815	239826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735769
124	NC_014256	GCTAAA	2	12	245183	245194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735774
125	NC_014256	GATTTG	2	12	254177	254188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298735787
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128	NC_014256	ATCACT	2	12	264940	264951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735792
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130	NC_014256	CCCATA	2	12	268308	268319	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298735793
131	NC_014256	GTTTTG	2	12	270113	270124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735797
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139	NC_014256	GCTTAC	2	12	282927	282938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735809
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143	NC_014256	AATGGC	2	12	287631	287642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735815
144	NC_014256	TTCTGT	2	12	290861	290872	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298735817
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147	NC_014256	GCTTGC	2	12	300752	300763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735827
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220	NC_014256	CTTGAG	2	12	498870	498881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298736022
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223	NC_014256	CTTTTT	2	12	501877	501888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298736025
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225	NC_014256	ACATTG	2	12	504254	504265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298736026
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228	NC_014256	TCAGTG	2	12	510583	510594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298736033
229	NC_014256	TAACAA	2	12	511204	511215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298736034
230	NC_014256	CTTTAG	2	12	512203	512214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298736034
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344	NC_014256	TCTTTT	2	12	751771	751782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298736276
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346	NC_014256	TGGCGA	2	12	758560	758571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298736283
347	NC_014256	TCAAGA	2	12	761323	761334	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298736286
348	NC_014256	TGGGGG	2	12	764430	764441	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	298736290
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457	NC_014256	TAGCGC	2	12	1021825	1021836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298736534
458	NC_014256	TCTAAA	2	12	1022993	1023004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298736536
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