MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 1900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	CCGCG	2	10	2817	2826	0 %	0 %	40 %	60 %	292654180
2	NC_013967	GAACC	2	10	3153	3162	40 %	0 %	20 %	40 %	292654181
3	NC_013967	CGACG	2	10	4706	4715	20 %	0 %	40 %	40 %	292654182
4	NC_013967	CGACG	2	10	5274	5283	20 %	0 %	40 %	40 %	292654182
5	NC_013967	CGCGG	2	10	5618	5627	0 %	0 %	60 %	40 %	292654182
6	NC_013967	CGTGG	2	10	8594	8603	0 %	20 %	60 %	20 %	292654185
7	NC_013967	TCGGT	2	10	11126	11135	0 %	40 %	40 %	20 %	292654189
8	NC_013967	GTCCG	2	10	13085	13094	0 %	20 %	40 %	40 %	292654191
9	NC_013967	CGCTC	2	10	14016	14025	0 %	20 %	20 %	60 %	292654191
10	NC_013967	CCGAC	2	10	16299	16308	20 %	0 %	20 %	60 %	292654193
11	NC_013967	GTTCC	2	10	18430	18439	0 %	40 %	20 %	40 %	292654197
12	NC_013967	CCGGG	2	10	18952	18961	0 %	0 %	60 %	40 %	292654197
13	NC_013967	GTCGA	2	10	19681	19690	20 %	20 %	40 %	20 %	292654198
14	NC_013967	CTCAC	2	10	21237	21246	20 %	20 %	0 %	60 %	292654199
15	NC_013967	GCGTC	2	10	22115	22124	0 %	20 %	40 %	40 %	292654199
16	NC_013967	GTCGC	2	10	22264	22273	0 %	20 %	40 %	40 %	292654199
17	NC_013967	CCGCG	2	10	27087	27096	0 %	0 %	40 %	60 %	292654204
18	NC_013967	CTTCG	2	10	27867	27876	0 %	40 %	20 %	40 %	292654205
19	NC_013967	CCTCG	2	10	31204	31213	0 %	20 %	20 %	60 %	292654209
20	NC_013967	GCGAC	2	10	32310	32319	20 %	0 %	40 %	40 %	292654210
21	NC_013967	GCGCG	2	10	32764	32773	0 %	0 %	60 %	40 %	292654211
22	NC_013967	CGTCG	2	10	36454	36463	0 %	20 %	40 %	40 %	292654215
23	NC_013967	CGGGT	2	10	36613	36622	0 %	20 %	60 %	20 %	292654215
24	NC_013967	GGGTA	2	10	37580	37589	20 %	20 %	60 %	0 %	292654216
25	NC_013967	CACGA	2	10	39603	39612	40 %	0 %	20 %	40 %	292654217
26	NC_013967	CGCGC	2	10	41748	41757	0 %	0 %	40 %	60 %	292654219
27	NC_013967	GCGCC	2	10	42745	42754	0 %	0 %	40 %	60 %	292654220
28	NC_013967	GCGGT	2	10	44380	44389	0 %	20 %	60 %	20 %	292654222
29	NC_013967	CTTCG	2	10	45468	45477	0 %	40 %	20 %	40 %	292654223
30	NC_013967	CGTCG	2	10	48373	48382	0 %	20 %	40 %	40 %	292654226
31	NC_013967	TGTCG	2	10	49447	49456	0 %	40 %	40 %	20 %	292654226
32	NC_013967	GCCGC	2	10	50007	50016	0 %	0 %	40 %	60 %	292654228
33	NC_013967	GTCGG	2	10	50325	50334	0 %	20 %	60 %	20 %	292654228
34	NC_013967	CGGCG	2	10	51899	51908	0 %	0 %	60 %	40 %	292654230
35	NC_013967	TCGGG	2	10	54300	54309	0 %	20 %	60 %	20 %	292654232
36	NC_013967	CGGCG	2	10	66668	66677	0 %	0 %	60 %	40 %	292654242
37	NC_013967	ACGGG	2	10	70896	70905	20 %	0 %	60 %	20 %	292654246
38	NC_013967	TGGTC	2	10	71533	71542	0 %	40 %	40 %	20 %	292654246
39	NC_013967	GTCGT	2	10	72201	72210	0 %	40 %	40 %	20 %	292654247
40	NC_013967	GGCGC	2	10	75287	75296	0 %	0 %	60 %	40 %	292654251
41	NC_013967	GCGAG	2	10	76006	76015	20 %	0 %	60 %	20 %	292654251
42	NC_013967	GCCGC	2	10	76576	76585	0 %	0 %	40 %	60 %	292654252
43	NC_013967	GCCGC	2	10	77203	77212	0 %	0 %	40 %	60 %	292654252
44	NC_013967	CGTCA	2	10	77442	77451	20 %	20 %	20 %	40 %	292654252
45	NC_013967	CGGCG	2	10	77464	77473	0 %	0 %	60 %	40 %	292654253
46	NC_013967	ACAGC	2	10	77962	77971	40 %	0 %	20 %	40 %	292654253
47	NC_013967	TCGGG	2	10	78087	78096	0 %	20 %	60 %	20 %	292654253
48	NC_013967	CCGGG	2	10	78884	78893	0 %	0 %	60 %	40 %	292654254
49	NC_013967	CTCGT	2	10	80567	80576	0 %	40 %	20 %	40 %	292654256
50	NC_013967	ACGGG	2	10	81808	81817	20 %	0 %	60 %	20 %	292654258
51	NC_013967	CCGCG	2	10	82664	82673	0 %	0 %	40 %	60 %	292654259
52	NC_013967	AACCC	2	10	82844	82853	40 %	0 %	0 %	60 %	292654259
53	NC_013967	CGAGC	2	10	84384	84393	20 %	0 %	40 %	40 %	292654261
54	NC_013967	CGAGG	2	10	85095	85104	20 %	0 %	60 %	20 %	292654261
55	NC_013967	CGAGC	2	10	85956	85965	20 %	0 %	40 %	40 %	292654263
56	NC_013967	GCGAC	2	10	86491	86500	20 %	0 %	40 %	40 %	292654263
57	NC_013967	CCTGC	2	10	87143	87152	0 %	20 %	20 %	60 %	292654263
58	NC_013967	AAGCG	2	10	91909	91918	40 %	0 %	40 %	20 %	292654270
59	NC_013967	CGCGG	2	10	92748	92757	0 %	0 %	60 %	40 %	292654272
60	NC_013967	CGACC	2	10	94373	94382	20 %	0 %	20 %	60 %	292654274
61	NC_013967	GCAAC	2	10	97107	97116	40 %	0 %	20 %	40 %	292654276
62	NC_013967	CGACT	2	10	97192	97201	20 %	20 %	20 %	40 %	292654276
63	NC_013967	CGCAC	2	10	99032	99041	20 %	0 %	20 %	60 %	292654278
64	NC_013967	CGACC	2	10	102667	102676	20 %	0 %	20 %	60 %	292654282
65	NC_013967	GCCGC	2	10	103578	103587	0 %	0 %	40 %	60 %	292654283
66	NC_013967	GGAGC	2	10	103670	103679	20 %	0 %	60 %	20 %	292654283
67	NC_013967	ACGCG	2	10	104953	104962	20 %	0 %	40 %	40 %	292654285
68	NC_013967	CGTCG	2	10	105209	105218	0 %	20 %	40 %	40 %	292654286
69	NC_013967	GCGCC	2	10	105541	105550	0 %	0 %	40 %	60 %	292654286
70	NC_013967	CGGCG	2	10	105707	105716	0 %	0 %	60 %	40 %	292654286
71	NC_013967	ACGAG	2	10	106079	106088	40 %	0 %	40 %	20 %	292654287
72	NC_013967	GCCCG	2	10	106752	106761	0 %	0 %	40 %	60 %	292654287
73	NC_013967	GCGCC	2	10	109135	109144	0 %	0 %	40 %	60 %	292654290
74	NC_013967	GTCGT	2	10	109575	109584	0 %	40 %	40 %	20 %	292654291
75	NC_013967	CGTCC	2	10	109601	109610	0 %	20 %	20 %	60 %	292654291
76	NC_013967	CACGC	2	10	109977	109986	20 %	0 %	20 %	60 %	292654291
77	NC_013967	GGTCG	2	10	110656	110665	0 %	20 %	60 %	20 %	292654292
78	NC_013967	AATCG	2	10	112326	112335	40 %	20 %	20 %	20 %	292654297
79	NC_013967	GTCCG	2	10	113240	113249	0 %	20 %	40 %	40 %	292654298
80	NC_013967	GCCCG	2	10	114663	114672	0 %	0 %	40 %	60 %	292654299
81	NC_013967	GACGG	2	10	116628	116637	20 %	0 %	60 %	20 %	292654301
82	NC_013967	TCGGT	2	10	118440	118449	0 %	40 %	40 %	20 %	292654303
83	NC_013967	CGGCG	2	10	119411	119420	0 %	0 %	60 %	40 %	292654304
84	NC_013967	TTCGA	2	10	120421	120430	20 %	40 %	20 %	20 %	292654306
85	NC_013967	CGTCG	2	10	126306	126315	0 %	20 %	40 %	40 %	292654313
86	NC_013967	CGGTT	2	10	127988	127997	0 %	40 %	40 %	20 %	292654316
87	NC_013967	CCGAG	2	10	128779	128788	20 %	0 %	40 %	40 %	292654317
88	NC_013967	GACGC	2	10	129385	129394	20 %	0 %	40 %	40 %	292654318
89	NC_013967	CCGCC	2	10	129805	129814	0 %	0 %	20 %	80 %	292654319
90	NC_013967	ACGAG	2	10	132738	132747	40 %	0 %	40 %	20 %	292654320
91	NC_013967	CCGCG	2	10	133393	133402	0 %	0 %	40 %	60 %	292654322
92	NC_013967	ACAGA	2	10	133432	133441	60 %	0 %	20 %	20 %	292654322
93	NC_013967	CCGCC	2	10	134097	134106	0 %	0 %	20 %	80 %	292654323
94	NC_013967	CGTCG	2	10	134341	134350	0 %	20 %	40 %	40 %	292654323
95	NC_013967	GCTCG	2	10	141740	141749	0 %	20 %	40 %	40 %	292654332
96	NC_013967	GCGAC	2	10	142110	142119	20 %	0 %	40 %	40 %	292654332
97	NC_013967	TCCGG	2	10	144961	144970	0 %	20 %	40 %	40 %	292654337
98	NC_013967	TCGGG	2	10	145240	145249	0 %	20 %	60 %	20 %	292654337
99	NC_013967	CGGAC	2	10	147051	147060	20 %	0 %	40 %	40 %	292654340
100	NC_013967	CGCGA	2	10	149532	149541	20 %	0 %	40 %	40 %	292654343
101	NC_013967	CGACG	2	10	149927	149936	20 %	0 %	40 %	40 %	292654344
102	NC_013967	CGGCG	2	10	150395	150404	0 %	0 %	60 %	40 %	292654344
103	NC_013967	GTCGC	2	10	151152	151161	0 %	20 %	40 %	40 %	292654344
104	NC_013967	CAGCT	2	10	151436	151445	20 %	20 %	20 %	40 %	292654345
105	NC_013967	GAACT	2	10	152178	152187	40 %	20 %	20 %	20 %	292654346
106	NC_013967	CACGG	2	10	152241	152250	20 %	0 %	40 %	40 %	292654346
107	NC_013967	CGGTC	2	10	153763	153772	0 %	20 %	40 %	40 %	292654348
108	NC_013967	CCGCG	2	10	156338	156347	0 %	0 %	40 %	60 %	292654352
109	NC_013967	CGACC	2	10	160238	160247	20 %	0 %	20 %	60 %	292654356
110	NC_013967	AGACG	2	10	163248	163257	40 %	0 %	40 %	20 %	292654359
111	NC_013967	CGGCG	2	10	164792	164801	0 %	0 %	60 %	40 %	292654362
112	NC_013967	CGCGG	2	10	166649	166658	0 %	0 %	60 %	40 %	292654364
113	NC_013967	CGAGA	2	10	168069	168078	40 %	0 %	40 %	20 %	292654365
114	NC_013967	CGACC	2	10	169145	169154	20 %	0 %	20 %	60 %	292654365
115	NC_013967	GGTGA	2	10	170742	170751	20 %	20 %	60 %	0 %	292654368
116	NC_013967	CCGGT	2	10	171046	171055	0 %	20 %	40 %	40 %	292654369
117	NC_013967	GGAGG	2	10	172142	172151	20 %	0 %	80 %	0 %	292654370
118	NC_013967	CCGAA	2	10	173162	173171	40 %	0 %	20 %	40 %	292654370
119	NC_013967	ACGAG	2	10	173968	173977	40 %	0 %	40 %	20 %	292654370
120	NC_013967	CCACG	2	10	174119	174128	20 %	0 %	20 %	60 %	292654371
121	NC_013967	TCGAC	2	10	175172	175181	20 %	20 %	20 %	40 %	292654373
122	NC_013967	GCGCC	2	10	176109	176118	0 %	0 %	40 %	60 %	292654374
123	NC_013967	CGCGG	2	10	177401	177410	0 %	0 %	60 %	40 %	292654376
124	NC_013967	TCCGG	2	10	179554	179563	0 %	20 %	40 %	40 %	292654379
125	NC_013967	GCGCC	2	10	181930	181939	0 %	0 %	40 %	60 %	292654383
126	NC_013967	CCCCG	2	10	183114	183123	0 %	0 %	20 %	80 %	292654384
127	NC_013967	GGCCT	2	10	183640	183649	0 %	20 %	40 %	40 %	292654384
128	NC_013967	AGCGA	2	10	185320	185329	40 %	0 %	40 %	20 %	292654385
129	NC_013967	GCGCG	2	10	186880	186889	0 %	0 %	60 %	40 %	292654386
130	NC_013967	ACCGA	2	10	187215	187224	40 %	0 %	20 %	40 %	292654386
131	NC_013967	CTCGT	2	10	188815	188824	0 %	40 %	20 %	40 %	292654387
132	NC_013967	TCGTG	2	10	189425	189434	0 %	40 %	40 %	20 %	292654388
133	NC_013967	TCGGG	2	10	190467	190476	0 %	20 %	60 %	20 %	292654389
134	NC_013967	CGGCG	2	10	190873	190882	0 %	0 %	60 %	40 %	292654389
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