MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013967	GCC	2	6	146006	146011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654339
4002	NC_013967	TCG	2	6	146021	146026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4003	NC_013967	TCGG	2	8	146038	146045	0 %	25 %	50 %	25 %	292654339
4004	NC_013967	CGC	2	6	146058	146063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654339
4005	NC_013967	TCG	3	9	146066	146074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4006	NC_013967	CG	3	6	146073	146078	0 %	0 %	50 %	50 %	292654339
4007	NC_013967	CTCGGA	2	12	146107	146118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4008	NC_013967	TGA	2	6	146174	146179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654339
4009	NC_013967	CCG	2	6	146180	146185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654339
4010	NC_013967	TCG	3	9	146189	146197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4011	NC_013967	TC	3	6	146222	146227	0 %	50 %	0 %	50 %	292654339
4012	NC_013967	CGAC	2	8	146244	146251	25 %	0 %	25 %	50 %	292654339
4013	NC_013967	TTC	2	6	146278	146283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654339
4014	NC_013967	GTC	3	9	146284	146292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4015	NC_013967	GGA	2	6	146301	146306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654339
4016	NC_013967	CGG	2	6	146375	146380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654339
4017	NC_013967	CGG	2	6	146385	146390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654339
4018	NC_013967	CGG	2	6	146405	146410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654339
4019	NC_013967	ACG	2	6	146458	146463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4020	NC_013967	CTCGGC	2	12	146488	146499	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654339
4021	NC_013967	GCG	2	6	146564	146569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654339
4022	NC_013967	TCG	2	6	146612	146617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4023	NC_013967	GAC	2	6	146619	146624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654339
4024	NC_013967	CGG	2	6	146649	146654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654339
4025	NC_013967	TCGGCG	2	12	146681	146692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654339
4026	NC_013967	GGAA	2	8	146789	146796	50 %	0 %	50 %	0 %	292654339
4027	NC_013967	TTC	2	6	146873	146878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654340
4028	NC_013967	GAC	2	6	146887	146892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4029	NC_013967	CGTT	2	8	146906	146913	0 %	50 %	25 %	25 %	292654340
4030	NC_013967	ACG	2	6	146915	146920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4031	NC_013967	GCC	2	6	146968	146973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654340
4032	NC_013967	CCT	2	6	146988	146993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654340
4033	NC_013967	TCG	2	6	146999	147004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4034	NC_013967	CG	3	6	147012	147017	0 %	0 %	50 %	50 %	292654340
4035	NC_013967	TCA	3	9	147024	147032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654340
4036	NC_013967	CGGAC	2	10	147051	147060	20 %	0 %	40 %	40 %	292654340
4037	NC_013967	CTG	2	6	147082	147087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4038	NC_013967	GTC	2	6	147097	147102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4039	NC_013967	GGGC	2	8	147113	147120	0 %	0 %	75 %	25 %	292654340
4040	NC_013967	CGA	3	9	147133	147141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4041	NC_013967	TCG	2	6	147149	147154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4042	NC_013967	GTC	2	6	147182	147187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4043	NC_013967	GAT	2	6	147205	147210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654340
4044	NC_013967	GCG	2	6	147231	147236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654340
4045	NC_013967	CGA	2	6	147261	147266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4046	NC_013967	CTC	3	9	147283	147291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654340
4047	NC_013967	CG	3	6	147302	147307	0 %	0 %	50 %	50 %	292654340
4048	NC_013967	CGA	2	6	147327	147332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4049	NC_013967	GCG	2	6	147380	147385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654340
4050	NC_013967	CGG	2	6	147480	147485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654340
4051	NC_013967	CGG	2	6	147513	147518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654340
4052	NC_013967	TCG	2	6	147621	147626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654340
4053	NC_013967	GGC	2	6	147636	147641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654340
4054	NC_013967	TTG	2	6	147644	147649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654340
4055	NC_013967	GC	3	6	147766	147771	0 %	0 %	50 %	50 %	292654341
4056	NC_013967	TCG	2	6	147772	147777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654341
4057	NC_013967	CTC	2	6	147786	147791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654341
4058	NC_013967	GCCG	2	8	147816	147823	0 %	0 %	50 %	50 %	292654341
4059	NC_013967	GTCC	2	8	147842	147849	0 %	25 %	25 %	50 %	292654341
4060	NC_013967	CGC	2	6	147887	147892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654341
4061	NC_013967	TCG	2	6	147901	147906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654341
4062	NC_013967	CGT	2	6	147908	147913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654341
4063	NC_013967	TGG	2	6	147915	147920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654341
4064	NC_013967	CTC	2	6	147939	147944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654341
4065	NC_013967	GGC	2	6	147977	147982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654341
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4067	NC_013967	ACC	2	6	148117	148122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654341
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4069	NC_013967	TCT	2	6	148141	148146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654341
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4082	NC_013967	TCGG	2	8	148492	148499	0 %	25 %	50 %	25 %	292654341
4083	NC_013967	TCG	2	6	148546	148551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654341
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4087	NC_013967	CGA	2	6	148670	148675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654341
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4090	NC_013967	CGC	2	6	148721	148726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654341
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4093	NC_013967	TC	3	6	148766	148771	0 %	50 %	0 %	50 %	292654341
4094	NC_013967	CGA	2	6	148874	148879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654342
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4103	NC_013967	GTC	2	6	149079	149084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654342
4104	NC_013967	CGT	2	6	149090	149095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654342
4105	NC_013967	GGGC	2	8	149098	149105	0 %	0 %	75 %	25 %	292654342
4106	NC_013967	GAG	2	6	149118	149123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654342
4107	NC_013967	CGG	2	6	149152	149157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654342
4108	NC_013967	CGAGCG	2	12	149159	149170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654342
4109	NC_013967	CGC	2	6	149171	149176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654342
4110	NC_013967	G	7	7	149196	149202	0 %	0 %	100 %	0 %	292654342
4111	NC_013967	AGT	2	6	149204	149209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654342
4112	NC_013967	CGTC	2	8	149211	149218	0 %	25 %	25 %	50 %	292654342
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4116	NC_013967	GC	3	6	149300	149305	0 %	0 %	50 %	50 %	292654342
4117	NC_013967	CTCA	2	8	149370	149377	25 %	25 %	0 %	50 %	292654342
4118	NC_013967	GTA	2	6	149417	149422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654343
4119	NC_013967	GGCC	2	8	149440	149447	0 %	0 %	50 %	50 %	292654343
4120	NC_013967	CGA	2	6	149470	149475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654343
4121	NC_013967	GTG	2	6	149477	149482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654343
4122	NC_013967	CGC	2	6	149500	149505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654343
4123	NC_013967	GCC	2	6	149526	149531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654343
4124	NC_013967	CGCGA	2	10	149532	149541	20 %	0 %	40 %	40 %	292654343
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4130	NC_013967	CGACG	2	10	149927	149936	20 %	0 %	40 %	40 %	292654344
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4241	NC_013967	GCG	2	6	153684	153689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654348
4242	NC_013967	CTG	2	6	153699	153704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654348
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4347	NC_013967	CGA	2	6	156965	156970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654352
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4352	NC_013967	CGA	2	6	157345	157350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654353
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4357	NC_013967	CCG	2	6	157470	157475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654353
4358	NC_013967	AG	3	6	157484	157489	50 %	0 %	50 %	0 %	292654353
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4480	NC_013967	CAT	2	6	162195	162200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654358
4481	NC_013967	GCA	2	6	162206	162211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4482	NC_013967	CGG	2	6	162237	162242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654358
4483	NC_013967	TCA	2	6	162326	162331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654358
4484	NC_013967	TGA	2	6	162344	162349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654358
4485	NC_013967	CGC	2	6	162355	162360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654358
4486	NC_013967	CG	3	6	162411	162416	0 %	0 %	50 %	50 %	292654358
4487	NC_013967	CGAAGA	2	12	162444	162455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	292654358
4488	NC_013967	CGA	2	6	162501	162506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4489	NC_013967	CGG	2	6	162507	162512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654358
4490	NC_013967	TCA	2	6	162536	162541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654358
4491	NC_013967	CGT	2	6	162561	162566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4492	NC_013967	AGCC	2	8	162597	162604	25 %	0 %	25 %	50 %	292654358
4493	NC_013967	CGA	3	9	162639	162647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4494	NC_013967	GAC	2	6	162718	162723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4495	NC_013967	TC	3	6	162735	162740	0 %	50 %	0 %	50 %	292654358
4496	NC_013967	CGG	2	6	162747	162752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654358
4497	NC_013967	GTC	2	6	162801	162806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654358
4498	NC_013967	ACT	2	6	162998	163003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654359
4499	NC_013967	ACA	2	6	163004	163009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654359
4500	NC_013967	AGG	2	6	163019	163024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654359

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