MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013967	CGG	2	6	110158	110163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654291
3002	NC_013967	CTCG	2	8	110230	110237	0 %	25 %	25 %	50 %	292654292
3003	NC_013967	CGG	2	6	110238	110243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654292
3004	NC_013967	CGC	2	6	110248	110253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654292
3005	NC_013967	CGGACG	2	12	110271	110282	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654292
3006	NC_013967	GGA	2	6	110365	110370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654292
3007	NC_013967	TCGG	2	8	110420	110427	0 %	25 %	50 %	25 %	292654292
3008	NC_013967	CGA	2	6	110482	110487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654292
3009	NC_013967	GAC	2	6	110533	110538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654292
3010	NC_013967	CGC	2	6	110574	110579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654292
3011	NC_013967	GAC	2	6	110600	110605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654292
3012	NC_013967	GCG	2	6	110626	110631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654292
3013	NC_013967	CGT	2	6	110632	110637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654292
3014	NC_013967	GGTCG	2	10	110656	110665	0 %	20 %	60 %	20 %	292654292
3015	NC_013967	GAA	2	6	110689	110694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654292
3016	NC_013967	AAG	2	6	110909	110914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654293
3017	NC_013967	AAG	3	9	110924	110932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654293
3018	NC_013967	GGC	2	6	111030	111035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654293
3019	NC_013967	GAG	2	6	111077	111082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654294
3020	NC_013967	CGT	2	6	111085	111090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654294
3021	NC_013967	CG	3	6	111134	111139	0 %	0 %	50 %	50 %	292654294
3022	NC_013967	CCG	2	6	111257	111262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654294
3023	NC_013967	TCCGCG	2	12	111270	111281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654294
3024	NC_013967	CG	3	6	111283	111288	0 %	0 %	50 %	50 %	292654294
3025	NC_013967	CGA	2	6	111292	111297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654294
3026	NC_013967	GTCG	2	8	111307	111314	0 %	25 %	50 %	25 %	292654294
3027	NC_013967	CCT	2	6	111351	111356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654295
3028	NC_013967	TCGC	2	8	111384	111391	0 %	25 %	25 %	50 %	292654295
3029	NC_013967	CGAC	2	8	111393	111400	25 %	0 %	25 %	50 %	292654295
3030	NC_013967	CGA	2	6	111427	111432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3031	NC_013967	CTCG	2	8	111433	111440	0 %	25 %	25 %	50 %	292654295
3032	NC_013967	GAC	2	6	111481	111486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3033	NC_013967	CGG	2	6	111490	111495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654295
3034	NC_013967	CGGT	2	8	111504	111511	0 %	25 %	50 %	25 %	292654295
3035	NC_013967	TCT	2	6	111538	111543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654295
3036	NC_013967	AGG	2	6	111573	111578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654295
3037	NC_013967	CGC	2	6	111631	111636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654295
3038	NC_013967	CGT	2	6	111643	111648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3039	NC_013967	CGA	2	6	111691	111696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3040	NC_013967	GAG	2	6	111713	111718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654295
3041	NC_013967	CGG	2	6	111774	111779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654295
3042	NC_013967	CAA	2	6	111787	111792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654295
3043	NC_013967	CG	3	6	111819	111824	0 %	0 %	50 %	50 %	292654295
3044	NC_013967	GCT	2	6	111850	111855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3045	NC_013967	CGG	2	6	111889	111894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654295
3046	NC_013967	TCG	2	6	111900	111905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3047	NC_013967	TCG	2	6	111915	111920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3048	NC_013967	ACG	2	6	111924	111929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3049	NC_013967	CGT	2	6	111937	111942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654295
3050	NC_013967	CGT	2	6	112129	112134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654296
3051	NC_013967	GAGC	2	8	112207	112214	25 %	0 %	50 %	25 %	292654296
3052	NC_013967	ATG	2	6	112261	112266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654296
3053	NC_013967	GGC	2	6	112267	112272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654297
3054	NC_013967	CAG	2	6	112276	112281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3055	NC_013967	CAG	2	6	112288	112293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3056	NC_013967	CGA	2	6	112317	112322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3057	NC_013967	AATCG	2	10	112326	112335	40 %	20 %	20 %	20 %	292654297
3058	NC_013967	ACG	2	6	112361	112366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3059	NC_013967	CGA	2	6	112380	112385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3060	NC_013967	CGG	2	6	112440	112445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654297
3061	NC_013967	CGA	2	6	112479	112484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3062	NC_013967	GTC	3	9	112486	112494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3063	NC_013967	CGC	2	6	112512	112517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654297
3064	NC_013967	CGA	2	6	112572	112577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3065	NC_013967	GAG	2	6	112606	112611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654297
3066	NC_013967	CGA	2	6	112626	112631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3067	NC_013967	CAG	2	6	112660	112665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3068	NC_013967	GCA	2	6	112668	112673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3069	NC_013967	CAG	2	6	112675	112680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3070	NC_013967	GCA	2	6	112683	112688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3071	NC_013967	GCA	2	6	112692	112697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3072	NC_013967	AGGGCG	2	12	112703	112714	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	292654297
3073	NC_013967	ACG	2	6	112715	112720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
3074	NC_013967	CGA	3	9	112722	112730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654297
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3076	NC_013967	ACG	2	6	112807	112812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
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3078	NC_013967	GGC	2	6	112841	112846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3079	NC_013967	CGA	2	6	112850	112855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3080	NC_013967	CCGACG	2	12	112864	112875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654298
3081	NC_013967	CAG	2	6	112894	112899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3082	NC_013967	CGG	2	6	112912	112917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3083	NC_013967	GCT	2	6	112941	112946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3084	NC_013967	GACGCC	2	12	112956	112967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654298
3085	NC_013967	GTC	3	9	113036	113044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3086	NC_013967	GCG	2	6	113046	113051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3087	NC_013967	CCGAAT	3	18	113065	113082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292654298
3088	NC_013967	CGA	2	6	113135	113140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3089	NC_013967	GCG	2	6	113146	113151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3090	NC_013967	CGA	2	6	113162	113167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3091	NC_013967	CG	3	6	113176	113181	0 %	0 %	50 %	50 %	292654298
3092	NC_013967	TCGC	2	8	113184	113191	0 %	25 %	25 %	50 %	292654298
3093	NC_013967	CGC	2	6	113198	113203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654298
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3096	NC_013967	GTCCG	2	10	113240	113249	0 %	20 %	40 %	40 %	292654298
3097	NC_013967	CCG	2	6	113258	113263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654298
3098	NC_013967	CGC	3	9	113264	113272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654298
3099	NC_013967	GTC	2	6	113289	113294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3100	NC_013967	GAG	2	6	113298	113303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654298
3101	NC_013967	CTC	2	6	113343	113348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654298
3102	NC_013967	GA	3	6	113413	113418	50 %	0 %	50 %	0 %	292654298
3103	NC_013967	ACG	2	6	113467	113472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3104	NC_013967	TCA	2	6	113485	113490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654298
3105	NC_013967	GAC	3	9	113579	113587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3106	NC_013967	AAG	2	6	113706	113711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654298
3107	NC_013967	GCG	2	6	113731	113736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3108	NC_013967	CGG	3	9	113740	113748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3109	NC_013967	ACG	2	6	113755	113760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3110	NC_013967	CGACAT	2	12	113783	113794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292654298
3111	NC_013967	CGT	2	6	113867	113872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654298
3112	NC_013967	ACG	2	6	113947	113952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654298
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3114	NC_013967	GCCGAC	2	12	113985	113996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654298
3115	NC_013967	CGG	2	6	114002	114007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654298
3116	NC_013967	GC	3	6	114239	114244	0 %	0 %	50 %	50 %	292654299
3117	NC_013967	CGA	2	6	114296	114301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654299
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3119	NC_013967	GGA	2	6	114392	114397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654299
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3233	NC_013967	CGA	3	9	118227	118235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3234	NC_013967	GGCGCG	2	12	118294	118305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654303
3235	NC_013967	CTC	2	6	118318	118323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654303
3236	NC_013967	GTC	2	6	118357	118362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3237	NC_013967	TCG	2	6	118364	118369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3238	NC_013967	GTC	2	6	118405	118410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3239	NC_013967	TCGGT	2	10	118440	118449	0 %	40 %	40 %	20 %	292654303
3240	NC_013967	CGA	2	6	118458	118463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3241	NC_013967	CGT	2	6	118476	118481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654303
3242	NC_013967	GTC	3	9	118507	118515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654303
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3247	NC_013967	TCG	3	9	118717	118725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654304
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3358	NC_013967	ACG	2	6	123625	123630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654311
3359	NC_013967	GGA	2	6	123647	123652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654311
3360	NC_013967	CGA	2	6	123686	123691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654311
3361	NC_013967	TCG	2	6	123700	123705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654311
3362	NC_013967	CCG	2	6	123706	123711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654311
3363	NC_013967	GTC	2	6	123747	123752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654311
3364	NC_013967	GTC	2	6	123762	123767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654311
3365	NC_013967	CTG	2	6	123772	123777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654311
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3442	NC_013967	GAC	2	6	126081	126086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654313
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3462	NC_013967	ACG	2	6	126822	126827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654314
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3468	NC_013967	GTATCG	2	12	127053	127064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292654315
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3471	NC_013967	TCG	3	9	127104	127112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654315
3472	NC_013967	TCG	2	6	127125	127130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654315
3473	NC_013967	CGG	2	6	127132	127137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654315
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3475	NC_013967	ACG	2	6	127259	127264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654316
3476	NC_013967	AAG	2	6	127270	127275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654316
3477	NC_013967	CGT	2	6	127298	127303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654316
3478	NC_013967	CGA	2	6	127364	127369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654316
3479	NC_013967	CGG	2	6	127401	127406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654316
3480	NC_013967	GTC	2	6	127428	127433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654316
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3482	NC_013967	GTC	2	6	127524	127529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654316
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3491	NC_013967	CGA	2	6	127868	127873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654316
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3495	NC_013967	CG	3	6	128138	128143	0 %	0 %	50 %	50 %	292654317
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3499	NC_013967	CCG	2	6	128262	128267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654317
3500	NC_013967	CGA	3	9	128284	128292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654317

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