MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013967	CTCA	2	8	54104	54111	25 %	25 %	0 %	50 %	292654231
1502	NC_013967	CAG	2	6	54123	54128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1503	NC_013967	GAC	2	6	54141	54146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1504	NC_013967	TCG	2	6	54157	54162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1505	NC_013967	ATC	2	6	54199	54204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654232
1506	NC_013967	GCG	2	6	54211	54216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654232
1507	NC_013967	GC	3	6	54229	54234	0 %	0 %	50 %	50 %	292654232
1508	NC_013967	GTC	2	6	54252	54257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1509	NC_013967	TCGGG	2	10	54300	54309	0 %	20 %	60 %	20 %	292654232
1510	NC_013967	TCG	2	6	54352	54357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1511	NC_013967	CGA	2	6	54398	54403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1512	NC_013967	GAT	2	6	54417	54422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654232
1513	NC_013967	TCG	3	9	54457	54465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1514	NC_013967	GAC	2	6	54468	54473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1515	NC_013967	CGA	2	6	54509	54514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1516	NC_013967	ACGT	2	8	54532	54539	25 %	25 %	25 %	25 %	292654232
1517	NC_013967	GCG	2	6	54556	54561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654232
1518	NC_013967	CGC	2	6	54593	54598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654232
1519	NC_013967	CGA	2	6	54656	54661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1520	NC_013967	GC	4	8	54672	54679	0 %	0 %	50 %	50 %	292654232
1521	NC_013967	TCG	2	6	54692	54697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1522	NC_013967	GTC	3	9	54714	54722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1523	NC_013967	TCG	2	6	54769	54774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1524	NC_013967	TCC	2	6	54790	54795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654232
1525	NC_013967	GA	3	6	54797	54802	50 %	0 %	50 %	0 %	292654232
1526	NC_013967	TCG	2	6	54826	54831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1527	NC_013967	CAC	2	6	54840	54845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654232
1528	NC_013967	AGA	2	6	54852	54857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654232
1529	NC_013967	CGT	2	6	54887	54892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654232
1530	NC_013967	CG	3	6	54893	54898	0 %	0 %	50 %	50 %	292654232
1531	NC_013967	CCT	2	6	54923	54928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654232
1532	NC_013967	TCG	2	6	55099	55104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1533	NC_013967	CCG	2	6	55137	55142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654233
1534	NC_013967	GAA	2	6	55161	55166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654233
1535	NC_013967	GTC	2	6	55176	55181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1536	NC_013967	CGA	2	6	55187	55192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1537	NC_013967	CGA	2	6	55196	55201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1538	NC_013967	CTC	2	6	55242	55247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654233
1539	NC_013967	CGGTCT	2	12	55310	55321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1540	NC_013967	CGT	2	6	55358	55363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1541	NC_013967	CG	3	6	55368	55373	0 %	0 %	50 %	50 %	292654233
1542	NC_013967	CGC	2	6	55472	55477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654233
1543	NC_013967	CCG	2	6	55514	55519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654233
1544	NC_013967	TCG	2	6	55555	55560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1545	NC_013967	GTC	2	6	55575	55580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1546	NC_013967	TCGC	2	8	55618	55625	0 %	25 %	25 %	50 %	292654233
1547	NC_013967	TCG	2	6	55648	55653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654233
1548	NC_013967	AGT	2	6	55734	55739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654234
1549	NC_013967	GAC	2	6	55750	55755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1550	NC_013967	GAG	3	9	55795	55803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654234
1551	NC_013967	TCG	2	6	55826	55831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1552	NC_013967	CGG	2	6	55852	55857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654234
1553	NC_013967	CGA	2	6	55881	55886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1554	NC_013967	TCG	2	6	55907	55912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1555	NC_013967	GCC	2	6	55927	55932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654234
1556	NC_013967	GCC	2	6	55939	55944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654234
1557	NC_013967	CGT	2	6	55950	55955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1558	NC_013967	CGC	2	6	55975	55980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654234
1559	NC_013967	ACG	2	6	56081	56086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1560	NC_013967	ACG	2	6	56093	56098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654234
1561	NC_013967	CTC	2	6	56214	56219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654235
1562	NC_013967	CTC	2	6	56313	56318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654235
1563	NC_013967	AGGT	2	8	56323	56330	25 %	25 %	50 %	0 %	292654235
1564	NC_013967	GCG	2	6	56335	56340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654235
1565	NC_013967	TCG	3	9	56344	56352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1566	NC_013967	CGG	2	6	56366	56371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654235
1567	NC_013967	TCA	2	6	56387	56392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654235
1568	NC_013967	GAT	2	6	56430	56435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654235
1569	NC_013967	GC	3	6	56506	56511	0 %	0 %	50 %	50 %	292654235
1570	NC_013967	CGG	2	6	56631	56636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654235
1571	NC_013967	CG	3	6	56639	56644	0 %	0 %	50 %	50 %	292654235
1572	NC_013967	CGG	2	6	56649	56654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654235
1573	NC_013967	CGA	2	6	56709	56714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1574	NC_013967	GCGT	2	8	56722	56729	0 %	25 %	50 %	25 %	292654235
1575	NC_013967	CCG	2	6	56762	56767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654235
1576	NC_013967	CAT	2	6	56778	56783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654235
1577	NC_013967	GAC	2	6	56826	56831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1578	NC_013967	TCG	2	6	56941	56946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1579	NC_013967	GAT	2	6	56949	56954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654235
1580	NC_013967	CGATGC	2	12	56984	56995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1581	NC_013967	GCTGGC	2	12	56996	57007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	292654235
1582	NC_013967	GTA	2	6	57033	57038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654235
1583	NC_013967	GTT	2	6	57041	57046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654235
1584	NC_013967	GTG	2	6	57238	57243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654235
1585	NC_013967	CGA	2	6	57338	57343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1586	NC_013967	CGC	2	6	57356	57361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654235
1587	NC_013967	TGC	2	6	57404	57409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654235
1588	NC_013967	GCC	2	6	57417	57422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654235
1589	NC_013967	GTA	2	6	57429	57434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654235
1590	NC_013967	CG	3	6	57470	57475	0 %	0 %	50 %	50 %	292654235
1591	NC_013967	CTT	2	6	57491	57496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654235
1592	NC_013967	CCT	2	6	57562	57567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654236
1593	NC_013967	GTC	2	6	57578	57583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1594	NC_013967	CAG	2	6	57590	57595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1595	NC_013967	ACG	2	6	57598	57603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1596	NC_013967	CG	3	6	57602	57607	0 %	0 %	50 %	50 %	292654236
1597	NC_013967	G	6	6	57685	57690	0 %	0 %	100 %	0 %	292654236
1598	NC_013967	TTCGTC	2	12	57755	57766	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	292654236
1599	NC_013967	CGA	2	6	57835	57840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1600	NC_013967	CGA	2	6	57853	57858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1601	NC_013967	TGA	2	6	57922	57927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654236
1602	NC_013967	ATG	2	6	57930	57935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654236
1603	NC_013967	GAG	2	6	57965	57970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654236
1604	NC_013967	CGT	2	6	58007	58012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1605	NC_013967	TCG	2	6	58017	58022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1606	NC_013967	GC	3	6	58068	58073	0 %	0 %	50 %	50 %	292654236
1607	NC_013967	CCG	2	6	58083	58088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654236
1608	NC_013967	TGG	2	6	58095	58100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654236
1609	NC_013967	CGG	2	6	58116	58121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654236
1610	NC_013967	TCG	2	6	58168	58173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1611	NC_013967	CCT	2	6	58210	58215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654236
1612	NC_013967	TGC	2	6	58282	58287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1613	NC_013967	CGC	2	6	58288	58293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654236
1614	NC_013967	GAG	2	6	58325	58330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654236
1615	NC_013967	CGT	2	6	58339	58344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1616	NC_013967	ATG	2	6	58347	58352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654236
1617	NC_013967	ATG	2	6	58392	58397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654236
1618	NC_013967	CGA	2	6	58435	58440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1619	NC_013967	CGC	2	6	58453	58458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654236
1620	NC_013967	CG	3	6	58487	58492	0 %	0 %	50 %	50 %	292654236
1621	NC_013967	CCT	2	6	58498	58503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654236
1622	NC_013967	ACG	2	6	58516	58521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
1623	NC_013967	AGC	2	6	58542	58547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654236
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1991	NC_013967	TCG	4	12	72659	72670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654248
1992	NC_013967	CCG	2	6	72678	72683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654248
1993	NC_013967	GTC	2	6	72700	72705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654248
1994	NC_013967	CTG	2	6	72763	72768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654248
1995	NC_013967	CGA	2	6	72787	72792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654248
1996	NC_013967	TCG	2	6	72800	72805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654248
1997	NC_013967	CG	3	6	72832	72837	0 %	0 %	50 %	50 %	292654248
1998	NC_013967	AGT	2	6	72852	72857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654248
1999	NC_013967	CG	4	8	73082	73089	0 %	0 %	50 %	50 %	292654249
2000	NC_013967	TCGC	2	8	73099	73106	0 %	25 %	25 %	50 %	292654249

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