MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013967	CTC	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654215
1002	NC_013967	CGTCG	2	10	36454	36463	0 %	20 %	40 %	40 %	292654215
1003	NC_013967	GAC	2	6	36473	36478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1004	NC_013967	CTC	2	6	36511	36516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654215
1005	NC_013967	CGGGT	2	10	36613	36622	0 %	20 %	60 %	20 %	292654215
1006	NC_013967	CG	3	6	36629	36634	0 %	0 %	50 %	50 %	292654215
1007	NC_013967	CCG	2	6	36661	36666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654215
1008	NC_013967	TCG	3	9	36674	36682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1009	NC_013967	CGA	2	6	36705	36710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1010	NC_013967	CCA	2	6	36750	36755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654215
1011	NC_013967	CGTCGC	2	12	36756	36767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654215
1012	NC_013967	ACG	2	6	36771	36776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1013	NC_013967	TCCG	2	8	36788	36795	0 %	25 %	25 %	50 %	292654215
1014	NC_013967	TCA	2	6	36801	36806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654215
1015	NC_013967	TCG	2	6	36816	36821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1016	NC_013967	TCA	2	6	36888	36893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654215
1017	NC_013967	CAG	2	6	36907	36912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654215
1018	NC_013967	CCG	2	6	36987	36992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654215
1019	NC_013967	AAC	2	6	37112	37117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292654215
1020	NC_013967	TCA	2	6	37149	37154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654215
1021	NC_013967	GCTCAG	2	12	37226	37237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1022	NC_013967	CGG	2	6	37243	37248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654216
1023	NC_013967	CGT	2	6	37254	37259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1024	NC_013967	CGT	2	6	37263	37268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1025	NC_013967	GTC	2	6	37429	37434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1026	NC_013967	GC	3	6	37437	37442	0 %	0 %	50 %	50 %	292654216
1027	NC_013967	TCG	2	6	37479	37484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1028	NC_013967	GA	3	6	37571	37576	50 %	0 %	50 %	0 %	292654216
1029	NC_013967	GGGTA	2	10	37580	37589	20 %	20 %	60 %	0 %	292654216
1030	NC_013967	CGA	2	6	37593	37598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1031	NC_013967	CGT	2	6	37614	37619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1032	NC_013967	CGA	2	6	37689	37694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1033	NC_013967	CTCGGC	2	12	37789	37800	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654216
1034	NC_013967	ACG	2	6	37803	37808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1035	NC_013967	GAA	2	6	37810	37815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654216
1036	NC_013967	CGG	2	6	37842	37847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654216
1037	NC_013967	CCT	2	6	37860	37865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654216
1038	NC_013967	TG	3	6	37877	37882	0 %	50 %	50 %	0 %	292654216
1039	NC_013967	GTC	2	6	37888	37893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1040	NC_013967	GGA	2	6	37900	37905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654216
1041	NC_013967	CGG	2	6	37937	37942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654216
1042	NC_013967	GTC	2	6	37984	37989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1043	NC_013967	CCT	2	6	38058	38063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654216
1044	NC_013967	CG	3	6	38110	38115	0 %	0 %	50 %	50 %	292654216
1045	NC_013967	TCG	2	6	38126	38131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1046	NC_013967	GCC	2	6	38134	38139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654216
1047	NC_013967	CGG	2	6	38144	38149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654216
1048	NC_013967	GGC	2	6	38166	38171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654216
1049	NC_013967	TCG	2	6	38177	38182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1050	NC_013967	CGC	2	6	38212	38217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654216
1051	NC_013967	CGT	2	6	38242	38247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1052	NC_013967	GTC	2	6	38371	38376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1053	NC_013967	CGA	2	6	38378	38383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1054	NC_013967	AG	3	6	38398	38403	50 %	0 %	50 %	0 %	292654216
1055	NC_013967	GCTCGC	2	12	38427	38438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654216
1056	NC_013967	GTC	2	6	38521	38526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1057	NC_013967	GC	3	6	38574	38579	0 %	0 %	50 %	50 %	292654216
1058	NC_013967	TGT	2	6	38610	38615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654216
1059	NC_013967	TCG	2	6	38621	38626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1060	NC_013967	CGT	2	6	38640	38645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1061	NC_013967	ACC	2	6	38661	38666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654216
1062	NC_013967	GAA	2	6	38668	38673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654216
1063	NC_013967	ATC	2	6	38684	38689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654216
1064	NC_013967	GGT	3	9	38700	38708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654216
1065	NC_013967	GAC	2	6	38716	38721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1066	NC_013967	CCT	2	6	38742	38747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654216
1067	NC_013967	CGT	2	6	38814	38819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1068	NC_013967	GAA	2	6	38833	38838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654216
1069	NC_013967	GTT	2	6	38860	38865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654216
1070	NC_013967	GTA	2	6	38866	38871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654216
1071	NC_013967	AGT	2	6	38880	38885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654216
1072	NC_013967	CCT	2	6	38889	38894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654216
1073	NC_013967	TCG	3	9	38909	38917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1074	NC_013967	CG	3	6	38948	38953	0 %	0 %	50 %	50 %	292654216
1075	NC_013967	GAG	2	6	38989	38994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654216
1076	NC_013967	CGA	2	6	39039	39044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
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1078	NC_013967	CCT	2	6	39141	39146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654216
1079	NC_013967	CT	3	6	39145	39150	0 %	50 %	0 %	50 %	292654216
1080	NC_013967	CGA	2	6	39171	39176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1081	NC_013967	CTG	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1082	NC_013967	TCG	2	6	39201	39206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1083	NC_013967	TGA	2	6	39207	39212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654216
1084	NC_013967	TCCCGG	2	12	39273	39284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654216
1085	NC_013967	GAG	2	6	39295	39300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654216
1086	NC_013967	TCG	3	9	39311	39319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1087	NC_013967	CGC	2	6	39343	39348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654216
1088	NC_013967	TCG	2	6	39368	39373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1089	NC_013967	GAA	2	6	39379	39384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654216
1090	NC_013967	TCCG	2	8	39394	39401	0 %	25 %	25 %	50 %	292654216
1091	NC_013967	CGT	2	6	39408	39413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654216
1092	NC_013967	CACGA	2	10	39603	39612	40 %	0 %	20 %	40 %	292654217
1093	NC_013967	CGA	2	6	39620	39625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654217
1094	NC_013967	CGC	2	6	39651	39656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654217
1095	NC_013967	GCTC	2	8	39659	39666	0 %	25 %	25 %	50 %	292654217
1096	NC_013967	GCC	2	6	39667	39672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654217
1097	NC_013967	GTC	2	6	39673	39678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654217
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1099	NC_013967	GTC	2	6	39694	39699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654217
1100	NC_013967	CGGG	2	8	39749	39756	0 %	0 %	75 %	25 %	292654217
1101	NC_013967	GCC	2	6	39757	39762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654217
1102	NC_013967	CGT	2	6	39885	39890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654217
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1104	NC_013967	CGC	2	6	39959	39964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654217
1105	NC_013967	GAACGT	2	12	39969	39980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292654217
1106	NC_013967	TCG	2	6	39989	39994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654217
1107	NC_013967	CGT	2	6	39999	40004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654217
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1109	NC_013967	TCT	2	6	40049	40054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654217
1110	NC_013967	TTC	2	6	40096	40101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654218
1111	NC_013967	CGA	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654218
1112	NC_013967	CGAG	2	8	40161	40168	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
1113	NC_013967	CGC	2	6	40203	40208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654218
1114	NC_013967	GGCA	2	8	40217	40224	25 %	0 %	50 %	25 %	292654218
1115	NC_013967	TCC	2	6	40310	40315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654218
1116	NC_013967	CGTCCG	2	12	40350	40361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654218
1117	NC_013967	CCT	2	6	40368	40373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654218
1118	NC_013967	GTCG	2	8	40378	40385	0 %	25 %	50 %	25 %	292654218
1119	NC_013967	TCG	2	6	40389	40394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654218
1120	NC_013967	CCG	2	6	40410	40415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654218
1121	NC_013967	CGT	3	9	40428	40436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654218
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1123	NC_013967	ACGA	2	8	40499	40506	50 %	0 %	25 %	25 %	292654218
1124	NC_013967	GTT	2	6	40516	40521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654218
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1241	NC_013967	GT	3	6	44319	44324	0 %	50 %	50 %	0 %	292654221
1242	NC_013967	GCGGT	2	10	44380	44389	0 %	20 %	60 %	20 %	292654222
1243	NC_013967	CGG	2	6	44430	44435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654222
1244	NC_013967	GGC	2	6	44461	44466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654222
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1492	NC_013967	CGA	2	6	53845	53850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1493	NC_013967	GTC	2	6	53855	53860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231
1494	NC_013967	ATG	2	6	53904	53909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654231
1495	NC_013967	CCT	2	6	53935	53940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654231
1496	NC_013967	CCT	2	6	53965	53970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654231
1497	NC_013967	CGC	2	6	54025	54030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654231
1498	NC_013967	GAA	3	9	54050	54058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654231
1499	NC_013967	GCG	2	6	54087	54092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654231
1500	NC_013967	TCG	2	6	54096	54101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654231

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