MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013967	GTTCC	2	10	18430	18439	0 %	40 %	20 %	40 %	292654197
502	NC_013967	CGT	2	6	18461	18466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
503	NC_013967	CGA	2	6	18487	18492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
504	NC_013967	GTT	2	6	18532	18537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
505	NC_013967	TCG	2	6	18561	18566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
506	NC_013967	CGCCGA	2	12	18634	18645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654197
507	NC_013967	C	7	7	18653	18659	0 %	0 %	0 %	100 %	292654197
508	NC_013967	CGA	2	6	18676	18681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
509	NC_013967	GTT	2	6	18695	18700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
510	NC_013967	CGA	2	6	18718	18723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
511	NC_013967	GGT	2	6	18739	18744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654197
512	NC_013967	GCC	2	6	18779	18784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
513	NC_013967	GTC	2	6	18849	18854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
514	NC_013967	CGG	2	6	18888	18893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654197
515	NC_013967	TCG	2	6	18933	18938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
516	NC_013967	AGC	2	6	18942	18947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
517	NC_013967	CCGGG	2	10	18952	18961	0 %	0 %	60 %	40 %	292654197
518	NC_013967	TGT	2	6	18990	18995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654197
519	NC_013967	GCC	2	6	18998	19003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
520	NC_013967	CGA	2	6	19045	19050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
521	NC_013967	GTC	2	6	19073	19078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
522	NC_013967	GCC	3	9	19085	19093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654197
523	NC_013967	CGG	2	6	19094	19099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654197
524	NC_013967	ACG	2	6	19173	19178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
525	NC_013967	TCGG	2	8	19242	19249	0 %	25 %	50 %	25 %	292654197
526	NC_013967	GTC	2	6	19281	19286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
527	NC_013967	CGA	2	6	19306	19311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654197
528	NC_013967	GAA	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654197
529	NC_013967	CGT	2	6	19327	19332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654197
530	NC_013967	CGAC	2	8	19333	19340	25 %	0 %	25 %	50 %	292654197
531	NC_013967	TCGAGT	2	12	19392	19403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292654197
532	NC_013967	GCC	2	6	19530	19535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
533	NC_013967	CGA	3	9	19544	19552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
534	NC_013967	CGACGG	2	12	19631	19642	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654198
535	NC_013967	GAT	2	6	19674	19679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654198
536	NC_013967	GTCGA	2	10	19681	19690	20 %	20 %	40 %	20 %	292654198
537	NC_013967	CGC	2	6	19719	19724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
538	NC_013967	CGA	2	6	19730	19735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
539	NC_013967	GC	3	6	19772	19777	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
540	NC_013967	CGAG	2	8	19793	19800	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
541	NC_013967	CG	3	6	19801	19806	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
542	NC_013967	GCCG	2	8	19817	19824	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
543	NC_013967	GCG	2	6	19841	19846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
544	NC_013967	CGA	2	6	19892	19897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
545	NC_013967	GC	3	6	19904	19909	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
546	NC_013967	AGGCCG	2	12	19966	19977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654198
547	NC_013967	ACG	2	6	19978	19983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
548	NC_013967	GCCCGC	2	12	20027	20038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
549	NC_013967	CGG	2	6	20044	20049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
550	NC_013967	ACG	2	6	20089	20094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
551	NC_013967	GCC	2	6	20208	20213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
552	NC_013967	CGC	2	6	20216	20221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
553	NC_013967	GAC	2	6	20256	20261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
554	NC_013967	CGA	3	9	20273	20281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
555	NC_013967	CCG	2	6	20290	20295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
556	NC_013967	GGAC	2	8	20342	20349	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
557	NC_013967	GCC	2	6	20373	20378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
558	NC_013967	GCTG	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	292654198
559	NC_013967	CGA	2	6	20444	20449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
560	NC_013967	GGC	2	6	20460	20465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
561	NC_013967	GCC	2	6	20529	20534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
562	NC_013967	ACG	2	6	20555	20560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
563	NC_013967	CGCCGA	2	12	20588	20599	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292654198
564	NC_013967	GGA	2	6	20618	20623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654198
565	NC_013967	CGC	2	6	20641	20646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
566	NC_013967	CGAG	2	8	20657	20664	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
567	NC_013967	CGG	2	6	20705	20710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
568	NC_013967	GAC	2	6	20712	20717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
569	NC_013967	CGA	2	6	20723	20728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
570	NC_013967	CGA	3	9	20753	20761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
571	NC_013967	CAG	2	6	20778	20783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
572	NC_013967	CGG	2	6	20790	20795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
573	NC_013967	CGA	2	6	20801	20806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
574	NC_013967	GA	4	8	20805	20812	50 %	0 %	50 %	0 %	292654198
575	NC_013967	GC	3	6	20813	20818	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
576	NC_013967	ATG	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654198
577	NC_013967	GGA	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654198
578	NC_013967	GAGC	2	8	20901	20908	25 %	0 %	50 %	25 %	292654198
579	NC_013967	CGG	2	6	20954	20959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654198
580	NC_013967	GAT	2	6	21018	21023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654198
581	NC_013967	CGA	2	6	21026	21031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
582	NC_013967	CTCG	2	8	21039	21046	0 %	25 %	25 %	50 %	292654198
583	NC_013967	CCG	2	6	21053	21058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654198
584	NC_013967	GCCG	2	8	21077	21084	0 %	0 %	50 %	50 %	292654198
585	NC_013967	GTA	2	6	21123	21128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654198
586	NC_013967	GAC	2	6	21144	21149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
587	NC_013967	CGA	2	6	21164	21169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
588	NC_013967	AGC	2	6	21175	21180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654198
589	NC_013967	CTCAC	2	10	21237	21246	20 %	20 %	0 %	60 %	292654199
590	NC_013967	GTT	2	6	21291	21296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654199
591	NC_013967	CGG	2	6	21330	21335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654199
592	NC_013967	CGG	2	6	21371	21376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654199
593	NC_013967	GTC	2	6	21379	21384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
594	NC_013967	CGG	2	6	21569	21574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654199
595	NC_013967	GGTC	2	8	21584	21591	0 %	25 %	50 %	25 %	292654199
596	NC_013967	GAC	2	6	21600	21605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654199
597	NC_013967	TCC	2	6	21643	21648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654199
598	NC_013967	CGT	2	6	21668	21673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
599	NC_013967	AGT	2	6	21692	21697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654199
600	NC_013967	CGA	2	6	21759	21764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654199
601	NC_013967	GAG	2	6	21780	21785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654199
602	NC_013967	CAG	2	6	21807	21812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654199
603	NC_013967	CGA	2	6	21833	21838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654199
604	NC_013967	GTCGCC	2	12	21840	21851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654199
605	NC_013967	TCG	2	6	21859	21864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
606	NC_013967	CGAG	2	8	21869	21876	25 %	0 %	50 %	25 %	292654199
607	NC_013967	CCT	2	6	21929	21934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654199
608	NC_013967	CGT	2	6	21938	21943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
609	NC_013967	CGG	2	6	21962	21967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654199
610	NC_013967	TCG	2	6	21982	21987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
611	NC_013967	GTA	2	6	22077	22082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654199
612	NC_013967	GCGTC	2	10	22115	22124	0 %	20 %	40 %	40 %	292654199
613	NC_013967	CGA	2	6	22181	22186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654199
614	NC_013967	CGC	2	6	22223	22228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654199
615	NC_013967	GTC	2	6	22234	22239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
616	NC_013967	GTC	2	6	22246	22251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
617	NC_013967	GTC	2	6	22255	22260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
618	NC_013967	GTCGC	2	10	22264	22273	0 %	20 %	40 %	40 %	292654199
619	NC_013967	GTC	3	9	22285	22293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
620	NC_013967	CGC	2	6	22298	22303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654199
621	NC_013967	GAG	2	6	22323	22328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654199
622	NC_013967	CGG	2	6	22349	22354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654199
623	NC_013967	CGT	2	6	22369	22374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654199
624	NC_013967	CGG	2	6	22536	22541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654200
625	NC_013967	CTC	2	6	22561	22566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654200
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746	NC_013967	CGG	2	6	26440	26445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654203
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1000	NC_013967	TCG	2	6	36401	36406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654215

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