MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 74220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013967	CGT	2	6	163098	163103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4502	NC_013967	GCC	2	6	163114	163119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654359
4503	NC_013967	CGG	2	6	163122	163127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654359
4504	NC_013967	GTC	2	6	163138	163143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4505	NC_013967	GAA	2	6	163147	163152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654359
4506	NC_013967	GTC	2	6	163171	163176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4507	NC_013967	AGACG	2	10	163248	163257	40 %	0 %	40 %	20 %	292654359
4508	NC_013967	AGG	2	6	163259	163264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654359
4509	NC_013967	CGT	2	6	163302	163307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4510	NC_013967	CGG	2	6	163413	163418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654359
4511	NC_013967	CTC	2	6	163530	163535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654359
4512	NC_013967	TCG	2	6	163547	163552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4513	NC_013967	CGA	2	6	163587	163592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4514	NC_013967	TCG	2	6	163607	163612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4515	NC_013967	GAG	2	6	163648	163653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654359
4516	NC_013967	GGCG	2	8	163680	163687	0 %	0 %	75 %	25 %	292654359
4517	NC_013967	GTTCGC	2	12	163725	163736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4518	NC_013967	CGA	3	9	163746	163754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654359
4519	NC_013967	CAG	2	6	163915	163920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654360
4520	NC_013967	ACG	2	6	163923	163928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654360
4521	NC_013967	ACC	2	6	163929	163934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654360
4522	NC_013967	GTT	2	6	163946	163951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292654360
4523	NC_013967	CT	4	8	164022	164029	0 %	50 %	0 %	50 %	292654360
4524	NC_013967	GGC	2	6	164131	164136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654360
4525	NC_013967	TCG	2	6	164149	164154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654360
4526	NC_013967	CGCT	2	8	164167	164174	0 %	25 %	25 %	50 %	292654360
4527	NC_013967	TC	3	6	164225	164230	0 %	50 %	0 %	50 %	292654360
4528	NC_013967	GCG	2	6	164236	164241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654360
4529	NC_013967	CGG	2	6	164260	164265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654360
4530	NC_013967	GCC	2	6	164304	164309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654360
4531	NC_013967	CCG	2	6	164437	164442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654361
4532	NC_013967	ACG	2	6	164474	164479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654361
4533	NC_013967	TGG	2	6	164542	164547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292654361
4534	NC_013967	TCG	2	6	164551	164556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654361
4535	NC_013967	GTCG	2	8	164636	164643	0 %	25 %	50 %	25 %	292654362
4536	NC_013967	TCG	3	9	164649	164657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4537	NC_013967	GGA	2	6	164662	164667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
4538	NC_013967	GAG	2	6	164711	164716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
4539	NC_013967	AGG	2	6	164721	164726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
4540	NC_013967	CGA	2	6	164746	164751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4541	NC_013967	CGGCG	2	10	164792	164801	0 %	0 %	60 %	40 %	292654362
4542	NC_013967	CGA	2	6	164815	164820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4543	NC_013967	TCG	2	6	164845	164850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4544	NC_013967	GAC	3	9	164915	164923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4545	NC_013967	CGA	2	6	164965	164970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4546	NC_013967	CGA	2	6	164981	164986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4547	NC_013967	GCG	2	6	165006	165011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4548	NC_013967	CGG	2	6	165025	165030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4549	NC_013967	GCG	2	6	165033	165038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4550	NC_013967	GAG	2	6	165059	165064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654362
4551	NC_013967	GCC	2	6	165105	165110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654362
4552	NC_013967	CGG	2	6	165111	165116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654362
4553	NC_013967	GAA	2	6	165146	165151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292654362
4554	NC_013967	CGA	2	6	165199	165204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4555	NC_013967	CCG	2	6	165220	165225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654362
4556	NC_013967	CGT	2	6	165269	165274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4557	NC_013967	CGA	2	6	165295	165300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654362
4558	NC_013967	CTCA	2	8	165329	165336	25 %	25 %	0 %	50 %	292654362
4559	NC_013967	CGA	2	6	165341	165346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654363
4560	NC_013967	GTCG	2	8	165356	165363	0 %	25 %	50 %	25 %	292654363
4561	NC_013967	TCG	2	6	165370	165375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654363
4562	NC_013967	CTT	2	6	165432	165437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654363
4563	NC_013967	GTC	2	6	165438	165443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654363
4564	NC_013967	TCG	2	6	165475	165480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654363
4565	NC_013967	CCG	2	6	165631	165636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
4566	NC_013967	CGC	2	6	165637	165642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
4567	NC_013967	GGGC	2	8	165643	165650	0 %	0 %	75 %	25 %	292654364
4568	NC_013967	GCCG	2	8	165661	165668	0 %	0 %	50 %	50 %	292654364
4569	NC_013967	GCC	2	6	165711	165716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
4570	NC_013967	TCG	2	6	165742	165747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
4571	NC_013967	CCG	2	6	165769	165774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
4572	NC_013967	CAT	2	6	165818	165823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292654364
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4574	NC_013967	GAG	2	6	165878	165883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654364
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4580	NC_013967	TGA	2	6	165982	165987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292654364
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4582	NC_013967	GAG	2	6	166028	166033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654364
4583	NC_013967	GCC	2	6	166034	166039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
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4588	NC_013967	CGA	2	6	166207	166212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654364
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4590	NC_013967	GTC	2	6	166262	166267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
4591	NC_013967	CCG	2	6	166284	166289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654364
4592	NC_013967	AGCC	2	8	166296	166303	25 %	0 %	25 %	50 %	292654364
4593	NC_013967	CGT	2	6	166307	166312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
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4601	NC_013967	CG	3	6	166457	166462	0 %	0 %	50 %	50 %	292654364
4602	NC_013967	GTC	2	6	166464	166469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
4603	NC_013967	GCCTCG	2	12	166527	166538	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292654364
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4606	NC_013967	TCT	2	6	166617	166622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654364
4607	NC_013967	CGG	2	6	166643	166648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654364
4608	NC_013967	CGCGG	2	10	166649	166658	0 %	0 %	60 %	40 %	292654364
4609	NC_013967	CGCC	2	8	166660	166667	0 %	0 %	25 %	75 %	292654364
4610	NC_013967	TCG	2	6	166693	166698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
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4615	NC_013967	CGT	2	6	166867	166872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654364
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4619	NC_013967	GAG	2	6	166943	166948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292654364
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4733	NC_013967	CCGGT	2	10	171046	171055	0 %	20 %	40 %	40 %	292654369
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4847	NC_013967	C	8	8	174678	174685	0 %	0 %	0 %	100 %	292654372
4848	NC_013967	CGAGCG	2	12	174688	174699	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	292654372
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4850	NC_013967	GAGG	2	8	174894	174901	25 %	0 %	75 %	0 %	292654373
4851	NC_013967	CGA	2	6	174945	174950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654373
4852	NC_013967	ACC	2	6	174989	174994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654373
4853	NC_013967	GCC	2	6	175077	175082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292654373
4854	NC_013967	ACC	2	6	175096	175101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292654373
4855	NC_013967	TCGAC	2	10	175172	175181	20 %	20 %	20 %	40 %	292654373
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4857	NC_013967	CGT	2	6	175235	175240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654373
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4978	NC_013967	GAC	2	6	179980	179985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654379
4979	NC_013967	CTC	2	6	179995	180000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654379
4980	NC_013967	CTC	2	6	180073	180078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292654379
4981	NC_013967	GCCG	2	8	180082	180089	0 %	0 %	50 %	50 %	292654379
4982	NC_013967	TCG	2	6	180095	180100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654379
4983	NC_013967	TC	3	6	180136	180141	0 %	50 %	0 %	50 %	292654380
4984	NC_013967	TTC	2	6	180142	180147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292654380
4985	NC_013967	GAC	2	6	180163	180168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654380
4986	NC_013967	CGA	2	6	180243	180248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654380
4987	NC_013967	CTG	2	6	180301	180306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654380
4988	NC_013967	GAC	2	6	180307	180312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654380
4989	NC_013967	TCG	2	6	180326	180331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654380
4990	NC_013967	GGTC	2	8	180339	180346	0 %	25 %	50 %	25 %	292654380
4991	NC_013967	GCG	2	6	180424	180429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292654380
4992	NC_013967	TCG	2	6	180592	180597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654381
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4994	NC_013967	TCG	3	9	180622	180630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292654381
4995	NC_013967	CGA	3	9	180692	180700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654381
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4997	NC_013967	C	6	6	180746	180751	0 %	0 %	0 %	100 %	292654381
4998	NC_013967	GC	3	6	180809	180814	0 %	0 %	50 %	50 %	292654381
4999	NC_013967	CGA	2	6	180815	180820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292654381
5000	NC_013967	CCGG	2	8	180822	180829	0 %	0 %	50 %	50 %	292654381

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