MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013966	TCG	2	6	164411	164416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3002	NC_013966	GAG	2	6	164434	164439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653722
3003	NC_013966	CTT	2	6	164628	164633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653722
3004	NC_013966	GCGGG	2	10	164654	164663	0 %	0 %	80 %	20 %	292653722
3005	NC_013966	CGT	2	6	164700	164705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3006	NC_013966	CGT	2	6	164712	164717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3007	NC_013966	TCA	2	6	164732	164737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653722
3008	NC_013966	GTC	2	6	164827	164832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3009	NC_013966	CAT	2	6	164841	164846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653722
3010	NC_013966	CG	3	6	164959	164964	0 %	0 %	50 %	50 %	292653722
3011	NC_013966	CT	3	6	164965	164970	0 %	50 %	0 %	50 %	292653722
3012	NC_013966	TCG	3	9	164987	164995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3013	NC_013966	CGT	2	6	165012	165017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3014	NC_013966	TCC	2	6	165059	165064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653722
3015	NC_013966	CG	3	6	165133	165138	0 %	0 %	50 %	50 %	292653722
3016	NC_013966	CGC	2	6	165156	165161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653722
3017	NC_013966	TTC	2	6	165172	165177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653722
3018	NC_013966	CGAC	2	8	165239	165246	25 %	0 %	25 %	50 %	292653722
3019	NC_013966	CAT	2	6	165312	165317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653722
3020	NC_013966	CGG	2	6	165330	165335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653722
3021	NC_013966	CGC	2	6	165363	165368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653722
3022	NC_013966	GTC	2	6	165379	165384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3023	NC_013966	TCG	2	6	165416	165421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3024	NC_013966	CTC	2	6	165433	165438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653722
3025	NC_013966	ACC	2	6	165463	165468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653722
3026	NC_013966	GCCG	2	8	165579	165586	0 %	0 %	50 %	50 %	292653722
3027	NC_013966	GCG	2	6	165587	165592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653722
3028	NC_013966	ACG	3	9	165602	165610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653722
3029	NC_013966	GT	3	6	165722	165727	0 %	50 %	50 %	0 %	292653723
3030	NC_013966	TGA	2	6	165753	165758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653723
3031	NC_013966	GCG	2	6	165759	165764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653723
3032	NC_013966	TTC	2	6	165787	165792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653723
3033	NC_013966	CGA	2	6	165798	165803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3034	NC_013966	CGA	2	6	165825	165830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3035	NC_013966	GC	3	6	165864	165869	0 %	0 %	50 %	50 %	292653723
3036	NC_013966	GGA	2	6	165879	165884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653723
3037	NC_013966	GTCCCA	2	12	165902	165913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292653723
3038	NC_013966	GAC	2	6	165946	165951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3039	NC_013966	TCG	2	6	165968	165973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3040	NC_013966	GATCGA	2	12	165994	166005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292653723
3041	NC_013966	CGA	2	6	166080	166085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3042	NC_013966	CGC	2	6	166090	166095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653723
3043	NC_013966	TGC	2	6	166097	166102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3044	NC_013966	GAA	2	6	166144	166149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653723
3045	NC_013966	GAC	2	6	166162	166167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3046	NC_013966	CGA	2	6	166180	166185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3047	NC_013966	CGA	2	6	166293	166298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3048	NC_013966	CCGG	2	8	166301	166308	0 %	0 %	50 %	50 %	292653723
3049	NC_013966	GTCGA	2	10	166336	166345	20 %	20 %	40 %	20 %	292653723
3050	NC_013966	GAG	2	6	166354	166359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653723
3051	NC_013966	GAC	2	6	166366	166371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3052	NC_013966	AGA	2	6	166422	166427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653723
3053	NC_013966	ACG	3	9	166460	166468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3054	NC_013966	GTC	2	6	166480	166485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3055	NC_013966	CAG	2	6	166507	166512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3056	NC_013966	CGAA	2	8	166539	166546	50 %	0 %	25 %	25 %	292653723
3057	NC_013966	CGA	3	9	166599	166607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3058	NC_013966	TG	3	6	166627	166632	0 %	50 %	50 %	0 %	292653723
3059	NC_013966	ACG	2	6	166650	166655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3060	NC_013966	GTG	2	6	166661	166666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653723
3061	NC_013966	TCG	2	6	166670	166675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3062	NC_013966	AACTCG	2	12	166676	166687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292653723
3063	NC_013966	TCG	2	6	166703	166708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653723
3064	NC_013966	CCA	2	6	166733	166738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653724
3065	NC_013966	TCG	2	6	166759	166764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653724
3066	NC_013966	CA	3	6	166806	166811	50 %	0 %	0 %	50 %	292653724
3067	NC_013966	CGG	3	9	166822	166830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653724
3068	NC_013966	GTC	2	6	166848	166853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653724
3069	NC_013966	CG	3	6	166860	166865	0 %	0 %	50 %	50 %	292653724
3070	NC_013966	CGT	2	6	166913	166918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653724
3071	NC_013966	CTC	2	6	166947	166952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653724
3072	NC_013966	AGG	2	6	166999	167004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653724
3073	NC_013966	GTC	2	6	167053	167058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3074	NC_013966	TCG	2	6	167093	167098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3075	NC_013966	ACG	2	6	167129	167134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3076	NC_013966	AGC	2	6	167159	167164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3077	NC_013966	ACG	2	6	167228	167233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3078	NC_013966	CCA	2	6	167260	167265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653725
3079	NC_013966	GC	3	6	167312	167317	0 %	0 %	50 %	50 %	292653725
3080	NC_013966	CGA	2	6	167337	167342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3081	NC_013966	GAT	2	6	167347	167352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653725
3082	NC_013966	CGA	2	6	167416	167421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3083	NC_013966	CGC	2	6	167454	167459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653725
3084	NC_013966	AGCAC	2	10	167468	167477	40 %	0 %	20 %	40 %	292653725
3085	NC_013966	TCC	2	6	167498	167503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653725
3086	NC_013966	GGT	2	6	167509	167514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653725
3087	NC_013966	GAA	3	9	167557	167565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653725
3088	NC_013966	GAA	2	6	167572	167577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653725
3089	NC_013966	CCG	2	6	167597	167602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653725
3090	NC_013966	GAC	2	6	167680	167685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3091	NC_013966	CCG	3	9	167747	167755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653725
3092	NC_013966	CGT	3	9	167763	167771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3093	NC_013966	CTGA	2	8	167836	167843	25 %	25 %	25 %	25 %	292653725
3094	NC_013966	CCG	2	6	167918	167923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653725
3095	NC_013966	CGA	3	9	167961	167969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
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3098	NC_013966	CGG	2	6	168008	168013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653725
3099	NC_013966	CGA	3	9	168066	168074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3100	NC_013966	GTT	2	6	168082	168087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653725
3101	NC_013966	GTA	2	6	168160	168165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653725
3102	NC_013966	GAT	2	6	168178	168183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653725
3103	NC_013966	GTA	2	6	168190	168195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653725
3104	NC_013966	ATC	2	6	168308	168313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653725
3105	NC_013966	ACA	2	6	168348	168353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653725
3106	NC_013966	CAC	2	6	168378	168383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653725
3107	NC_013966	CGT	2	6	168397	168402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653725
3108	NC_013966	CCA	2	6	168432	168437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653725
3109	NC_013966	TA	3	6	168757	168762	50 %	50 %	0 %	0 %	292653726
3110	NC_013966	ACC	2	6	168777	168782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653726
3111	NC_013966	ACG	2	6	168799	168804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653726
3112	NC_013966	AACG	2	8	168834	168841	50 %	0 %	25 %	25 %	292653726
3113	NC_013966	GC	3	6	168872	168877	0 %	0 %	50 %	50 %	292653726
3114	NC_013966	GA	3	6	168880	168885	50 %	0 %	50 %	0 %	292653726
3115	NC_013966	GACG	2	8	168892	168899	25 %	0 %	50 %	25 %	292653726
3116	NC_013966	CGGA	2	8	168902	168909	25 %	0 %	50 %	25 %	292653726
3117	NC_013966	GGAC	2	8	168985	168992	25 %	0 %	50 %	25 %	292653726
3118	NC_013966	CAG	2	6	169028	169033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653726
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3120	NC_013966	GAC	2	6	169167	169172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653727
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3240	NC_013966	AGCGG	2	10	173557	173566	20 %	0 %	60 %	20 %	292653731
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3243	NC_013966	GAC	2	6	173687	173692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653731
3244	NC_013966	CGA	2	6	173707	173712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653731
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3479	NC_013966	CGA	2	6	181621	181626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3480	NC_013966	CG	3	6	181691	181696	0 %	0 %	50 %	50 %	292653738
3481	NC_013966	TCG	2	6	181749	181754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3482	NC_013966	TTCT	2	8	181769	181776	0 %	75 %	0 %	25 %	292653738
3483	NC_013966	CGGCG	2	10	181785	181794	0 %	0 %	60 %	40 %	292653738
3484	NC_013966	CGGG	2	8	181804	181811	0 %	0 %	75 %	25 %	292653738
3485	NC_013966	GC	3	6	181833	181838	0 %	0 %	50 %	50 %	292653738
3486	NC_013966	CGA	3	9	181840	181848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3487	NC_013966	TCG	2	6	181851	181856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3488	NC_013966	GTCG	2	8	181867	181874	0 %	25 %	50 %	25 %	292653738
3489	NC_013966	GGA	2	6	181876	181881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653738
3490	NC_013966	CGT	2	6	181882	181887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3491	NC_013966	GCGG	2	8	181903	181910	0 %	0 %	75 %	25 %	292653738
3492	NC_013966	TCC	2	6	181911	181916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653738
3493	NC_013966	CTC	2	6	181922	181927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653738
3494	NC_013966	CGGCTC	2	12	181940	181951	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	292653738
3495	NC_013966	CCG	2	6	182011	182016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653738
3496	NC_013966	CGA	2	6	182023	182028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3497	NC_013966	CGA	2	6	182111	182116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3498	NC_013966	CAG	2	6	182126	182131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3499	NC_013966	CAG	2	6	182141	182146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653738
3500	NC_013966	CAA	2	6	182156	182161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653738

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