MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013966	GGT	2	6	111670	111675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653673
2002	NC_013966	CGCTT	2	10	111680	111689	0 %	40 %	20 %	40 %	292653673
2003	NC_013966	GTGA	2	8	111690	111697	25 %	25 %	50 %	0 %	292653673
2004	NC_013966	TCG	2	6	111719	111724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653673
2005	NC_013966	GTA	2	6	111727	111732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653673
2006	NC_013966	CTG	2	6	111766	111771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653673
2007	NC_013966	GGA	2	6	111798	111803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653673
2008	NC_013966	CGA	2	6	111936	111941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653673
2009	NC_013966	GA	3	6	111989	111994	50 %	0 %	50 %	0 %	292653673
2010	NC_013966	AG	3	6	112010	112015	50 %	0 %	50 %	0 %	292653673
2011	NC_013966	GTT	2	6	112069	112074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653673
2012	NC_013966	TGA	2	6	112269	112274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653674
2013	NC_013966	ACT	2	6	112277	112282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653674
2014	NC_013966	AGA	2	6	112390	112395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653674
2015	NC_013966	GAC	2	6	112725	112730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653675
2016	NC_013966	ATC	2	6	112738	112743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653675
2017	NC_013966	AGT	2	6	112802	112807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653675
2018	NC_013966	GAT	2	6	112974	112979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653676
2019	NC_013966	CGA	2	6	113363	113368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653677
2020	NC_013966	TCA	2	6	113376	113381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653677
2021	NC_013966	CTT	2	6	113435	113440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653677
2022	NC_013966	TAG	2	6	113483	113488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653677
2023	NC_013966	TCG	2	6	113496	113501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653677
2024	NC_013966	CGGG	2	8	113554	113561	0 %	0 %	75 %	25 %	292653677
2025	NC_013966	GAG	2	6	113579	113584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653677
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2027	NC_013966	GAC	2	6	113639	113644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653677
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2029	NC_013966	CTG	2	6	113710	113715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653677
2030	NC_013966	TCG	2	6	113775	113780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653677
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2037	NC_013966	CTG	2	6	114484	114489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653679
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2042	NC_013966	TCG	2	6	114725	114730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653679
2043	NC_013966	CGG	2	6	114776	114781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653679
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2052	NC_013966	ATC	2	6	115180	115185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653679
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2058	NC_013966	CGC	2	6	115376	115381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653679
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2105	NC_013966	GT	4	8	117878	117885	0 %	50 %	50 %	0 %	292653682
2106	NC_013966	CGA	2	6	117945	117950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653682
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2121	NC_013966	CAC	2	6	118984	118989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653684
2122	NC_013966	ATT	2	6	119014	119019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292653684
2123	NC_013966	TC	3	6	119165	119170	0 %	50 %	0 %	50 %	292653684
2124	NC_013966	TGA	2	6	119217	119222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653684
2125	NC_013966	CTC	2	6	119305	119310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653684
2126	NC_013966	ATC	2	6	119344	119349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653684
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2128	NC_013966	GAG	2	6	119395	119400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653684
2129	NC_013966	TAC	2	6	119404	119409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653684
2130	NC_013966	GAGC	2	8	119475	119482	25 %	0 %	50 %	25 %	292653684
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2147	NC_013966	CT	3	6	121595	121600	0 %	50 %	0 %	50 %	292653687
2148	NC_013966	TCG	2	6	121649	121654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653687
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2153	NC_013966	GAC	2	6	121873	121878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653687
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2155	NC_013966	TCAC	2	8	121893	121900	25 %	25 %	0 %	50 %	292653687
2156	NC_013966	AAGCG	2	10	121901	121910	40 %	0 %	40 %	20 %	292653687
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2164	NC_013966	TACC	2	8	122277	122284	25 %	25 %	0 %	50 %	292653687
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2235	NC_013966	TCC	2	6	126321	126326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653690
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2239	NC_013966	CTG	2	6	126454	126459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653690
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2364	NC_013966	ACT	2	6	138068	138073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653702
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2481	NC_013966	CGT	2	6	143960	143965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653707
2482	NC_013966	CCG	2	6	143967	143972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653707
2483	NC_013966	GGA	2	6	143974	143979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653707
2484	NC_013966	AG	3	6	144041	144046	50 %	0 %	50 %	0 %	292653707
2485	NC_013966	GTCG	2	8	144047	144054	0 %	25 %	50 %	25 %	292653707
2486	NC_013966	CAG	2	6	144137	144142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653707
2487	NC_013966	AAG	2	6	144183	144188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653707
2488	NC_013966	CGA	2	6	144190	144195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653707
2489	NC_013966	CCCG	2	8	144201	144208	0 %	0 %	25 %	75 %	292653707
2490	NC_013966	TC	3	6	144323	144328	0 %	50 %	0 %	50 %	292653708
2491	NC_013966	CTGGA	2	10	144342	144351	20 %	20 %	40 %	20 %	292653708
2492	NC_013966	CG	3	6	144392	144397	0 %	0 %	50 %	50 %	292653708
2493	NC_013966	GTT	2	6	144428	144433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653708
2494	NC_013966	GCCG	2	8	144500	144507	0 %	0 %	50 %	50 %	292653708
2495	NC_013966	CTC	2	6	144593	144598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653708
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2497	NC_013966	GCCA	2	8	144667	144674	25 %	0 %	25 %	50 %	292653708
2498	NC_013966	GTC	2	6	144758	144763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653708
2499	NC_013966	GCT	2	6	144777	144782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653708
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