MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 13672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013966	TC	3	6	242689	242694	0 %	50 %	0 %	50 %	292653798
5002	NC_013966	GA	3	6	242795	242800	50 %	0 %	50 %	0 %	292653798
5003	NC_013966	CAG	2	6	242812	242817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653798
5004	NC_013966	GT	3	6	242833	242838	0 %	50 %	50 %	0 %	292653798
5005	NC_013966	GC	3	6	242895	242900	0 %	0 %	50 %	50 %	292653798
5006	NC_013966	TCA	2	6	242910	242915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653798
5007	NC_013966	TCG	2	6	243082	243087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5008	NC_013966	GCG	2	6	243097	243102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653799
5009	NC_013966	GAATC	2	10	243134	243143	40 %	20 %	20 %	20 %	292653799
5010	NC_013966	TCG	2	6	243151	243156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5011	NC_013966	TCG	2	6	243181	243186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5012	NC_013966	GAC	2	6	243198	243203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5013	NC_013966	GTC	3	9	243204	243212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5014	NC_013966	TCG	2	6	243247	243252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5015	NC_013966	ACC	2	6	243262	243267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653799
5016	NC_013966	GCA	2	6	243274	243279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5017	NC_013966	CGA	2	6	243293	243298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5018	NC_013966	TCG	2	6	243334	243339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653799
5019	NC_013966	TGT	2	6	243753	243758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653800
5020	NC_013966	AC	3	6	243764	243769	50 %	0 %	0 %	50 %	292653800
5021	NC_013966	CGAG	2	8	243825	243832	25 %	0 %	50 %	25 %	292653800
5022	NC_013966	CCG	2	6	243840	243845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653800
5023	NC_013966	TCG	2	6	243887	243892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653800
5024	NC_013966	TGA	2	6	243939	243944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653800
5025	NC_013966	CGG	2	6	244005	244010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653800
5026	NC_013966	CGG	2	6	244037	244042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653800
5027	NC_013966	TCG	2	6	244083	244088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653800
5028	NC_013966	CGA	2	6	244125	244130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653800
5029	NC_013966	AGT	2	6	244176	244181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653800
5030	NC_013966	TCGT	2	8	244198	244205	0 %	50 %	25 %	25 %	292653800
5031	NC_013966	GCA	3	9	244263	244271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653800
5032	NC_013966	CCG	2	6	244463	244468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653800
5033	NC_013966	GCG	2	6	244481	244486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653800
5034	NC_013966	GA	3	6	244545	244550	50 %	0 %	50 %	0 %	292653800
5035	NC_013966	TAC	2	6	244753	244758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653801
5036	NC_013966	GA	3	6	244769	244774	50 %	0 %	50 %	0 %	292653801
5037	NC_013966	ATG	2	6	244799	244804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653801
5038	NC_013966	AGA	2	6	244818	244823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653801
5039	NC_013966	TCA	2	6	244831	244836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653801
5040	NC_013966	TCG	2	6	244884	244889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653801
5041	NC_013966	GGT	2	6	244896	244901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653801
5042	NC_013966	ATC	2	6	244979	244984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653801
5043	NC_013966	GAA	2	6	245026	245031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653801
5044	NC_013966	TAC	2	6	245116	245121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653801
5045	NC_013966	TTA	2	6	245157	245162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292653801
5046	NC_013966	TA	3	6	245161	245166	50 %	50 %	0 %	0 %	292653801
5047	NC_013966	ACG	2	6	245204	245209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653801
5048	NC_013966	ACG	2	6	245282	245287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653801
5049	NC_013966	GAA	2	6	245293	245298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653801
5050	NC_013966	GAC	2	6	245317	245322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653801
5051	NC_013966	ATC	2	6	245446	245451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653801
5052	NC_013966	TGG	2	6	245598	245603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653801
5053	NC_013966	AGA	2	6	245616	245621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653801
5054	NC_013966	GAC	2	6	245630	245635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653801
5055	NC_013966	CGA	2	6	245814	245819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653802
5056	NC_013966	TAC	2	6	245824	245829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653802
5057	NC_013966	ATC	2	6	245903	245908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653802
5058	NC_013966	ATA	2	6	245920	245925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292653802
5059	NC_013966	TG	3	6	245938	245943	0 %	50 %	50 %	0 %	292653802
5060	NC_013966	A	7	7	246109	246115	100 %	0 %	0 %	0 %	292653802
5061	NC_013966	AGG	2	6	246230	246235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653802
5062	NC_013966	GTTT	2	8	246305	246312	0 %	75 %	25 %	0 %	292653802
5063	NC_013966	CGC	2	6	246338	246343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653802
5064	NC_013966	GCG	2	6	246832	246837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653803
5065	NC_013966	GGC	2	6	246851	246856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653803
5066	NC_013966	TCG	2	6	246901	246906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653803
5067	NC_013966	GCC	2	6	246913	246918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653803
5068	NC_013966	CTT	2	6	246944	246949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653803
5069	NC_013966	CGA	2	6	247027	247032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653804
5070	NC_013966	CGG	2	6	247073	247078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653804
5071	NC_013966	AGA	2	6	247154	247159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653804
5072	NC_013966	CGA	2	6	247196	247201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653804
5073	NC_013966	GAT	2	6	247205	247210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292653804
5074	NC_013966	CAA	2	6	247214	247219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292653804
5075	NC_013966	ACTGC	2	10	247292	247301	20 %	20 %	20 %	40 %	292653804
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5077	NC_013966	CGT	2	6	247406	247411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653804
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5079	NC_013966	ATCG	2	8	247586	247593	25 %	25 %	25 %	25 %	292653805
5080	NC_013966	GTC	2	6	247598	247603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653805
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5082	NC_013966	GCT	2	6	247702	247707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653805
5083	NC_013966	GTTG	2	8	247738	247745	0 %	50 %	50 %	0 %	292653805
5084	NC_013966	CGC	2	6	247749	247754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653805
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5088	NC_013966	CGT	2	6	247945	247950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653805
5089	NC_013966	GGGC	2	8	247976	247983	0 %	0 %	75 %	25 %	292653805
5090	NC_013966	CAC	2	6	248176	248181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653806
5091	NC_013966	CCA	2	6	248198	248203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292653806
5092	NC_013966	ACG	2	6	248204	248209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653806
5093	NC_013966	GAC	2	6	248237	248242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653806
5094	NC_013966	TG	3	6	248246	248251	0 %	50 %	50 %	0 %	292653806
5095	NC_013966	CTC	2	6	248266	248271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292653806
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5099	NC_013966	CGA	2	6	248439	248444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653806
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5101	NC_013966	GTT	2	6	248532	248537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653806
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5103	NC_013966	TCG	2	6	249344	249349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653807
5104	NC_013966	AGA	2	6	249366	249371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292653807
5105	NC_013966	CTT	2	6	249472	249477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292653807
5106	NC_013966	TGGAC	2	10	249549	249558	20 %	20 %	40 %	20 %	292653807
5107	NC_013966	GGT	2	6	249624	249629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292653807
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5110	NC_013966	ACCGT	2	10	250436	250445	20 %	20 %	20 %	40 %	292653808
5111	NC_013966	CGG	2	6	250535	250540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653808
5112	NC_013966	GCG	2	6	250547	250552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653808
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5120	NC_013966	TGT	2	6	251217	251222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292653809
5121	NC_013966	TCA	2	6	251249	251254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653809
5122	NC_013966	GTC	2	6	251578	251583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653810
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5234	NC_013966	CTTGA	2	10	257995	258004	20 %	40 %	20 %	20 %	292653817
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5238	NC_013966	T	6	6	258245	258250	0 %	100 %	0 %	0 %	292653817
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5362	NC_013966	CCGCTC	2	12	266939	266950	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	292653823
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5364	NC_013966	GTC	2	6	267118	267123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653823
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5481	NC_013966	CCGC	2	8	274132	274139	0 %	0 %	25 %	75 %	292653827
5482	NC_013966	GAC	2	6	274199	274204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5483	NC_013966	AG	3	6	274259	274264	50 %	0 %	50 %	0 %	292653827
5484	NC_013966	CGG	2	6	274331	274336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653827
5485	NC_013966	CGA	2	6	274364	274369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5486	NC_013966	CCGA	2	8	274413	274420	25 %	0 %	25 %	50 %	292653827
5487	NC_013966	GAG	2	6	274434	274439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292653827
5488	NC_013966	CGC	2	6	274535	274540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292653827
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5490	NC_013966	ACGC	2	8	274572	274579	25 %	0 %	25 %	50 %	292653827
5491	NC_013966	GTC	2	6	274584	274589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5492	NC_013966	GTC	2	6	274596	274601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653827
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5494	NC_013966	GCG	2	6	274665	274670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653827
5495	NC_013966	GGC	2	6	274736	274741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292653827
5496	NC_013966	GTC	2	6	274788	274793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292653827
5497	NC_013966	TCA	2	6	274819	274824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653827
5498	NC_013966	AGGGCG	2	12	274840	274851	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	292653827
5499	NC_013966	CAT	2	6	274856	274861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292653827
5500	NC_013966	GAC	2	6	274871	274876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292653827

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