MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 32083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	GACA	2	8	3	10	50 %	0 %	25 %	25 %	291276244
2	NC_013949	GAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
3	NC_013949	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	291276244
4	NC_013949	TCAAA	2	10	72	81	60 %	20 %	0 %	20 %	291276244
5	NC_013949	CGT	2	6	222	227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291276244
6	NC_013949	A	7	7	238	244	100 %	0 %	0 %	0 %	291276244
7	NC_013949	CCT	2	6	299	304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276244
8	NC_013949	TAA	2	6	336	341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276244
9	NC_013949	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	291276244
10	NC_013949	A	7	7	470	476	100 %	0 %	0 %	0 %	291276244
11	NC_013949	ATT	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276244
12	NC_013949	AG	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	291276244
13	NC_013949	ATT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276244
14	NC_013949	TGA	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276244
15	NC_013949	T	6	6	607	612	0 %	100 %	0 %	0 %	291276244
16	NC_013949	ACAA	2	8	674	681	75 %	0 %	0 %	25 %	291276244
17	NC_013949	AGA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
18	NC_013949	ATC	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
19	NC_013949	CAT	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
20	NC_013949	TCA	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
21	NC_013949	CAT	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
22	NC_013949	CAT	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
23	NC_013949	CAT	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276244
24	NC_013949	ATCT	2	8	1123	1130	25 %	50 %	0 %	25 %	291276244
25	NC_013949	CAA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276244
26	NC_013949	AGA	2	6	1239	1244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276244
27	NC_013949	AAGC	2	8	1278	1285	50 %	0 %	25 %	25 %	291276244
28	NC_013949	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276245
29	NC_013949	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
30	NC_013949	A	6	6	1514	1519	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
31	NC_013949	CTC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291276245
32	NC_013949	ATCT	2	8	1544	1551	25 %	50 %	0 %	25 %	291276245
33	NC_013949	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276245
34	NC_013949	A	6	6	1625	1630	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
35	NC_013949	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
36	NC_013949	GA	3	6	1698	1703	50 %	0 %	50 %	0 %	291276245
37	NC_013949	A	6	6	1792	1797	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
38	NC_013949	TTG	2	6	1800	1805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276245
39	NC_013949	TTCA	2	8	1844	1851	25 %	50 %	0 %	25 %	291276245
40	NC_013949	TC	3	6	1853	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	291276245
41	NC_013949	A	7	7	1859	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
42	NC_013949	ACCA	2	8	1886	1893	50 %	0 %	0 %	50 %	291276245
43	NC_013949	TTG	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291276245
44	NC_013949	ATT	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
45	NC_013949	CAAG	2	8	1981	1988	50 %	0 %	25 %	25 %	291276245
46	NC_013949	TAT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
47	NC_013949	A	6	6	2026	2031	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
48	NC_013949	TCA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276245
49	NC_013949	ATT	2	6	2115	2120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276245
50	NC_013949	CTTT	2	8	2121	2128	0 %	75 %	0 %	25 %	291276245
51	NC_013949	A	6	6	2163	2168	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
52	NC_013949	TTCAAC	2	12	2190	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276245
53	NC_013949	A	6	6	2253	2258	100 %	0 %	0 %	0 %	291276245
54	NC_013949	T	6	6	2288	2293	0 %	100 %	0 %	0 %	291276245
55	NC_013949	AGA	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276245
56	NC_013949	T	6	6	2482	2487	0 %	100 %	0 %	0 %	291276245
57	NC_013949	CAT	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
58	NC_013949	GTG	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
59	NC_013949	TGA	2	6	2665	2670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
60	NC_013949	TCACAC	2	12	2703	2714	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	291276246
61	NC_013949	GAT	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
62	NC_013949	TGCA	2	8	2814	2821	25 %	25 %	25 %	25 %	291276246
63	NC_013949	GGA	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276246
64	NC_013949	CT	3	6	2897	2902	0 %	50 %	0 %	50 %	291276246
65	NC_013949	A	8	8	2924	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
66	NC_013949	ATC	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
67	NC_013949	T	6	6	3026	3031	0 %	100 %	0 %	0 %	291276246
68	NC_013949	TCA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
69	NC_013949	TCAA	2	8	3108	3115	50 %	25 %	0 %	25 %	291276246
70	NC_013949	AGA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
71	NC_013949	A	6	6	3141	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
72	NC_013949	AG	3	6	3152	3157	50 %	0 %	50 %	0 %	291276246
73	NC_013949	AGA	2	6	3196	3201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
74	NC_013949	TC	3	6	3222	3227	0 %	50 %	0 %	50 %	291276246
75	NC_013949	TAT	2	6	3229	3234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
76	NC_013949	ATG	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
77	NC_013949	AAT	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291276246
78	NC_013949	TGG	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
79	NC_013949	TGCCAG	2	12	3412	3423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291276246
80	NC_013949	GA	3	6	3457	3462	50 %	0 %	50 %	0 %	291276246
81	NC_013949	ATT	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
82	NC_013949	T	6	6	3590	3595	0 %	100 %	0 %	0 %	291276246
83	NC_013949	GAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
84	NC_013949	A	8	8	3616	3623	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
85	NC_013949	TTGC	2	8	3638	3645	0 %	50 %	25 %	25 %	291276246
86	NC_013949	GCA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276246
87	NC_013949	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
88	NC_013949	A	6	6	3692	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
89	NC_013949	TC	3	6	3701	3706	0 %	50 %	0 %	50 %	291276246
90	NC_013949	GGT	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291276246
91	NC_013949	TGA	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
92	NC_013949	GGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291276246
93	NC_013949	AG	3	6	3964	3969	50 %	0 %	50 %	0 %	291276246
94	NC_013949	ATC	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276246
95	NC_013949	T	7	7	4046	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	291276246
96	NC_013949	A	6	6	4121	4126	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
97	NC_013949	A	6	6	4130	4135	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
98	NC_013949	ATCT	2	8	4139	4146	25 %	50 %	0 %	25 %	291276246
99	NC_013949	TGAG	2	8	4164	4171	25 %	25 %	50 %	0 %	291276246
100	NC_013949	ATTTTC	2	12	4197	4208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	291276246
101	NC_013949	TC	3	6	4251	4256	0 %	50 %	0 %	50 %	291276246
102	NC_013949	TTGA	2	8	4319	4326	25 %	50 %	25 %	0 %	291276246
103	NC_013949	ATTG	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	291276246
104	NC_013949	CAA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276246
105	NC_013949	TGA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276246
106	NC_013949	T	7	7	4507	4513	0 %	100 %	0 %	0 %	291276246
107	NC_013949	CAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291276246
108	NC_013949	TGAT	2	8	4581	4588	25 %	50 %	25 %	0 %	291276246
109	NC_013949	CTT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276246
110	NC_013949	GAA	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
111	NC_013949	GAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
112	NC_013949	A	6	6	4616	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	291276246
113	NC_013949	AGC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276246
114	NC_013949	AGA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276246
115	NC_013949	AG	3	6	4735	4740	50 %	0 %	50 %	0 %	291276246
116	NC_013949	ATT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276246
117	NC_013949	CGC	2	6	4787	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291276246
118	NC_013949	AT	3	6	4795	4800	50 %	50 %	0 %	0 %	291276246
119	NC_013949	T	7	7	4913	4919	0 %	100 %	0 %	0 %	291276247
120	NC_013949	T	6	6	5033	5038	0 %	100 %	0 %	0 %	291276247
121	NC_013949	ATC	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276247
122	NC_013949	A	6	6	5072	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	291276247
123	NC_013949	ATT	2	6	5093	5098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291276248
124	NC_013949	CTT	2	6	5112	5117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276248
125	NC_013949	TTC	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291276248
126	NC_013949	GAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276248
127	NC_013949	T	6	6	5209	5214	0 %	100 %	0 %	0 %	291276248
128	NC_013949	ATAA	2	8	5290	5297	75 %	25 %	0 %	0 %	291276248
129	NC_013949	T	6	6	5299	5304	0 %	100 %	0 %	0 %	291276248
130	NC_013949	A	6	6	5453	5458	100 %	0 %	0 %	0 %	291276248
131	NC_013949	T	6	6	5469	5474	0 %	100 %	0 %	0 %	291276248
132	NC_013949	T	6	6	5479	5484	0 %	100 %	0 %	0 %	291276248
133	NC_013949	T	7	7	5498	5504	0 %	100 %	0 %	0 %	291276248
134	NC_013949	CAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291276248
135	NC_013949	TAG	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276248
136	NC_013949	AG	3	6	5562	5567	50 %	0 %	50 %	0 %	291276248
137	NC_013949	GCA	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291276248
138	NC_013949	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291276248
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266	NC_013949	TCTTG	2	10	12549	12558	0 %	60 %	20 %	20 %	291276256
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269	NC_013949	AG	3	6	12674	12679	50 %	0 %	50 %	0 %	291276256
270	NC_013949	AGA	2	6	12688	12693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291276256
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