MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR06

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013749	TTC	2	6	82	87	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176392
2	NC_013749	GCC	2	6	116	121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176392
3	NC_013749	TCG	2	6	122	127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176392
4	NC_013749	TCC	2	6	244	249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176392
5	NC_013749	GTC	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176392
6	NC_013749	AAG	2	6	493	498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176393
7	NC_013749	CAT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176393
8	NC_013749	CAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176393
9	NC_013749	ACT	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176393
10	NC_013749	TTG	2	6	754	759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176393
11	NC_013749	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176393
12	NC_013749	TAA	2	6	860	865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284176394
13	NC_013749	CGA	2	6	897	902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176394
14	NC_013749	GCT	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176394
15	NC_013749	GAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176394
16	NC_013749	GTC	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176395
17	NC_013749	AAC	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176395
18	NC_013749	TTC	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176396
19	NC_013749	CGA	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176396
20	NC_013749	GAC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176396
21	NC_013749	GAG	2	6	1899	1904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176396
22	NC_013749	GCG	2	6	1908	1913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176396
23	NC_013749	GCG	2	6	1932	1937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176396
24	NC_013749	ACG	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176396
25	NC_013749	GTG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176396
26	NC_013749	GCC	2	6	2073	2078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176396
27	NC_013749	TCG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176397
28	NC_013749	CGT	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176397
29	NC_013749	GTG	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176397
30	NC_013749	TCG	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176397
31	NC_013749	CGT	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176397
32	NC_013749	CCT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176397
33	NC_013749	ACC	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176398
34	NC_013749	TCG	2	6	2507	2512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
35	NC_013749	TCG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
36	NC_013749	CAT	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
37	NC_013749	CAC	2	6	2670	2675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176398
38	NC_013749	GCG	3	9	2706	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176398
39	NC_013749	GCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
40	NC_013749	TCG	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
41	NC_013749	CAA	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176398
42	NC_013749	GGC	2	6	3276	3281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176398
43	NC_013749	TGC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
44	NC_013749	GAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176398
45	NC_013749	GCC	2	6	3691	3696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176398
46	NC_013749	ACG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176398
47	NC_013749	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176398
48	NC_013749	CTT	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
49	NC_013749	CGT	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
50	NC_013749	CTA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
51	NC_013749	CGT	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
52	NC_013749	CTC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176398
53	NC_013749	TCC	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176398
54	NC_013749	CCA	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176398
55	NC_013749	CTT	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
56	NC_013749	CTT	3	9	4332	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
57	NC_013749	CTT	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
58	NC_013749	CGG	2	6	4362	4367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176398
59	NC_013749	GCC	2	6	4378	4383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176398
60	NC_013749	TCC	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176398
61	NC_013749	GTT	2	6	4558	4563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176398
62	NC_013749	ATA	2	6	4568	4573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284176398
63	NC_013749	CAT	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
64	NC_013749	CGC	2	6	4623	4628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176398
65	NC_013749	TCT	2	6	4637	4642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
66	NC_013749	CAT	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
67	NC_013749	TCT	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
68	NC_013749	GTT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176398
69	NC_013749	GTC	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
70	NC_013749	GTC	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
71	NC_013749	ATC	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
72	NC_013749	GTC	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176398
73	NC_013749	TCA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176398
74	NC_013749	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176398
75	NC_013749	GGC	2	6	5026	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176398
76	NC_013749	CAG	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176399
77	NC_013749	ATC	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176400
78	NC_013749	TCC	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176400
79	NC_013749	ACG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176400
80	NC_013749	GAC	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176400
81	NC_013749	CAA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176400
82	NC_013749	ATC	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176400
83	NC_013749	TCA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176400
84	NC_013749	TGT	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176400
85	NC_013749	TCG	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176400
86	NC_013749	GTT	3	9	6249	6257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176400
87	NC_013749	CGT	2	6	6263	6268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176400
88	NC_013749	AGT	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176400
89	NC_013749	TGC	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176400
90	NC_013749	GTA	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176400
91	NC_013749	CTT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176400
92	NC_013749	CGC	2	6	6644	6649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176400
93	NC_013749	CGG	2	6	6752	6757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176400
94	NC_013749	CTT	2	6	7047	7052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176401
95	NC_013749	CGT	3	9	7209	7217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
96	NC_013749	CGT	2	6	7253	7258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
97	NC_013749	CGG	2	6	7316	7321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176401
98	NC_013749	TCG	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
99	NC_013749	CTC	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176401
100	NC_013749	TCG	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
101	NC_013749	CGA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176401
102	NC_013749	CGA	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176401
103	NC_013749	TCA	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176401
104	NC_013749	CTT	2	6	7860	7865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176401
105	NC_013749	GAA	2	6	7866	7871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176401
106	NC_013749	CGT	2	6	7934	7939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
107	NC_013749	GTT	2	6	8009	8014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176401
108	NC_013749	TTC	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176401
109	NC_013749	GAG	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176401
110	NC_013749	CGT	2	6	8130	8135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
111	NC_013749	AGC	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176401
112	NC_013749	GTT	2	6	8184	8189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176401
113	NC_013749	CGG	2	6	8274	8279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176401
114	NC_013749	CAT	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176401
115	NC_013749	CCG	2	6	8362	8367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176401
116	NC_013749	GTC	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
117	NC_013749	CGG	2	6	8417	8422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176401
118	NC_013749	GCC	2	6	8511	8516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176401
119	NC_013749	CGA	2	6	8528	8533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176401
120	NC_013749	CGT	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
121	NC_013749	GTC	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
122	NC_013749	CTC	2	6	8679	8684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176401
123	NC_013749	TCC	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176401
124	NC_013749	CTC	2	6	8847	8852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176401
125	NC_013749	TGC	2	6	8905	8910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
126	NC_013749	AGT	2	6	8912	8917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176401
127	NC_013749	CGC	3	9	8960	8968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176401
128	NC_013749	GTA	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176401
129	NC_013749	CTC	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176401
130	NC_013749	CGT	2	6	9021	9026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
131	NC_013749	CGT	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176401
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.