MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	CGCCGA	2	12	449	460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284176294
2	NC_013748	CGCCTA	2	12	2036	2047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284176296
3	NC_013748	AGCCAA	2	12	4944	4955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284176301
4	NC_013748	CGTTCG	2	12	5668	5679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
5	NC_013748	CGACCA	2	12	5758	5769	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284176302
6	NC_013748	GACTCG	2	12	7764	7775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176302
7	NC_013748	CGGCGA	2	12	8732	8743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284176302
8	NC_013748	CGACGG	2	12	9741	9752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284176303
9	NC_013748	CGAGGA	2	12	11874	11885	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284176305
10	NC_013748	ACGGAA	2	12	12682	12693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284176306
11	NC_013748	ACACAA	2	12	14723	14734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176308
12	NC_013748	CACGAT	2	12	15207	15218	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284176308
13	NC_013748	GACGCT	2	12	16380	16391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176310
14	NC_013748	GCTCGG	2	12	17852	17863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176313
15	NC_013748	CGGCGA	2	12	18150	18161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284176314
16	NC_013748	ACGATG	2	12	18164	18175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284176314
17	NC_013748	CGGCGA	2	12	18634	18645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284176314
18	NC_013748	AGTACG	2	12	20464	20475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284176318
19	NC_013748	TGGCCG	2	12	23113	23124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176321
20	NC_013748	CGGCCG	2	12	24191	24202	0 %	0 %	50 %	50 %	284176321
21	NC_013748	ACCGGC	2	12	29056	29067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284176324
22	NC_013748	CGTGTC	2	12	29874	29885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176325
23	NC_013748	GTCGGC	2	12	30215	30226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176325
24	NC_013748	ACCGTC	2	12	42811	42822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284176344
25	NC_013748	CCGAGA	2	12	43509	43520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176346
26	NC_013748	TTCGTC	2	12	45710	45721	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284176350
27	NC_013748	CGGCTT	2	12	46765	46776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176352
28	NC_013748	GCGGCC	2	12	46806	46817	0 %	0 %	50 %	50 %	284176352
29	NC_013748	CCGACG	2	12	53364	53375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284176367
30	NC_013748	CGTCGG	2	12	54223	54234	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176370
31	NC_013748	CGGGTC	2	12	55227	55238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176372
32	NC_013748	ACGTCG	2	12	56434	56445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284176374
33	NC_013748	CGGTCG	2	12	57996	58007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176376
34	NC_013748	TGTTCG	2	12	59411	59422	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284176376
35	NC_013748	CGTCGG	2	12	59541	59552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284176376
36	NC_013748	GCTCGC	2	12	60152	60163	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284176377
37	NC_013748	CGCGGC	2	12	64753	64764	0 %	0 %	50 %	50 %	284176382
38	NC_013748	CGAACC	2	12	70314	70325	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284176389

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.