MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 1079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	CAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176295
2	NC_013748	CTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176295
3	NC_013748	GTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176295
4	NC_013748	TGA	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176295
5	NC_013748	GTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176295
6	NC_013748	TCA	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176295
7	NC_013748	TCT	2	6	1059	1064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176295
8	NC_013748	CGC	2	6	1453	1458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
9	NC_013748	CGA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
10	NC_013748	CGC	2	6	1536	1541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
11	NC_013748	CGA	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
12	NC_013748	TCG	2	6	1738	1743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176296
13	NC_013748	TCT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176296
14	NC_013748	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176296
15	NC_013748	CGC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
16	NC_013748	CGA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
17	NC_013748	CGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176296
18	NC_013748	CGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
19	NC_013748	ACG	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176296
20	NC_013748	GAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176296
21	NC_013748	CGG	2	6	2654	2659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176297
22	NC_013748	CGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176297
23	NC_013748	AGT	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
24	NC_013748	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
25	NC_013748	CAA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176297
26	NC_013748	TGA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176297
27	NC_013748	GAA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176297
28	NC_013748	TGG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176298
29	NC_013748	ACA	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176298
30	NC_013748	TGA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176298
31	NC_013748	CGA	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176299
32	NC_013748	GAC	3	9	3677	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176299
33	NC_013748	TGG	2	6	3724	3729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176299
34	NC_013748	TGC	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176299
35	NC_013748	TCC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176299
36	NC_013748	TCG	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176299
37	NC_013748	TCG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176300
38	NC_013748	TTC	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176300
39	NC_013748	CGA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176300
40	NC_013748	CAT	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176300
41	NC_013748	TGG	2	6	5016	5021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176301
42	NC_013748	CCT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176301
43	NC_013748	GAA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176301
44	NC_013748	CCT	2	6	5375	5380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176301
45	NC_013748	CGA	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176301
46	NC_013748	ACG	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176301
47	NC_013748	GAT	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176301
48	NC_013748	CCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
49	NC_013748	TCG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
50	NC_013748	TCC	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176302
51	NC_013748	ACG	4	12	5724	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
52	NC_013748	TGA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
53	NC_013748	CTA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176302
54	NC_013748	AAT	2	6	5855	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284176302
55	NC_013748	CAG	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
56	NC_013748	GCG	2	6	6013	6018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
57	NC_013748	ACG	3	9	6138	6146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
58	NC_013748	GAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
59	NC_013748	GGA	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
60	NC_013748	TTC	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176302
61	NC_013748	GGC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
62	NC_013748	GAT	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
63	NC_013748	AAC	2	6	6504	6509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176302
64	NC_013748	CCG	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
65	NC_013748	GAA	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
66	NC_013748	GAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
67	NC_013748	ACG	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
68	NC_013748	GAG	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176302
69	NC_013748	GAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
70	NC_013748	TCC	2	6	6808	6813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176302
71	NC_013748	GTC	2	6	6864	6869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
72	NC_013748	GAA	2	6	7068	7073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
73	NC_013748	CGA	2	6	7112	7117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
74	NC_013748	GAC	4	12	7199	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
75	NC_013748	CGA	2	6	7211	7216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
76	NC_013748	GCC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
77	NC_013748	CGT	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
78	NC_013748	CGA	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
79	NC_013748	TGA	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
80	NC_013748	CTT	2	6	7472	7477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176302
81	NC_013748	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176302
82	NC_013748	GAC	3	9	7683	7691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
83	NC_013748	CCG	2	6	7749	7754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
84	NC_013748	CGA	2	6	7970	7975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
85	NC_013748	CGG	2	6	7984	7989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
86	NC_013748	CGG	3	9	8009	8017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
87	NC_013748	GGC	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
88	NC_013748	CGT	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
89	NC_013748	TGA	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176302
90	NC_013748	CGG	2	6	8171	8176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
91	NC_013748	CGT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
92	NC_013748	CGG	2	6	8306	8311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
93	NC_013748	CGG	2	6	8453	8458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
94	NC_013748	CGG	2	6	8486	8491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176302
95	NC_013748	TCG	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
96	NC_013748	CGC	2	6	8525	8530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176302
97	NC_013748	ACG	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176302
98	NC_013748	CCT	2	6	8669	8674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176302
99	NC_013748	GTC	2	6	8913	8918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176302
100	NC_013748	GAC	2	6	8988	8993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
101	NC_013748	TCG	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176303
102	NC_013748	CGT	2	6	9128	9133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176303
103	NC_013748	TTC	2	6	9139	9144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176303
104	NC_013748	CGA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
105	NC_013748	ATC	2	6	9165	9170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176303
106	NC_013748	CGA	2	6	9195	9200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
107	NC_013748	ATG	2	6	9235	9240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176303
108	NC_013748	CGG	2	6	9327	9332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176303
109	NC_013748	CGA	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
110	NC_013748	CGA	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
111	NC_013748	GCC	2	6	9662	9667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176303
112	NC_013748	GAG	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176303
113	NC_013748	CGA	2	6	9837	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
114	NC_013748	GCG	2	6	9848	9853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176303
115	NC_013748	CAT	2	6	9864	9869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176303
116	NC_013748	GCG	3	9	9952	9960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176303
117	NC_013748	ACG	2	6	9965	9970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
118	NC_013748	CGG	2	6	10056	10061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176303
119	NC_013748	CGA	2	6	10104	10109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
120	NC_013748	GCA	2	6	10151	10156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
121	NC_013748	CTG	2	6	10195	10200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176303
122	NC_013748	AGC	2	6	10308	10313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
123	NC_013748	CGA	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
124	NC_013748	TCA	2	6	10346	10351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176303
125	NC_013748	CGA	2	6	10443	10448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
126	NC_013748	GCC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176303
127	NC_013748	CGA	2	6	10485	10490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176303
128	NC_013748	CGA	2	6	10531	10536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176304
129	NC_013748	ACC	2	6	10549	10554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176304
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133	NC_013748	CGA	2	6	10740	10745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176304
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243	NC_013748	TCG	3	9	17953	17961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176313
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247	NC_013748	CGG	2	6	18246	18251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176314
248	NC_013748	ACA	2	6	18282	18287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176314
249	NC_013748	GAA	2	6	18334	18339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176314
250	NC_013748	GTC	2	6	18365	18370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176314
251	NC_013748	AAC	2	6	18422	18427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176314
252	NC_013748	CGA	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176314
253	NC_013748	TCC	2	6	18501	18506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176314
254	NC_013748	GCG	2	6	18510	18515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176314
255	NC_013748	AAG	2	6	18516	18521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176314
256	NC_013748	CCG	2	6	18672	18677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176314
257	NC_013748	AAC	2	6	18680	18685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176314
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283	NC_013748	CGA	2	6	20084	20089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176318
284	NC_013748	CGA	2	6	20195	20200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176318
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372	NC_013748	GCC	2	6	24949	24954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176322
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375	NC_013748	TCG	2	6	25050	25055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176322
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495	NC_013748	TCT	2	6	33657	33662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176329
496	NC_013748	TCA	2	6	33684	33689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176329
497	NC_013748	AGC	2	6	33717	33722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176329
498	NC_013748	ATT	2	6	33743	33748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284176329
499	NC_013748	TCC	2	6	33795	33800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176329
500	NC_013748	GAA	2	6	33806	33811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284176329

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