MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	TG	3	6	1254	1259	0 %	50 %	50 %	0 %	284176135
2	NC_013747	GC	3	6	2691	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
3	NC_013747	AC	3	6	2784	2789	50 %	0 %	0 %	50 %	284176135
4	NC_013747	GC	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
5	NC_013747	GA	3	6	3769	3774	50 %	0 %	50 %	0 %	284176136
6	NC_013747	CG	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	284176139
7	NC_013747	CG	3	6	7163	7168	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
8	NC_013747	TC	3	6	7498	7503	0 %	50 %	0 %	50 %	284176140
9	NC_013747	GC	3	6	7834	7839	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
10	NC_013747	CG	3	6	8184	8189	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
11	NC_013747	GC	3	6	8368	8373	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
12	NC_013747	GC	3	6	9763	9768	0 %	0 %	50 %	50 %	284176141
13	NC_013747	CG	3	6	9988	9993	0 %	0 %	50 %	50 %	284176141
14	NC_013747	GA	3	6	10005	10010	50 %	0 %	50 %	0 %	284176141
15	NC_013747	GC	3	6	10289	10294	0 %	0 %	50 %	50 %	284176142
16	NC_013747	CA	3	6	12913	12918	50 %	0 %	0 %	50 %	284176143
17	NC_013747	GC	4	8	14068	14075	0 %	0 %	50 %	50 %	284176144
18	NC_013747	AG	3	6	14971	14976	50 %	0 %	50 %	0 %	284176145
19	NC_013747	CG	3	6	15554	15559	0 %	0 %	50 %	50 %	284176145
20	NC_013747	GC	3	6	15825	15830	0 %	0 %	50 %	50 %	284176145
21	NC_013747	GC	3	6	16768	16773	0 %	0 %	50 %	50 %	284176146
22	NC_013747	TG	3	6	17581	17586	0 %	50 %	50 %	0 %	284176146
23	NC_013747	CG	3	6	17993	17998	0 %	0 %	50 %	50 %	284176146
24	NC_013747	CG	3	6	18155	18160	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
25	NC_013747	GC	3	6	18611	18616	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
26	NC_013747	GC	3	6	19100	19105	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
27	NC_013747	CG	3	6	19329	19334	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
28	NC_013747	CG	3	6	20268	20273	0 %	0 %	50 %	50 %	284176148
29	NC_013747	CG	3	6	20707	20712	0 %	0 %	50 %	50 %	284176149
30	NC_013747	GC	3	6	21209	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
31	NC_013747	TC	3	6	21218	21223	0 %	50 %	0 %	50 %	284176150
32	NC_013747	GA	3	6	21602	21607	50 %	0 %	50 %	0 %	284176150
33	NC_013747	GC	3	6	22501	22506	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
34	NC_013747	CG	3	6	22608	22613	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
35	NC_013747	TC	3	6	22724	22729	0 %	50 %	0 %	50 %	284176150
36	NC_013747	CG	4	8	23190	23197	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
37	NC_013747	AC	3	6	24519	24524	50 %	0 %	0 %	50 %	284176152
38	NC_013747	CG	3	6	24697	24702	0 %	0 %	50 %	50 %	284176152
39	NC_013747	CT	3	6	25308	25313	0 %	50 %	0 %	50 %	284176153
40	NC_013747	GC	3	6	28502	28507	0 %	0 %	50 %	50 %	284176158
41	NC_013747	GC	4	8	29067	29074	0 %	0 %	50 %	50 %	284176159
42	NC_013747	CG	3	6	29646	29651	0 %	0 %	50 %	50 %	284176160
43	NC_013747	GA	3	6	29758	29763	50 %	0 %	50 %	0 %	284176160
44	NC_013747	GA	3	6	30438	30443	50 %	0 %	50 %	0 %	284176161
45	NC_013747	TG	3	6	30638	30643	0 %	50 %	50 %	0 %	284176162
46	NC_013747	CT	3	6	30953	30958	0 %	50 %	0 %	50 %	284176162
47	NC_013747	CT	3	6	31325	31330	0 %	50 %	0 %	50 %	284176162
48	NC_013747	TC	3	6	31881	31886	0 %	50 %	0 %	50 %	284176163
49	NC_013747	GA	3	6	34029	34034	50 %	0 %	50 %	0 %	284176164
50	NC_013747	CG	3	6	34799	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
51	NC_013747	CG	3	6	35289	35294	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
52	NC_013747	CG	3	6	35703	35708	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
53	NC_013747	GT	3	6	36296	36301	0 %	50 %	50 %	0 %	284176166
54	NC_013747	CG	3	6	37342	37347	0 %	0 %	50 %	50 %	284176167
55	NC_013747	CG	3	6	37389	37394	0 %	0 %	50 %	50 %	284176167
56	NC_013747	CG	3	6	39136	39141	0 %	0 %	50 %	50 %	284176170
57	NC_013747	CG	3	6	39327	39332	0 %	0 %	50 %	50 %	284176170
58	NC_013747	GC	3	6	40560	40565	0 %	0 %	50 %	50 %	284176173
59	NC_013747	AG	3	6	43084	43089	50 %	0 %	50 %	0 %	284176175
60	NC_013747	GA	3	6	43705	43710	50 %	0 %	50 %	0 %	284176176
61	NC_013747	CG	3	6	43877	43882	0 %	0 %	50 %	50 %	284176176
62	NC_013747	TC	3	6	45199	45204	0 %	50 %	0 %	50 %	284176177
63	NC_013747	CG	3	6	45959	45964	0 %	0 %	50 %	50 %	284176177
64	NC_013747	CT	3	6	46709	46714	0 %	50 %	0 %	50 %	284176178
65	NC_013747	GC	3	6	46896	46901	0 %	0 %	50 %	50 %	284176178
66	NC_013747	GC	3	6	47868	47873	0 %	0 %	50 %	50 %	284176178
67	NC_013747	GT	4	8	48775	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	284176179
68	NC_013747	CG	3	6	49099	49104	0 %	0 %	50 %	50 %	284176179
69	NC_013747	GT	3	6	50886	50891	0 %	50 %	50 %	0 %	284176180
70	NC_013747	CG	3	6	51250	51255	0 %	0 %	50 %	50 %	284176180
71	NC_013747	CT	3	6	52744	52749	0 %	50 %	0 %	50 %	284176183
72	NC_013747	GC	3	6	52777	52782	0 %	0 %	50 %	50 %	284176183
73	NC_013747	CG	3	6	53576	53581	0 %	0 %	50 %	50 %	284176185
74	NC_013747	CG	3	6	53903	53908	0 %	0 %	50 %	50 %	284176186
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77	NC_013747	GC	3	6	57551	57556	0 %	0 %	50 %	50 %	284176192
78	NC_013747	CG	3	6	58511	58516	0 %	0 %	50 %	50 %	284176192
79	NC_013747	CG	3	6	59743	59748	0 %	0 %	50 %	50 %	284176193
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83	NC_013747	GA	3	6	64919	64924	50 %	0 %	50 %	0 %	284176198
84	NC_013747	GA	3	6	66485	66490	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
85	NC_013747	GA	3	6	66776	66781	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
86	NC_013747	GA	3	6	67217	67222	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
87	NC_013747	TG	3	6	68358	68363	0 %	50 %	50 %	0 %	284176201
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90	NC_013747	CG	3	6	75873	75878	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
91	NC_013747	CG	3	6	76120	76125	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
92	NC_013747	CG	4	8	76631	76638	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
93	NC_013747	GC	3	6	76727	76732	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
94	NC_013747	GA	3	6	78285	78290	50 %	0 %	50 %	0 %	284176211
95	NC_013747	GA	3	6	79192	79197	50 %	0 %	50 %	0 %	284176213
96	NC_013747	CG	3	6	79242	79247	0 %	0 %	50 %	50 %	284176213
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101	NC_013747	CG	3	6	87643	87648	0 %	0 %	50 %	50 %	284176223
102	NC_013747	GC	3	6	88702	88707	0 %	0 %	50 %	50 %	284176225
103	NC_013747	TG	3	6	90555	90560	0 %	50 %	50 %	0 %	284176227
104	NC_013747	GC	3	6	91386	91391	0 %	0 %	50 %	50 %	284176228
105	NC_013747	GA	3	6	91788	91793	50 %	0 %	50 %	0 %	284176228
106	NC_013747	GT	3	6	92173	92178	0 %	50 %	50 %	0 %	284176229
107	NC_013747	GC	3	6	93451	93456	0 %	0 %	50 %	50 %	284176230
108	NC_013747	GC	3	6	94190	94195	0 %	0 %	50 %	50 %	284176231
109	NC_013747	CG	3	6	94284	94289	0 %	0 %	50 %	50 %	284176231
110	NC_013747	CG	3	6	95202	95207	0 %	0 %	50 %	50 %	284176232
111	NC_013747	CG	3	6	95335	95340	0 %	0 %	50 %	50 %	284176232
112	NC_013747	CG	3	6	95371	95376	0 %	0 %	50 %	50 %	284176232
113	NC_013747	GC	3	6	97685	97690	0 %	0 %	50 %	50 %	284176234
114	NC_013747	CT	3	6	98085	98090	0 %	50 %	0 %	50 %	284176234
115	NC_013747	GC	3	6	99917	99922	0 %	0 %	50 %	50 %	284176236
116	NC_013747	GC	3	6	100211	100216	0 %	0 %	50 %	50 %	284176236
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119	NC_013747	GA	3	6	102425	102430	50 %	0 %	50 %	0 %	284176237
120	NC_013747	TC	3	6	102475	102480	0 %	50 %	0 %	50 %	284176237
121	NC_013747	AG	3	6	103181	103186	50 %	0 %	50 %	0 %	284176237
122	NC_013747	GC	3	6	107768	107773	0 %	0 %	50 %	50 %	284176241
123	NC_013747	GA	3	6	108924	108929	50 %	0 %	50 %	0 %	284176242
124	NC_013747	GA	3	6	109294	109299	50 %	0 %	50 %	0 %	284176242
125	NC_013747	GA	3	6	110144	110149	50 %	0 %	50 %	0 %	284176242
126	NC_013747	CG	3	6	110646	110651	0 %	0 %	50 %	50 %	284176242
127	NC_013747	CG	3	6	111418	111423	0 %	0 %	50 %	50 %	284176243
128	NC_013747	GC	3	6	111888	111893	0 %	0 %	50 %	50 %	284176244
129	NC_013747	GT	3	6	112862	112867	0 %	50 %	50 %	0 %	284176245
130	NC_013747	CG	3	6	113335	113340	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
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132	NC_013747	CG	3	6	113757	113762	0 %	0 %	50 %	50 %	284176246
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141	NC_013747	AG	3	6	118401	118406	50 %	0 %	50 %	0 %	284176249
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.